Нейссерия РНК -термометр
LST термометр | |
---|---|
![]() Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности термометра LST | |
Идентификаторы | |
RFAM | RF02810 |
Другие данные | |
Домен (ы) | Бактерии |
ИДТИ | Go: 0009266 , Go: 0030371 |
ТАК | SO: 005836 , так: 0000204 |
PDB Структуры | PDBE |
Термометр FHBP | |
---|---|
![]() Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности термометра FHBP | |
Идентификаторы | |
RFAM | RF02811 |
Другие данные | |
Домен (ы) | Бактерии |
ИДТИ | Go: 0009266 , Go: 0030371 |
ТАК | SO: 005836 , так: 0000204 |
PDB Структуры | PDBE |
РНК -термометры (RNAT) регулируют экспрессию генов в ответ на температуру, позволяя патогенам, таким как Neisseria meningitidis для включения молчаливых генов [ нужно разъяснения ] После входа в организм хозяина. Однако температура для экспрессии признаков, связанных с вирулентностью Neisseria, составляет 42 ° C, в то время как другие бактериальные патогенные RNAT требуют 37 ° C. Вероятно, это связано с тем, что N. meningitidis является обязательным комменсалом носоглотки человека и становится патогенным во время воспаления из -за вирусной инфекции. Три независимых термосенсора РНК были идентифицированы в 5'UTR генов, необходимых для: биосинтеза капсулы ( CSSA ), экспрессии белка, связывающего фактор H ( FHBP ) и сиалилирования липополисахарида , что необходимо для устойчивости бактерий в отношении иммунного убийства ( LST ). [ 1 ] Соответствующая нуклеотидная последовательность и прогнозируемая ингибирующие структуры трех RNAT указывают на то, что они развивались независимо.
Дальнейшее изучение молекулярных механизмов CSSA RNAT показало, что он действует как реостат , который реагирует на небольшие изменения температуры около 37 ° C, которые встречаются в пределах верхних дыхательных путей во время инфекции. Повышение температуры открывает структуру, чтобы обеспечить увеличение доступа к сайту связывания рибосом . Кроме того, даже небольшие изменения в нуклеотидном составе приводят к неразниманию выработки CSSA. Эти изменения искажают структуру таким образом, что усиливается при повышении температуры. Следовательно, отдельная нуклеотидная замещение приводит к снижению активации белка и сдвигу активации к более высокой температуре. Эта деятельность может быть модулирована путем фармакологического вмешательства . [ 2 ] Механизмы, лежащие в основе терморегуляции FHBP, также были дополнительно охарактеризованы. [ 3 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Loh E, Kugelberg E, Tracy A, Zhang Q, Gollan B, Ewles H, Chalmers R, Pelicic V, Tang CM (октябрь 2013). «Температура вызывает иммунное уклонение от Neisseria meningitidis» . Природа . 502 (7470): 237–240. BIBCODE : 2013NATR.502..237L . doi : 10.1038/nature12616 . PMC 3836223 . PMID 24067614 .
- ^ Barnwal RP, Loh E, Годин KS, Yip J, Lavender H, Tang CM, Varani G (ноябрь 2016 г.). «Структура и механизм молекулярного реостата, термометр РНК, который модулирует иммунное уклонение от Neisseria meningitidis» . Исследование нуклеиновых кислот . 44 (19): 9426–9437. doi : 10.1093/nar/gkw584 . PMC 5100586 . PMID 27369378 .
- ^ Loh E, Lavender H, Tan F, Tracy A, Tang CM (август 2016 г.). «Терморегуляция менингококкового FHBP, важного фактора вирулентности и антигена вакцины, опосредуется последовательностями сайтов антирибосомного связывания в открытой раме считывания» . PLO -патогены . 12 (8): E1005794. doi : 10.1371/journal.ppat.1005794 . PMC 4999090 . PMID 27560142 .