Христос Узунис
Христос Узунис | |
|---|---|
| Рожденный | Христос А. Узунис 1965 (58–59 лет) |
| Альма-матер | Университет Аристотеля в Салониках (бакалавр) Йоркский университет (магистр, доктор философии) |
| Научная карьера | |
| Поля | Вычислительная биология Системная биомедицина Биоинформатика Эволюция [ 1 ] |
| Учреждения | Европейская лаборатория молекулярной биологии НИИ Международный Европейский институт биоинформатики [ 2 ] Королевский колледж Лондона Центр исследований и технологий Эллады [ 3 ] |
| Диссертация | Роль консервации последовательности в предсказании структуры белка. (1993) |
| Докторантура | Крис Сандер |
| Веб-сайт | bcplab |
Христос А. Узунис — компьютерный биолог , директор по исследованиям в CERTH и профессор биоинформатики в Университете Аристотеля в Салониках . [ 4 ] [ 5 ] [ 1 ] [ 6 ]
Образование
[ редактировать ]Узунис получил степень бакалавра биологических наук в Университете Аристотеля в Салониках (AUTH) в 1987 году. [ 4 ] Затем он получил степень магистра наук. степень бакалавра биологических вычислений в Йоркском университете в 1988 г. [ 4 ] и продолжил работу над докторской диссертацией вместе с Крисом Сандером в Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге , Германия, получив докторскую степень в Йоркском университете в 1993 году. [ 4 ] [ 7 ]
Карьера и исследования
[ редактировать ]После получения докторской степени Узунис работал научным сотрудником программы Human Frontiers Science Programme (HFSP) в SRI International , Менло-Парк, Калифорния . Узунис открыл свою собственную лабораторию по исследованию компьютерной геномики в молекулярной биологии Европейской лаборатории Европейского института биоинформатики (EMBL-EBI) в 1996 году.
Затем он перевел свою лабораторию в Королевский колледж Лондона (KCL) в качестве профессора, председателя и директора Центра биоинформатики KCL в 2007 году. После реструктуризации Королевского колледжа в 2009/2010 году он вернулся в Грецию , присоединившись к CPERI в CERTH в Салониках. . В 2020 году он был назначен профессором биоинформатики в AUTH . Его исследовательские интересы включают структуру, функции и эволюцию генома, эволюцию функций белков, эволюцию систем обработки генетической информации, теорию и применение сравнения биологических последовательностей, представление данных и знаний для геномики, машинное обучение без учителя в очень больших наборах данных, биологические идеи. инженерия аппаратного и программного обеспечения (неопубликованные работы), синтетическая биология, экзобиология и научная коммуникация.
Некоторые из его наиболее известных вкладов в области вычислительной геномики включают автоматическое аннотирование последовательностей, [ 8 ] открытие методов геномного контекста, [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] вывод метаболических путей из последовательностей генома, [ 12 ] [ 13 ] разработка методов крупномасштабной кластеризации сходств последовательностей, [ 14 ] [ 15 ] определение Последнего Вселенского Общего Предка ( LUCA ) совместно с Никосом Кирпидом , [ 16 ] [ 17 ] и количественная оценка моделей горизонтального переноса генов через «сеть жизни». [ 18 ] Он также сохраняет большой интерес к развитию вычислительной биологии как образцовой парадигмы в истории современной науки. [ 19 ] основанный на его личном опыте развития биоинформатики в 1990-е годы. В качестве наставников он называет своего покойного отца Андреаса Узуниса†, Костаса Кастрициса†, Криса Сандера , Антуана Данчина и Карла Везе †.
His former PhD students include David Kreil (2001), [ нужна ссылка ] Антон Энрайт (2002) [ нужна ссылка ] Дж. М. Перегрин-Альварес (2003 г.), [ нужна ссылка ] Виктор Кунин (2004) [ нужна ссылка ] Никос Дарзенц (2005) [ нужна ссылка ] and Ignat Drozdov (2010). [ нужна ссылка ]
Награды и почести
[ редактировать ]Узунис — заместитель редактора журнала PLOS Computational Biology (с 2007 г.). Он также является заместителем редактора журнала BioSystems и почетным редактором журнала Bioinformatics . Он является одним из основателей Международного общества вычислительной биологии (ISCB), инициативы «Микробиокосмос» (Греция), Греческого общества вычислительной биологии и биоинформатики и Греческой биоинформатики . [ 4 ] Он является активным членом консорциума MetaSUB и членом правления Elixir-Europe . Он был приглашенным профессором в Университете Торонто (2011–2014).
Он также заядлый искатель приключений/фотограф и обученный инструктор по виндсерфингу/тренер-любитель RYA по виндсерфингу.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Публикации Христа Узуниса, проиндексированные Google Scholar
- ^ «От деревьев жизни к безмасштабным сетям: новый взгляд на эволюцию бактерий» . Европейский Союз, КОРДИС . КОРДИС , Европейский Союз .
- ^ «Биография Христа А. Узуниса» .
- ^ Jump up to: а б с д и «Консультативный совет фонда спасательных шлюпок» .
