Роджер Брент

Роджер Брент
Роджер Брент
	Роджер Брент в своей лаборатории в Онкологическом исследовательском центре Фреда Хатчинсона
Рожденный	28 декабря 1955 г. ; Спартанберг, Южная Каролина , США
Альма-матер	Университет Южного Миссисипи ; Гарвардский университет ;
Известный	Доменная структура регуляторов транскрипции, системная биология
	Научная карьера
Поля	Биолог
Учреждения	Гарвардский университет ; Институт молекулярных наук ; Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона ;
Диссертация	Регуляция клеточного ответа на повреждение ДНК (1982)
Веб-сайт	http://brentlab.fredhutch.org/brent/en.html

Роджер Брент (родился 28 декабря 1955 г.) - американский биолог, известный своими работами в области регуляции генов и системной биологии. Он изучает количественное поведение клеточных сигнальных систем, а также причины и последствия их изменений. Он является действительным членом Отделения фундаментальных наук Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона и доцентом кафедры геномных наук в Вашингтонском университете .

Ранний период жизни

Брент вырос в Хаттисберге, штат Миссисипи , и получил степень бакалавра компьютерных наук и статистики в Университете Южного Миссисипи , где он применил методы искусственного интеллекта для сворачивания белков. Защитил кандидатскую диссертацию (1982). ^[1] и постдокторская работа (1985) по биохимии и молекулярной биологии в Гарвардском университете в лаборатории Марка Пташне . В своей работе он клонировал репрессор LexA E. coli и показал, как он контролирует реакцию клетки на повреждение ДНК, использовал LexA в качестве репрессора у дрожжей. ^[2]^[3] и создали слитые белки, которые использовали LexA для переноса частей дрожжевого Gal4 и других белков, регулирующих транскрипцию, к синтетическим репортерным генам дрожжей. ^[4] Эти эксперименты по замене доменов установили доменную структуру эукариотических белков, регулирующих транскрипцию. ^[5]^[6]^[7]^[8]

Карьера

Использование Брентом прокариотических белков-репрессоров у эукариот и разработка химерных белков, содержащих прокариотические ДНК-связывающие домены, позволило идентифицировать другие домены, регулирующие транскрипцию. ^[9] и технологии регуляции генов, включая репрессию транскрипции, контролируемую тетрациклиновым репрессором. ^[10] и системы БПЛА Gal4 и LexA, используемые в других модельных организмах. ^[11] Использование ДНК-связывающих доменов для нацеливания на связанные функциональные белковые домены (например, двухцепочечные эндонуклеазы). ^[12] и ДНК-метилазы ^[13]) или фрагменты-приманки в экспериментах с двумя гибридами для определенных участков ДНК теперь являются обычным явлением.

В 1985 году Брент перешёл на кафедру молекулярной биологии Массачусетской больницы общего профиля и на кафедру генетики Гарвардской медицинской школы . Его работа там способствовала развитию двухгибридных методов и разработке крупномасштабных/универсальных функциональных геномных средств (взаимодействующее спаривание ^[14] и разработка пептидных аптамеров ) для обнаружения и нарушения белок-белковых взаимодействий. ^[15] В 1997 году вместе с Сиднеем Бреннером он помог основать Институт молекулярных наук. ^[16] некоммерческой исследовательской лаборатории в Беркли, Калифорния , и стал ее генеральным директором. ^[17] директор по исследованиям и президент в 2001 году. Он инициировал там исследования в своей лаборатории по контролю клеточных сигналов и межклеточным вариациям. Сейчас он профессор фундаментальных наук в Онкологическом центре Фреда Хатчинсона и доцент кафедры геномных наук и биоинженерии в Вашингтонском университете .

