БЫТЬ РНК

Богато украшенная большая экстремофильная РНК
Богато украшенная большая экстремофильная РНК
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности OLE
Идентификаторы
Символ	БЫТЬ
Рфам	RF01071
Другие данные
РНК Тип	Ген
Домен(ы)	Бактерии
ТАК	ТАК: 0001263
PDB Структуры	ПДБе https://www.rcsb.org/structure/7KKV

OLE РНК ( богатая большая экстремофильная РНК ) представляет собой консервативную структуру РНК, присутствующую у некоторых бактерий . ^{[ 1 ]} Длина РНК составляет в среднем около 610 нуклеотидов . Единственными известными РНК, которые длиннее OLE-РНК, являются рибозимы , такие как интрон группы II и рибосомальные РНК . Исключительная длина и высококонсервативная структура OLE РНК позволили предположить, что OLE РНК может быть рибозимом или иным образом выполнять сложную биохимическую задачу.

OLE-РНК преимущественно встречаются в отряде Clostridiales , но другие виды Bacillota также содержат OLE-РНК. Организмы, содержащие OLE РНК, являются преимущественно экстремофилами и анаэробами .

OLE-РНК транскрибируются как РНК, а эксперименты на Bacillus halodurans показывают, что они транскрибируются в мРНК с 10 другими генами . Соседние гены консервативны вблизи OLE РНК у большинства содержащих ее видов, но у Desulfitobacterium hafniense они расположены в другом месте хромосомы . OLE-РНК преобразуются из более крупного транскрипта в более короткую РНК, которая примерно соответствует консервативной структуре из ~610 нуклеотидов. Гены, кодирующие класс белков с неизвестной функцией, обычно расположены непосредственно после OLE РНК, и присутствие этого класса белков у видов коррелирует с наличием OLE РНК. Эта корреляция предполагает возможную функциональную связь между РНК и белком.

Рентгеноструктурные исследования выявили ключевые элементы, которые помогают специфически распознавать белок OapB в Bacillus halodurans . ^{[ 2 ]}