Фиона Бринкман

Фиона Бринкман (урожденная Лоусон) — профессор биоинформатики и геномики кафедре молекулярной биологии и биохимии на Университета Саймона Фрейзера в Британской Колумбии , Канада, и лидер в области микробной биоинформатики . Она заинтересована в разработке «более устойчивых, целостных подходов к борьбе с инфекционными заболеваниями и сохранению микробиомов». ^{[ 1 ]}

Образование

Бринкман получила степень бакалавра наук. в получила степень доктора биохимии Университете Ватерлоо в 1990 году и получила степень доктора философии. под руководством доктора Джо-Энн Диллон в Университете Оттавы в 1996 году. Она получила две постдокторские стипендии в Университете Британской Колумбии под руководством докторов Роберта (Боба) Хэнкока и Энн Роуз. Хотя изначально она была микробиологом, у нее появился интерес к биоинформатике во время учебы в аспирантуре и докторантуре, объединив эти области, когда в 2001 году она основала свою собственную группу, занимающуюся биоинформатикой патогенов и микробов в Университете Саймона Фрейзера.

Исследовать

Текущие исследовательские интересы Бринкмана сосредоточены на улучшении понимания того, как развиваются микробы, и совершенствовании вычислительных методов, которые помогают анализировать микробы и разрабатывать новые вакцины, лекарства и средства диагностики инфекционных заболеваний . Ее методы все чаще применяются для решения экологических задач. Она известна разработкой PSORTb, ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} самый точный метод, доступный для вычислительного прогнозирования субклеточной локализации белков , и первый вычислительный метод, который превысил точность некоторых распространенных высокопроизводительных лабораторных методов для такого анализа субклеточной локализации . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Этот метод помогает прогнозировать клеточную поверхность и секретируемые белки в бактериальной клетке, которые могут быть подходящими мишенями для лекарств, компонентами вакцин или диагностическими средствами. Она также разработала методы биоинформатики, которые помогают более точно идентифицировать геномные острова (например, IslandViewer ) и ортологов (например, OrtholugeDB ). Ее исследования позволили по-новому взглянуть на эволюцию патогенов и роль, которую играют горизонтальный перенос генов и геномные острова. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Она подтвердила анекдотическое предположение о том, что факторы вирулентности (гены, вызывающие заболевания в патогенах) непропорционально связаны с геномными островами. ^{[ 9 ]} Она была среди первых исследователей, которые использовали полногеномное секвенирование для помощи в расследовании вспышек инфекционных заболеваний («геномная эпидемиология»), интегрируя данные о последовательностях генома с анализом социальных сетей. ^{[ 10 ]} Она участвовала в проекте «Геном Pseudomonas». ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} и является координатором базы данных генома Pseudomonas , базы данных геномных данных видов Pseudomonas и связанных с ними аннотаций, которая постоянно обновляется. Она также разработала базы данных (например, InnateDB и Портал аллергии и астмы), чтобы помочь в более системном анализе иммунных нарушений и иммунного ответа на инфекции у людей и других животных - базы данных, которые помогли идентифицировать новые иммуномодулирующие препараты. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} У нее растет интерес к применению своих методов в экологических приложениях в рамках более широкого интереса к разработке подходов к более целостному, устойчивому контролю инфекционных заболеваний и сохранению микробиома - разработке подходов, которые могут меньше отбирать устойчивость к противомикробным препаратам, улучшать отслеживание патогенов и их происхождения и лучше учитывать важную роль социальных изменений и окружающей среды в формировании микробиомов. ^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 8 ]}^{[ 10 ]}