Работа Брента преследует два основных вопроса: как системы сигнализации клеток контролируют свои сигналы и информацию, которую они передают. ^[18]^[19] и происхождение и фенотипические последствия межклеточных вариаций в передаче сигналов и последующих ответах. ^[20]

В 1987 году Брент помог найти и продолжает вносить свой вклад в « Текущие протоколы в молекулярной биологии» , «руководство по клонированию». ^[21] который начал журналы Current Protocols . С 1995 по 2000 год он организовал семинары «После генома» в Санта-Фе, содержание которых внесло вклад в некоторые из ранних программ системной биологии. ^[22] Помимо обычной консультативной работы с НИЗ, ННФ и промышленными организациями, в 1997 году он начал консультировать правительство США по тактическим и стратегическим вопросам защиты от биологического нападения и новых болезней. ^[23]^[24]^[25]^[26] В 1998 году в Институте молекулярных наук он участвовал в дискуссиях с Робом Карлсоном и Дрю Энди, которые помогли разработать некоторые идеи, лежащие в основе синтетической биологии . ^[27] С 2011 по 2014 год он руководил Центром биологического будущего, экспериментальным проектом, призванным лучше понять влияние достижений биологических знаний и возможностей на жизнь человечества. ^[28]

Он был стипендиатом Благотворительного фонда Пью. ^[29] и старший научный сотрудник Медицинского фонда Эллисона . ^[30] В 2003 году он получил премию Габбая в области биотехнологии и медицины за работу над методами взаимодействия белков. ^[31] а в 2011 году он был назван членом Американской ассоциации содействия развитию науки «за выдающийся вклад в области биохимии, транскрипции, геномики и системной биологии». ^[32]

Использование Брентом прокариотических белков-репрессоров и их использование в химерных белках для регуляции экспрессии генов у эукариот было предметом основных патентов (включая патент США № 4 833 080 «Регулирование экспрессии генов эукариот» с Марком Пташнем). Доктор Брент является изобретателем еще 16 патентов США и четырех патентов США, находящихся на рассмотрении. ^[33]

Персональный

В 2006 году Брент женился на биологе и лауреате Нобелевской премии по физиологии и медицине 2004 года Линде Б. Бак . ^[34]

