эксперимент HNCOCA
HNCOCA — это трехмерный эксперимент с тройным резонансом ЯМР- , обычно используемый в области ЯМР белков . Название происходит от пути переноса намагниченности в эксперименте: намагниченность амидного протона аминокислотного остатка передается амидному азоту, а затем альфа-углероду предыдущего остатка в аминокислотной последовательности белка. Напротив, дополнительный эксперимент HNCA передает намагниченность альфа-углеродам как начального остатка, так и предыдущего остатка в последовательности. Эксперимент HNCOCA используется, часто в тандеме с HNCA, для сопоставления сигналов резонанса альфа-углерода с определенными остатками в белке. Для этого эксперимента требуется очищенный образец белка, приготовленный с помощью 13 С и 15 N Мечение изотопом в концентрации более 0,1 мМ обычно применяется только к рекомбинантным белкам .
Спектр, полученный в этом эксперименте, имеет три измерения: ось протона, 15 Ось N и 13 Ось С. Для остатка i пики появятся только при {H N (i), N(i), C α (i-1)}, тогда как для дополнительного эксперимента HNCA пики появляются при {H N (i), N (i), C α (i-1)} и {H N (i), N(i), C α (i)}. Вместе эти два эксперимента выявляют химический сдвиг альфа-углерода для каждого аминокислотного остатка в белке и предоставляют информацию, связывающую соседние остатки в последовательности белка.
Ссылки
[ редактировать ]Цитаты
[ редактировать ]Бакс А., Икура М. (май 1991 г.). «Эффективный метод 3D-ЯМР для корреляции резонансов протонов и амидов основной цепи 15N с альфа-углеродом предыдущего остатка в белках, равномерно обогащенных 15N/13C». Дж. Биомол. ЯМР . 1 (1): 99–104. дои : 10.1007/BF01874573 . ПМИД 1668719 .
Общие ссылки
[ редактировать ]Джон Кавана; Уэйн Дж. Фэйрбразер; Артур Дж. Палмер III; Николас Дж. Скелтон (1995). ЯМР-спектроскопия белков: принципы и практика . Академическая пресса .
 | Эта биофизике статья по незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |