Стив Хорват
Стив Хорват | |
---|---|
![]() Хорват выступает с докладом в 2015 году | |
Рожденный | |
Занятие | Профессор генетики человека и биостатистики |
Известный | Разработка эпигенетических часов (часов Хорвата) и анализа сети взвешенной корреляции. |
Академическое образование | |
Альма-матер | Технический университет Берлина ( БС ) Университет Северной Каролины, Чапел-Хилл ( доктор философии ) Гарвардская школа общественного здравоохранения ( доктор биологических наук ) |
Докторантура | Роберт Браун Гарднер В Лэрде |
Академическая работа | |
Учреждения | Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе Альтос Лабс |
Стив Хорват — немецко-американский исследователь старения, генетик и биостатистик . Он — профессор Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе, известный разработкой часов старения Хорвата , которые являются высокоточным молекулярным биомаркером старения , а также разработкой сетевого анализа взвешенной корреляции . Его работа над геномными биомаркерами старения , процессом старения и многими возрастными заболеваниями/состояниями принесла ему несколько исследовательских наград. Хорват — главный исследователь антивозрастного стартапа Altos Labs. [1] и соучредитель некоммерческой организации Clock Foundation. [2]
Фон
[ редактировать ]Хорват родился во Франкфурте , Германия ; как указывает фамилия Хорват , он имеет венгерское происхождение. Он получил диплом по математике и физике в Техническом университете Берлина , который окончил в 1989 году. [3] [4] Он получил докторскую степень. по математике в Университете Северной Каролины в Чапел-Хилл в 1995 году и получил степень доктора философии. в области биостатистики в Гарварде в 2000 году. [4] В 2000 году Хорват поступил на факультет Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе , где он является профессором генетики человека в Медицинской школе Дэвида Геффена в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе и биостатистики в Школе общественного здравоохранения Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе. [3]
Работа над эпигенетическими часами
[ редактировать ]Разработка Хорватом метода оценки возраста на основе метилирования ДНК , известного как эпигенетические часы, была представлена в журнале Nature . [3] В 2011 году Хорват стал соавтором первой статьи, в которой описывался метод оценки возраста, основанный на уровнях метилирования ДНК по слюне. [5] В 2013 году Хорват опубликовал статью одного автора о методе оценки возраста нескольких тканей, который применим ко всем ядросодержащим клеткам, тканям и органам. [6] [3] Это открытие, известное как часы Хорвата, было неожиданным, поскольку типы клеток различаются по характеру метилирования ДНК, а возрастные изменения метилирования ДНК, как правило, тканеспецифичны. [3] В своей статье он продемонстрировал, что предполагаемый возраст, также называемый возрастом метилирования ДНК, обладает следующими свойствами: он близок к нулю для эмбриональных и индуцированных плюрипотентных стволовых клеток , он коррелирует с числом пассажей клеток ; это приводит к высоконаследственной мере ускорения старения; и это применимо к шимпанзе. [6] Поскольку часы Хорвата позволяют сопоставлять возраст различных тканей одних и тех же людей, их можно использовать для идентификации тканей, которые демонстрируют признаки увеличения или уменьшения возраста. [7]
Возрастные состояния и фенотипы
[ редактировать ]Хорват стал соавтором первых статей, демонстрирующих, что возраст метилирования ДНК предсказывает продолжительность жизни. [8] [9] [10] и положительно связан с ожирением , [11] ВИЧ- инфекция, [12] болезнь Альцгеймера , [13] когнитивное снижение, [14] болезнь Паркинсона , [15] болезнь Гентингтона , [16] ранняя менопауза , [17] и синдром Вернера . [18]
Генетика старения
[ редактировать ]Хорват опубликовал первую статью, демонстрирующую, что трисомия 21 ( синдром Дауна ) связана с сильными эпигенетическими эффектами ускорения старения как в крови, так и в тканях мозга. [19] Используя полногеномные исследования ассоциаций , команда Хорвата определила первые генетические маркеры (SNP), которые демонстрируют значимую общегеномную связь с темпами эпигенетического старения. [20] [21] – в частности, первые общегеномные значимые генетические локусы, связанные с эпигенетическими темпами старения в крови, в частности локус гена теломеразы обратной транскриптазы ( TERT ). [22]
В рамках этой работы его команда обнаружила парадоксальную взаимосвязь: генетические варианты, связанные с большей длиной теломер лейкоцитов в гене TERT, парадоксальным образом приводят к более высокому эпигенетическому ускорению старения в крови. [22]
Работа в биодемографии
[ редактировать ]Хорват предположил, что более медленные темпы эпигенетического старения могут объяснить преимущество женщин в смертности и парадокс смертности латиноамериканцев . [23]
Факторы образа жизни и питание
[ редактировать ]Хорват опубликовал первое крупномасштабное исследование влияния факторов образа жизни на скорость эпигенетического старения. [24]
Эти перекрестные данные о темпах эпигенетического старения в крови подтверждают общепринятое мнение о пользе образования, диеты с высоким содержанием растений и нежирным мясом, умеренного потребления алкоголя, физической активности и рисков, связанных с метаболическим синдромом .
