Уильям ДеГрадо
Уильям (Билл) ДеГрадо (род. 1955) — профессор Калифорнийского университета в Сан-Франциско , где он является президентским профессором предпринимательства и инноваций Тоби Херфиндала на факультете фармацевтической химии. [1] Будучи пионером в области дизайна белков, он ввел термин « дизайн белков de novo» . Он также активно занимается открытием низкомолекулярных лекарств для лечения различных заболеваний человека. Он является членом Национальной академии наук США (1999 г.), Американской академии искусств и наук (1997 г.) и Национальной академии изобретателей . Он также является научным соучредителем компании Pliant Therapeutics.
Молодость образование и
После окончания средней школы ДеГрадо работал на фабрике по производству вешалок, и этот опыт побудил его продолжить свое образование. Он учился в колледжах в пригороде Чикаго и одновременно руководил службой стрижки газонов. Примерно в это же время его отец, Джим ДеГрадо, разработал очень успешный Red Solo Cup, работая коммерческим художником в Solo. В знак признательности Solo Cup предложил ДеГрадо стипендию на последние два года обучения в колледже, которые ДеГрадо закончил в колледже Каламазу .
ДеГрадо получил степень бакалавра химии в колледже Каламазу (1978 г.) и степень доктора органической химии в Чикагском университете (1981 г.).
и академическая карьера Промышленная
Получив докторскую степень по органической химии в Чикагском университете (1981) под руководством Эмиля Т. Кайзера , ДеГрадо начал работать в DuPont в качестве химика-исследователя, в конечном итоге став старшим директором по низкомолекулярной терапии в отделе медицинской химии DuPont Merck. В 1995 году он перешёл в Пенсильванский университет , где был профессором кафедры биохимии и биофизики, а также адъюнкт-профессором кафедры химии. С 2011 года он работает в Калифорнийского университета в Сан-Франциско фармацевтической школе , где является президентским профессором предпринимательства и инноваций Тоби Херфиндала. Он также является членом Института сердечно-сосудистых исследований и адъюнкт-членом Института нейродегенеративных заболеваний при Калифорнийском университете в Сан-Франциско.
Исследования [ править ]
Начиная с 1980-х годов группа ДеГрадо разработала подход к дизайну белков de novo - термин, который они придумали для описания дизайна белков на основе основных принципов, а не путем модификации природных последовательностей белков. [2] [3] [4] Они были пионерами параметрических подходов к созданию водорастворимых 4-спиральных (альфа4) и 3-спиральных пучков (альфа3D), а также пептидов ионных каналов. Белок альфа3D в то время был примечателен, поскольку он был лучшим примером белка de novo , который был биологически экспрессирован, структурно подтвержден и чья последовательность и структура не были основаны на последовательности или точной третичной структуре природного белка. белок. [5] Последовательность альфа3D была разработана с использованием алгоритмов вычислительной переупаковки боковой цепи, недавно разработанных Ponders & Richards. [6] [7] [8] [9] Дежарле и Гендель, Дахият и Майо. Кинетика сворачивания альфа3D является одной из наиболее подробно изученных среди однодоменных белков. [10] [11] и он использовался в качестве шаблона для создания металлопротеинов. [12] Компания Арцеллекс [13] использовал альфа3D [14] в качестве отправной точки для создания химерных антигенных рецепторов (CAR). Клинические данные, объявленные в 2020 году, показали глубокие и стойкие реакции на множественную миелому, иллюстрируя потенциал белков de novo для лечения заболеваний человека. [15]
Совместно с Анжелой Ломбарди ( Неаполитанский университет ), Лесом Даттоном и Майклом Териеном ( Университет Дьюка ) ДеГрадо также разработал многочисленные белки, которые имитируют многие каталитические свойства и свойства электронной ретрансляции гемовых и негемовых белков железа, включая трансмембранный белок, способный перемещаться электроны через мембраны. [16] Его группа также разработала первые образцы de novo ионных и протонных каналов .
Поскольку первоначальные подходы к дизайну белков de novo были сосредоточены на физико-химических принципах, их легко распространить на создание биологически активных полимеров и фолдамеров (коротких гомогенных полимеров со специфичной последовательностью, которые складываются в уникальные структуры). [17] Эта работа привела к созданию брилацидина. [18] который в настоящее время находится на стадии II клинических испытаний.
в фармацевтическую Вклад химию
ДеГрадо внес значительный вклад в разработку брилацидина , который проходит клинические испытания по нескольким показаниям. Группа ДеГрадо также внесла свой вклад в разработку низкомолекулярных антагонистов интегринов. [19] который достиг клинических испытаний. [20] Его работа на эту тему с Дином Шеппардом. [21] также легла в основу основания Pliant Pharmaceuticals, [22] компания, проводящая клинические исследования идиопатического легочного фиброза (ИЛФ) и первичного склерозирующего холангита.
