Грибы парабурхолдерии
Грибы парабурхолдерии | |
---|---|
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Псевдомонадота |
Сорт: | Бетапротеобактерии |
Заказ: | Буркхолдериалес |
Семья: | Буркхолдериевые |
Род: | Парабуркхолдерия |
Разновидность: | П. грибы |
Биномиальное имя | |
Грибы парабурхолдерии (Coenye et al. 2001) Sawana et al . 2015 год [1] | |
Синонимы | |
|
Грибы парабурхолдерии (P. fungi) — грамотрицательный вид бактерий . [2] который широко использовался в качестве полезного микроорганизма в сельском хозяйстве в качестве агента биоконтроля и биоремедиации. Paraburkholderia fungorum . Некоторые из его штаммов могут использовать уран для своего роста и превращать U(VI) в U(IV). [3]
Методология
Геном панголина P. fungorum (pangolin Pf) имеет размер генома примерно 7,7 Мбит/с с N50 69 666 бит/с. Было показано, что панголин Pf является Paraburkholderia fungorum. Данные филогенетического анализа на основе SNP основного генома и анализа ANI, подкрепленного функциональным анализом, показали, что наличие значительно большого количества генов, связанных с реакцией на стресс, вирулентностью, болезнями, и защита. В геноме панголина Pf идентифицированы различные типы систем секреции, которые являются высокоспециализированными и отвечают за реакцию бактерии на окружающую среду и за физиологические процессы, такие как выживание, адгезия и адаптация.
Панголин Pf также имел некоторые общие гены вирулентности с известным патогенным представителем Burkholderiales. Эти гены играют важную роль в адгезии, подвижности и инвазии. Добавление этой последовательности генома также важно для будущего сравнительного анализа и функциональной работы P. fungorum. [1]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Савана А., Адеолу М., Гупта Р.С. (2014). «Молекулярные признаки и филогеномный анализ рода Burkholderia : Предложение о разделении этого рода на исправленный род Burkholderia , содержащий патогенные организмы, и новый род Paraburkholderia gen. nov., содержащий виды из окружающей среды» . Передний. Жене . 5 : 429. дои : 10.3389/fgene.2014.00429 . ПМК 4271702 . ПМИД 25566316 .
- ^ Буркольдерия Дж. П. Эзеби: Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре
- ^ Корибаникс, Нью-Мексико; Туорто, С.Дж.; Лопес-Кьяффарелли, Н.; МакГиннесс, ЛР; Хэггблом, ММ; Уильямс, К.Х.; Лонг, ЧП; Керкхоф, ЖЖ (2015). «Пространственное распределение уран-дышащей бетапротеобактерии на полигоне полевых исследований в Винтовке, штат Колорадо» . ПЛОС ОДИН . 10 (4): e0123378. Бибкод : 2015PLoSO..1023378K . дои : 10.1371/journal.pone.0123378 . ПМЦ 4395306 . ПМИД 25874721 .