Эпигенетическая теория старения
[ редактировать ]Хорват и Радж предложили теорию старения, основанную на эпигенетических часах. [25] который рассматривает биологическое старение как непреднамеренное последствие как программ развития, так и программ поддержания, молекулярные следы которых приводят к появлению оценок возраста по метилированию ДНК. Возраст DNAm рассматривается как проксимальное считывание набора врожденных процессов старения, которые взаимодействуют с другими, независимыми коренными причинами старения, нанося ущерб функции тканей. [25]
Анализ сети взвешенной корреляции
[ редактировать ]Хорват и члены его лаборатории разработали широко используемый метод системного анализа биологических данных, известный как сетевой анализ взвешенной корреляции . [26] [27] [28] Он опубликовал книгу о взвешенном сетевом анализе и геномных приложениях. [29]
Награды и почести
[ редактировать ]Хорват получил несколько наград за свою работу над эпигенетическими часами.
- Премия Аллена «Выдающийся исследователь» 2017 года за исследования часов у позвоночных [30]
- Премия Открытого благотворительного проекта 2019 года за механистические исследования эпигенетических часов [31]
- Премия Шобера 2019 года за выдающиеся и инновационные исследования в области старения [32]
- Премия Натана В. Шока 2022 года [33]
- 2022 г. Член Американской статистической ассоциации [34]
- Премия WNAR 2023 года за выдающееся влияние в области эпигенетических часов и анализа сетей взвешенной корреляции [35]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Познакомьтесь с Altos Labs, последней безумной ставкой Кремниевой долины на вечную жизнь» . 4 сентября 2021 г.
- ^ «О Фонде Часов» . 12 октября 2023 г.
- ^ Jump up to: а б с д и Гиббс, WT (2014). «Биомаркеры и старение: наблюдатель за часами» . Природа . 508 (7495): 168–170. Бибкод : 2014Natur.508..168G . дои : 10.1038/508168a . ПМИД 24717494 .
- ^ Jump up to: а б «Об университетах» . Калифорнийский университет Лос-Анджелеса . Проверено 20 августа 2020 г.
- ^ Бокландт, С; Лин, В; Зель, Мэн; Санчес, Ф.Дж.; Зиншаймер, Дж. С.; Хорват, С; Вилен, Э (2011). «Эпигенетический предсказатель возраста» . ПЛОС ОДИН . 6 (6): e14821. Бибкод : 2011PLoSO...614821B . дои : 10.1371/journal.pone.0014821 . ПМК 3120753 . ПМИД 21731603 .
- ^ Jump up to: а б Хорват, С (2013). «Возраст метилирования ДНК тканей и типов клеток человека» . Геномная биология . 14 (10): 115 р. дои : 10.1186/gb-2013-14-10-r115 . ПМК 4015143 . ПМИД 24138928 . (Ошибка: два : 10.1186/s13059-015-0649-6 , PMID 25968125 , Часы втягивания )
- ^ Хорват, С; Мах, В; Лу, АТ; Ву, Дж.С.; Чой, Огайо; Ясинска, AJ; Рианчо, JA; Тунг, С; Коулз, Н.С.; Браун, Дж; Винтерс, Х.В.; Коулз, Л.С. (2015). «Мозжечок стареет медленно в соответствии с эпигенетическими часами» (PDF) . Старение . 7 (5): 294–306. дои : 10.18632/aging.100742 . ПМЦ 4468311 . ПМИД 26000617 . Архивировано из оригинала (PDF) 25 мая 2015 г. Проверено 23 июня 2017 г.