Награды

Член Королевского общества Канады (2018 г.) ^{[ 18 ]}
Высоко цитируемый исследователь Thomson Reuter (2014 г.) ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}
Сеть женщин-руководителей - 100 лучших в Канаде - законодатели моды и первопроходцы (2009 г.) ^{[ 22 ]}
Премия Фишера Канадского общества микробиологов (2007 г.) ^{[ 23 ]}
Старший научный сотрудник Фонда Майкла Смита по исследованиям в области здравоохранения (2007–2012 гг.) ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}
Новый исследователь Канадского института медицинских исследований (2005–2010 гг.) ^{[ 26 ]}
Канадский «Кто есть кто» (2005) ^{[ 27 ]}
Топ-40 Канады до 40 лет (2003) ^{[ 28 ]}
Совет по инновациям и науке Британской Колумбии (ныне Совет по инновациям Британской Колумбии ), Премия молодым новаторам (2003 г.) ^{[ 29 ]}
MIT Technology Review TR100 (2002) как один из 100 лучших новаторов мира в возрасте до 35 лет. ^{[ 30 ]}
Ученый Фонда Майкла Смита по исследованиям в области здравоохранения (2001–2006 гг.) ^{[ 24 ]}

Профессиональное обслуживание

Бринкман давно интересуется обучением биоинформатике, улучшением обработки биологических/биоинформатических данных и разработкой эффективных стандартов и баз данных биоинформатических данных. ^{[ 31 ]}^{[ 32 ]}^{[ 33 ]}^{[ 34 ]}^{[ 35 ]}^{[ 36 ]} включая Pseudomonas aeruginosa проект аннотаций сообщества ^{[ 37 ]} и база данных генома Pseudomonas .

Она возглавляет Научно-консультативный совет Европейского архива нуклеотидов (EMBL-EBI) и является членом нескольких других советов, включая Genome Canada . совет директоров ^{[ 38 ]} и Научно-консультативный совет РЕАКТОМА . Бринкман также является соруководителем проекта и консорциума комплексного быстрого анализа инфекционных заболеваний (IRIDA). ^{[ 39 ]} и является одним из основателей Консорциума онтологии геномной эпидемиологии (GenEpiO). ^{[ 40 ]} и онтология еды (FoodOn) ^{[ 41 ]} Группа.

В академическом сообществе Ванкувера Бринкман в настоящее время является содиректором программы подготовки выпускников биоинформатики, проводимой Университетом Саймона Фрейзера, Университетом Британской Колумбии и Раковым агентством Британской Колумбии , а также представителем СФУ в Канадском обществе микробиологов . Она является основным преподавателем канадских семинаров по биоинформатике .

Среди известных выпускников ее лаборатории — Дженнифер Гарди .

Личная биография

Дочь шотландских родителей, Бринкман родилась в Мельбурне , Австралия, в 1967 году. В детстве она иммигрировала в Канаду , где выросла в основном в Миссиссоге , Онтарио. Бринкман живет в Коквитламе со своей семьей, включая сына и дочь.

