Gyra RNA Motif
Gyra RNA Motif | |
---|---|
![]() Консенсусная вторичная структура Gyra RNAS | |
Идентификаторы | |
Символ | gyrA RNA |
RFAM | RF01740 |
Другие данные | |
РНК тип | Цис -регуляторный элемент |
Домен (ы) | Pseudomonadales |
PDB Структуры | PDBE |
Мотив Gyra РНК представляет собой консервативную РНК -структуру, идентифицированную биоинформатикой . [ 1 ] РНК присутствуют у нескольких видов бактерий в пределах порядка псевдомонадал . Этот порядок содержит род Pseudomonas , который включает в себя оппортунистические патогенные патогены человека Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas syringae , растительный патоген.
Gyra RNA всегда обнаруживаются в предполагаемых 5 -'нетранслируемых областях генов Gyra , которые кодируют белок, образующий субъединицу ДНК -гиразы . Устойчивость к антибиотикому ципрофлоксацину в псевдомонах часто достигается с помощью мутаций в ген -гире . [ 2 ] Из-за своего позиционирования мотив РНК Gyra , как было предположительно, является цис-регуляторным элементом, действующим по генам вниз по течению . Тем не менее, Gyra ранее рассматривалась как ген, уровень экспрессии, чей уровень экспрессии согласуется в самых разных условиях роста. [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
- ^ Bonomo RA, Szabo D (сентябрь 2006 г.). «Механизмы устойчивости к множеству лекарств у видов Acinetobacter и Pseudomonas aeruginosa» . Клин Инфекция Диск . 43 (Suppl 2): S49–56. doi : 10.1086/504477 . PMID 16894515 .
- ^ Vencato M, Tian F, Alfano JR, et al. (Ноябрь 2006 г.). «Идентификация с поддержкой биоинформатики HRPL регулона и системы секреции типа III Эффекторные белки Pseudomonas syringae pv. Phaseologola 1448a» . Мол Завод микроб взаимодействует . 19 (11): 1193–1206. doi : 10.1094/mpmi-19-1193 . PMID 17073302 .