CABIG

caGrid
Разработчик(и)	NCI Центр биомедицинской информатики и информационных технологий CBIIT), Исследовательский фонд Университета штата Огайо , Чикагского университета , Аргоннская национальная лаборатория ( Университет Дьюка , Booz Allen Hamilton , SemanticBits LLC, Ekagra Software Technologies
Операционная система	Кросс-платформенный
Тип	Грид-вычисления , Веб-сервис
Лицензия	BSD 3-пункт
Веб-сайт	Кагрид .org

caGrid
Разработчик(и)	NCI Центр биомедицинской информатики и информационных технологий CBIIT), Исследовательский фонд Университета штата Огайо , Чикагского университета , Аргоннская национальная лаборатория ( Университет Дьюка , Booz Allen Hamilton , SemanticBits LLC, Ekagra Software Technologies
Тип	Грид-вычисления , Веб-сервис
Лицензия	BSD 3-пункт
Веб-сайт	Кагрид .org

Cancer Biomedical Informatics Grid ( caBIG ) — это программа правительства США по разработке информационной сети с открытым исходным кодом и открытым доступом под названием caGrid для безопасного обмена данными об исследованиях рака. Инициатива была разработана Национальным институтом рака (входит в состав Национальных институтов здравоохранения ) и поддерживалась Центром биомедицинской информатики и информационных технологий (CBIIT) и программой, которой руководил Буз Аллен Гамильтон . В 2011 году отчет CABIG поднял серьезные вопросы об эффективности и надзоре, а его бюджет и объем были значительно урезаны. В мае 2012 года Национальная программа информатики рака (NCIP) была создана как программа-преемница caBIG.

История

Весной 2004 года Национальный институт рака (NCI) США профинансировал инициативу «Сетка биомедицинской информатики рака» (caBIG), которую возглавил Кеннет Бьютоу. ^[1]Его целью было объединить американских биомедицинских исследователей рака с помощью технологии, известной как грид-вычисления . Программа, возглавляемая Центром биоинформатики и информационных технологий (CBIIT), началась с трехлетнего пилотного этапа. Пилотный этап завершился в марте 2007 года, и было объявлено о судебном разбирательстве. ^[2]Буетов продвигал программу в 2008 году. ^[1]^[3]

В дополнение к caGrid, базовой инфраструктуре для обмена данными между организациями, caBIG разработала программные инструменты, политики обмена данными, а также общие стандарты и словари для облегчения обмена данными .

Программные инструменты, предназначенные для:

Сбор, анализ и управление данными фундаментальных исследований.
Управление клиническими исследованиями , от набора пациентов до нежелательных явлений . отчетности и анализа
Сбор, аннотирование, обмен и хранение медицинских изображений. данных
Управление биообразцами

caBIG стремилась предоставить основополагающую технологию для подхода к биомедицине, который она назвала «обучающейся системой здравоохранения». ^[4] Это зависит от быстрого обмена информацией между всеми секторами исследований и лечения, чтобы исследователи и врачи могли совместно анализировать и точно включать последние результаты в свою работу. Конечная цель заключалась в ускорении процесса биомедицинских исследований. Его также продвигали за то, что часто называют персонализированной медициной .Технология caBIG использовалась в адаптивных клинических исследованиях, таких как «Исследование серийных исследований для прогнозирования терапевтического ответа с помощью визуализации» и «Молекулярный анализ 2» (I-SPY2), который был разработан для использования биомаркеров для определения подходящей терапии для женщин с распространенным раком молочной железы . ^[5]

Информационные технологии здравоохранения

Информационные технологии здравоохранения (HIT) продвигались для управления и безопасного обмена медицинской информацией между исследователями, поставщиками медицинских услуг и потребителями. Инициативы HIT, в которых упоминался caBIG, были:NCI и Американское общество клинической онкологии инициировали сотрудничество с целью создания электронной системы медицинских карт для онкологии с использованием стандартов caBIG для совместимости, которая позволит онкологам управлять информацией о пациентах в электронном формате, который точно отражает конкретные интервенционные проблемы, уникальные для онкологии.Национальная информационная сеть здравоохранения была инициативой, направленной на обмен клиническими данными пациентов из географически разрозненных источников и создание электронного обмена национальной медицинской информацией. Возможно, это как-то связано.