См. также

Список людей Университета Ватерлоо

Ссылки

^ «Лаборатория Фионы Бринкман — исследовательская лаборатория биоинформатики и геномики, любящая микробы, стремящаяся к более эффективному устойчивому контролю инфекционных заболеваний» . Brinkman.mbb.sfu.ca . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ Гарди, Дж. Л., К. Спенсер и др. (2003). PSORT-B: Улучшение прогнозирования субклеточной локализации белков грамотрицательных бактерий. Нуклеиновые кислоты Res 31:3613-7.
^ Гарди, Дж. Л., М. Лэрд, Ф. Чен, С. Рей, Си Джей Уолш, Дж. Э. Туснади, М. Эстер, FSL Бринкман (2005). PSORTb v.2.0: расширенный прогноз субклеточной локализации бактериальных белков и данные, полученные в результате сравнительного анализа протеома. Биоинформатика. 21:617-623.
^ Гарди, Дж. Л. и ФСЛ Бринкман (2006). Методы прогнозирования субклеточной локализации бактериальных белков. Обзоры природы по микробиологии 4:741-751.
^ Рей, С., Дж. Л. Гарди и ФСЛ Бринкман (2005). Оценка точности высокопроизводительных вычислительных и лабораторных подходов для полногеномной идентификации субклеточной локализации белков у бактерий. БМК Геномика 6:162
^ Сяо, WWL, К. Унг, Д. Эшлиман, Дж. Брайан, BB Финли и FSL Бринкман (2005). Доказательства большого нового генофонда, связанного с геномными островами прокариот. PLoS Генетика 1:e62.
^ Бринкман ФСЛ, Бланшар Дж.Л., Черкасов А., Греберг Х., Ав-Гей Ю., Бранхэм Р.К., Фернандес Р.К., Финли Б.Б., Отто С.П., Уэллетт БФФ, Килинг П.Дж., Роуз А.М., Хэнкок РЭВ, Джонс С.Дж. (2002) . Доказательства того, что растительные гены у видов Chlamydia отражают наследственное родство между Chlamydiaceae, цианобактериями и хлоропластами. Геномные исследования. 12:1159-1167.
^ Jump up to: ^а ^б Гилл Э. и ФСЛ Бринкман (2011). Пропорциональное отсутствие архейных патогенов: имеют ли фаги ключ к успеху? Биоэссе 33:248-254.
^ Хо Суй, С.Дж., Фединак, А., Ланжиль, MGI, Сяо, WW и FSL Бринкман (2009). Ассоциация факторов вирулентности с геномными островками. PLoS ONE 4:e8094.
^ Jump up to: ^а ^б Гарди, Дж.Л.*, Дж.К. Джонстон*, С.Дж. Хо Суй*, С.Дж. Джонс, В.Дж. Кук, Л. Шах, Э. Бродкин, С. Ремпел, М. Лем, М.К. Шарма, К. Элвуд, Ф.С.Л. Бринкман, Р.К. Брунэм и П. Тан (2011). Геномная эпидемиология вспышки туберкулеза: полногеномное секвенирование и анализ социальных сетей показывают динамику передачи (*эти авторы внесли равный вклад) The New England Journal of Medicine 364:730-739.
^ Бринкман, FSL, CK Stover и REW Hancock (2000). Решение для секвенирования: используйте добровольных аннотаторов, организованных через Интернет. Природа.406:933.
^ Стовер, К.К., XQ Фам, А.Л. Эрвин, С.Д. Мидзогучи, П. Уорренер, М.Дж. Хики, ФСЛ Бринкман, В.О. Хафнагл, DJ Ковалик, М. Лагру, Р.Л. Гарбер, Л. Голтри, Э. Толентино, С. Вестброк-Вадман , Юань, Л.Л. Броуди, С.Н. Коултер, К.Р. Фолджер, А. Кас, К. Ларбиг, Р. Лим, К. Смит, Д. Спенсер, Г.К.-С. Вонг, З. Ву, И. Полсен, Дж. Рейзер, М. Х. Сайер, РЭУ Хэнкок, С. Лори и М. В. Олсон (2000). Полная последовательность генома Pseudomonas aeruginosa PAO1: условно-патогенного патогена. Природа. 406: 959-964.
^ Ахтман, AHS Пилат, CW Лоу, DJ Lynn, Л. Джано, М. Майер, С. Ма, Дж. Киндрачук, Б. Б. Финли, FSL Бринкман, Г. К. Смит, REW Хэнкок, Л. Шофилд (2012). Эффективная дополнительная терапия с помощью врожденного защитного регуляторного пептида в доклинической модели тяжелой малярии. Научная трансляционная медицина 4:135ra64.
^ Консорциум по секвенированию и анализу генома крупного рогатого скота, К.Г. Элсик, Р.Л. Теллам, К.К. Уорли (2009). Последовательность генома тауринового крупного рогатого скота: окно в биологию и эволюцию жвачных животных. Наука. 24:522-528.
^ Линн, DJ, Г.Л. Винзор, К. Чан, Н. Ричард, М. Р. Лэрд, А. Барски, Дж. Л. Гарди, Ф. М. Рош, THW Чан, Н. Шах, Р. Ло, М. Насир, Дж. Ку, М. Яу, М. Акаб, Д. Тюльпан, М. Уайтсайд, А. Чикатамарла, Б. Мах, Т. М. Манцнер, К. Хокамп, РЭУ Хэнкок и ФСЛ Бринкман (2008). Содействие анализу системного уровня врожденного иммунного ответа млекопитающих. Молекулярная системная биология. 4:218.
^ О'Догерти К.К., Нойфельд Дж.Д., Бринкман ФСЛ, Гарднер Х., Гуттман Д.С. и Бейко Р.Г. (2014), Мнение: Сохранение и управление микробиомом человека. Труды Национальной академии наук США 111: 14312-14313.
^ Хо Суй, С. Дж., Р. Ло, А. Р. Фернандес, ЦРТ Колфилд, Дж. А. Лерман, Л. Се, П. Е. Борн, Д. Л. Бэйли и ФСЛ Бринкман (2012). Модулятор рецепторов эстрогена Ралоксифен снижает вирулентность Pseudomonas aeruginosa. Международный журнал противомикробных препаратов, 2012 г., 40:246-251.
