Рибономика
Рибономика — это изучение рибонуклеиновых кислот ( РНК ), связанных с РНК-связывающими белками (RBP). Термин был введен Робертом Седергреном и его коллегами. [1] который использовал инструмент биоинформатического поиска для обнаружения новых рибозимов и мотивов РНК, первоначально обнаруженных в ВИЧ .Рибономика, подобно геномике или протеомике , представляет собой крупномасштабный и высокопроизводительный подход к идентификации подмножеств РНК путем их ассоциации с белками в клетках. Поскольку многие информационные РНК (мРНК) связаны с множеством процессов, этот метод предлагает простой механизм для изучения взаимоотношений различных внутриклеточных систем. Прокариоты совместно регулируют гены, общие для клеточных процессов, посредством полицистронного оперона . Поскольку эукариотическая транскрипция производит мРНК, кодирующую белки, моноцистронным способом, многие генные продукты должны одновременно экспрессироваться (см. Экспрессия генов ) и транслироваться во времени. ОДП считаются [ кем? ] быть молекулами, которые физически и биохимически организуют эти сообщения в различные клеточные места, где они могут транслироваться, разлагаться или храниться. Поэтому считается, что изучение транскриптов, связанных с RBP, [ кем? ] быть важным у эукариот как механизм скоординированной регуляции генов . Вероятными биохимическими процессами, ответственными за эту регуляцию, являются ускоренная/замедленная деградация РНК. Считается, что помимо влияния на период полураспада РНК скорость трансляции также изменяется за счет взаимодействий РНК-белок.Семейство дрозофилы ЭЛАВ. [2] семья Пуф [3] в дрожжах , и в человеческом Ла, Ро, [4] и ФМР [5] белки являются известными примерами RBP, демонстрирующими разнообразные виды и процессы, с которыми связана посттранскрипционная регуляция генов.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Бурдо В., Фербейр Г., Пажо М., Пакен Б., Седергрен Р. (ноябрь 1999 г.). «Распределение мотивов РНК в природных последовательностях» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (22): 4457–67. дои : 10.1093/нар/27.22.4457 . ПМК 148730 . ПМИД 10536156 .
- ^ «Семья ЭЛАВ» . Проверено 30 августа 2019 г.
- ^ Гербер А.П., Хершлаг Д., Браун П.О. (март 2004 г.). «Обширная ассоциация функционально и цитотопически связанных мРНК с РНК-связывающими белками семейства Puf у дрожжей» . ПЛОС Биол . 2 (3): Е79. дои : 10.1371/journal.pbio.0020079 . ПМК 368173 . ПМИД 15024427 .
- ^ Космопулу А., Власси М., Ставракудис А., Сакареллос С., Сакареллос-Дайциотис М. (июль 2006 г.). «Т-клеточные эпитопы аутоантигена La/SSB: прогноз, основанный на моделировании гомологии HLA-DQ2/DQ7 с комплексом инсулин-B-пептид/HLA-DQ8». J Comput Chem . 27 (9): 1033–44. дои : 10.1002/jcc.20422 . ПМИД 16639700 . S2CID 10167394 .
- ^ Маккензи Джей-Джей, Сумарго I, Тейлор С.А. (июль 2006 г.). «Загадочная полная мутация у мужчины с классическим фенотипом хрупкой X». Клин. Жене . 70 (1): 39–42. дои : 10.1111/j.1399-0004.2006.00634.x . ПМИД 16813602 . S2CID 38749866 .