Сотрудничество

Консорциум BIG Health был создан в 2008 году для продвижения персонализированной медицины, но распущен в 2012 году. ^[6] В июле 2009 года caBIG объявила о сотрудничестве с Исследовательским фондом доктора Сьюзен Лав с целью создания онлайн-группы женщин, желающих участвовать в клинических испытаниях. ^[7] Названная «Армией женщин», в ее базе данных была цель — один миллион; к декабрю 2009 года сайт был «запущен», и к 2010 году на него зарегистрировались около 30 000 женщин и мужчин. ^[8]

Целью Атласа генома рака было охарактеризовать более 10 000 опухолей как минимум 20 видов рака к 2015 году. caBIG предоставила возможности подключения, стандарты данных и инструменты для сбора, организации, обмена и анализа разнообразных исследовательских данных в своей базе данных.С 2007 года NCI сотрудничал с Национальным институтом исследования рака Великобритании (NCRI). Обе организации поделились технологиями для совместных исследований и безопасного обмена исследовательскими данными с использованием caGrid и веб-портала NCRI Oncology Information Exchange (ONIX) , анонсированного в августе 2009 года. ^[9]ONIX закрылся в марте 2012 года. ^[10]Институт рака Дьюка использовал инструменты клинических испытаний caBIG в сотрудничестве с Пекинской онкологической больницей Пекинского университета. ^[11]

Выполнение

Целью проекта было объединение 65 онкологических центров, назначенных NCI, для проведения совместных исследований.Участвующие учреждения могут либо «принять» инструменты caBIG для обмена данными напрямую через caGrid, либо «адаптировать» коммерческое или разработанное собственными силами программное обеспечение для обеспечения совместимости с caBIG. В рамках программы caBIG были разработаны комплекты разработки программного обеспечения (SDK) для совместимых программных инструментов и инструкции по процессу адаптации существующих инструментов или разработки приложений для совместимости с caBIG.

Программа Enterprise Support Network включала специалистов по конкретной предметной области, а также поставщиков услуг поддержки и сторонние организации, которые предоставляют помощь на основе контракта на оказание услуг. ^[12]Веб-портал с использованием программного обеспечения Liferay был доступен с 2008 по 2013 год. ^[13]

Открытый исходный код

С 2004 года программа caBIG использовала сообщества с открытым исходным кодом , адаптированные на основе других государственно-частных партнерств. Программа caBIG производила программное обеспечение по контракту с группами разработчиков программного обеспечения, в основном представителями коммерческого исследовательского сообщества. ^{[ нужна ссылка ]}

В целом программное обеспечение, разработанное по контрактам правительства США, является собственностью правительства США и налогоплательщиков США. В зависимости от условий конкретных контрактов они могут быть доступны только по запросу в соответствии с Законом о свободе информации (FOIA). Своевременность ответа на такие запросы может помешать запрашивающей стороне когда-либо получить какую-либо вторичную ценность от программного обеспечения, выпущенного по запросу FOIA.

Программа caBIG поместила все программное обеспечение caBIG в репозиторий программного обеспечения, доступный для загрузки. Открытый исходный код означает, что каждый может модифицировать загруженное программное обеспечение; однако лицензирование загружаемого программного обеспечения обеспечивает большую гибкость, чем обычно. Частному лицу или предприятию разрешено внести измененный код обратно в программу caBIG, но это не обязательно. Аналогичным образом, модификации могут быть доступны как с открытым исходным кодом, но не обязательно должны быть доступны как с открытым исходным кодом. Лицензия caBIG даже позволяет использовать приложения и компоненты caBIG в сочетании с дополнениями и модификациями для выпуска в качестве коммерческих продуктов. Эти аспекты программы caBIG фактически способствуют коммерциализации технологии caBIG.