^ «Пять преподавателей СФУ включены в стипендию и колледж Королевского общества Канады - Новости СФУ - Университет Саймона Фрейзера» . www.sfu.ca. Проверено 29 ноября 2018 г.
^ «Thomson Reuters объявляет самых влиятельных научных умов мира 2014» . Томсон Рейтер. Архивировано из оригинала 27 марта 2015 года.
^ «HCR Clarivate Analytics» . Highlycited.com . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «HCR Clarivate Analytics» . Thomsonreuters.com . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Самые влиятельные женщины Канады: 100 лучших» . Wxnetwork.com . WXN — Женская исполнительная сеть . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Канадское общество микробиологов – бывшие победители» . Csm-scm.org . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Фиона С.Л. Бринкман - Фонд Майкла Смита по исследованиям в области здравоохранения» . Msfhr.org . 18 декабря 2012 г. Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Биоинформатика патогенов и эволюция вирулентности микробов - Фонд исследований в области здравоохранения Майкла Смита» . Msfhr.org . 2 января 2007 г. Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Федеральное финансирование поддерживает исследования в области здравоохранения в СФУ – пресс-релизы канадского университета» . Canadian-universities.net . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Канадский кто есть кто» . Канадский «Кто есть кто» . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Программа награждения 40 лучших кандидатов в возрасте до 40 лет в Канаде — Caldwell Partners» . Caldwellpartners.com . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ Слот, Корри (7 ноября 2003 г.). «Приложение Business Media – Канада – Издательство – Полиграфия – Журнал – B2B» . Labcanada.com . Проверено 2 ноября 2017 г.
^ «Молодые новаторы до 35 лет, 2002: Фиона Бринкман, 34 года» . Обзор технологий . 2002 . Проверено 14 августа 2011 г.
^ Бринкман, FSL, CK Stover и REW Hancock (2000). Решение для секвенирования: используйте добровольных аннотаторов, организованных через Интернет. Природа. 406:933.
^ Винзор, Г., Р. Ло, С. Дж. Хо Суй, KSE Унг, С. Хуанг, Д. Ченг, В.-К. Хо Чинг, РЭВ Хэнкок и ФСЛ Бринкман (2005). База данных геномов Pseudomonas aeruginosa и PseudoCAP: содействие постоянно обновляемой аннотации генома на уровне сообщества. Исследования нуклеиновых кислот. 33: Д338-343.
^ Линн, DJ, К. Чан, М. Насир, М. Яу, Р. Ло, А. Срибная, Г. Ринг, Дж. Цю, К. Ви, Г. Л. Винзор, М. Р. Лэрд, К. Брейер, А. К. Форушани, ФСЛ Бринкман, РЭВ Хэнкок (2010). Курирование интерактома врожденного иммунитета. Системная биология BMC 4:117.
^ Орчард, С., Керриен, С., Аббани, С., Аранда, Б., Бхате, Дж., Бидвелл, С., Бридж, А., Бриганти, Л., Бринкман, ФСЛ, Чезарени, Г., Чатр-арьямонтри, А., Шотар, Э., Чен, К., Дюмуссо, М., Айзенберг, Д., Голл, Дж., Хэнкок, Р.Ю., Ханник, Л.И., Юришика, И., Хадаке, Дж., Линн, Д.Д., Махадеван, У., Перфетто, Л., Рагунат, А., Рикард-Блюм, С., Рехерт, Б., Салвински , Л., Стампфлен В., Тайерс М., Уетц П., Ксенариос И., Хермякоб, Х. (2012). Курирование данных о взаимодействии белков - Международный консорциум молекулярного обмена (IMEx). Природные методы 9:345-350.
^ Б. Аранда, Х. Бланкенбург, С. Керриен, ФСЛ Бринкман, А. Сеол, Э. Шотар, Дж. М. Дана, Дж. Де Лас Ривас, М. Дюмуссо, Э. Галеота, А. Голтон, Дж. Голл, REW Хэнкок, Р. Иссерлин, Р. К. Хименес, Дж. Керссемакерс, Дж. Хадаке, Д. Д. Линн, М. Мишо, Г. О'Келли, К. Оно, С. Орчард, К. Прието, С. Разик, О. Ригина , Л. Салвински, М. Симонович, С. Веланкар, А. Винтер, Г. Ву, Г. Д. Бадер, Г. Чезарени, И. М. Дональдсон, Д. Айзенберг, Г. Дж. Клейвегт, Дж. Оверингтон, С. Рикар-Блюм, М. Тайерс, М. Альбрехт и Х. Хермякоб (2011). PSICQUIC и PSISCORE – доступ и оценка молекулярных взаимодействий. Природные методы. 8:528-529.
^ Брейер, К., Форушани, А., Лэрд, М.Р., Чен, К., Срибная, А., Ло, Р., Винзор, Г.Л., Хэнкок, Р.В., Бринкман, ФСЛ, и Линн, Д. (2013) InnateDB : системная биология врожденного иммунитета и не только - последние обновления и постоянное курирование. Исследования нуклеиновых кислот. (Проблема с базой данных) 41: D1228-D1233.
^ «Проект аннотаций сообщества Pseudomonas» . www.pseudomonas.com . Проверено 29 ноября 2018 г.
^ «Фиона Бринкман | Геном Канады» . www.genomecanada.ca . Проверено 29 ноября 2018 г.
^ «IRIDA – Комплексный проект быстрого анализа инфекционных заболеваний» . www.irida.ca . Проверено 29 ноября 2018 г.
^ «Онтология геномной эпидемиологии» . Онтология геномной эпидемиологии . Проверено 29 ноября 2018 г.
^ «FoodOn от FoodOntology» . foodontology.github.io . Проверено 29 ноября 2018 г.