Ссылки

^ «Регуляция клеточного ответа на повреждение ДНК» (1982)
^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1984). «Бактериальный белок-репрессор или терминатор транскрипции дрожжей могут блокировать активацию вышестоящего гена дрожжей». Природа . 312 (5995): 612–615. Бибкод : 1984Natur.312..612B . дои : 10.1038/312612a0 . ПМИД 6390216 . S2CID 4309764 .
^ Норт, Г. (1984). «Современные уроки лямбды и лака» . Природа . 308 (5961): 687–688. дои : 10.1038/308687a0 . ПМИД 6232462 . S2CID 4240047 .
^ Брент, Роджер; Пташне, Марк (1985). «Эукариотический активатор транскрипции, обладающий специфичностью ДНК прокариотического репрессора» . Клетка . 43 (3): 729–736. дои : 10.1016/0092-8674(85)90246-6 . ПМИД 3907859 .
^ Альбертс, А.; Брей, Д.; Льюис, Дж.; Рафф, М.; Робертс, К. (1989). «Мембранная структура». Молекулярная биология клетки (6-е изд.). Гирляндная наука. п. 568: Рисунок 10–24. ISBN 978-0-8153-4432-2 .
^ Франкель, AD; Ким, PS (1991). «Модульная структура факторов транскрипции: значение для регуляции генов». Клетка . 65 (5): 717–719. дои : 10.1016/0092-8674(91)90378-c . ПМИД 2040012 . S2CID 6632853 .
^ «Генетика: Лекция 21» (PDF) . MIT OpenCourseWare . Массачусетский технологический институт. hdl : 1721.1/34953 . Архивировано (PDF) из оригинала 18 мая 2020 г. Проверено 15 декабря 2014 г.
^ Гротеволд, Э.; Келлог, Э.; Чаппелл, Л. (июнь 2015 г.). Гены растений, геномы и генетика (1-е изд.). Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-1-119-99887-7 .
^ Годовский, П.Дж.; Пикард, Д.; Ямамото, КР (август 1988 г.). «Передача сигнала и регуляция транскрипции с помощью слитых белков глюкокортикоидного рецептора и LexA». Наука . 241 (4867): 812–816. Бибкод : 1988Sci...241..812G . дои : 10.1126/science.3043662 . ПМИД 3043662 .
^ Дойшле, У.; Мейер, ВК; Тизен, HJ (апрель 1995 г.). «Тетрациклин-обратимое замалчивание эукариотических промоторов» . Молекулярно-клеточная биология . 15 (4): 1907–1914. дои : 10.1128/mcb.15.4.1907 . ПМК 230416 . ПМИД 7891684 .
^ Родригес, AD V; Диданиол, Д.; Десплан, К. (2012). «Мощные инструменты для экспрессии генов и клонального анализа у дрозофилы» . Природные методы . 9 (1): 47–55. дои : 10.1038/nmeth.1800 . ПМЦ 3574576 . ПМИД 22205518 .
^ Бибикова, МЮ; Кэрролл, Д.; Сигал, диджей; Траутман, Дж. К.; Смит, Дж.; Ким, Ю.Г.; Чандрасегаран, С. (январь 2001 г.). «Стимуляция гомологичной рекомбинации путем целенаправленного расщепления химерными нуклеазами» . Мол Клеточная Биол . 21 (1): 289–297. дои : 10.1128/MCB.21.1.289-297.2001 . ПМК 88802 . ПМИД 11113203 .
^ ван Стинсел, Б.; Хеникофф, С. (апрель 2000 г.). «Идентификация in vivo ДНК-мишеней белков хроматина с использованием привязанной метилтрансферазы плотины». Нат. Биотехнология . 18 (4): 424–428. дои : 10.1038/74487 . ПМИД 10748524 . S2CID 30350384 .
^ Финли-младший, Р.Л.-младший; и Брент Р. (1994). «Взаимодействующее спаривание выявляет бинарные и тройные взаимодействия между регуляторами клеточного цикла дрозофилы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (26): 12980–12984. дои : 10.1073/pnas.91.26.12980 . ПМК 45564 . ПМИД 7809159 .
^ Брент, Роджер; Пташне, Марк. «Регуляция экспрессии эукариотических генов, патент США № 4,833,080 (1989)» . Проверено 6 января 2015 г.
