Матиас Хейнеманн
Матиас Хейнеманн | |
---|---|
![]() | |
Рожденный | 1 июля 1972 года |
Альма -матер | RWTH AACHEN Университет (PhD) |
Награды | Награда Dupont Young Professor Award (2011) [ 1 ]
Award Vidi (2011) [ 2 ] Университет Кента - награда за науку и бизнес (2018) [ 3 ] Премия VICI (2020) [ 4 ] |
Научная карьера | |
Учреждения | Университет Гронингена
Эт Цюрих RWTH AACHEN Университет |
Тезис | Экспериментальный анализ, моделирование и динамическое моделирование термодинамических и кинетических явлений в гель-стабилизированных ферментативных носителях. [ 5 ] (2003) |
Веб -сайт | https://heinemannlab.eu/ https://www.rug.nl/research/molecular-systems-biology/ https://twitter.com/HeinemannLab |
Матиас Хейнеманн (родился 1 июля 1972 года) - профессор биологии молекулярных систем в Университете Гронингена . Heinemann руководит междисциплинарной лабораторией из приблизительно 12 аспирантов и постдокторских ученых. [ 6 ] До 2019 года он занимал должность председателя Института биомолекулярных наук и биотехнологий Гронингена, [ 7 ] [ 8 ] был членом правления голландского центра Origins [ 9 ] и координатор проекта EU ITN Metarna. [ 10 ] Хейнеманн является членом 1000 факультета. [ 11 ]
Образование
[ редактировать ]Хейнеманн получил степень (Dipl.-Ign.) В области экологической инженерии в Университете Штутгарта . В 2003 году он получил докторскую степень в биохимической инженерии ( Summa Cum Laude ) из Университета Rwth Aachen , после чего он присоединился к лаборатории биопроцессов Eth Zurich в качестве постдока. В 2006 году он присоединился к институту биологии молекулярных систем [ 12 ] Эт Цюрих как лидер группы в исследовательской подразделении Уве Сауэр. В 2010 году он переехал в Университет Гронингена в качестве доцента, где он получил повышение до полного профессора в 2013 году.
Исследовать
[ редактировать ]Исследовательская область Хейнеманна - это система биологии микробного метаболизма . Вместе со своими членами лаборатории он внес следующий основной вклад в фундаментальное понимание метаболизма :
- обнаружил, что клетки могут измерять внутриклеточный поток - скорость метаболической активности - и использовать эту информацию для регулирования других метаболических потоков, [ 13 ] [ 14 ]
- продемонстрировал, что состояние внутриклеточного потока развивается как компромисс между двумя принципами-оптимальность в данном состоянии окружающей среды и минимальная корректировка к альтернативным условиям, [ 15 ]
- показал, что чувствительность к потоку может привести к бистатичности в метаболизме [ 16 ] и к антибиотическим устойчивым персисттерам , [ 17 ] а также это имеет отношение к старению в дрожжах , [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]
- обнаружил, что метаболизм дрожжей является автономным генератором, [ 21 ] [ 22 ] вместе с механизмом клеточного цикла, действующей в системе связанных генераторов, [ 23 ] [ 24 ] С метаболической динамикой связана с тем, что биосинтетические процессы частично сегрегируются во время клеточного цикла, [ 25 ]
- обнаружил, что верхний предел в скорости рассеяния энергии Гиббса регулирует клеточный метаболизм . [ 26 ]
Его лаборатория разработала новые технологии и ресурсы для метаболических исследований на уровне отдельных клеток и протеомики :
- разработал первый метод для одноклеточной метаболомики [ 27 ] [ 14 ] с Renato Zenobi ( Eth Zurich ) и для одноклеточного динамического измерения NAD (P) H, [ 21 ]
- спроектировал первое микрофлюидное устройство для микроскопического мониторинга дрожжевых клеток, которое позволяло наблюдать дрожжи на протяжении всей жизни, [ 28 ] [ 29 ]
- разработанные молекулярные датчики для измерения гликолитического потока в отдельных дрожжевых клетках, [ 30 ] [ 31 ]
- Сгенерировал эталонный набор данных протеомики для E. coli путем количественной оценки уровней экспрессированных белков в широком диапазоне условий роста. [ 32 ] [ 33 ]
В целом, Heinemann написал или соавторил около 90 рецензируемых научных статей. [ 34 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ "Dupont" . Архивировано из оригинала 15 октября 2012 года.
- ^ "Vidi" .
- ^ «Университет Кента - награда за науку и бизнес (2018)» .
- ^ "Вици" .
- ^ «Тезис» .
- ^ «Члены группы | Биология молекулярных систем | GBB | Исследования | Университет Гронингена» . www.rug.nl. 8 июля 2011 года . Получено 2018-10-05 .
- ^ «Команда управления | Организация | GBB | Исследование | Университет Гронингена» . www.rug.nl. 15 февраля 2016 года . Получено 2018-10-05 .
- ^ «Гронингенский институт биомолекулярных наук и биотехнологий (GBB) | Исследования | Университет Гронингена» . www.rug.nl. 3 октября 2012 года . Получено 2018-11-01 .
