Naba Family
Семейство NABA ( TC# 2.A.34 ) принадлежит к суперсемейству ионного транспортера (ИТ) . [ 1 ] Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству nhab, можно найти в базе данных классификации Transporter .
Гомологи-гомологов, как правило, составляют около 500 аминоацильных остатков (AAS) в длину и имеют около 12 трансмембранных альфа-списках (TMS), хотя некоторые члены отличаются по количеству TMS. Гомологи nhab также демонстрируют область с ограниченным сходством последовательностей с мембранным белком 46 кДа неизвестной функции от микобактерии лепраэ (SPP46838), который также гомологичен члену устойчивости к арсенату бактерий , археи и эукариотов ( TC# 3.A.4. ) Только грамотрицательные бактериальные белки были функционально охарактеризованы.
E. coli nhab на 58% идентична ортологичному Vibrio alginolyticus na + /ЧАС + Антипортер. [ 2 ] Хотя предсказывается, что последний белок будет иметь 10 TMS, построение слияний naby-phoa привела к доказательствам модели 9 TMS с N-концевой конец в цитоплазме и C-конце в периплазме . [ 3 ] Основанный в центре аспартия в 3 -м TMS сохраняется во всех членах семьи и важна для деятельности. [ 4 ]
Генерализованная транспортная реакция, катализируемая nabe of E. coli, составляет:
2 NA + (в) + 3 ч + (Out) ⇌ 2 на + (OUT) + 3 ч + (в).
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Пракаш, Шраддха; Купер, Гаррет; Сингхи, Суйя; Saier, Milton H. (2003-12-03). «Суперсемейство ионо -транспортер». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes . 1618 (1): 79–92. doi : 10.1016/j.bbamem.2003.10.010 . ISSN 0006-3002 . PMID 14643936 .
- ^ Pinner, E.; Padan, E.; Schuldiner, S. (1992-06-05). «Клонирование, секвенирование и экспрессия гена nhab, кодируя антипортер Na+/H+ в Escherichia coli» . Журнал биологической химии . 267 (16): 11064–11068. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 49875-x . ISSN 0021-9258 . PMID 1317851 .
- ^ Enomoto, H.; Unemoto, T.; Nishibuchi, M.; Padan, E.; Накура Т. (1998-03-06). «Топологическое исследование антипортера Vibrio alginolyticus nhab+/h с использованием слияний генов в клетках Escherichia coli » Biochimics et biophyca acta (bba) - viombres 1370 (1): 77–8 Doi : 10.1016/s0005-2736 (97) 0245-9 ISSN 0006-3 PMID 9518558
- ^ Накура, Т.; Fujisaki, Y.; Enomoto, H.; Nakayama, Y.; Takabe, T.; Yamaguchi, N.; Uozumi, N. (2001-10-01). «Рейду Асират-147 из третьей области трансмематемельны антипортера Na (+)/H (+) щетчатого щетки из вибрио-альгинолитика, который является ролью в ее активности » Журнал бактериологии 183 (19): 5762–5 Doi : 10.1128/ jb.183.19.5762-5767.2 ISSN 0021-9 PMC 95471 PMID 115444242
На этом редактировании этой статье используется контент из 2.a.34 в . « Под GFDL . Все соответствующие условия должны соблюдаться.