- ^ Мариони, Р; Шах, С; Макрей, А; Чен, Б; Количено, Э; Харрис, С; Гибсон, Дж; Хендерс, А; Редмонд, П; Кокс, С; Патти, А; Корли, Дж; Мерфи, Л; Мартин, Н; Монтгомери, Дж; Фейнберг, А; Фаллин, М; Мультауп, М; Яффе, А; Джоханес, Р; Шварц, Дж; Просто, А; Лунетта, К; Мурабито, Дж. М.; Старр, Дж; Хорват, С; Баккарелли, А; Леви, Д; Вишер, П; Рэй, Н; Дорогая, я (2015). «Возраст метилирования ДНК в крови предсказывает смертность от всех причин в более позднем возрасте» . Геномная биология . 16 (1): 25. дои : 10.1186/s13059-015-0584-6 . ПМК 4350614 . ПМИД 25633388 .
- ^ Хорват, С (2015). «Снижение эпигенетического возраста РВМС у итальянских полудолгожителей и их потомков» . Старение . 7 (декабрь): 1159–70. дои : 10.18632/aging.100861 . ПМЦ 4712339 . ПМИД 26678252 .
- ^ Чен, Б; Мариони, Мэн (2016). «Измерение биологического возраста на основе метилирования ДНК: метаанализ, прогнозирующий время до смерти» . Старение . 8 (9): 1844–1865. дои : 10.18632/aging.101020 . ПМК 5076441 . ПМИД 27690265 .
- ^ Хорват, С; Эрхарт, В; Брош, М; Аммерполь, О; фон Шенфельс, Вт; Аренс, М; Хейтс, Н; Белл, Дж. Т.; Цай, ПК; Спектор, ТД; Делоукас, П; Зиберт, Р; Сипос, Б; Беккер, Т; Рекен, К; Шафмайер, К; Хампе, Дж (2014). «Ожирение ускоряет эпигенетическое старение печени человека» . Proc Natl Acad Sci США . 111 (43): 15538–43. Бибкод : 2014PNAS..11115538H . дои : 10.1073/pnas.1412759111 . ПМК 4217403 . ПМИД 25313081 .
- ^ Хорват, С; Левин, Эй Джей (2015). «Инфекция ВИЧ-1 ускоряет старение по эпигенетическим часам» . J Заразить Дис . 212 (10): 1563–73. дои : 10.1093/infdis/jiv277 . ПМЦ 4621253 . ПМИД 25969563 .
- ^ Левин, М. (2015). «Эпигенетический возраст префронтальной коры связан с нейритическими бляшками, амилоидной нагрузкой и когнитивными функциями, связанными с болезнью Альцгеймера» . Старение . 7 (декабрь): 1198–211. дои : 10.18632/aging.100864 . ПМЦ 4712342 . ПМИД 26684672 .
- ^ Мариони, Р; Шах, С; Макрей, А; Ричи, С; Мунис-Террера, GH; СЭ; Гибсон, Дж; Редмонд, П; СР, С; Патти, А; Корли, Дж; Тейлор, А; Мерфи, Л; Старр, Дж; Хорват, С; Вишер, П; Рэй, Н; Дорогая, я (2015). «Эпигенетические часы коррелируют с физической и когнитивной подготовленностью в Лотианской когорте рождения 1936 года» . Международный журнал эпидемиологии . 44 (4): 1388–1396. дои : 10.1093/ije/dyu277 . ПМЦ 4588858 . ПМИД 25617346 .
- ^ Хорват, С (2015). «Повышение эпигенетического возраста и количества гранулоцитов в крови пациентов с болезнью Паркинсона» . Старение . 7 (12): 1130–42. дои : 10.18632/aging.100859 . ПМЦ 4712337 . ПМИД 26655927 .
- ^ Хорват, С (2016). «Болезнь Хантингтона ускоряет эпигенетическое старение человеческого мозга и нарушает уровень метилирования ДНК» . Старение . 8 (7): 1485–512. дои : 10.18632/aging.101005 . ПМЦ 4993344 . ПМИД 27479945 .
