Топономика

Топономика — это дисциплина в системной биологии , молекулярной клеточной биологии и гистологии, изучающая топоном организмов . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Это область исследований, целью которой является расшифровка полного топонома здоровья и болезней (проект топонома человека). ^{[ 3 ]}— что является следующей большой проблемой в области биотехнологии человека после расшифровки генома человека. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Топоном — это пространственный сетевой код белков и других биомолекул в морфологически неповрежденных клетках и тканях. ^{[ 2 ]}^{[ 5 ]}

Пространственная организация биомолекул в клетках напрямую выявляется с помощью визуализирующей циклической микроскопии с функциональным разрешением, не ограниченным по параметрам и размерам. Полученные структуры топономов иерархически организованы и могут быть описаны трехсимвольным кодом. ^{[ 1 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этимология

Термины топоном и топономика были введены в 2003 году Вальтером Шубертом на основе наблюдений с помощью визуализирующих циклических микроскопов (ICM) . ^{[ 1 ]}

Топоном произошел от древнегреческих существительных топос (τόπος, «место, положение») и номос (νόμος, «закон»). Следовательно, топономика — это описательный термин, обозначающий тот факт, что пространственная сеть биомолекул в клетках следует топологическим правилам, обеспечивающим скоординированные действия. ^{[ 1 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Шуберт, В. (2003). Топологическая протеомика, Топономика, МЭЛК-технология . Том. 83. стр. 189–209. дои : 10.1007/3-540-36459-5_8 . ISBN 978-3-540-00546-9 . ПМИД 12934931 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )
^ Jump up to: ^а ^б Шуберт, В. (2013). «Топономика». Энциклопедия системной биологии . Спрингер Нью-Йорк. стр. 2191–2212. дои : 10.1007/978-1-4419-9863-7_631 . ISBN 978-1-4419-9862-0 .
^ Jump up to: ^а ^б Коттингем, Кэти (май 2008 г.). «Проект «Человеческий топоном | Человеческая протеинпедия» открыта для (бесплатного) бизнеса» . Журнал исследований протеома . 7 (5): 1806. doi : 10.1021/pr083701k .
^ Эботт, А. (12 октября 2006 г.). « «Составление карты единения» (основной момент исследования со ссылкой на Шуберта и др., 2006 г.)» . Природа . 443 (7112): 608–609. Бибкод : 2006Natur.443..608. . дои : 10.1038/443608a .
^ Jump up to: ^а ^б Шуберт, Вальтер; Боннеко, Бернд; Поммер, Ансгар Дж; Филипсен, Ларс; Бёкельманн, Райк; Малых, Янина; Голлник, Харальд; Фриденбергер, Мануэла; Боде, Маркус; Платье, Андреас В.М. (1 октября 2006 г.). «Анализ топологии и функции протеома с помощью автоматизированной многомерной флуоресцентной микроскопии». Природная биотехнология . 24 (10): 1270–1278. дои : 10.1038/nbt1250 . ПМИД 17013374 . S2CID 30436820 .
^ Шуберт, Вальтер (июнь 2007 г.). «Трёхсимвольный код для организованных протеомов, основанный на циклическом отображении местоположений белков» . Цитометрия Часть А. 71А (6): 352–360. doi : 10.1002/cyto.a.20281 . ПМИД 17326231 . S2CID 3132423 .
^ Шуберт, В. «Прямое пространственное изображение случайно больших супермолекул с использованием циклической микроскопии TIS с неограниченным параметром» (PDF) . Международная конференция по микроскопии 2013 . Проверено 23 сентября 2013 г.

Эта по биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[ref1-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Шуберт, В. (2003). Топологическая протеомика, Топономика, МЭЛК-технология . Том. 83. стр. 189–209. дои : 10.1007/3-540-36459-5_8 . ISBN 978-3-540-00546-9 . ПМИД 12934931 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )

[ref2-2] Jump up to: ^а ^б Шуберт, В. (2013). «Топономика». Энциклопедия системной биологии . Спрингер Нью-Йорк. стр. 2191–2212. дои : 10.1007/978-1-4419-9863-7_631 . ISBN 978-1-4419-9862-0 .

[ref6-3] Jump up to: ^а ^б Коттингем, Кэти (май 2008 г.). «Проект «Человеческий топоном | Человеческая протеинпедия» открыта для (бесплатного) бизнеса» . Журнал исследований протеома . 7 (5): 1806. doi : 10.1021/pr083701k .

[ref7-4] Эботт, А. (12 октября 2006 г.). « «Составление карты единения» (основной момент исследования со ссылкой на Шуберта и др., 2006 г.)» . Природа . 443 (7112): 608–609. Бибкод : 2006Natur.443..608. . дои : 10.1038/443608a .

[ref3-5] Jump up to: ^а ^б Шуберт, Вальтер; Боннеко, Бернд; Поммер, Ансгар Дж; Филипсен, Ларс; Бёкельманн, Райк; Малых, Янина; Голлник, Харальд; Фриденбергер, Мануэла; Боде, Маркус; Платье, Андреас В.М. (1 октября 2006 г.). «Анализ топологии и функции протеома с помощью автоматизированной многомерной флуоресцентной микроскопии». Природная биотехнология . 24 (10): 1270–1278. дои : 10.1038/nbt1250 . ПМИД 17013374 . S2CID 30436820 .

[ref4-6] Шуберт, Вальтер (июнь 2007 г.). «Трёхсимвольный код для организованных протеомов, основанный на циклическом отображении местоположений белков» . Цитометрия Часть А. 71А (6): 352–360. doi : 10.1002/cyto.a.20281 . ПМИД 17326231 . S2CID 3132423 .

[ref5-7] Шуберт, В. «Прямое пространственное изображение случайно больших супермолекул с использованием циклической микроскопии TIS с неограниченным параметром» (PDF) . Международная конференция по микроскопии 2013 . Проверено 23 сентября 2013 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]