Награды [ править ]
- Премия Дю Виньо 1988 года молодым исследователям в области исследований пептидов
- Премия молодого исследователя Белкового общества 1989 года
- 1992 года в области биологической химии Премия Эли Лилли
- Премия саммита DuPont Merck 1993 года
- 1995 год, член Американской ассоциации содействия развитию науки.
- Сотрудник 1998 года, AAAS
- 1999 Член Национальной академии наук (США).
- 2003 Премия Меррифилда Американского пептидного общества
- 2008 Премия Американского химического общества Ральфа Ф. Хиршмана в области химии пептидов
- 2009 Премия Макинени Американского пептидного общества
- 2015 Премия Штейна и Мура Белкового общества [23]
- Лекция памяти Макса Перуца в Институте Вейцмана, 2016 г.
- 2018 Премия Американского химического общества Коупа
- Американского химического общества 2018 Премия Мемориала Мюррея Гудмана [24]
- 2020 Премия Института Франклина и городского совета Филадельфии Джона К. Скотта
Ссылки [ править ]
- ^ «Кафедра фармацевтической химии» . Кафедра фармацевтической химии UCSF . 10 января 2017 г. Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ Риган, Линн; ДеГрадо, Уильям Ф. (19 августа 1988 г.). «Характеристика спирального белка, созданного на основе первых принципов» . Наука . 241 (4868): 976–978. Бибкод : 1988Sci...241..976R . дои : 10.1126/science.3043666 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 3043666 .
- ^ ДеГрадо, Уильям Ф.; Вассерман, Зельда Р.; Лир, Джеймс Д. (3 февраля 1989 г.). «Протеиновый дизайн: минималистский подход» . Наука . 243 (4891): 622–628. Бибкод : 1989Sci...243..622D . дои : 10.1126/science.2464850 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 2464850 .
- ^ Брайсон, Джеймс В.; Бетц, Стивен Ф.; Лу, Хелен С.; Суич, Дэниел Дж.; Чжоу, Хунсин X.; О'Нил, Карин Т.; ДеГрадо, Уильям Ф. (10 ноября 1995 г.). «Дизайн белка: иерархический подход» . Наука . 270 (5238): 935–941. Бибкод : 1995Sci...270..935B . дои : 10.1126/science.270.5238.935 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 7481798 . S2CID 31116489 .
- ^ Уолш, Скотт Т.Р.; Ченг, Хун; Брайсон, Джеймс В.; Родер, Генрих; ДеГрадо, Уильям Ф. (11 мая 1999 г.). «Структура раствора и динамика белка трехспирального пучка, созданного de novo» . Труды Национальной академии наук . 96 (10): 5486–5491. Бибкод : 1999PNAS...96.5486W . дои : 10.1073/pnas.96.10.5486 . ISSN 0027-8424 . ПМК 21886 . ПМИД 10318910 .
- ^ Дежарле, Джон Р.; Гендель, Трейси М. (1995). «Дизайн de novo гидрофобных ядер белков» . Белковая наука . 4 (10): 2006–2018. дои : 10.1002/pro.5560041006 . ISSN 0961-8368 . ПМК 2142989 . ПМИД 8535237 .
- ^ Дахият, Василий И.; Мэйо, Стивен Л. (1996). «Автоматизация проектирования белков» . Белковая наука . 5 (5): 895–903. дои : 10.1002/pro.5560050511 . ISSN 0961-8368 . ПМК 2143401 . ПМИД 8732761 .
- ^ Дахият, Василий И.; Мэйо, Стивен Л. (3 октября 1997 г.). «Дизайн белка De Novo: полностью автоматизированный выбор последовательности» . Наука . 278 (5335): 82–87. дои : 10.1126/science.278.5335.82 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 9311930 .
- ^ Подумайте, Джей В.; Ричардс, Фредерик М. (1987). «Третичные матрицы белков» . Журнал молекулярной биологии . 193 (4): 775–791. дои : 10.1016/0022-2836(87)90358-5 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 2441069 .
- ^ Чанг, Хой Сунг; Пиана-Агостинетти, Стефано; Шоу, Дэвид Э.; Итон, Уильям А. (25 сентября 2015 г.). «Структурная природа медленной диффузии при сворачивании белка» . Наука . 349 (6255): 1504–1510. Бибкод : 2015Sci...349.1504C . дои : 10.1126/science.aab1369 . ISSN 0036-8075 . ПМК 6260792 . ПМИД 26404828 .