- ^ Левин, М. (2016). «Менопауза ускоряет биологическое старение» . Proc Natl Acad Sci США . 113 (33): 9327–9332. Бибкод : 2016PNAS..113.9327L . дои : 10.1073/pnas.1604558113 . ПМЦ 4995944 . ПМИД 27457926 .
- ^ Майерхофер, А (2017). «Ускоренное эпигенетическое старение при синдроме Вернера» . Старение . 9 (4): 1143–1152. дои : 10.18632/aging.101217 . ПМЦ 5425119 . ПМИД 28377537 .
- ^ Хорват, С; Гараньяни, П; Бакалини, МГ; Пираццини, К; Сальвиоли, С; Джентилини, Д; Ди Блазио, AM; Джулиани, К; Тунг, С; Винтерс, Х.В.; Франчески, К. (февраль 2015 г.). «Ускоренное эпигенетическое старение при синдроме Дауна» . Стареющая клетка . 14 (3): 491–5. дои : 10.1111/acel.12325 . ПМК 4406678 . ПМИД 25678027 .
- ^ Лу, А (2016). «Генетические варианты рядом с MLST8 и DHX57 влияют на эпигенетический возраст мозжечка» . Природные коммуникации . 7 : 10561. Бибкод : 2016NatCo...710561L . дои : 10.1038/ncomms10561 . ПМК 4740877 . ПМИД 26830004 .
- ^ Лу, А (2017). «Генетическая архитектура эпигенетических и нейрональных темпов старения в областях мозга человека» . Природные коммуникации . 8 (15353): 15353. Бибкод : 2017NatCo...815353L . дои : 10.1038/ncomms15353 . ПМЦ 5454371 . ПМИД 28516910 .
- ^ Jump up to: а б Лу, Аке Т.; Сюэ, Лютинг; Салфати, Элайджа Л.; Чен, Брайан Х.; Ферруччи, Луиджи; Леви, Дэниел; Джоханес, Роби; Мурабито, Джоан М.; Киль, Дуглас П.; Цай, Пей-Цянь; И все же, Идил; Белл, Джордан Т.; Манджино, Массимо; Танака, Тошико; Макрей, Аллан Ф.; Мариони, Риккардо Э.; Вишер, Питер М.; Рэй, Наоми Р.; Дорогой, Ян Дж.; Левин, Морган Э.; Куах, Остин; Асимес, Фемистокл; Цао, Филип С.; Абшер, Девин; Стюарт, Джеймс Д.; Ли, Юн; Райнер, Алекс П.; Хоу, Лифан; Баккарелли, Андреа А.; Уитсел, Эрик А.; Авив, Авраам; Кардона, Алексия; Дэй, Феликс Р.; Уэрхэм, Николас Дж.; Перри, Джон РБ; Онг, Кен К.; Радж, Кеннет; Лунетта, Кэтрин Л.; Хорват, Стив (26 января 2018 г.). «GWAS скорости эпигенетического старения в крови раскрывает критическую роль TERT» . Природные коммуникации . 9 (1): 387. Бибкод : 2018NatCo...9..387L . дои : 10.1038/ s41467-017-02697-5 ПМК 5786029 . ПМИД 29374233 .
- ^ Хорват, Стив; Гурвен, Майкл; Левин, Морган Э.; Трамбл, Бенджамин К.; Каплан, Хиллард; Аллайи, Хуман; Ритц, Беате Р.; Чен, Брайан; Лу, Аке Т.; Рикабо, Тэмми М.; Джеймисон, Бет Д.; Сунь, Дяньцзяньи; Ли, Шэнсюй; Чен, Вэй; Кинтана-Мурси, Луис; Фагни, Мод; Кобор, Майкл С.; Цао, Филип С.; Райнер, Александр П.; Эдлефсен, Керстин Л.; Абшер, Девин; Ассимес, Фемистокл Л. (11 августа 2016 г.). «Эпигенетический часовой анализ расы/этнической принадлежности, пола и ишемической болезни сердца» . Геномная биология . 17 (1): 171. дои : 10.1186/s13059-016-1030-0 . ПМЦ 4980791 . ПМИД 27511193 .
