Сьюзан Бергет

Сьюзен М. Бергет — биохимик и почетный профессор Бэйлора Медицинского колледжа . Первоначально работавшая в Массачусетского технологического института лаборатории Филлипа Шарпа в рамках своей постдокторской стажировки, она сыграла важную роль в исследованиях, которые привели к открытию сплайсинга РНК и расщепления генов , за что Шарп был удостоен Нобелевской премии по физиологии и медицине 1993 года . Однако Бергет была исключена Шарпа из получения кредита, что препятствовало ее попыткам впоследствии подать заявление на должность профессора, особенно из-за того, что в рекомендательном письме также не признавалась ее заслуга в исследованиях в его лаборатории. В конце концов Нэнси Хопкинс и Дэвид Ботштейн убедили Шарпа переписать письмо, что позволило Берже получить приглашение профессора Университета Райса .

Затем она стала профессором Медицинского колледжа Бэйлора, где ее исследования были сосредоточены на дальнейшем понимании экзонов , интронов и общих механизмов сплайсинга РНК. Ее исследования оказали большое влияние на выяснение системы определения экзонов и распознавания клеток, а также биохимических факторов, которые помогают определить, как определяются места сплайсинга.

Карьера

Бергет получила докторскую степень. из Университета Миннесоты , прежде чем подать заявку на постдокторантуру в Филиппа Шарпа лаборатории в Массачусетском технологическом институте в 1975 году. Ей было поручено сравнить геномы клеток человека с аденовирусом, чтобы определить количество вирусных генов в геноме человека. Эта работа привела к тому, что Шарп получил в 1993 году Нобелевскую премию по физиологии и медицине . Из-за лаборатория долгосрочного правила Нобелевского комитета, разрешающего получать Нобелевскую премию только трем лауреатам, а также из-за того, что Ричарда Дж. Робертса также должна была разделить премию, Бергет и сотрудница Робертса Луиза Чоу были исключены из премии . Бергет заявила, что она «помирилась» с Шарпом и покончила с разговорами о «старых проблемах», но признала, что, если бы она могла прожить эту часть своей жизни заново, она была бы «намного более агрессивной», настаивая на этом. похвала за ее постдокторскую работу.

Однако осенью 1977 года, после публикации и презентации своих работ на съезде, в то время как Берже подавала заявку на должность профессора и проходила собеседования в Гарварде , Стэнфорде , Колумбийском университете и Калифорнийском университете в Беркли , она в конечном итоге была отклонено во всех заявлениях. Друг, который «позвонил» в одну из школ, чтобы узнать, обнаружил, что рекомендательное письмо Шарп не произвело впечатления, поскольку он только обсуждал ее работу до прихода в его лабораторию и ничего не упомянул о ее участии в открытии расщепленного гена. Бергет пошел поговорить об этом вопросе с Нэнси Хопкинс , которая сама пошла поговорить с Шарпом вместе с Дэвидом Ботштейном , объяснив, что если Бергет не отдаст должное открытию, он «выглядит мелочным» и в процессе нанесет вред своей собственной карьере. В ответ он дал Бергет более сильное рекомендательное письмо, и это привело к тому, что ей предложили работу в Университете Райса и Университете Карнеги-Меллона , из которых она выбрала первый, чтобы стать профессором биохимии. Она оставалась на этой должности факультета с 1978 по 1989 год.

Бергет стала профессором Медицинского колледжа Бэйлора, занимаясь исследованиями экзонов . В середине 1990-х Бергет был назначен ответственным за расследование научных нарушений в отношении своего коллеги-профессора Бэйлора Кимона Ангелидеса, и в течение 30 месяцев комиссия по расследованию вынесла обвинительный приговор за фальсификацию данных в опубликованных статьях и заявках на гранты НИЗ. После того, как Ангелидес был уволен в 1995 году, он подал иски о клевете против Берже и других участников расследования, которые были урегулированы только в 1999 году после того, как НИЗ провел независимое расследование, подтвердившее обоснованность обвинительного заключения. В начале 2000-х Берже был назначен исполняющим обязанности заведующего кафедрой фармакологии , несмотря на то, что он был профессором биохимии. Затем, в мае 2004 года, она была назначена вице-президентом и заместителем декана по академическому планированию медицинского колледжа.

