Антуан Даншен
Антуан Даншен | |
|---|---|
| Рожденный | 7 мая 1944 г. [1] |
| Национальность | Французский |
| Альма-матер | Высшая нормальная школа Институт Анри Пуанкаре Институт физико-химической биологии |
| Научная карьера | |
| Поля | Биоинформатика |
| Учреждения | Институт физико-химической биологии Политехническая школа Институт Пастера Университет Гонконга |
| Веб-сайт | www |
Антуан Даншен (родился 7 мая 1944 г.) — французский генетик . Он наиболее известен своими исследованиями в нескольких областях биологии, от структуры и функции аденилатциклазы до моделирования обучения нервной системы и раннего развития геномики и биоинформатики . Он является председателем стартапа AMAbiotics, который специализируется на метаболической биоремедиации и синтетической биологии. Он был директором отдела геномов и генетики Института Пастера в Париже, где возглавлял отдел генетики бактериальных геномов.
Ранняя жизнь и карьера
[ редактировать ]Он получил образование математика в Институте Анри Пуанкаре и физика в Высшей нормальной школе . Работая сначала с Милдред Кон , Марианной Грюнберг-Манаго и Ионелом Соломоном в области ядерного магнитного резонанса экспериментатором , Данчин стал микробиологом- в начале семидесятых. в Париже, Франция, он создал Вместе с Филиппом Куррежом и Жан-Пьером Шанже в Физико-химическом институте биологии рабочий семинар, на котором они вместе работали над построением математических моделей обучения и памяти. [2]
Заинтересовавшись университетским обучением, он вместе с Морисом Героном организовал первый семестр биологии в Политехнической школе и развивал свое преподавание в течение четырех лет. Среди его первых учеников можно найти Дэниела Кана, Патрика Чарне и многих других. Основная цель его исследований заключалась в том, чтобы попытаться понять, как гены могут коллективно функционировать в клетке. Это привело его к работе над системами регуляции, которые контролируют глобальную экспрессию генов у бактерий. Часть его работ была посвящена изучению ферментов, синтезирующих циклический АМФ. Он установил эталонную классификацию аденилатциклаз. [3] аденилатциклазы после того, как его лаборатория успешно клонировала и секвенировала гены токсина из коклюша . возбудителя [4] а также от возбудителя сибирской язвы . [5] Эта работа побудила его задуматься об этических аспектах практики молекулярной генетики и геномики в то время, когда это не считалось важным. [6]
Данчин начал в 1985 году сотрудничество с учеными-компьютерщиками для оценки методов искусственного интеллекта для изучения комплексных проблем молекулярной генетики . [7] Это убедило его в том, что пришло время исследовать геномы в целом, при условии, что параллельно будут начаты важные усилия в области компьютерных наук ( в кремниевой биологии). В начале 1987 года он предложил провести программу секвенирования Bacillus subtilis . Это предложение было реализовано в результате совместных европейских усилий по изучению этого генома, начавшихся в 1988 году. Полная последовательность была опубликована в 1997 году. [8] Первым значительным и неожиданным открытием этой работы стало в 1991 году то, что многие гены (на тот момент половина генов) имели совершенно неизвестную функцию. Это побудило его попытаться организовать биоинформатику во Франции с помощью нескольких коллег из университетов, CNRS и INRIA , посредством создания общенациональной группы GDR 1029 (1991–1995) и впоследствии посредством координации программы биоинформатики Groupement. de Recherche et d'Etudes des Genomes (1992–1996), затем в Координационном комитете живых наук (1998–2000). Повторное секвенирование и повторная аннотация генома B. subtilis были завершены в 2009 году с целью обновления последовательности и аннотации этого эталонного генома . [9]
В 2000 году Данчин создал Исследовательский центр HKU-Пастера в Гонконге, предназначенный для развития микробной геномики в регионе, при помощи Комиссии по инновациям и технологиям правительства САР Гонконг для развития биоинформатики (программа Биоподдержка). [10]
Данчин сейчас развивает теоретические размышления и эксперименты в области синтетической биологии . [11] пытаясь ясно объяснить идею о том, что клетки ведут себя как компьютеры ( машины Тьюринга ), создающие компьютеры. [12] Вместе с Виктором де Лоренцо он создал журнал Symplectic Biology в свободном и открытом доступе , посвященный публикации инновационных идей в области системной и синтетической биологии. [13]
Antoine Danchin — отец Рафаэля Даншена .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «АКАДЕМИЯ НАУК ВЫБИРАЕТ 17 НОВЫХ ЧЛЕНОВ» (PDF) . Академия наук. 10 декабря 2013 г. Архивировано из оригинала (PDF) 27 апреля 2014 г. . Проверено 13 июня 2014 г.