Результаты

В 2008 году GlaxoSmithKline объявила, что поделится геномными данными раковых клеток с caBIG. ^[14]Некоторые частные компании заявили о преимуществах технологии caBIG в 2010 году. ^[15]

Веб-сайт сообщества caGrid был создан в 2007 году. ^[16]Версия основного программного обеспечения 1.x была добавлена в проект GitHub в середине 2013 года под лицензией BSD 3-Clause . ^[17]Он использовал версию 4.03 Globus Toolkit и рабочую систему Taverna для управления рабочим процессом и язык выполнения бизнес-процессов . ^[17]^[18]^[19]Программное обеспечение под названием Introduce было разработано примерно в 2006 году. ^[20] число участников входили Университета штата Огайо Центр клинических и трансляционных наук , Университет Дьюка , Чикагского университета В Аргоннская национальная лаборатория , а также частные компании Booze Allen Hamilton , Ekagra Software Technologies и Semantic Bits. ^[16]

Критика

К 2008 году некоторые задавались вопросом, принесла ли программа пользу крупным фармацевтическим компаниям. ^[21]К 2011 году на проект было потрачено около 350 миллионов долларов. ^[22] Хотя цель была сочтена похвальной, большая часть программного обеспечения была принята неравномерно после того, как была разработана с большими затратами, чтобы конкурировать с коммерческими предложениями.В марте 2011 года рабочая группа NCI пришла к выводу, что caBIG «…вышла далеко за рамки этих целей и внедрила чрезмерно сложное и амбициозное предприятие по разработке программного обеспечения с инструментами под брендом NCI, особенно в области системы управления клиническими исследованиями (CTMS). оказало ограниченное влияние на онкологическое сообщество, конкурировало с признанными коммерческими поставщиками и создало финансово несостоятельные долгосрочные обязательства по обслуживанию и поддержке для NCI». ^[2] В 2012 году NCI объявил о новой программе — Национальной программе информатики рака (NCIP) в качестве преемницы caBIG. ^[23]^[24]^[25]

caGrid

Компьютерная сеть и программное обеспечение caGrid поддержали инициативу «Сетка биомедицинской информатики рака» (caBIG) Национального института рака США Национальных институтов здравоохранения .

caBIG представляла собой добровольную виртуальную информационную инфраструктуру, которая соединяет данные, исследовательские инструменты, ученых и организации.

В 2013 году National Cancer Informatics Program (NCIP) перевыпустила caGrid под лицензией BSD 3-Clause и перенесла репозиторий исходников на github .

caGrid использовал версию 4.03 Globus Toolkit, выпущенную Globus Alliance.

Управление программой

Проектом caGrid и большей частью его финансирования руководил Буз Аллен Гамильтон.

Портал

Портал caGrid представлял собой веб-приложение, созданное на основе Liferay , которое позволяет пользователям находить сервисы, доступные в инфраструктуре caGrid, и взаимодействовать с ними. Портал служит основным инструментом визуализации для промежуточного программного обеспечения caGrid . Он также служил источником информации CABIG. Через портал caGrid пользователи имели доступ к информации об участниках caBIG, контактных лицах caGrid (POC), а также новостях и событиях, связанных с caGrid.

Рабочий процесс

Рабочий процесс caGrid использует:

Активный BPEL
Таверна

Авторы

НЦИ CBIIT Программа
Буз Аллен Хэмилтон
Университет штата Огайо
Чикагский университет , Аргоннская национальная лаборатория
Университет Дьюка
СемантикБитс, ООО
Экагра Программные Технологии