Исследования

Открытие

Работая в лаборатории Филиппа Шарпа в 1976 году, Берже начал исследовать РНК в клеточной цитоплазме и то, как они связаны со структурой генома аденовируса . Она использовала электронную микроскопию , чтобы визуально изучить структурные различия. лаборатории Сотрудница Клер Мур начала использовать анализ R-петли , чтобы иметь возможность картировать цепочку РНК на матрице ДНК и гибридизировать их, что позволило изолировать, из каких генов была секвенирована РНК. Используя аденовирус для заражения клеток человека, Бергет затем очистил информационную РНК (мРНК) вируса, реплицирующегося в клетках, и гибридизовал их с клеточной ДНК человека с помощью Мура и процесса анализа R-петли. R-петли Однако микрофотографии имели неожиданное несоответствие: на нормальных R-петлях были видны кусочки РНК, отходящие от них. Другие ученые обнаружили, что РНК аденовируса в ядре клетки обычно длиннее, чем РНК, вырабатываемая в цитоплазме, поэтому Бергет, Мур и Шарп решили, что это просто артефакты, добавленные в процессе гибридизации.

Чтобы исправить это, они удалили противоположную сторону цепи ДНК, чтобы последовательность РНК не имела конкуренции за связывание со своим аналогом цепи ДНК, но удлиненные хвосты сохранились. Несколько месяцев и эксперименты по удалению хвостов путем совершенствования других частей процесса гибридизации не увенчались успехом. Но собранные Берже данные позволили предположить, что, возможно, хвостовые последовательности принадлежали другой части последовательности аденовируса, что побудило их использовать более длинную последовательность ДНК из клеток человека. Это оказалось успешным: хвосты соединились с дальнейшей частью ДНК и образовали R-петли, что доказывает открытие сплайсинга РНК и расщепления генов . Бергет, Мур и Шарп обнаружили, что причина того, что ядерная мРНК длиннее, заключается в том, что цитоплазматическая мРНК имеет сращенные интроны , позволяющие синтезировать белок . Они опубликовали это открытие в PNAS в августе 1977 года.

Экзоны и сайты сплайсинга

Создав собственную лабораторию, Бергет начала работу над изучением более глубоких особенностей сплайсинга РНК, а также того, как обрабатываются интроны и экзоны и какие биохимические механизмы в этом участвуют. Используя уридинтрифосфат, меченный радиоизотопом , ее лаборатория смогла производить несколько радиоактивных субстратов РНК для исследования каждую неделю, а также использовать клетки HeLa для получения экстрактов ядерной ДНК. Это побудило ее разработать модель определения экзонов, которая объясняла, как разные сайты сплайсинга обеспечивают клеточную связь между одним местоположением экзона и другими в последовательности во время транскрипции РНК , делая сайты зависимыми друг от друга. В конце 1980-х годов она обнаружила, что, уничтожая определенные фрагменты, участвующие в сращивании, она может вообще предотвратить этот процесс.

В статье 1990 года лаборатория Берже предположила, что для организмов с более длинными участками интронов между каждым экзоном, таких как позвоночные , должна существовать какая-то другая система, способная идентифицировать сами последовательности экзонов. В статье отмечается, что существование нижнего участка сплайсинга необходимо для сплайсинга верхнего интрона, что подтверждает наличие своего рода комплекса распознавания белков. В 1998 году они расширили механизмы дифференциального выбора сплайсинга, например, между пре-мРНК кальцитонина и CGRP , показав, что существует своего рода «фактор сплайсинга», который связывается с сайтом сплайсинга, чтобы вызвать полиаденилирование выше по ходу процесса. этого места привязки.

Организации

Бергет является членом консультативного совета Центра научного обзора , который контролирует 70% ежегодных заявок на гранты Национального института здравоохранения .

Награды

В 1996 году Бергет был удостоен Премии за выдающиеся достижения Университета Миннесоты для выпускников , добившихся значительных достижений в своей научной области.

Дальнейшее чтение

• Кэт Арни (18 июля 2019 г.). «Сплайс-девочки» . Генетика в разархивированном виде (подкаст). Общество генетиков . Проверено 12 января 2024 г.