Связывание промотора сквамоза

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

SBP
SBP
	Структура раствора ДНК-связывающего домена сквамозы, связывающего промотор-промотор-подобный 4, 4
Идентификаторы
Символ	SBP
Pfam	PF03110
InterPro	IPR004333
PROSITE	PDOC00798
Краткое содержание	2lao / scope / supfam
TCDB	3.A.1
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Семейство, связывающее промотор-промотор, как белкоподобное, SBP или SPL факторов ( транскрипционных семейство ) . Основатель семьи был идентифицирован на основе специфического связывания in vitro с промотором гена Snapdragon Squamosa. ^{[ 1 ]} Считается, что белки SBP являются активаторами транскрипции.

Функция

Белки SPB играют роль в развитии листьев, изменении вегетативной фазы , развитии цветов и фруктах, архитектуре растений, спорогенезе, передаче сигналов гиббеловой кислоты и реакции токсина. ^{[ 2 ]}

Структура

Домен содержит 10 консервативных цистеина и гистидина остатков , которые, вероятно, являются цинковыми лигандами . Домен SBP является высококонсервативным ДНК-связывающим доменом. около 80 аминокислот Длиной цинкового пальца и содержит мотив С двумя цинковыми сайтами: Cys-Cys-His-Cys и Cys-Cys-his. Он имеет трехцепочечный антипараллельный бета-лист . ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Klein J, Saedler H, Huijser P (январь 1996 г.). «Новое семейство белков, связывающих ДНК, включает предполагаемые транскрипционные регуляторы антирриновой гены цветочной идентичности цветочной меристмы MAJUS MAJUS». Мол Генерал Генет . 250 (1): 7–16. doi : 10.1007/bf02191820 . PMID 8569690 . S2CID 20915344 .
^ Chen X, Zhang Z, Liu D, Zhang K, Li A, Mao L (2010). «Сквамоза, связывающий промотор, белкоподобные факторы транскрипции: звездные игроки для роста и развития растений». Журнал интегративной биологии растений . 52 (11): 946–51. doi : 10.1111/j.1744-7909.2010.00987.x . PMID 20977652 .
^ Yamasaki K, Kigawa T, Inoue M, Tateno M, Yamasaki T, Yabuki T, et al. (2004). «Новый цинк-связывающий мотив, выявленный структурами растворов ДНК-связывающих доменов Arabidopsis Family Family Factors». J Mol Biol . 337 (1): 49–63. doi : 10.1016/j.jmb.2004.01.015 . PMID 15001351 .

Внешние ссылки

Семейство SBP в Plaintfdb: база данных факторов транскрипции растений

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR004333

Эта молекулярной биологии статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid8569690-1] Klein J, Saedler H, Huijser P (январь 1996 г.). «Новое семейство белков, связывающих ДНК, включает предполагаемые транскрипционные регуляторы антирриновой гены цветочной идентичности цветочной меристмы MAJUS MAJUS». Мол Генерал Генет . 250 (1): 7–16. doi : 10.1007/bf02191820 . PMID 8569690 . S2CID 20915344 .

[pmid20977652-2] Chen X, Zhang Z, Liu D, Zhang K, Li A, Mao L (2010). «Сквамоза, связывающий промотор, белкоподобные факторы транскрипции: звездные игроки для роста и развития растений». Журнал интегративной биологии растений . 52 (11): 946–51. doi : 10.1111/j.1744-7909.2010.00987.x . PMID 20977652 .

[pmid15001351-3] Yamasaki K, Kigawa T, Inoue M, Tateno M, Yamasaki T, Yabuki T, et al. (2004). «Новый цинк-связывающий мотив, выявленный структурами растворов ДНК-связывающих доменов Arabidopsis Family Family Factors». J Mol Biol . 337 (1): 49–63. doi : 10.1016/j.jmb.2004.01.015 . PMID 15001351 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]