- ^ Куах, Остин; Левин, Морган Э.; Танака, Тошико; Лу, Аке Т.; Чен, Брайан Х.; Ферруччи, Луиджи; Ритц, Беате; Бандинелли, Стефания; Нойхаузер, Мэриан Л.; Бизли, Жаннетт М.; Снетселаар, Линда; Уоллес, Роберт Б.; Цао, Филип С.; Абшер, Девин; Ассимес, Фемистокл Л.; Стюарт, Джеймс Д.; Ли, Юн; Хоу, Лифан; Баккарелли, Андреа А.; Уитсел, Эрик А.; Хорват, Стив (14 февраля 2017 г.). «Эпигенетический часовой анализ факторов питания, физических упражнений, образования и образа жизни» . Старение . 9 (2): 419–446. дои : 10.18632/aging.101168 . ПМЦ 5361673 . ПМИД 28198702 .
- ^ Jump up to: а б Хорват, Стив; Радж, Кеннет (11 апреля 2018 г.). «Биомаркеры, основанные на метилировании ДНК, и теория старения эпигенетических часов». Обзоры природы Генетика . 19 (6): 371–384. дои : 10.1038/s41576-018-0004-3 . ПМИД 29643443 . S2CID 4709691 .
- ^ Чжан, Б; Хорват, С. (2005). «Общая основа анализа сети взвешенной совместной экспрессии генов» (PDF) . Stat Appl Genet Mol Biol . 4 : Статья 17. дои : 10.2202/1544-6115.1128 . ПМИД 16646834 . S2CID 7756201 . Архивировано из оригинала (PDF) 28 сентября 2020 г. Проверено 23 июня 2017 г.
- ^ Хорват, С; Чжан, Б; Карлсон, М; Лу, КВ; Чжу, С; Фельчано, РМ; Лоуренс, МФ; Чжао, Вт; Шу, Кью; Ли, Ю; Шек, AC; Лиау, LM; Ву, Х; Гешвинд, DH; Феббо, PG; Корнблюм, Гавайи; Клоузи, Техас ; Нельсон, Сан-Франциско; Мишель, PS (2006). «Анализ онкогенных сигнальных сетей при глиобластоме идентифицирует ASPM как новую молекулярную мишень» . ПНАС . 103 (46): 17402–17407. Бибкод : 2006PNAS..10317402H . дои : 10.1073/pnas.0608396103 . ПМК 1635024 . ПМИД 17090670 .
- ^ Лангфельдер, П; Хорват, С (2008). «WGCNA: пакет R для анализа сети взвешенной корреляции» . БМК Биоинформатика . 9 : 559. дои : 10.1186/1471-2105-9-559 . ПМЦ 2631488 . ПМИД 19114008 .
- ^ Хорват С (2011). Взвешенный сетевой анализ: приложения в геномике и системной биологии. Книга Спрингера. Издание 1-е., 2011, XXII, 414 с. Твердый переплет. ISBN 978-1-4419-8818-8 веб-сайт
- ^ «Группа Пола Дж. Аллена Frontiers называет пять выдающихся следователей Аллена» . Cision PR Newswire. 15 июня 2017 г.
- ^ «Премия Открытой благотворительности за исследование эпигенетических часов Стива Хорвата» . openphilanthropy.org. Апрель 2019.
- ^ «Премия Шобера 2019 года Стиву Хорвату из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе» . Университет Галле (Заале) Германия. 13 сентября 2019 г.
- ^ Отчет о состоянии директора НИЗ за май 2021 г.
- ^ «Стипендиаты ASA 2022» (PDF) . Американская статистическая ассоциация . Проверено 20 июля 2022 г.
- ^ «Награда IBS/WNAR за выдающееся влияние и лекция» . Международное биометрическое общество.
- 1967 года рождения
- Американцы венгерского происхождения
- Немецкий народ венгерского происхождения
- Преподаватели из Калифорнии
- Медицинская школа Дэвида Геффена факультета Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе
- Биогеронтологи
- Выпускники Гарвардской школы общественного здравоохранения им. Т.Ч.Чана
- Живые люди
- Выпускники Берлинского технического университета
- Выпускники Университета Северной Каролины
- Члены Американской статистической ассоциации