Внешние ссылки

«Лаборатория Фионы Бринкман — исследовательская лаборатория биоинформатики и геномики, любящая микробы, стремящаяся к более эффективному устойчивому контролю инфекционных заболеваний» . Brinkman.mbb.sfu.ca . Проверено 2 ноября 2017 г.
Публикации Фионы Бринкман, проиндексированные Google Scholar
«Добро пожаловать на psort.org!!» . Psort.org . Проверено 2 ноября 2017 г.
База данных геномов псевдомонад

[1] «Лаборатория Фионы Бринкман — исследовательская лаборатория биоинформатики и геномики, любящая микробы, стремящаяся к более эффективному устойчивому контролю инфекционных заболеваний» . Brinkman.mbb.sfu.ca . Проверено 2 ноября 2017 г.

[2] Гарди, Дж. Л., К. Спенсер и др. (2003). PSORT-B: Улучшение прогнозирования субклеточной локализации белков грамотрицательных бактерий. Нуклеиновые кислоты Res 31:3613-7.

[3] Гарди, Дж. Л., М. Лэрд, Ф. Чен, С. Рей, Си Джей Уолш, Дж. Э. Туснади, М. Эстер, FSL Бринкман (2005). PSORTb v.2.0: расширенный прогноз субклеточной локализации бактериальных белков и данные, полученные в результате сравнительного анализа протеома. Биоинформатика. 21:617-623.