Критика

В марте 2011 года NCI опубликовал обширный обзор CaBIG, программы NCI CBIIT, которая финансировала разработку программного обеспечения caGrid (см. [1] , [2] ), который включал длинный список проблем с программой и рекомендовал проекты разработки программного обеспечения должны быть прекращены.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Кеннет Бьютоу (1 апреля 2008 г.). «На пути к БОЛЬШЕМУ времени» (PDF) . Ученый . Том. 22, нет. 4. с. 60. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2012 года . Проверено 9 сентября 2013 г.
^ Jump up to: ^а ^б Специальная рабочая группа Совета научных консультантов (3 марта 2011 г.). «Оценка влияния сетки биомедицинской информатики NCI по раку (caBIG®)» (PDF) . Национальный институт рака . Проверено 14 августа 2017 г.
^ Лори Виглер (14 июля 2008 г.). «Объединение онкологического сообщества caBIG Time» . Био-ИТ-Мир . Архивировано из оригинала 10 июня 2011 года . Проверено 10 сентября 2013 г.
^ «Обучающаяся система здравоохранения для лечения рака» . Архивировано из оригинала 7 марта 2010 г. Проверено 9 марта 2010 г.
^ Баркер А.Д., Сигман К.С., Келлофф Г.Дж., Хилтон Н.М., Берри Д.А., Эссерман Л.Дж. (июль 2009 г.). «I-SPY 2: адаптивный дизайн исследования рака молочной железы в условиях неоадъювантной химиотерапии». Клиническая фармакология и терапия . 86 (1): 97–100. дои : 10.1038/clpt.2009.68 . ПМИД 19440188 . S2CID 22909517 .
^ «Консорциум БОЛЬШОГО Здоровья» . Архивировано из оригинала 13 февраля 2009 года . Проверено 10 июня 2013 г.
^ Эдита Зелинска (22 июля 2009 г.). «NCI занимается пробной регистрацией» . Ученый . Проверено 4 октября 2011 г.
^ «Исследование здоровья женщин» . Сайт Армии женщин . Архивировано из оригинала 30 мая 2010 года . Проверено 4 октября 2011 г.
^ «NCRI запускает бесплатный онлайн-портал исследований рака ONIX» . Онкология Таймс, Великобритания . Август 2009. с. 4.
^ «Инициатива NCRI в области информатики» . НКРИ. Архивировано из оригинала 22 августа 2013 года . Проверено 10 сентября 2013 г.
^ «Дьюк играет важную роль в общенациональном проекте по улучшению лечения рака» (PDF) . Заметки онкологического центра . Комплексный онкологический центр Дьюка. Март 2004. с. 6. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 г. Проверено 10 июня 2013 г.
^ «Сеть поддержки предприятий» . Архивировано из оригинала 28 мая 2010 г. Проверено 9 марта 2010 г.
^ «Ворота в решетку биомедицинской информатики рака» . Старый веб-портал . Архивировано из оригинала 7 сентября 2008 года.
^ «GlaxoSmithKline сотрудничает с Национальным институтом рака, чтобы сделать большой объем геномных данных раковых клеток доступными для всех исследователей рака» . Пресс-релиз . Доступны геномные данные раковых клеток. Архивировано из оригинала 27 июня 2008 года . Проверено 10 июня 2013 г.
^ «Неожиданная и удачная синергия: BIGR® и caBIG®» . Сайт компании . HealthCare IT, Inc. Архивировано из оригинала 18 октября 2010 года . Проверено 10 июня 2013 г.
^ Jump up to: ^а ^б «КаГрид» . Веб-сайт . Архивировано из оригинала 1 июля 2007 года . Проверено 10 сентября 2013 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Добро пожаловать в основной проект caGrid» . Гитхаб . Проверено 9 сентября 2013 г.
^ Вэй Тан; Паоло Миссье; Рави Маддури; Ян Фостер (2009). «Построение научного рабочего процесса с помощью Taverna и BPEL: сравнительное исследование в caGrid». Сервис-ориентированные вычисления – ICSOC 2007 (PDF) . Конспекты лекций по информатике. Том. 5472. стр. 118–129. дои : 10.1007/978-3-642-01247-1_11 . ISBN 978-3-642-01246-4 .
^ Вэй Тан; Ян Фостер ; Рави Маддури (ноябрь – декабрь 2008 г.). «Объединение возможностей Taverna и caGrid: научные рабочие процессы, обеспечивающие совместную работу в веб-масштабе». IEEE Интернет-вычисления . 12 (6): 61–68. дои : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .
^ Шеннон Гастингс; Скотт Остер; Стивен Ланджелла; Дэвид Эрвин; Тахсин Курц и Джоэл Сальц (декабрь 2007 г.). «Представляем: набор инструментов с открытым исходным кодом для быстрой разработки строго типизированных грид-сервисов» . Журнал грид-вычислений . 5 (4): 407–427. дои : 10.1007/s10723-007-9074-8 .
^ Гарет Халфакри (23 июня 2008 г.). «Исследования рака становятся открытыми» . Бит-Тех. Архивировано из оригинала 20 марта 2012 года . Проверено 10 июня 2013 г.
^ Джон Фоули (8 апреля 2011 г.). «Отчет взрывает сетку проблемных исследований рака» . Информационная неделя . Проверено 10 июня 2013 г.
^ Удуак Грейс Томас (20 апреля 2012 г.). «NCI реорганизует усилия по информатике рака; сокращает некоторые программы caBIG, переводит другие в NCIP» . БИОИНФОРМ . Проверено 25 апреля 2012 г.
^ Джордж А. Комацулис. «Анонс программы» . Национальный институт рака. Архивировано из оригинала 30 июля 2012 года . Проверено 10 июня 2013 г.
^ Гарольд Вармус. «О НЦИП» . Национальный институт рака. Архивировано из оригинала 6 августа 2013 года . Проверено 9 сентября 2013 г.

