Идиомарина loihiensis

Идиомарина loihiensis
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Гаммапротеобактерии
Заказ:	Альтеромонадалы
Семья:	Идиомариновые
Род:	Идиомарина
Разновидность:	И. loihiensis
Биномиальное имя
	Идиомарина loihiensis ; Доначи и др., 2003 г.

Idiomarina loihiensis — галофильная бактерия рода Idiomarina . ^{[ 1 ]} Это палочковидная грамотрицательная аэробная клетка с одним полярным жгутиком. Клетки обычно имеют ширину 0,35 мкм и длину 0,7–1,8 мкм, оптимальная температура роста составляет 4–46 ° C. Он был изолирован из гидротермального жерла на глубине 1300 м на подводном вулкане Камаэуаканалоа (ранее Лойхи) на Гавайях. ^{[ 2 ]}

Геном

Геном был секвенирован и содержит 2 839 318 пар оснований с содержанием GC 47,04%, кодирующих 2640 генов, кодирующих белок. ^{[ 3 ]} К ним относятся многие ферменты, участвующие в деградации и транспортировке аминокислот, что позволяет предположить, что эти бактерии используют белковые частицы, присутствующие в их естественной среде обитания. Геном также кодирует ферменты синтеза экзополисахаридов , которые могут использоваться для присоединения к этим частицам.

Ссылки

^ Айзава, Син-Ичи (16 декабря 2013 г.). Мир жгутиков: электронно-микроскопические изображения бактериальных жгутиков и связанных с ними поверхностных структур . Эльзевир. ISBN 978-0-12-417283-8 .
^ «Idiomarina loihiensis (штамм ATCC BAA-735/DSM 15497/L2-TR)» . www.uniprot.org . Проверено 14 декабря 2021 г.
^ Хоу, С.; Пила, Дж. Х.; Ли, Канзас; Фрейтас, Т.А.; Белайл, К.; Каварабаяси, Ю.; Доначи, СП; Пикина А.; Гальперин, М.Ю.; Кунин Е.В.; Макарова К.С.; Омельченко М.В.; Сорокин А.; Вольф, Ю.И.; Ли, QX; Кеум, Ю.С.; Кэмпбелл, С.; Денери, Дж.; Айзава, С.; Сибата, С.; Малахофф, А.; Алам, М. (декабрь 2004 г.). «Последовательность генома глубоководной гамма-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (52): 18036–41. Бибкод : 2004PNAS..10118036H . дои : 10.1073/pnas.0407638102 . ПМК 539801 . ПМИД 15596722 .

Внешние ссылки

Типовой штамм Idiomarina loihiensis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию

Эта об Alteromonadales статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Айзава, Син-Ичи (16 декабря 2013 г.). Мир жгутиков: электронно-микроскопические изображения бактериальных жгутиков и связанных с ними поверхностных структур . Эльзевир. ISBN 978-0-12-417283-8 .

[2] «Idiomarina loihiensis (штамм ATCC BAA-735/DSM 15497/L2-TR)» . www.uniprot.org . Проверено 14 декабря 2021 г.

[3] Хоу, С.; Пила, Дж. Х.; Ли, Канзас; Фрейтас, Т.А.; Белайл, К.; Каварабаяси, Ю.; Доначи, СП; Пикина А.; Гальперин, М.Ю.; Кунин Е.В.; Макарова К.С.; Омельченко М.В.; Сорокин А.; Вольф, Ю.И.; Ли, QX; Кеум, Ю.С.; Кэмпбелл, С.; Денери, Дж.; Айзава, С.; Сибата, С.; Малахофф, А.; Алам, М. (декабрь 2004 г.). «Последовательность генома глубоководной гамма-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (52): 18036–41. Бибкод : 2004PNAS..10118036H . дои : 10.1073/pnas.0407638102 . ПМК 539801 . ПМИД 15596722 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]