- ^ Чжу, Юнджин; Алонсо, Дарвин ОВ; Маки, Косуке; Хуан, Ченг-Йен; Лар, Стивен Дж.; Даггетт, Валери; Родер, Генрих; ДеГрадо, Уильям Ф.; Гай, Фэн (11 декабря 2003 г.). «Сверхбыстрое сворачивание α3D: трехспиральный белок, созданный de novo» . Труды Национальной академии наук . 100 (26): 15486–15491. Бибкод : 2003PNAS..10015486Z . дои : 10.1073/pnas.2136623100 . ISSN 0027-8424 . ПМК 307594 . ПМИД 14671331 .
- ^ Мокни, Кэтрин С.; Пекораро, Винсент Л. (18 августа 2015 г.). «Протеиновый дизайн De Novo как методология синтетической бионеорганической химии» . Отчеты о химических исследованиях . 48 (8): 2388–2396. doi : 10.1021/acs.accounts.5b00175 . ISSN 0001-4842 . ПМЦ 5257248 . ПМИД 26237119 .
- ^ «Клеточная терапия Arcellx при раке и аутоиммунных заболеваниях» . Арселлкс . 6 февраля 2023 г. . Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ Цинь, Хайин; Эдвардс, Джастин П.; Зарицкая, Любовь; Гупта, Анкит; Му, К. Дженни; Фрай, Терри Дж.; Гилберт, Дэвид М.; ЛаФлер, Дэвид В. (2019). «Химерные антигенные рецепторы, включающие D-домены, направленные на CD123, направленные на мощную моно- и биспецифическую противоопухолевую активность Т-клеток» . Молекулярная терапия . 27 (7): 1262–1274. дои : 10.1016/j.ymthe.2019.04.010 . ПМК 6612629 . ПМИД 31043341 .
- ^ «Основной протокол исследования фазы 1 клеточной терапии при множественной миеломе - полнотекстовый просмотр» . ClinicalTrials.gov . 7 ноября 2019 г. Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ Корендович Иван Васильевич; ДеГрадо, Уильям Ф. (2020). «Дизайн белка de novo, ретроспектива» . Ежеквартальные обзоры биофизики . 53 : е3. дои : 10.1017/S0033583519000131 . ISSN 0033-5835 . ПМЦ 7243446 . ПМИД 32041676 .
- ^ Ченг, Ричард П.; Геллман, Сэмюэл Х.; ДеГрадо, Уильям Ф. (1 октября 2001 г.). «β-пептиды: от структуры к функции» . Химические обзоры . 101 (10): 3219–3232. дои : 10.1021/cr000045i . ISSN 0009-2665 . ПМИД 11710070 .
- ^ Тью, Грегори Н.; Скотт, Ричард В.; Кляйн, Майкл Л.; ДеГрадо, Уильям Ф. (19 января 2010 г.). «Дизайн антимикробных полимеров, фолдамеров и малых молекул De Novo: от открытия к практическому применению» . Отчеты о химических исследованиях . 43 (1): 30–39. дои : 10.1021/ar900036b . ISSN 0001-4842 . ПМЦ 2808429 . ПМИД 19813703 .
- ^ Бах, Элвин К.; Эспина, Дж. Роберт; Джексон, Шэрон А.; Стоутен, Питер Ф.В.; Дюк, Джоди Л.; Муса, Шейкер А.; ДеГрадо, Уильям Ф. (1 января 1996 г.). «Обмен β-поворотов с типа II на тип I меняет специфичность для интегринов» . Журнал Американского химического общества . 118 (1): 293–294. дои : 10.1021/ja953163+ . ISSN 0002-7863 .
- ^ Муса, Шейкер А.; ДеГрадо, Уильям Ф.; Му, Дунь-Сюй; Капил, Рам П.; Луккези, Бенедикт Р.; Рейли, Томас М. (1996). «Поральный антиагрегант, антитромботическая эффективность DMP 728, нового антагониста тромбоцитов GPIIb/IIIa» . Тираж . 93 (3): 537–543. дои : 10.1161/01.cir.93.3.537 . ISSN 0009-7322 . ПМИД 8565173 .
- ^ Рид, Нилгун И.; Джо, Хюнил; Чен, Чун; Цудзино, Казуюки; Арнольд, Томас Д.; ДеГрадо, Уильям Ф.; Шеппард, Дин (20 мая 2015 г.). «Интегрин α v β 1 играет решающую роль in vivo в фиброзе тканей» . Наука трансляционной медицины . 7 (288): 288ра79. doi : 10.1126/scitranslmed.aaa5094 . ISSN 1946-6234 . ПМК 4461057 . ПМИД 25995225 .
- ^ «Податливый» . Податливый . 5 января 2023 г. . Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ «Протеиновое общество: Награды Протеинового общества» . Белковое общество . Проверено 8 февраля 2023 г.
- ^ «Получатели | Веб-сайт Отдела биологической химии ACS» . www.divbiolchem.org . Проверено 22 марта 2018 г.