^ Фридберг, Эррол (октябрь 2010 г.). Сидней Бреннер: Биография . ЦШЛ Пресс . ISBN 978-0-87969-947-5 .
^ «Протеомика: текущее состояние и будущие направления - интервью с доктором философии Роджером Брентом» . Проверено 5 июля 2010 г.
^ Ю, Р.; Гордон, А.; Колман-Лернер, А.; Бенджамин, КР; Пинкус, Д.; Серра, Э.; Холл, М.; Брент, Р. (2008). «Отрицательная обратная связь оптимизирует передачу информации в сотовой сигнальной системе» . Природа . 456 (7223): 755–761. дои : 10.1038/nature07513 . ПМК 2716709 . ПМИД 19079053 .
^ Брент, Р. (2009). «Что такое сигнал и какую информацию он несет?». Письма ФЭБС . 583 (24): 4019–24. дои : 10.1016/j.febslet.2009.11.029 . ПМИД 19917282 . S2CID 15873809 .
^ Колман-Лернер, А.; Гордон, А.; Серра, Э.; Холл, Э.; Брент, Р. (2005). «Регулируемые межклеточные вариации в системе принятия решений о судьбе клеток». Природа . 437 (7059): 699–706. Бибкод : 2005Natur.437..699C . дои : 10.1038/nature03998 . ПМИД 16170311 . S2CID 4398874 .
^ Осубель, FM; Брент, Р.; Кингстон, RE; Мур, Д.Д.; Зейдман, Дж.Г.; Смит, Дж.А.; Струл, К. (2012). "Предисловие". Современные протоколы молекулярной биологии . Том. 98. стр. iii–v. дои : 10.1002/0471142727.mbprefs98 . ISBN 978-0-471-14272-0 . S2CID 221604713 .
^ Грубер, М. «Составьте карту генома, взломайте геном» . Wired.com . Проверено 2 февраля 2010 г.
^ Маршалл, Э. (1997). «Слишком радикально для НИЗ? Попробуйте DARPA». Наука . 275 (5301): 744–746. дои : 10.1126/science.275.5301.744 . ПМИД 9036531 . S2CID 5825319 .
^ Миллер, Дж.; Броуд, У.Дж.; Энгельберг, С. (2001). Микробы: биологическое оружие и секретная война Америки . Нью-Йорк: Саймон и Шустер. ISBN 978-0-684-87159-2 .
^ Бхаттачарджи, Ю. (2007). «Комиссия проводит экспертную оценку разведывательных исследований» . Наука . 318 (5856): 1538. doi : 10.1126/science.318.5856.1538 . ПМИД 18063763 . S2CID 41060126 .
^ Брент, Р. (22 ноября 2006 г.). В долине смертной тени. DSpace@MIT (черновик). hdl : 1721.1/34914 .
^ Карлсон, Р; и др. «Компоненты BIO-IO и инструменты проектирования» (PDF) . Проверено 5 августа 2010 г.
^ Вудворд, Кристин (13 октября 2011 г.). «Центр биологического будущего для решения проблем, вызванных взрывом биологических знаний в 21 веке» . Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона . Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона . Проверено 6 января 2014 г.
^ «Программа стипендиатов Pew в области биомедицинских наук» . Благотворительные фонды PEW . Проверено 10 октября 2011 г.
^ «HOME::Премия старшего научного сотрудника в области старения::2000::Стволовые клетки» . Медицинский фонд Эллисона . Медицинский фонд Эллисона . Проверено 8 августа 2011 г.
^ «ПРЕДШЕДШИЕ ПОБЕДИТЕЛИ 2003 г.» за разработку двугибридных дрожжевых ловушек и ловушек для взаимодействия спаривания дрожжей » . Розенстильский исследовательский центр фундаментальных медицинских наук . Научно-исследовательский центр фундаментальных медицинских наук Университета Брандейса Розенстиль . Проверено 13 июня 2012 г.
^ Сосвилл, Э.А. (2011). «Награды, назначения, объявления» . J Национальный онкологический институт . 103 (4): 295. doi : 10.1093/jnci/djr038 .
^ «Патентный поиск на USPTO.gov» . Проверено 20 декабря 2022 г.
^ Значок, Питер (2008). Нобелевские лица . Джон Уайли и сыновья . п. 180. ИСБН 978-3-527-40678-4 . Проверено 2 декабря 2015 г.