[4] Гарди, Дж. Л. и ФСЛ Бринкман (2006). Методы прогнозирования субклеточной локализации бактериальных белков. Обзоры природы по микробиологии 4:741-751.

[5] Рей, С., Дж. Л. Гарди и ФСЛ Бринкман (2005). Оценка точности высокопроизводительных вычислительных и лабораторных подходов для полногеномной идентификации субклеточной локализации белков у бактерий. БМК Геномика 6:162

[6] Сяо, WWL, К. Унг, Д. Эшлиман, Дж. Брайан, BB Финли и FSL Бринкман (2005). Доказательства большого нового генофонда, связанного с геномными островами прокариот. PLoS Генетика 1:e62.

[7] Бринкман ФСЛ, Бланшар Дж.Л., Черкасов А., Греберг Х., Ав-Гей Ю., Бранхэм Р.К., Фернандес Р.К., Финли Б.Б., Отто С.П., Уэллетт БФФ, Килинг П.Дж., Роуз А.М., Хэнкок РЭВ, Джонс С.Дж. (2002) . Доказательства того, что растительные гены у видов Chlamydia отражают наследственное родство между Chlamydiaceae, цианобактериями и хлоропластами. Геномные исследования. 12:1159-1167.

[auto-8] Jump up to: ^а ^б Гилл Э. и ФСЛ Бринкман (2011). Пропорциональное отсутствие архейных патогенов: имеют ли фаги ключ к успеху? Биоэссе 33:248-254.

[9] Хо Суй, С.Дж., Фединак, А., Ланжиль, MGI, Сяо, WW и FSL Бринкман (2009). Ассоциация факторов вирулентности с геномными островками. PLoS ONE 4:e8094.

[auto1-10] Jump up to: ^а ^б Гарди, Дж.Л.*, Дж.К. Джонстон*, С.Дж. Хо Суй*, С.Дж. Джонс, В.Дж. Кук, Л. Шах, Э. Бродкин, С. Ремпел, М. Лем, М.К. Шарма, К. Элвуд, Ф.С.Л. Бринкман, Р.К. Брунэм и П. Тан (2011). Геномная эпидемиология вспышки туберкулеза: полногеномное секвенирование и анализ социальных сетей показывают динамику передачи (*эти авторы внесли равный вклад) The New England Journal of Medicine 364:730-739.

[11] Бринкман, FSL, CK Stover и REW Hancock (2000). Решение для секвенирования: используйте добровольных аннотаторов, организованных через Интернет. Природа.406:933.

[12] Стовер, К.К., XQ Фам, А.Л. Эрвин, С.Д. Мидзогучи, П. Уорренер, М.Дж. Хики, ФСЛ Бринкман, В.О. Хафнагл, DJ Ковалик, М. Лагру, Р.Л. Гарбер, Л. Голтри, Э. Толентино, С. Вестброк-Вадман , Юань, Л.Л. Броуди, С.Н. Коултер, К.Р. Фолджер, А. Кас, К. Ларбиг, Р. Лим, К. Смит, Д. Спенсер, Г.К.-С. Вонг, З. Ву, И. Полсен, Дж. Рейзер, М. Х. Сайер, РЭУ Хэнкок, С. Лори и М. В. Олсон (2000). Полная последовательность генома Pseudomonas aeruginosa PAO1: условно-патогенного патогена. Природа. 406: 959-964.

[13] Ахтман, AHS Пилат, CW Лоу, DJ Lynn, Л. Джано, М. Майер, С. Ма, Дж. Киндрачук, Б. Б. Финли, FSL Бринкман, Г. К. Смит, REW Хэнкок, Л. Шофилд (2012). Эффективная дополнительная терапия с помощью врожденного защитного регуляторного пептида в доклинической модели тяжелой малярии. Научная трансляционная медицина 4:135ra64.

