Филосимбиоз

В области исследований микробиома считается , что группа видов демонстрирует филосимбиотический сигнал, если степень сходства между микробиомами видов в значительной степени повторяет их эволюционную историю . ^[1]Другими словами, филосимбиотический сигнал среди группы видов очевиден, если может оказаться, что их дендрограмма сходства микробиома имеет значительное сходство с филогенетическим деревом хозяина. Чтобы анализ филосимбиотического сигнала был надежным, необходимо учитывать различия в окружающей среде.которые могут формировать микробиом хозяина, должны быть либо устранены, либо учтены.Одним из правдоподобных механистических объяснений таких явлений может быть, например, результат иммунных генов хозяина, которые быстро развиваются в непрерывной гонке вооружений с членами его микробиома.

У животных

В животном мире существует множество ярких примеров филосимбиоза. Например, у приматов, не являющихся людьми, было обнаружено, что эволюционная история хозяина оказала значительно большее влияние на микробиом кишечника , чем пищевая ниша хозяина или географическое местоположение. ^[2] Было высказано предположение, что основной причиной были изменения в физиологии кишечника в ходе эволюционной истории приматов. Это открытие было особенно интересным, поскольку оно противоречило предыдущим исследованиям, в которых сообщалось, что пищевая ниша является сильным фактором, определяющим микробиом кишечника млекопитающих. ^[3]^[4]^[5]

Растения

Филосимбиоз зарегистрирован у нескольких групп растений, включая Malus. ^[6] и Poaceae . ^[7] В первом случае виды Malus, включая дикие и одомашненные сорта, содержали эндофитные сообщества, соответствующие их филогенетическому родству. ^[6]

См. также

Ссылки

^ В. Брукс, Эндрю (18 ноября 2016 г.). «Филосимбиоз: взаимоотношения и функциональные эффекты микробных сообществ в истории эволюции хозяина» . ПЛОС Биология . 14 (11): e2000225. doi : 10.1371/journal.pbio.2000225.g004 . ПМЦ 5115861 . ПМИД 27861590 .
^ Кэтрин Р. Амато; Джон Дж. Сандерс; Се Джин Сон; и др. (11 июля 2018 г.). «Эволюционные тенденции в физиологии хозяина перевешивают диетическую нишу в структурировании микробиома кишечника приматов» . Журнал ISME . 13 (3): 576–587. дои : 10.1038/S41396-018-0175-0 . ISSN 1751-7362 . ПМК 6461848 . ПМИД 29995839 . Викиданные Q57735585 .
^ Фредерик Дельсюк; Джессика Л. Меткалф; Лаура Вегенер Парфри ; Се Джин Сон; Антонио Гонсалес; Роб Найт (7 октября 2013 г.). «Конвергенция кишечных микробиомов млекопитающих-мирмекофагов». Молекулярная экология . 23 (6): 1301–1317. дои : 10.1111/MEC.12501 . ISSN 0962-1083 . ПМИД 24118574 . Викиданные Q35015637 .
^ Гордон, Джеффри И.; Найт, Роб; Шренцель, Марк Д.; Такер, Тэмми А.; Шлегель, Майкл Л.; Бирчер, Дж. Стивен; Рэми, Роб Рой; Тернбо, Питер Дж.; Лозупоне, Кэтрин (20 июня 2008 г.). «Эволюция млекопитающих и их кишечных микробов» . Наука . 320 (5883): 1647–1651. Бибкод : 2008Sci...320.1647L . дои : 10.1126/science.1155725 . ISSN 1095-9203 . ПМК 2649005 . ПМИД 18497261 .
^ Гордон, Джеффри И.; Найт, Роб; Анрисса, Бернар; Фонтана, Луиджи; Гонсалес, Антонио; Клементе, Хосе К.; Найтс, Дэн; Кучински, Джастин; Мюгге, Брайан Д. (20 мая 2011 г.). «Диета способствует сближению функций кишечного микробиома в филогении млекопитающих и у человека» . Наука . 332 (6032): 970–974. Бибкод : 2011Sci...332..970M . дои : 10.1126/science.1198719 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 3303602 . ПМИД 21596990 .
^ Jump up to: ^а ^б Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Вассерман, Биргит; Лю, Цзя; Берг, Габриэле; Норелли, Джон; Дроби, Самир; Вишневский, Майкл (2021). «Доказательства коэволюции хозяина и микробиома яблока» . Новый фитолог . 234 (6): 2088–2100. дои : 10.1111/nph.17820 . ISSN 1469-8137 . ПМЦ 9299473 . ПМИД 34823272 . S2CID 244661193 .
^ Буффо, Мари-Лара; Пуарье, Мари-Андре; Мюллер, Дэниел; Мённ-Локкоз, Иван (2014). «Корневой микробиом связан с эволюцией растений-хозяев кукурузы и других злаков» . Экологическая микробиология . 16 (9): 2804–2814. дои : 10.1111/1462-2920.12442 . ISSN 1462-2920 . ПМИД 24588973 .

