Тканевый микрочип
Тканевые микрочипы (также ТМА ) состоят из парафиновых блоков, в которых до 1000 [1] отдельные ядра тканей собираются в виде массива, что позволяет проводить мультиплексный гистологический анализ .
История
[ редактировать ]Основные ограничения молекулярного клинического анализа тканей включают громоздкость процедур, ограниченную доступность диагностических реагентов и ограниченный размер выборки пациентов. Для решения этих проблем была разработана методика тканевого микрочипа.
Мультитканевые блоки были впервые представлены Х. Баттифорой в 1986 году с его так называемым «мультиопухолевым (колбасным) тканевым блоком» и модифицированы в 1990 году с его усовершенствованием, «тканевым блоком шахматной доски». В 1998 году Й. Кононен и соавторы разработали нынешняя методика, в которой используется новый подход к выборке образцов для получения тканей регулярного размера и формы, которые можно располагать более плотно и точно.
Процедура
[ редактировать ]В методе тканевого микрочипа полая игла используется для удаления сердцевин ткани диаметром до 0,6 мм из интересующих областей в парафиновых тканях, таких как клинические биопсии или образцы опухолей . Эти ядра тканей затем вставляются в парафиновый блок реципиента в точно расположенном порядке. Срезы из этого блока вырезают с помощью микротома , монтируют на предметное стекло микроскопа и затем анализируют любым методом стандартного гистологического анализа. Каждый блок микрочипов можно разрезать на 100–500 секций, которые можно подвергнуть независимым испытаниям. Тесты, обычно используемые в тканевых микрочипах, включают иммуногистохимию и флуоресцентную гибридизацию in situ . Тканевые микроматрицы особенно полезны при анализе образцов рака .
Одним из вариантов является массив замороженных тканей .
Использование в исследованиях
[ редактировать ]Использование тканевых микрочипов в сочетании с иммуногистохимией было предпочтительным методом изучения и проверки биомаркеров рака в различных определенных когортах больных раком . Возможность собрать большое количество репрезентативных образцов рака из определенной группы пациентов, которая также имеет соответствующую клиническую базу данных, предоставляет мощный ресурс для изучения того, как различные паттерны экспрессии белков коррелируют с различными клиническими параметрами. Поскольку образцы пациентов собираются в один блок, срезы можно окрашивать по одному и тому же протоколу, чтобы избежать экспериментальной изменчивости и технических артефактов. Клинические когорты больных раком и соответствующие наборы тканевых микрочипов использовались для изучения диагностических, прогностических и прогнозирующих лечение биомаркеров рака при большинстве форм рака, включая рак легких, молочной железы, колоректальный и почечно-клеточный рак. [2] [3] [4] [5]
Иммуногистохимия в сочетании с тканевым микрочипом также успешно использовалась в крупномасштабных усилиях по созданию карты экспрессии белков в более глобальном масштабе. [6]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Установка микрочипов основных тканей Йельского университета» . Архивировано из оригинала 10 мая 2009 года.
- ^ Гремель, Габриэла; Бергман, Джулия; Джурейнович, Дияна; Эдквист, Пер-Хенрик; Майндад, Викас; Бхарамбе, Бхавана М; Хан, Васиф Али З.А.; Навани, Санджай; Элебро, Джейкоб (01 января 2014 г.). «Систематический анализ обычно используемых антител в диагностике рака». Гистопатология . 64 (2): 293–305. дои : 10.1111/его.12255 . ISSN 1365-2559 . ПМИД 24330150 . S2CID 21225276 .
- ^ Кэмп, Роберт Л.; Ноймайстер, Вероника; Римм, Дэвид Л. (1 декабря 2008 г.). «Десятилетие тканевых микроматриц: прогресс в открытии и проверке биомаркеров рака». Журнал клинической онкологии . 26 (34): 5630–5637. дои : 10.1200/jco.2008.17.3567 . ISSN 0732-183X . ПМИД 18936473 .
- ^ Фредхольм, Ханна; Магнуссон, Кристина; Линдстрем, Линда С.; Гармо, Ганс; Филд, Соня Икер; Линдман, Хенрик; Берг, Йонас; Хольмберг, Ларс; Понтен, Фредрик (1 ноября 2016 г.). «Долгосрочные результаты у молодых женщин с раком молочной железы: популяционное исследование» . Исследование и лечение рака молочной железы . 160 (1): 131–143. дои : 10.1007/s10549-016-3983-9 . ISSN 0167-6806 . ПМК 5050247 . ПМИД 27624330 .
- ^ Гремель, Габриэла; Джурейнович, Дияна; Ниинивирта, Марджут; Лэрд, Александр; Юнгквист, Оскар; Йоханнессон, Хенрик; Бергман, Джулия; Эдквист, Пер-Хенрик; Навани, Санджай (4 января 2017 г.). «Стратегия систематического поиска идентифицирует кубилин как независимый прогностический маркер почечно-клеточного рака» . БМК Рак . 17 (1): 9. дои : 10.1186/s12885-016-3030-6 . ISSN 1471-2407 . ПМЦ 5215231 . ПМИД 28052770 .
- ^ Кампф, Кэролайн; Олссон, ИнгМари; Райберг, Урбан; Шёстедт, Эвелина; Понтен, Фредрик (31 мая 2012 г.). «Производство тканевых микроматриц, иммуногистохимическое окрашивание и оцифровка в атласе белков человека» . Журнал визуализированных экспериментов (63): e3620. дои : 10.3791/3620 . ISSN 1940-087X . ПМК 3468196 . ПМИД 22688270 .
- Баттифора H: Блок мультиопухолевой (колбасной) ткани: новый метод иммуногистохимического тестирования антител. Лаб Инвест 1986, 55:244-248.
- Баттифора Х., Мехта П.: Блок тканей в виде шахматной доски. Улучшенный блок управления несколькими тканями. Лаб Инвест 1990, 63:722-724.
- Кононен Дж., Бубендорф Л., Каллионими А., Барлунд М., Шрамл П., Лейтон С., Торхорст Дж., Михатч М.Дж., Заутер Г., Каллионими О.П.: Тканевые микрочипы для высокопроизводительного молекулярного профилирования образцов опухолей. Nat Med 1998, 4:844-847.
Внешние ссылки
[ редактировать ]
СМИ, связанные с тканевым микрочипом, на Викискладе? - Программа исследований массивов тканей Национального института рака