- ^ «Люди - центр происхождения» . www.origins-center.nl . Получено 2018-10-05 .
- ^ «Технологии на основе РНК для анализа одноклеточных метаболитов | Проекты | H2020 | Cordis | Европейская комиссия» . Cordis | Европейская комиссия . Получено 2018-10-07 .
- ^ «Матиас Хейнеманн - F1000Prime» . f1000.com . Получено 2018-11-01 .
- ^ «Институт биологии молекулярных систем» . www.imsb.ethz.ch. Получено 2018-11-01 .
- ^ Котте, Оливер; Заугг, Джудит Б.; Heinemann, Matthias (2010-01-01). «Бактериальная адаптация посредством распределенного восприятия метаболических потоков» . Биология молекулярных систем . 6 (1): 355. doi : 10.1038/msb.2010.10 . ISSN 1744-4292 . PMC 2858440 . PMID 20212527 .
- ^ Jump up to: а беременный Кочановский, Карл; Волкмер, Бенджамин; Героза, Лука; Rijsewijk, Bart R. Haverkorn Van; Шмидт, Александр; Heinemann, Matthias (2013-01-15). «Функция датчика метаболического потока в Escherichia coli» . Труды Национальной академии наук . 110 (3): 1130–1135. doi : 10.1073/pnas.1202582110 . ISSN 0027-8424 . PMC 3549114 . PMID 23277571 .
- ^ Шуц, Роберт; Замбони, Никола; Zampieri, Mattia; Хейнеманн, Матиас; Sauer, UWE (2012-05-04). «Многомерная оптимальность микробного метаболизма». Наука . 336 (6081): 601–604. doi : 10.1126/science.1216882 . ISSN 0036-8075 . PMID 22556256 . S2CID 16674761 .
- ^ Котте, Оливер; Волкмер, Бенджамин; Radzikowski, Jakub L.; Heinemann, Matthias (2014-07-01). «Фенотипическая бистатичность в центральном метаболизме углерода Escherichia coli» . Биология молекулярных систем . 10 (7): 736. doi : 10.15252/msb.20135022 . ISSN 1744-4292 . PMC 4299493 . PMID 24987115 .
- ^ Радзиковски, Джакуб Лесзек; Веделаар, Силке; Зигель, Дэвид; Ортега, Альваро Дарио; Шмидт, Александр; Heinemann, Matthias (2016-09-01). «Бактериальная стойкость является активной реакцией на стресс σs на ограничение метаболического потока» . Биология молекулярных систем . 12 (9): 882. doi : 10.15252/msb.20166998 . ISSN 1744-4292 . PMC 5043093 . PMID 27655400 .
- ^ Janssens, Жорж E; Meinema, Anne C; Гонсалес, Хавьер; Wolters, Justina C; Шмидт, Александр; Гурив, Виктор; Бишофф, Рейнер; Остроумие, Эрнст С; Veenhoff, Liesbeth M (2015-12-01). «Механизм биогенеза белка является движущей силой репликативного старения у дрожжей» . элиф . 4 : E08527. doi : 10.7554/elife.08527 . ISSN 2050-084X . PMC 4718733 . PMID 26422514 .
- ^ «Новая техника раскрывает причины старения в дрожжах» . Эврикалерт! Полем Получено 2018-10-07 .
- ^ Лейпольд, Симеон; Хабманн, Георг; Литсиос, Афанасиос; Meinema, Anne C.; Такхавеев, Вакиль; Папагианнакис, Александрос; Нибель, Бастиан; Янссенс, Жорж; Зигель, Дэвид; Heinemann, Matthias (2019-04-09). «Saccharomyces cerevisiae проходит через различные метаболические фазы во время его репликативной жизни» . элиф . 8 doi : 10.7554/elife.41046 . ISSN 2050-084X . PMC 6467564 . PMID 30963997 .
- ^ Jump up to: а беременный Папагианнакис, Александрос; Нибель, Бастиан; Остроумие, Эрнст С.; Heinemann, Matthias (2017-01-19). «Автономные метаболические колебания надежно прирастают ранний и поздний клеточный цикл» . Молекулярная клетка . 65 (2): 285–295. doi : 10.1016/j.molcel.2016.11.018 . ISSN 1097-4164 . PMID 27989441 .
- ^ «Новая исследовательская работа бросает вызов догме контроля клеточного цикла» . Эврикалерт! Полем Получено 2018-10-07 .
- ^ Озсезен, Сердар; Папагианнакис, Александрос; Чен, Хаоки; Нибель, Бастиан; Милиас-Аргиейт, Андреас; Heinemann, Matthias (2019-10-04). «Вывод высокоуровневой топологии взаимодействия между метаболическими и клеточными генераторами из одноклеточной динамики» . Клеточные системы . 9 (4): 354–365.e6. doi : 10.1016/j.cels.2019.09.003 . ISSN 2405-4720 . PMID 31606371 .