Эта микробиологии, статья, посвященная незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] В. Брукс, Эндрю (18 ноября 2016 г.). «Филосимбиоз: взаимоотношения и функциональные эффекты микробных сообществ в истории эволюции хозяина» . ПЛОС Биология . 14 (11): e2000225. doi : 10.1371/journal.pbio.2000225.g004 . ПМЦ 5115861 . ПМИД 27861590 .

[2] Кэтрин Р. Амато; Джон Дж. Сандерс; Се Джин Сон; и др. (11 июля 2018 г.). «Эволюционные тенденции в физиологии хозяина перевешивают диетическую нишу в структурировании микробиома кишечника приматов» . Журнал ISME . 13 (3): 576–587. дои : 10.1038/S41396-018-0175-0 . ISSN 1751-7362 . ПМК 6461848 . ПМИД 29995839 . Викиданные Q57735585 .

[3] Фредерик Дельсюк; Джессика Л. Меткалф; Лаура Вегенер Парфри ; Се Джин Сон; Антонио Гонсалес; Роб Найт (7 октября 2013 г.). «Конвергенция кишечных микробиомов млекопитающих-мирмекофагов». Молекулярная экология . 23 (6): 1301–1317. дои : 10.1111/MEC.12501 . ISSN 0962-1083 . ПМИД 24118574 . Викиданные Q35015637 .

[4] Гордон, Джеффри И.; Найт, Роб; Шренцель, Марк Д.; Такер, Тэмми А.; Шлегель, Майкл Л.; Бирчер, Дж. Стивен; Рэми, Роб Рой; Тернбо, Питер Дж.; Лозупоне, Кэтрин (20 июня 2008 г.). «Эволюция млекопитающих и их кишечных микробов» . Наука . 320 (5883): 1647–1651. Бибкод : 2008Sci...320.1647L . дои : 10.1126/science.1155725 . ISSN 1095-9203 . ПМК 2649005 . ПМИД 18497261 .

[5] Гордон, Джеффри И.; Найт, Роб; Анрисса, Бернар; Фонтана, Луиджи; Гонсалес, Антонио; Клементе, Хосе К.; Найтс, Дэн; Кучински, Джастин; Мюгге, Брайан Д. (20 мая 2011 г.). «Диета способствует сближению функций кишечного микробиома в филогении млекопитающих и у человека» . Наука . 332 (6032): 970–974. Бибкод : 2011Sci...332..970M . дои : 10.1126/science.1198719 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 3303602 . ПМИД 21596990 .

[:0-6] Jump up to: ^а ^б Абдельфаттах, Ахмед; Тэк, Эйко Дж. М.; Вассерман, Биргит; Лю, Цзя; Берг, Габриэле; Норелли, Джон; Дроби, Самир; Вишневский, Майкл (2021). «Доказательства коэволюции хозяина и микробиома яблока» . Новый фитолог . 234 (6): 2088–2100. дои : 10.1111/nph.17820 . ISSN 1469-8137 . ПМЦ 9299473 . ПМИД 34823272 . S2CID 244661193 .

[7] Буффо, Мари-Лара; Пуарье, Мари-Андре; Мюллер, Дэниел; Мённ-Локкоз, Иван (2014). «Корневой микробиом связан с эволюцией растений-хозяев кукурузы и других злаков» . Экологическая микробиология . 16 (9): 2804–2814. дои : 10.1111/1462-2920.12442 . ISSN 1462-2920 . ПМИД 24588973 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]