[1] «Регуляция клеточного ответа на повреждение ДНК» (1982)

[2] Брент, Роджер; Пташне, Марк (1984). «Бактериальный белок-репрессор или терминатор транскрипции дрожжей могут блокировать активацию вышестоящего гена дрожжей». Природа . 312 (5995): 612–615. Бибкод : 1984Natur.312..612B . дои : 10.1038/312612a0 . ПМИД 6390216 . S2CID 4309764 .

[3] Норт, Г. (1984). «Современные уроки лямбды и лака» . Природа . 308 (5961): 687–688. дои : 10.1038/308687a0 . ПМИД 6232462 . S2CID 4240047 .

[4] Брент, Роджер; Пташне, Марк (1985). «Эукариотический активатор транскрипции, обладающий специфичностью ДНК прокариотического репрессора» . Клетка . 43 (3): 729–736. дои : 10.1016/0092-8674(85)90246-6 . ПМИД 3907859 .

[5] Альбертс, А.; Брей, Д.; Льюис, Дж.; Рафф, М.; Робертс, К. (1989). «Мембранная структура». Молекулярная биология клетки (6-е изд.). Гирляндная наука. п. 568: Рисунок 10–24. ISBN 978-0-8153-4432-2 .

[6] Франкель, AD; Ким, PS (1991). «Модульная структура факторов транскрипции: значение для регуляции генов». Клетка . 65 (5): 717–719. дои : 10.1016/0092-8674(91)90378-c . ПМИД 2040012 . S2CID 6632853 .

[7] «Генетика: Лекция 21» (PDF) . MIT OpenCourseWare . Массачусетский технологический институт. hdl : 1721.1/34953 . Архивировано (PDF) из оригинала 18 мая 2020 г. Проверено 15 декабря 2014 г.

[8] Гротеволд, Э.; Келлог, Э.; Чаппелл, Л. (июнь 2015 г.). Гены растений, геномы и генетика (1-е изд.). Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-1-119-99887-7 .

[9] Годовский, П.Дж.; Пикард, Д.; Ямамото, КР (август 1988 г.). «Передача сигнала и регуляция транскрипции с помощью слитых белков глюкокортикоидного рецептора и LexA». Наука . 241 (4867): 812–816. Бибкод : 1988Sci...241..812G . дои : 10.1126/science.3043662 . ПМИД 3043662 .

[10] Дойшле, У.; Мейер, ВК; Тизен, HJ (апрель 1995 г.). «Тетрациклин-обратимое замалчивание эукариотических промоторов» . Молекулярно-клеточная биология . 15 (4): 1907–1914. дои : 10.1128/mcb.15.4.1907 . ПМК 230416 . ПМИД 7891684 .

[11] Родригес, AD V; Диданиол, Д.; Десплан, К. (2012). «Мощные инструменты для экспрессии генов и клонального анализа у дрозофилы» . Природные методы . 9 (1): 47–55. дои : 10.1038/nmeth.1800 . ПМЦ 3574576 . ПМИД 22205518 .

[12] Бибикова, МЮ; Кэрролл, Д.; Сигал, диджей; Траутман, Дж. К.; Смит, Дж.; Ким, Ю.Г.; Чандрасегаран, С. (январь 2001 г.). «Стимуляция гомологичной рекомбинации путем целенаправленного расщепления химерными нуклеазами» . Мол Клеточная Биол . 21 (1): 289–297. дои : 10.1128/MCB.21.1.289-297.2001 . ПМК 88802 . ПМИД 11113203 .

[13] ван Стинсел, Б.; Хеникофф, С. (апрель 2000 г.). «Идентификация in vivo ДНК-мишеней белков хроматина с использованием привязанной метилтрансферазы плотины». Нат. Биотехнология . 18 (4): 424–428. дои : 10.1038/74487 . ПМИД 10748524 . S2CID 30350384 .

[14] Финли-младший, Р.Л.-младший; и Брент Р. (1994). «Взаимодействующее спаривание выявляет бинарные и тройные взаимодействия между регуляторами клеточного цикла дрозофилы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 91 (26): 12980–12984. дои : 10.1073/pnas.91.26.12980 . ПМК 45564 . ПМИД 7809159 .

[US_Patent-15] Брент, Роджер; Пташне, Марк. «Регуляция экспрессии эукариотических генов, патент США № 4,833,080 (1989)» . Проверено 6 января 2015 г.

[16] Фридберг, Эррол (октябрь 2010 г.). Сидней Бреннер: Биография . ЦШЛ Пресс . ISBN 978-0-87969-947-5 .

[17] «Протеомика: текущее состояние и будущие направления - интервью с доктором философии Роджером Брентом» . Проверено 5 июля 2010 г.

[18] Ю, Р.; Гордон, А.; Колман-Лернер, А.; Бенджамин, КР; Пинкус, Д.; Серра, Э.; Холл, М.; Брент, Р. (2008). «Отрицательная обратная связь оптимизирует передачу информации в сотовой сигнальной системе» . Природа . 456 (7223): 755–761. дои : 10.1038/nature07513 . ПМК 2716709 . ПМИД 19079053 .

