Джампстарт РНК -мотив
Jumpstart RNA | |
---|---|
![]() Консенсусная вторичная структура Jumpstart RNAS | |
Идентификаторы | |
Символ | Jumpstart RNA |
RFAM | RF01707 |
Другие данные | |
РНК тип | Цис -регуляторный элемент |
Домен (ы) | Бактерии |
PDB Структуры | PDBE |
Мотив РНК -мотива Jumpstart описывает консервативную РНК -вторичную структуру , связанную с элементами Jumpstart. [ 1 ] Последовательность прыжков с 39-базой PAIR описывает консервативный элемент выше генов , которые участвуют в синтезе полисахаридов . [ 2 ] Было показано, что элемент Jumpstart функционирует как РНК и присутствует в 5 -'нетранслируемых областях генов, которые он регулирует. [ 3 ]
Последовательности Jumpstart включают элемент OPS, который является аббревиатурой для «супрессора опероконного полярного» и имеет консенсус -нуклеотид GGCGGUAG. [ 4 ] Элемент OPS действует совместно с RFAH белком для улучшения транскрипции генов ниже элемента OPS, особенно генов, далеко внутри длинных оперонов . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
- ^ Хоббс М., Ривз П.Р. (июнь 1994 г.). «Последовательность Jumpstart: элемент 39 п.н., общий для нескольких кластеров генов полисахаридов». Мол Микробиол . 12 (5): 855–856. doi : 10.1111/j.1365-2958.1994.tb01071.x . PMID 8052136 . S2CID 19948539 .
- ^ Jump up to: а беременный Марольда К.Л., Валвано М.А. (июнь 1998 г.). «Промоторная область Escherichia coli O7-специфической генов липополисахаридов: структурная и функциональная характеристика непереводящейся последовательности мРНК вверх по течению» . J. Bacteriol . 180 (12): 3070–3079. doi : 10.1128/jb.180.12.3070-3079.1998 . PMC 107806 . PMID 9620955 .
- ^ Jump up to: а беременный Nieto JM, Bailey MJ, Hughes C, Koronakis V (февраль 1996 г.). «Подавление транскрипционной полярности в опероне Escherichia coli гемолизин с помощью короткого восходящего элемента, разделяемого полисахаридом и детерминантами переноса ДНК». Мол Микробиол . 19 (4): 705–713. doi : 10.1046/j.1365-2958.1996.446951.x . PMID 8820641 . S2CID 39593320 .
- ^ Лидс JA, Welch RA (июнь 1997 г.). «Увеличение транскрипции через оперон гемолизина Escherichia coli, HLYCABD: RFAH и вверх по течению последовательностей ДНК Jumpstart Fewkens функционируют вместе с помощью механизма постинитирования» . J. Bacteriol . 179 (11): 3519–3527. doi : 10.1128/jb.179.11.3519-3527.1997 . PMC 179143 . PMID 9171395 .
- ^ Wang L, Jensen S, Hallman R, Reeves PR (август 1998 г.). «Экспрессия кластера генов o антигена регулируется RFAH через последовательность Jumpstart» . FEMS Microbiol. Летал 165 (1): 201–206. doi : 10.1111/j.1574-6968.1998.tb13147.x . PMID 9711858 .