Белковый домен UbiD
| УбиД | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура 3-октапренил-4-гидроксибензоатдекарбоксилазы (убид) из Escherichia coli, цель северо-восточной структурной геномики er459. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | УбиД | ||
| Пфам | PF01977 | ||
| ИнтерПро | ИПР002830 | ||
| |||
В молекулярной биологии этот белковый домен относится к UbiD, который обнаружен у прокариот , архей и грибов , с двумя членами у Archaeoglobus fulgidus . Они родственны UbiD, 3-октапренил-4-гидроксибензоаткарбоксилазе из Escherichia coli , которая участвует в убихинона биосинтезе . [ 1 ] Представитель Helicobacter pylori имеет С-концевое удлинение, составляющее чуть более 100 остатков , которое частично совпадает с Aquifex aeolicus гомологом .
Функция
[ редактировать ]Убихинон — важный переносчик электронов у прокариот . В Escherichia coli путь биосинтеза убихинона включает по меньшей мере девять реакций, в которых образуется 3-октапренил-4-гидроксибензоат. декарбоксилаза (UbiD) представляет собой фермент на пути, который катализирует превращение субстрата 3-октапренил-4-гидроксибензоата в продукт, 2-октапренилфенол. [ 2 ] Мутанты E. coli ubiD- имеют дефекты биосинтеза Q8, накапливают 4-гидрокси-3-октапренилбензойную кислоту (HP8B) и лишены декарбоксилазной активности in vitro . Однако ubiD-мутанты E. coli сохраняли способность продуцировать около 20–25% нормального уровня Q 4-гидрокси-3-октапренилбензойной кислоты. [ 3 ] По сути, белковый домен UbiD жизненно важен для создания убихинона, важного переносчика электронов в создании энергии.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чжан Х, Явор Г.Т. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация гена ubiD на хромосоме Escherichia coli» . Дж. Бактериол . 182 (21): 6243–6. дои : 10.1128/jb.182.21.6243-6246.2000 . ПМК 94763 . ПМИД 11029449 .
- ^ Лю Дж, Лю Дж. Х. (2006). «Биосинтез убихинона (коэнзима Q) у Chlamydophila pneumoniae AR39: идентификация гена ubiD» . Acta Biochim Biophys Sin (Шанхай) . 38 (10): 725–30. дои : 10.1111/j.1745-7270.2006.00214.x . ПМИД 17033719 .
- ^ Гулмезян М., Хайман К.Р., Марбуа Б.Н., Кларк К.Ф., Джавор Г.Т. (2007). «Роль UbiX в биосинтезе кофермента Q Escherichia coli» . Арх Биохим Биофиз . 467 (2): 144–53. дои : 10.1016/j.abb.2007.08.009 . ПМК 2475804 . ПМИД 17889824 .