[19] Брент, Р. (2009). «Что такое сигнал и какую информацию он несет?». Письма ФЭБС . 583 (24): 4019–24. дои : 10.1016/j.febslet.2009.11.029 . ПМИД 19917282 . S2CID 15873809 .

[20] Колман-Лернер, А.; Гордон, А.; Серра, Э.; Холл, Э.; Брент, Р. (2005). «Регулируемые межклеточные вариации в системе принятия решений о судьбе клеток». Природа . 437 (7059): 699–706. Бибкод : 2005Natur.437..699C . дои : 10.1038/nature03998 . ПМИД 16170311 . S2CID 4398874 .

[21] Осубель, FM; Брент, Р.; Кингстон, RE; Мур, Д.Д.; Зейдман, Дж.Г.; Смит, Дж.А.; Струл, К. (2012). "Предисловие". Современные протоколы молекулярной биологии . Том. 98. стр. iii–v. дои : 10.1002/0471142727.mbprefs98 . ISBN 978-0-471-14272-0 . S2CID 221604713 .

[22] Грубер, М. «Составьте карту генома, взломайте геном» . Wired.com . Проверено 2 февраля 2010 г.

[23] Маршалл, Э. (1997). «Слишком радикально для НИЗ? Попробуйте DARPA». Наука . 275 (5301): 744–746. дои : 10.1126/science.275.5301.744 . ПМИД 9036531 . S2CID 5825319 .

[24] Миллер, Дж.; Броуд, У.Дж.; Энгельберг, С. (2001). Микробы: биологическое оружие и секретная война Америки . Нью-Йорк: Саймон и Шустер. ISBN 978-0-684-87159-2 .

[25] Бхаттачарджи, Ю. (2007). «Комиссия проводит экспертную оценку разведывательных исследований» . Наука . 318 (5856): 1538. doi : 10.1126/science.318.5856.1538 . ПМИД 18063763 . S2CID 41060126 .

[26] Брент, Р. (22 ноября 2006 г.). В долине смертной тени. DSpace@MIT (черновик). hdl : 1721.1/34914 .

[27] Карлсон, Р; и др. «Компоненты BIO-IO и инструменты проектирования» (PDF) . Проверено 5 августа 2010 г.

[28] Вудворд, Кристин (13 октября 2011 г.). «Центр биологического будущего для решения проблем, вызванных взрывом биологических знаний в 21 веке» . Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона . Онкологический исследовательский центр Фреда Хатчинсона . Проверено 6 января 2014 г.

[29] «Программа стипендиатов Pew в области биомедицинских наук» . Благотворительные фонды PEW . Проверено 10 октября 2011 г.

[30] «HOME::Премия старшего научного сотрудника в области старения::2000::Стволовые клетки» . Медицинский фонд Эллисона . Медицинский фонд Эллисона . Проверено 8 августа 2011 г.

[31] «ПРЕДШЕДШИЕ ПОБЕДИТЕЛИ 2003 г.» за разработку двугибридных дрожжевых ловушек и ловушек для взаимодействия спаривания дрожжей » . Розенстильский исследовательский центр фундаментальных медицинских наук . Научно-исследовательский центр фундаментальных медицинских наук Университета Брандейса Розенстиль . Проверено 13 июня 2012 г.

[32] Сосвилл, Э.А. (2011). «Награды, назначения, объявления» . J Национальный онкологический институт . 103 (4): 295. doi : 10.1093/jnci/djr038 .

[33] «Патентный поиск на USPTO.gov» . Проверено 20 декабря 2022 г.

[34] Значок, Питер (2008). Нобелевские лица . Джон Уайли и сыновья . п. 180. ИСБН 978-3-527-40678-4 . Проверено 2 декабря 2015 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]

[30]

[31]

[32]

[33]

[34]