Тетрагидрофолатный рибопереключатель

Тетрагидрофолатный рибопереключатель
Тетрагидрофолатный рибопереключатель
	Консенсусная вторичная структура рибопереключателей тетрагидрофолата (THF)
Идентификаторы
Символ	рибопереключатель ТГФ
Рфам	RF01831
Другие данные
РНК Тип	Рибопереключатель
Домен(ы)	Клостридиалы , лактобактерии
PDB Структуры	ПДБе

Тетрагидрофолатные рибопереключатели представляют собой класс гомологичных РНК у некоторых бактерий , которые связывают тетрагидрофолат (ТГФ). ^{[ 1 ]} Он почти всегда локализован в вероятных 5'-нетранслируемых областях генов белок кодирующих , , и известно, что большинство этих генов кодируют либо фолата транспортеры , либо ферменты, фолата участвующие в метаболизме . По этим причинам был сделан вывод, что РНК функционируют как рибопереключатели . Рибопереключатели THF обнаружены у различных Bacillota , особенно у порядков Clostridiales и Lactobacillales , и реже у других линий бактерий. Рибопереключатель THF был одной из многих консервативных структур РНК, обнаруженных в проекте, основанном на сравнительной геномике . ^{[ 2 ]} Трехмерная структура тетрагидрофолатного рибопереключателя решена отдельными группами с помощью рентгеновской кристаллографии. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Эти структуры были депонированы в Банке данных белков под номерами 3SD1 и 3SUX, а другие записи содержали варианты.

См. также

Мотив Pfl РНК

Ссылки

^ Эймс Т.Д., Родионов Д.А., Вайнберг З., Брейкер Р.Р. (июль 2010 г.). «Класс эубактериальных рибопереключателей, чувствительных к коферменту тетрагидрофолату» . хим. Биол . 17 (7): 681–685. doi : 10.1016/j.chembiol.2010.05.020 . ПМК 3417113 . ПМИД 20659680 .
^ Вайнберг З., Ван Дж. Х., Бог Дж. и др. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата в структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов» . Геном Биол . 11 (3): С31. дои : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . ПМЦ 2864571 . ПМИД 20230605 .
^ Хуанг Л., Ишибе-Мураками С., Патель DJ, Серганов А. (сентябрь 2011 г.). «Взаимодействия псевдоузлов дальнего действия диктуют регуляторную реакцию тетрагидрофолатного рибопереключателя» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (36): 14801–14806. Бибкод : 2011PNAS..10814801H . дои : 10.1073/pnas.1111701108 . ПМК 3169164 . ПМИД 21873197 .
^ Трауш Дж.Дж., Церера П., Рейес Ф.Е., Бэти Р.Т. (октябрь 2011 г.). «Структура рибопереключателя, чувствительного к тетрагидрофолату, обнаруживает два сайта связывания лиганда в одном аптамере» . Структура . 19 (10): 1413–1423. дои : 10.1016/j.str.2011.06.019 . ПМК 3196276 . ПМИД 21906956 .

Внешние ссылки

Страница рибопереключателя THF на Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Ames2010-1] Эймс Т.Д., Родионов Д.А., Вайнберг З., Брейкер Р.Р. (июль 2010 г.). «Класс эубактериальных рибопереключателей, чувствительных к коферменту тетрагидрофолату» . хим. Биол . 17 (7): 681–685. doi : 10.1016/j.chembiol.2010.05.020 . ПМК 3417113 . ПМИД 20659680 .

[Weinberg2010-2] Вайнберг З., Ван Дж. Х., Бог Дж. и др. (март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявила 104 кандидата в структурированные РНК из бактерий, архей и их метагеномов» . Геном Биол . 11 (3): С31. дои : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . ПМЦ 2864571 . ПМИД 20230605 .

[3] Хуанг Л., Ишибе-Мураками С., Патель DJ, Серганов А. (сентябрь 2011 г.). «Взаимодействия псевдоузлов дальнего действия диктуют регуляторную реакцию тетрагидрофолатного рибопереключателя» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 108 (36): 14801–14806. Бибкод : 2011PNAS..10814801H . дои : 10.1073/pnas.1111701108 . ПМК 3169164 . ПМИД 21873197 .

[4] Трауш Дж.Дж., Церера П., Рейес Ф.Е., Бэти Р.Т. (октябрь 2011 г.). «Структура рибопереключателя, чувствительного к тетрагидрофолату, обнаруживает два сайта связывания лиганда в одном аптамере» . Структура . 19 (10): 1413–1423. дои : 10.1016/j.str.2011.06.019 . ПМК 3196276 . ПМИД 21906956 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]