Будапештский эталонный коннектом

Будапештский эталонный коннектом
Разработчик(и)	Балаж Салкай, Чаба Керепеши, Балинт Варга, Винс Гролмуш
Стабильная версия	3.0
Написано в	Перл , JavaScript , WebGL
Доступно в	Английский
Тип	Коннектомика
Веб-сайт	пит-группа .org /коннектом /

Сервер Будапештского эталонного коннектома вычисляет часто встречающиеся анатомические связи мозга 418 здоровых людей. ^[1]^[2] Он был подготовлен на основе диффузных наборов данных МРТ проекта Human Connectome в эталонный коннектом (или граф мозга ), который можно загрузить в форматах CSV и GraphML и визуализировать на сайте в 3D.

Функции

Будапештский эталонный коннектом имеет 1015 узлов, соответствующих анатомически идентифицированным областям серого вещества. Пользователь может установить множество параметров, и полученный консенсусный коннектом легко визуализируется на веб-странице. ^[2] Пользователи могут масштабировать, вращать и запрашивать анатомические метки узлов графического компонента.

Фон

Будапештский эталонный коннектом представляет собой согласованный граф графов мозга 96 субъектов в версии 2 и 418 субъектов в версии 3. Возвращаются только те ребра, которые присутствуют у заданного процента субъектов. Каждое из выбранных ребер имеет определенный вес в каждом из графов, содержащих это ребро, поэтому эти множественные веса объединяются в один вес, беря либо их среднее значение (т. е. среднее значение), либо медиану. Пользовательский интерфейс позволяет настраивать эти параметры: пользователь может выбрать минимальную частоту возвращаемых фронтов. Существует возможность просмотра и сравнения эталонных женских и мужских коннектомов. Коннектомы женщин содержат значительно больше ребер, чем у мужчин, и большая часть ребер в коннектомах женщин проходит между двумя полушариями. ^[3]^[4]^[5]

Открытия

Будапештский эталонный коннектом привел исследователей к открытию консенсусной динамики коннектома графиков человеческого мозга . Ребра, появляющиеся на всех графах мозга, образуют связный подграф вокруг ствола мозга . Благодаря постепенному уменьшению частоты ребер этот основной подграф непрерывно растет, как куст . Динамика роста может отражать индивидуальное развитие мозга и давать возможность направлять некоторые края консенсусного графика мозга человека. ^[6]

Ссылки

^ Салкай, Балаж; и др. (2015). «Будапештский эталонный сервер Connectome v2.0». Письма по неврологии . 595 : 60–2. arXiv : 1412.3151 . дои : 10.1016/j.neulet.2015.03.071 . ПМИД 25862487 . S2CID 6563189 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Салкай, Балаж; Керепеси, Чаба; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Параметрируемые консенсусные коннектомы из проекта Human Connectome: Будапештский эталонный сервер коннектома v3.0» . Когнитивная нейродинамика . 11 (1): 113–116. arXiv : 1602.04776 . дои : 10.1007/s11571-016-9407-z . ПМК 5264751 . ПМИД 28174617 .
^ Ингалхаликар, М.; Смит, А.; Паркер, Д.; Саттертуэйт, Т.Д.; Эллиотт, Массачусетс; Рупарель, К.; Хаконарсон, Х.; Гур, РЭ; Гур, РЦ; Верма, Р. (2013). «Половые различия в структурном коннектоме человеческого мозга» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 823–828. Бибкод : 2014PNAS..111..823I . дои : 10.1073/pnas.1316909110 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 3896179 . ПМИД 24297904 .
^ Салкай, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2015). «Теоретический анализ графов показывает: женский мозг лучше связан, чем мужской» . ПЛОС ОДИН . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Бибкод : 2015PLoSO..1030045S . дои : 10.1371/journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4488527 . ПМИД 26132764 .
^ Салкай, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Теоретико-графовые параметры, компенсированные смещением размера мозга, также лучше в женских структурных коннектомах». Мозговые изображения и поведение . 12 (3): 663–673. дои : 10.1007/s11682-017-9720-0 . ПМИД 28447246 . S2CID 4028467 .
^ Керепеси, Чаба; и др. (2016). «Как направлять края коннектомов: динамика консенсусных коннектомов и развитие связей в мозгу человека» . ПЛОС ОДИН . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Бибкод : 2016PLoSO..1158680K . дои : 10.1371/journal.pone.0158680 . ПМЦ 4928947 . ПМИД 27362431 .

[connectome-1] Салкай, Балаж; и др. (2015). «Будапештский эталонный сервер Connectome v2.0». Письма по неврологии . 595 : 60–2. arXiv : 1412.3151 . дои : 10.1016/j.neulet.2015.03.071 . ПМИД 25862487 . S2CID 6563189 .

[bpconn3-2] Перейти обратно: ^а ^б Салкай, Балаж; Керепеси, Чаба; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Параметрируемые консенсусные коннектомы из проекта Human Connectome: Будапештский эталонный сервер коннектома v3.0» . Когнитивная нейродинамика . 11 (1): 113–116. arXiv : 1602.04776 . дои : 10.1007/s11571-016-9407-z . ПМК 5264751 . ПМИД 28174617 .

[IngalhalikarSmith2013-3] Ингалхаликар, М.; Смит, А.; Паркер, Д.; Саттертуэйт, Т.Д.; Эллиотт, Массачусетс; Рупарель, К.; Хаконарсон, Х.; Гур, РЭ; Гур, РЦ; Верма, Р. (2013). «Половые различия в структурном коннектоме человеческого мозга» . Труды Национальной академии наук . 111 (2): 823–828. Бибкод : 2014PNAS..111..823I . дои : 10.1073/pnas.1316909110 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 3896179 . ПМИД 24297904 .

[Szalkai2015-4] Салкай, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2015). «Теоретический анализ графов показывает: женский мозг лучше связан, чем мужской» . ПЛОС ОДИН . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Бибкод : 2015PLoSO..1030045S . дои : 10.1371/journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4488527 . ПМИД 26132764 .

[Szalkai2017-5] Салкай, Балаж; Варга, Балинт; Гролмуш, Винс (2017). «Теоретико-графовые параметры, компенсированные смещением размера мозга, также лучше в женских структурных коннектомах». Мозговые изображения и поведение . 12 (3): 663–673. дои : 10.1007/s11682-017-9720-0 . ПМИД 28447246 . S2CID 4028467 .

[Kerepesi2016-6] Керепеси, Чаба; и др. (2016). «Как направлять края коннектомов: динамика консенсусных коннектомов и развитие связей в мозгу человека» . ПЛОС ОДИН . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Бибкод : 2016PLoSO..1158680K . дои : 10.1371/journal.pone.0158680 . ПМЦ 4928947 . ПМИД 27362431 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]