Дальнейшее чтение

Абернети А.П., Койтауз Р., Роу К., Уиллер Дж.Л., Лайерли Х.К. Электронный сбор данных от пациентов как основа обучающейся системы здравоохранения. JCO. 2009;27:6522.
Буетов Х. caBIG: подтверждение концепции персонализированного лечения рака. JCO. 2009:27 Приложение 15S:e20712.
Холфорд М.Э., Радживан Х., Чжао Х., Кидд К.К., Чунг К.Х. (2009). «Семантическая веб-интеграция путей развития рака и данных о частоте аллелей» . Раковая информатика . 8 :19–30. дои : 10.4137/CIN.S1006 . ПМК 2664696 . ПМИД 19458791 .
Хуан Т., Шеной П.Дж., Синха Р., Грейзер М., Бамперы К.В., Flowers CR (2009). «Разработка базы данных архитектуры предприятия Lymphoma: система, соответствующая уровню caBIG(tm) Silver» . Раковая информатика . 8 : 45–64. дои : 10.4137/CIN.S940 . ПМЦ 2675136 . ПМИД 19492074 .
Кунц И., Лин М.К., Фрей Л. (2009). «Сопоставление и повторное использование метаданных в caBIG» . БМК Биоинформатика . 10 (Приложение 2): S4. дои : 10.1186/1471-2105-10-S2-S4 . ПМЦ 2646244 . ПМИД 19208192 .
Оманн С., Кучинке В. (2009). «Будущие разработки медицинской информатики с точки зрения сетевых клинических исследований. Функциональная совместимость и интеграция» . Методы информации в медицине . 48 (1): 45–54. дои : 10.3414/me9137 . ПМИД 19151883 . S2CID 23089030 . Архивировано из оригинала 11 февраля 2013 г.
Фан Дж.Х., Моффитт Р.А., Стоукс Т.Х. и др. (июнь 2009 г.). «Конвергенция биомаркеров, биоинформатики и нанотехнологий для индивидуального лечения рака» . Тенденции в биотехнологии . 27 (6): 350–8. дои : 10.1016/j.tibtech.2009.02.010 . ПМЦ 3779321 . ПМИД 19409634 .
Стас С.Дж., Сюй В., ЛеФевр С.Д. и др. (2009). «Аргументы в пользу использования грид-архитектуры для информатики общественного здравоохранения штата: перспектива штата Юта» . BMC Медицинская информатика и принятие решений . 9:32 . дои : 10.1186/1472-6947-9-32 . ПМК 2707374 . ПМИД 19545428 .
Питер А. Ковиц; Фрэнк Хартел; Карл Шефер; Шерри Де Коронадо; Жилберто Фрагозо; Химансо Сахни; Скотт Густафсон и Кеннет Х. Бьютоу (23 апреля 2003 г.). «caCORE: Общая инфраструктура для информатики рака». Биоинформатика . 19 (18): 2404–2412. doi : 10.1093/биоинформатика/btg335 . ПМИД 14668224 .
«Информационные технологии в сфере здравоохранения становятся личными», InformationWeek (13.11.09).
«Необработанные данные о состоянии здоровья». Архивировано 26 декабря 2010 г. в Wayback Machine Government Health IT (6 ноября 2009 г.).
«NCI откроет исследовательскую сеть для «армии» больных раком», Архивировано 26 ноября 2010 г. в Wayback Machine Government Health IT (9 октября 2009 г.).
«GridBriefing: Будущее здравоохранения — электронное здравоохранение и Grid-вычисления», GridTalk (9 сентября)
«Сотрудничество и устойчивое развитие находятся на переднем плане, поскольку caBIG отмечает пятилетие», GenomeWeb/BioInform (7/09)
«Обмен огромными данными», Scientific American (5/09).
«Трансляционные исследования стимулируют спрос на «виртуальные» биобанки, созданные на основе инструментов caBIG», GenomeWeb/BioInfom (3 апреля 2009 г.)
"КаГрид" . Архивировано из оригинала 05 февраля 2012 г. Проверено 22 ноября 2016 г.
«caGrid 1.0: корпоративная грид-инфраструктура для биомедицинских исследований» .
«Включение обеспечения и управления фабрикой доверия федеративной сети» .
«Представляем: набор инструментов с открытым исходным кодом для быстрой разработки строго типизированных грид-сервисов» .
«caGrid: проектирование и реализация базовой архитектуры сетки биомедицинской информатики рака» .
Тан, Вэй; Фостер, Ян; Маддури, Рави (2008). «Объединение возможностей Taverna и caGrid: научные рабочие процессы, обеспечивающие совместную работу в веб-масштабе». IEEE Интернет-вычисления . 12 (6): 61–68. дои : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .

Внешние ссылки

Веб-сайт caBIG для потребителей/пользователей (нетехнический)
Веб-сайт сообщества caBIG (технический)
caGrid вики
проект caGrid gforge
Портал caGrid

Компоненты

Представляем Toolkit Globus , также проект инкубатора
Службы передачи данных
Метаданные
Безопасность
- Служба делегирования учетных данных (CDS)
- Дориан
- ГАРДЫ
- Сетка группера
- Служба доверия сети (GTS)
- WebSSO — компонент системы единого входа в Интернет, основанный на JASIG CAS.

[Buetow08-1] Jump up to: ^а ^б Кеннет Бьютоу (1 апреля 2008 г.). «На пути к БОЛЬШЕМУ времени» (PDF) . Ученый . Том. 22, нет. 4. с. 60. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2012 года . Проверено 9 сентября 2013 г.

[assess-2] Jump up to: ^а ^б Специальная рабочая группа Совета научных консультантов (3 марта 2011 г.). «Оценка влияния сетки биомедицинской информатики NCI по раку (caBIG®)» (PDF) . Национальный институт рака . Проверено 14 августа 2017 г.

[3] Лори Виглер (14 июля 2008 г.). «Объединение онкологического сообщества caBIG Time» . Био-ИТ-Мир . Архивировано из оригинала 10 июня 2011 года . Проверено 10 сентября 2013 г.

[4] «Обучающаяся система здравоохранения для лечения рака» . Архивировано из оригинала 7 марта 2010 г. Проверено 9 марта 2010 г.

[5] Баркер А.Д., Сигман К.С., Келлофф Г.Дж., Хилтон Н.М., Берри Д.А., Эссерман Л.Дж. (июль 2009 г.). «I-SPY 2: адаптивный дизайн исследования рака молочной железы в условиях неоадъювантной химиотерапии». Клиническая фармакология и терапия . 86 (1): 97–100. дои : 10.1038/clpt.2009.68 . ПМИД 19440188 . S2CID 22909517 .

[6] «Консорциум БОЛЬШОГО Здоровья» . Архивировано из оригинала 13 февраля 2009 года . Проверено 10 июня 2013 г.

[7] Эдита Зелинска (22 июля 2009 г.). «NCI занимается пробной регистрацией» . Ученый . Проверено 4 октября 2011 г.