- ^ Шанжё, Ж.-П.; Курреж, П.; Данчин, А. (1 октября 1973 г.). «Теория эпигенеза нейрональных сетей путем избирательной стабилизации синапсов» . Труды Национальной академии наук . 70 (10): 2974–2978. Бибкод : 1973PNAS...70.2974C . дои : 10.1073/pnas.70.10.2974 . ПМК 427150 . ПМИД 4517949 .
- ^ Данчин, А (1993). «Филогения аденилатциклаз». Достижения в области исследований второго мессенджера и фосфопротеинов . 27 : 109–62. ПМИД 8418825 .
- ^ Глейзер, П; Ладант, Д; Сезер, О; Пишо, Ф; Ульманн, А; Данчин, А. (январь 1988 г.). «Кальмодулин-чувствительная аденилатциклаза Bordetella pertussis: клонирование и экспрессия в Escherichia coli». Молекулярная микробиология . 2 (1): 19–30. дои : 10.1111/j.1365-2958.1988.tb00003.x . ПМИД 2897067 . S2CID 205365386 .
- ^ Эскуайер, Винсент; Дюфло, Эдит; Сезер, Одиль; Данчин, Антуан; Мок, Мишель (ноябрь 1988 г.). «Структурная гомология между бактериальными аденилатциклазами, связанными с вирулентностью». Смущенный . 71 (2): 293–298. дои : 10.1016/0378-1119(88)90045-5 . ПМИД 2906312 .
- ^ Данчин, Антуан (февраль 2002 г.). «Не всякая правда хороша: опасность публикации знаний о потенциальном биологическом оружии» . Отчеты ЭМБО . 3 (2): 102–104. дои : 10.1093/embo-reports/kvf040 . ПМК 1083978 . ПМИД 11839688 .
- ^ Гаскуэль, Оливье; Данчин, Антуан (декабрь 1986 г.). «Экспорт белка у прокариот и эукариот: признаки разницы в механизме экспорта». Журнал молекулярной эволюции . 24 (1–2): 130–142. Бибкод : 1986JMolE..24..130G . дои : 10.1007/BF02099961 . ПМИД 3104613 . S2CID 931622 .
- ^ Кунст, Ф.; и др. (ноябрь 1997 г.). «Полная последовательность генома грамположительной бактерии Bacillus subtilis» (PDF) . Природа . 390 (6657): 249–256. Бибкод : 1997Natur.390..249K . дои : 10.1038/36786 . ПМИД 9384377 . S2CID 205025258 .
- ^ Барб, Валери; Крювейе, Стефан; Кунст, Фрэнк; Ленобль, Патрисия; Мерис, Гийом; Сековская, Агнешка; Валленет, Дэвид; Ван, Тинчжан; Мошер, Иван; Медиг, Клодин; Данчин, Антуан (1 июня 2009 г.). «От последовательности консорциума к унифицированной последовательности: эталонный геном Bacillus subtilis 168 десятилетие спустя» . Микробиология . 155 (6): 1758–1775. дои : 10.1099/mic.0.027839-0 . ПМЦ 2885750 . ПМИД 19383706 .
- ^ «Добро пожаловать на веб-страницу Биоподдержки» . 19 сентября 2009 года. Архивировано из оригинала 19 сентября 2009 года . Проверено 28 мая 2021 г.
- ^ де Лоренцо, Виктор; Данчин, Антуан (сентябрь 2008 г.). «Синтетическая биология: открытие новых миров и новых слов: новые и не очень новые аспекты этой развивающейся области исследований» . Отчеты ЭМБО . 9 (9): 822–827. дои : 10.1038/embor.2008.159 . ПМК 2529360 . ПМИД 18724274 .
- ^ Данчин, Антуан (январь 2009 г.). «Бактерии как компьютеры, создающие компьютеры» . Обзоры микробиологии FEMS . 33 (1): 3–26. дои : 10.1111/j.1574-6976.2008.00137.x . ПМК 2704931 . ПМИД 19016882 .
- ^ «Симплектическая биология: краткие исследовательские заметки в области системной и синтетической биологии» (PDF) .
Избранные работы
[ редактировать ]- Дельфийская лодка: что нам говорят геномы , перевод Элисон Куэйл, издательство Гарвардского университета , 2003.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Институт физико-химической биологии
- Справочная классификация аденилатциклаз
- «Создание Исследовательского центра ХКУ-Пастер» . Архивировано из оригинала 12 сентября 2009 года . Проверено 21 августа 2009 г.
- Ссылки на PubMed ( бесплатные полнотекстовые ссылки )
- «Биоподдержка» . Архивировано из оригинала 19 сентября 2009 года . Проверено 23 сентября 2009 г.
- АМАбиотикс САС
| Международный | |
|---|---|
| Национальный | |
| академики | |
| Другой | |
