РНК дрозофилы roX
| дрозофилы нкРНК roX1 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура РНК roX1 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | roX1 |
| Рфам | RF01667 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Цис -регуляторный элемент |
| Домен(ы) | Дрозофила |
| PDB Структуры | ПДБе |
RoX РНК представляет собой некодирующую РНК (нкРНК), присутствующую в мужском летальном комплексе (MSL) и необходимую для компенсации половой дозы у дрозофилы . Поскольку самцы содержат только одну Х-хромосому , дозы самцов мух компенсируют Х-хромосому за счет гипертранскрипции Х-хромосомы. Это достигается за счет связывания комплекса MSL с Х-хромосомой и индукции гистона лизина 16 ацетилирования H4 , что позволяет образовывать эухроматин . [ 1 ] [ 2 ] Эти нкРНК были впервые обнаружены в РНК, выделенной из нейрональных клеток. [ 3 ] [ 4 ]
Две roX РНК были идентифицированы в комплексе MSL Drosophila melanogaster , и было показано, что они консервативны у разных видов дрозофил. Было показано, что две roX РНК, известные как roX1 и roX2, различаются по первичной последовательности и длине последовательности, но, несмотря на эти различия, они обе содержат сайт связывания MSL и функционально избыточны. [ 5 ] [ 6 ] Клонирование генов roX и последующее выравнивание последовательностей ряда различных видов дрозофил выявило несколько консервативных областей , а также было замечено, что РНК roX присутствует только у самцов мух. [ 7 ]
вторичной структуры Прогнозы стволовой петли предсказывали наличие на 3'- конце транскриптов РНК roX. Было показано, что мутагенез в этой области, который либо изменял последовательность, либо предотвращал образование стволовой петли, был смертельным для самцов мух, поскольку они не могли компенсировать дозу, поскольку эти мутации предотвращали связывание MSL с X-хромосомой. Было также показано, что в присутствии мутантной roX РНК комплекс MSL не способен локализоваться на Х-хромосоме и неправильно локализоваться в гетерохроматическом хромоцентре. Это предполагает, что roX РНК играет роль в направлении комплекса MSL к Х-хромосоме. [ 7 ] Выравнивание последовательностей roX2 выявило несколько областей консервативности последовательности, известных как области Gub и отсутствующих в roX1. Многие из этих областей Gub считаются избыточными, поскольку мутации не оказывают никакого эффекта, однако Gub1, который присутствует в 3'-области петли стебля, считается ключевым мотивом, необходимым для roX2, поскольку было показано, что мутации Gub1 летальны. Эти исследования показывают, что РНК roX необходима для компенсации дозировки, при этом 3'- область стволовой петли в РНК roX имеет решающее значение для локализации MSL, и считается, что это мотив, который позволяет двум РНК roX быть функционально избыточными.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Меллер, В.; Гордадзе П.; Парк, Ю.; Чу, X.; Штукенхольц, К.; Келли, Р.; Курода, М. (февраль 2000 г.). «Упорядоченная сборка roX РНК в комплексы MSL на дозово-компенсированной Х-хромосоме у дрозофилы» . Современная биология . 10 (3): 136–143. дои : 10.1016/S0960-9822(00)00311-0 . ISSN 0960-9822 . ПМИД 10679323 .
- ^ Хамада, Н.; Парк, Дж.; Гордадзе Р.; Курода, И. (октябрь 2005 г.). «Глобальная регуляция генов Х-хромосомы комплексом MSL у Drosophila melanogaster» (бесплатный полный текст) . Гены и развитие . 19 (19): 2289–2294. дои : 10.1101/gad.1343705 . ISSN 0890-9369 . ПМК 1240037 . ПМИД 16204180 .
- ^ Меллер В.; Ву К; Роман Г.; Курода М; Дэвис Р. (1997). «РНК roX1 окрашивает Х-хромосому самцов дрозофилы и регулируется системой дозовой компенсации» . Клетка . 88 (4): 445–457. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81885-1 . ПМИД 9038336 .
- ^ Амрейн Х., Аксель Р. (1997). «Гены, экспрессируемые в нейронах взрослых самцов дрозофилы» . Клетка . 88 (4): 459–469. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81886-3 . ПМИД 9038337 .
- ^ Франке, А.; Бейкер, Б. (июль 1999 г.). «РНК rox1 и rox2 являются важными компонентами компенсасомы, которая обеспечивает компенсацию дозы у дрозофилы» . Молекулярная клетка . 4 (1): 117–122. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80193-8 . ISSN 1097-2765 . ПМИД 10445033 .
- ^ Меллер, Х.; Раттнер, П. (март 2002 г.). «Гены roX кодируют избыточные летальные транскрипты, специфичные для самцов, необходимые для нацеливания на комплекс MSL» . Журнал EMBO (бесплатный полный текст). 21 (5): 1084–1091. дои : 10.1093/emboj/21.5.1084 . ISSN 0261-4189 . ПМЦ 125901 . ПМИД 11867536 .
- ^ Jump up to: а б Парк, В.; Канг, Э.; Сипула, Г.; Чой, Дж.; Ох.; Парк, Ю. (ноябрь 2007 г.). «Эволюционно консервативный домен РНК roX2 достаточен для индукции ацетилирования H4-Lys16 на X-хромосоме дрозофилы» (бесплатный полный текст) . Генетика . 177 (3): 1429–1437. doi : 10.1534/genetics.107.071001 . ISSN 0016-6731 . ПМК 2147973 . ПМИД 18039876 .