[8] «Исследование здоровья женщин» . Сайт Армии женщин . Архивировано из оригинала 30 мая 2010 года . Проверено 4 октября 2011 г.

[9] «NCRI запускает бесплатный онлайн-портал исследований рака ONIX» . Онкология Таймс, Великобритания . Август 2009. с. 4.

[10] «Инициатива NCRI в области информатики» . НКРИ. Архивировано из оригинала 22 августа 2013 года . Проверено 10 сентября 2013 г.

[11] «Дьюк играет важную роль в общенациональном проекте по улучшению лечения рака» (PDF) . Заметки онкологического центра . Комплексный онкологический центр Дьюка. Март 2004. с. 6. Архивировано из оригинала (PDF) 4 марта 2016 г. Проверено 10 июня 2013 г.

[12] «Сеть поддержки предприятий» . Архивировано из оригинала 28 мая 2010 г. Проверено 9 марта 2010 г.

[13] «Ворота в решетку биомедицинской информатики рака» . Старый веб-портал . Архивировано из оригинала 7 сентября 2008 года.

[14] «GlaxoSmithKline сотрудничает с Национальным институтом рака, чтобы сделать большой объем геномных данных раковых клеток доступными для всех исследователей рака» . Пресс-релиз . Доступны геномные данные раковых клеток. Архивировано из оригинала 27 июня 2008 года . Проверено 10 июня 2013 г.

[15] «Неожиданная и удачная синергия: BIGR® и caBIG®» . Сайт компании . HealthCare IT, Inc. Архивировано из оригинала 18 октября 2010 года . Проверено 10 июня 2013 г.

[grid-16] Jump up to: ^а ^б «КаГрид» . Веб-сайт . Архивировано из оригинала 1 июля 2007 года . Проверено 10 сентября 2013 г.

[v1-17] Jump up to: ^а ^б «Добро пожаловать в основной проект caGrid» . Гитхаб . Проверено 9 сентября 2013 г.

[18] Вэй Тан; Паоло Миссье; Рави Маддури; Ян Фостер (2009). «Построение научного рабочего процесса с помощью Taverna и BPEL: сравнительное исследование в caGrid». Сервис-ориентированные вычисления – ICSOC 2007 (PDF) . Конспекты лекций по информатике. Том. 5472. стр. 118–129. дои : 10.1007/978-3-642-01247-1_11 . ISBN 978-3-642-01246-4 .

[19] Вэй Тан; Ян Фостер ; Рави Маддури (ноябрь – декабрь 2008 г.). «Объединение возможностей Taverna и caGrid: научные рабочие процессы, обеспечивающие совместную работу в веб-масштабе». IEEE Интернет-вычисления . 12 (6): 61–68. дои : 10.1109/MIC.2008.120 . S2CID 2690862 .

[20] Шеннон Гастингс; Скотт Остер; Стивен Ланджелла; Дэвид Эрвин; Тахсин Курц и Джоэл Сальц (декабрь 2007 г.). «Представляем: набор инструментов с открытым исходным кодом для быстрой разработки строго типизированных грид-сервисов» . Журнал грид-вычислений . 5 (4): 407–427. дои : 10.1007/s10723-007-9074-8 .

[21] Гарет Халфакри (23 июня 2008 г.). «Исследования рака становятся открытыми» . Бит-Тех. Архивировано из оригинала 20 марта 2012 года . Проверено 10 июня 2013 г.

[22] Джон Фоули (8 апреля 2011 г.). «Отчет взрывает сетку проблемных исследований рака» . Информационная неделя . Проверено 10 июня 2013 г.

[23] Удуак Грейс Томас (20 апреля 2012 г.). «NCI реорганизует усилия по информатике рака; сокращает некоторые программы caBIG, переводит другие в NCIP» . БИОИНФОРМ . Проверено 25 апреля 2012 г.

[24] Джордж А. Комацулис. «Анонс программы» . Национальный институт рака. Архивировано из оригинала 30 июля 2012 года . Проверено 10 июня 2013 г.

[25] Гарольд Вармус. «О НЦИП» . Национальный институт рака. Архивировано из оригинала 6 августа 2013 года . Проверено 9 сентября 2013 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]