[14] Консорциум по секвенированию и анализу генома крупного рогатого скота, К.Г. Элсик, Р.Л. Теллам, К.К. Уорли (2009). Последовательность генома тауринового крупного рогатого скота: окно в биологию и эволюцию жвачных животных. Наука. 24:522-528.

[15] Линн, DJ, Г.Л. Винзор, К. Чан, Н. Ричард, М. Р. Лэрд, А. Барски, Дж. Л. Гарди, Ф. М. Рош, THW Чан, Н. Шах, Р. Ло, М. Насир, Дж. Ку, М. Яу, М. Акаб, Д. Тюльпан, М. Уайтсайд, А. Чикатамарла, Б. Мах, Т. М. Манцнер, К. Хокамп, РЭУ Хэнкок и ФСЛ Бринкман (2008). Содействие анализу системного уровня врожденного иммунного ответа млекопитающих. Молекулярная системная биология. 4:218.

[16] О'Догерти К.К., Нойфельд Дж.Д., Бринкман ФСЛ, Гарднер Х., Гуттман Д.С. и Бейко Р.Г. (2014), Мнение: Сохранение и управление микробиомом человека. Труды Национальной академии наук США 111: 14312-14313.

[17] Хо Суй, С. Дж., Р. Ло, А. Р. Фернандес, ЦРТ Колфилд, Дж. А. Лерман, Л. Се, П. Е. Борн, Д. Л. Бэйли и ФСЛ Бринкман (2012). Модулятор рецепторов эстрогена Ралоксифен снижает вирулентность Pseudomonas aeruginosa. Международный журнал противомикробных препаратов, 2012 г., 40:246-251.

[18] «Пять преподавателей СФУ включены в стипендию и колледж Королевского общества Канады - Новости СФУ - Университет Саймона Фрейзера» . www.sfu.ca. Проверено 29 ноября 2018 г.

[19] «Thomson Reuters объявляет самых влиятельных научных умов мира 2014» . Томсон Рейтер. Архивировано из оригинала 27 марта 2015 года.

[highlycited.com-20] «HCR Clarivate Analytics» . Highlycited.com . Проверено 2 ноября 2017 г.

[21] «HCR Clarivate Analytics» . Thomsonreuters.com . Проверено 2 ноября 2017 г.

[22] «Самые влиятельные женщины Канады: 100 лучших» . Wxnetwork.com . WXN — Женская исполнительная сеть . Проверено 2 ноября 2017 г.

[23] «Канадское общество микробиологов – бывшие победители» . Csm-scm.org . Проверено 2 ноября 2017 г.

[msfhr.org-24] Jump up to: ^а ^б «Фиона С.Л. Бринкман - Фонд Майкла Смита по исследованиям в области здравоохранения» . Msfhr.org . 18 декабря 2012 г. Проверено 2 ноября 2017 г.

[25] «Биоинформатика патогенов и эволюция вирулентности микробов - Фонд исследований в области здравоохранения Майкла Смита» . Msfhr.org . 2 января 2007 г. Проверено 2 ноября 2017 г.

[26] «Федеральное финансирование поддерживает исследования в области здравоохранения в СФУ – пресс-релизы канадского университета» . Canadian-universities.net . Проверено 2 ноября 2017 г.

[27] «Канадский кто есть кто» . Канадский «Кто есть кто» . Проверено 2 ноября 2017 г.

[28] «Программа награждения 40 лучших кандидатов в возрасте до 40 лет в Канаде — Caldwell Partners» . Caldwellpartners.com . Проверено 2 ноября 2017 г.

[29] Слот, Корри (7 ноября 2003 г.). «Приложение Business Media – Канада – Издательство – Полиграфия – Журнал – B2B» . Labcanada.com . Проверено 2 ноября 2017 г.

[30] «Молодые новаторы до 35 лет, 2002: Фиона Бринкман, 34 года» . Обзор технологий . 2002 . Проверено 14 августа 2011 г.