- ^ Литсиос, послы; Хубертс, Дафни Хью; Терпстра, кража М.; Герра, Паоло; Шмидт, Александр; Букзак, Катаржина; Папагиннакис, Александрос; Роветта, Матта; Хекилар, Йохан; Хабманн, Георг; Exterkate, Marten (ноябрь 2019). «Дифференциальная sccaling между производством белка G1 и динамикой размера клеток способствует приверженности циклу деления клеток у почкующихся дрожжей » Природная клеточная биология 21 (11): 1382–1 Doi : 10.1038/ s41556-019-0413-3 ISSN 1476-4 31685990PMID 207891139S2CID
- ^ Такхавеев, Вакиль; Озсезен, Сердар; Смит, Эдвард Н.; Зилстра, Андре; Chaillet, Marten L.; Чен, Хаоки; Папагианнакис, Александрос; Милиас-Аргиейт, Андреас; Хейнеманн, Матиас (февраль 2023 г.). «Временная сегрегация биосинтетических процессов отвечает за метаболические колебания во время подаящего клеточного цикла дрожжей» . Природа метаболизм . 5 (2): 294–313. doi : 10.1038/s42255-023-00741-x . HDL : 20.500.11850/601600 . ISSN 2522-5812 .
- ^ Хейнеманн, Матиас; Лейпольд, Симеон; Нибель, Бастиан (январь 2019 г.). «Верхний предел рассеяния энергии Гиббса управляет клеточным метаболизмом» (PDF) . Природа метаболизм . 1 (1): 125–132. doi : 10.1038/s42255-018-0006-7 . ISSN 2522-5812 . PMID 32694810 . S2CID 104433703 .
- ^ Амантонико, Андреа; О, Джу Ен; Собек, Йенс; Хейнеманн, Матиас; Zenobi, Renato (2008-07-07). «Масс -спектрометрический метод для анализа метаболитов в дрожжах с чувствительностью к одноклетам» . Angewandte Chemie International Edition . 47 (29): 5382–5385. doi : 10.1002/anie.200705923 . ISSN 1433-7851 . PMID 18543269 .
- ^ Ли, Сун Сик; Визкарра, Има Авалос; Хубертс, Дафни Хью; Ли, Люк П .; Heinemann, Matthias (2012-03-27). «Микроскопическое наблюдение за продолжительностью продолжительности продолжительности продолжительности продолжительности жизни послушного старения дрожжей через микрофлюидную платформу рассечения» . Труды Национальной академии наук . 109 (13): 4916–4920. doi : 10.1073/pnas.1113505109 . ISSN 0027-8424 . PMC 3324001 . PMID 22421136 .
- ^ Хубертс, Дафни Хью; Sik Lee, Sell; Гонсалес, Хавьер; Janssens, Жорж E; Визкарра, Има Авалос; Heinemann, Matthias (2013-05-02). «Строительство и использование микрофлюидной платформы рассечения для долгосрочной визуализации клеточных процессов у почкующихся дрожжей» (PDF) . Природные протоколы . 8 (6): 1019–1027. doi : 10.1038/nprot.2013.060 . ISSN 1754-2189 . PMID 23640166 . S2CID 11836636 .
- ^ Монтейро, Франциска; Хабманн, Георг; Такхавеев, Вакиль; ВЕДЕЛААР, SILKE R; Нордер, Джастин; Хекелаар, Йохан; Салдида, Джоана; Литсиос, Афанасиос; Wijma, Hein J; Шмидт, Александр; Хейнеманн, Матиас (декабрь 2019 г.). «Измерение гликолитического потока в отдельных дрожжевых клетках с ортогональным синтетическим биосенсором» . Биология молекулярных систем . 15 (12): E9071. doi : 10.15252/msb.20199071 . ISSN 1744-4292 . PMC 6920703 . PMID 31885198 .
- ^ Ортега, Альваро Дарио; Такхавеев, Вакиль; Веделар, Силке Роли; Лонг, И; Mestre-faràs, Neus; ИНКАРНАТО, Дэнни; Эрсой, Франзиска; Олсен, Ларс Фолке; Майер, Гюнтер; Хейнеманн, Мэтью (ноябрь 2021 г.). «Синтетический биосенсор на основе РНК для фруктозы-1,6-бисфосфата, который сообщает о гликолитическом потоке » Клеточная химическая биология 28 (11): 1554–1568.e8 Doi : 10.1016/ j.chemb.2021.04.0
- ^ Шмидт, Александр; Кохановский, Карл; Веделаар, Силке; Арне, Эрик; Волкмер, Бенджамин; Каллипо, Лучано; Knoops, Kèvin; Бауэр, Мануэль; Aebersold, Ruedi; Heinemann, Matthias (2015-12-07). «Количественный и неразличиваемый состояние протеома Escherichia coli» . Nature Biotechnology . 34 (1): 104–110. Doi : 10.1038/nbt . ISSN 1087-0156 . PMC 4888949 . PMID 26641532 .
- ^ «Новый массивный набор данных бактериальных белков» . Эврикалерт! Полем Получено 2018-10-07 .
- ^ «Матиас Хейнеманн - цитаты Google Scholar» . Scholar.google.com . Получено 2018-10-07 .