- ^ «Библиография Христа Узуниса» . Проверено 5 октября 2019 г.
- ^ Христа Узуниса Публикации из Europe PubMed Central
- ^ Узунис, Христос (1993). Роль консервации последовательности в предсказании структуры белка (кандидатская диссертация). Университет Йорка. OCLC 53486615 . EThOS uk.bl.ethos.387193 .
- ^ Казари, Г.; Андраде, Массачусетс; Борк, П.; Бойл, Дж.; Дарувар, А.; Узунис, К.; Шнайдер, Р.; Тамамес, Дж.; Валенсия, А.; Сандер, К. (24 августа 1995 г.). «Трудные времена для биоинформатики». Природа . 376 (6542): 647–648. Бибкод : 1995Natur.376..647C . дои : 10.1038/376647a0 . hdl : 10993/19513 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 7651513 . S2CID 25792350 .
- ^ Узунис, К.; Кирпидес, Н. (1996). «Появление основных клеточных процессов в эволюции» . Письма ФЭБС . 390 (2): 119–123. дои : 10.1016/0014-5793(96)00631-x . ISSN 0014-5793 . ПМИД 8706840 . S2CID 39128865 .
- ^ Тамамес, Дж.; Казари, Г.; Узунис, К.; Валенсия, А. (1997). «Консервативные кластеры функционально связанных генов в двух бактериальных геномах». Журнал молекулярной эволюции . 44 (1): 66–73. Бибкод : 1997JMolE..44...66T . дои : 10.1007/pl00006122 . ISSN 0022-2844 . ПМИД 9010137 . S2CID 26625775 .
- ^ Энрайт, Эй Джей; Илиопулос, И.; Кирпидес, Северная Каролина; Узунис, Калифорния (1999). «Карты взаимодействия белков для полных геномов, основанные на событиях слияния генов». Природа . 402 (11): 87–90. Бибкод : 1999Natur.402...86E . дои : 10.1038/47056 . ПМИД 10573422 . S2CID 4417772 .
- ^ Карп, П.Д.; Узунис, К.; Пейли, С. (1996). «HinCyc: база знаний о полном геноме и путях метаболизма H. Influenzae». Слушания. Международная конференция по интеллектуальным системам молекулярной биологии . 4 : 116–124. ISSN 1553-0833 . ПМИД 8877511 .
- ^ Карп, Питер Д.; Узунис, Христос А.; Мур-Кохлакс, Кэролайн; Голдовский, Леон; Кайпа, Паллави; Арен, Даг; Воскресение, София; Десятки, Никос; Сегодня, Виктор; Лопес-Бигас, Нурия (2005). «Расширение коллекции BioCyc баз данных путей/геномов до 160 геномов» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (19): 6083–6089. дои : 10.1093/nar/gki892 . ISSN 1362-4962 . ПМК 1266070 . ПМИД 16246909 .
- ^ Энрайт, Эй Джей; ван Донген, С.; Узунис, Калифорния (2002). «Эффективный алгоритм крупномасштабного обнаружения семейств белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (7): 1575–1584. дои : 10.1093/нар/30.7.1575 . ПМК 101833 . ПМИД 11917018 .
- ^ Кунин, Виктор; Арен, Даг; Голдовский, Леон; Янссен, Пол; Узунис, Христос А. (2005). «Измерение сохранения генома разных таксонов: разделенные штаммы и Соединенное королевство» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (2): 616–621. дои : 10.1093/nar/gki181 . ISSN 1362-4962 . ПМЦ 548337 . ПМИД 15681613 .
- ^ Кирпидес, Н.; Овербек, Р.; Узунис, К. (1999). «Универсальные семейства белков и функциональное содержание последнего универсального общего предка». Журнал молекулярной эволюции . 49 (4): 413–423. Бибкод : 1999JMolE..49..413K . дои : 10.1007/pl00006564 . ISSN 0022-2844 . ПМИД 10485999 . S2CID 14597850 .
- ^ Узунис, Христос А.; Кунин, Виктор; Дарзентас, Никос; Голдовский, Леон (2006). «Минимальная оценка содержания генов последнего универсального общего предка — экзобиология с земной точки зрения» . Исследования в области микробиологии . 157 (1): 57–68. дои : 10.1016/j.resmic.2005.06.015 . ISSN 0923-2508 . ПМИД 16431085 .
- ^ Кунин, Виктор; Голдовский, Леон; Дарзентас, Никос; Узунис, Христос А. (2005). «Сеть жизни: реконструкция микробной филогенетической сети» . Геномные исследования . 15 (7): 954–959. дои : 10.1101/гр.3666505 . ISSN 1088-9051 . ПМЦ 1172039 . ПМИД 15965028 .
- ^ Узунис, Христос А. (2012). «Взлет и упадок биоинформатики? Перспективы и прогресс» . PLOS Вычислительная биология . 8 (4): e1002487. Бибкод : 2012PLSCB...8E2487O . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002487 . ISSN 1553-7358 . ПМК 3343106 . ПМИД 22570600 .
| Международный | |
|---|---|
| академики | |