[31] Бринкман, FSL, CK Stover и REW Hancock (2000). Решение для секвенирования: используйте добровольных аннотаторов, организованных через Интернет. Природа. 406:933.

[32] Винзор, Г., Р. Ло, С. Дж. Хо Суй, KSE Унг, С. Хуанг, Д. Ченг, В.-К. Хо Чинг, РЭВ Хэнкок и ФСЛ Бринкман (2005). База данных геномов Pseudomonas aeruginosa и PseudoCAP: содействие постоянно обновляемой аннотации генома на уровне сообщества. Исследования нуклеиновых кислот. 33: Д338-343.

[33] Линн, DJ, К. Чан, М. Насир, М. Яу, Р. Ло, А. Срибная, Г. Ринг, Дж. Цю, К. Ви, Г. Л. Винзор, М. Р. Лэрд, К. Брейер, А. К. Форушани, ФСЛ Бринкман, РЭВ Хэнкок (2010). Курирование интерактома врожденного иммунитета. Системная биология BMC 4:117.

[34] Орчард, С., Керриен, С., Аббани, С., Аранда, Б., Бхате, Дж., Бидвелл, С., Бридж, А., Бриганти, Л., Бринкман, ФСЛ, Чезарени, Г., Чатр-арьямонтри, А., Шотар, Э., Чен, К., Дюмуссо, М., Айзенберг, Д., Голл, Дж., Хэнкок, Р.Ю., Ханник, Л.И., Юришика, И., Хадаке, Дж., Линн, Д.Д., Махадеван, У., Перфетто, Л., Рагунат, А., Рикард-Блюм, С., Рехерт, Б., Салвински , Л., Стампфлен В., Тайерс М., Уетц П., Ксенариос И., Хермякоб, Х. (2012). Курирование данных о взаимодействии белков - Международный консорциум молекулярного обмена (IMEx). Природные методы 9:345-350.

[35] Б. Аранда, Х. Бланкенбург, С. Керриен, ФСЛ Бринкман, А. Сеол, Э. Шотар, Дж. М. Дана, Дж. Де Лас Ривас, М. Дюмуссо, Э. Галеота, А. Голтон, Дж. Голл, REW Хэнкок, Р. Иссерлин, Р. К. Хименес, Дж. Керссемакерс, Дж. Хадаке, Д. Д. Линн, М. Мишо, Г. О'Келли, К. Оно, С. Орчард, К. Прието, С. Разик, О. Ригина , Л. Салвински, М. Симонович, С. Веланкар, А. Винтер, Г. Ву, Г. Д. Бадер, Г. Чезарени, И. М. Дональдсон, Д. Айзенберг, Г. Дж. Клейвегт, Дж. Оверингтон, С. Рикар-Блюм, М. Тайерс, М. Альбрехт и Х. Хермякоб (2011). PSICQUIC и PSISCORE – доступ и оценка молекулярных взаимодействий. Природные методы. 8:528-529.

[36] Брейер, К., Форушани, А., Лэрд, М.Р., Чен, К., Срибная, А., Ло, Р., Винзор, Г.Л., Хэнкок, Р.В., Бринкман, ФСЛ, и Линн, Д. (2013) InnateDB : системная биология врожденного иммунитета и не только - последние обновления и постоянное курирование. Исследования нуклеиновых кислот. (Проблема с базой данных) 41: D1228-D1233.

[37] «Проект аннотаций сообщества Pseudomonas» . www.pseudomonas.com . Проверено 29 ноября 2018 г.

[38] «Фиона Бринкман | Геном Канады» . www.genomecanada.ca . Проверено 29 ноября 2018 г.

[39] «IRIDA – Комплексный проект быстрого анализа инфекционных заболеваний» . www.irida.ca . Проверено 29 ноября 2018 г.

[40] «Онтология геномной эпидемиологии» . Онтология геномной эпидемиологии . Проверено 29 ноября 2018 г.

[41] «FoodOn от FoodOntology» . foodontology.github.io . Проверено 29 ноября 2018 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]