Sam-Chlorobi RNA Motif
 |
| Сэм-хлорби РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура RNA Sam-Chlorobi | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Сэм-хлорби РНК |
| RFAM | RF01724 |
| Другие данные | |
| РНК тип | Цис -регуляторный элемент |
| Домен (ы) | Хлоробиот |
| PDB Структуры | PDBE |
РНК -мотив SAM-Chlorobi представляет собой консервативную РНК- структуру, которая была идентифицирована биоинформатикой . [ 1 ] РНК обнаружены только у бактерий, классифицированных как в рамках филовой хлорбиоты . Эти РНК всегда находятся в 5 'нетранслируемых областях оперонов , которые содержат metk и ahcy гены . Гены MetK кодируют метионин аденозилтрансферазу , которая синтезирует S-аденозилметионин (SAM), а Ahcy гены кодируют S-аденозилгомоцистеин гидролазу , которая разлагает связанный метаболит S-аденозил-L-гомоцистеин (SAH). Фактически всем предсказали гены Метка и Ахи в бактериях хлорбиоты по состоянию на 2010 год, предшествуют предсказанные РНК Sam-Chlorobi. [ 1 ] Прогнозируемые промоторные последовательности последовательно обнаруживаются вверх по течению от RNAS Sam-Chlorobi, [ 1 ] И эти промоторные последовательности подразумевают, что RNA Sam-Chlorobi действительно транскрибируются как РНК. Промоторные последовательности обычно ассоциируются с сильной транскрипцией в филахлобиоте и бактероидоте , но не используются большинством линий бактерий. Размещение RNAS Sam-Chlorobi предполагает, что они участвуют в регуляции оперона Metk/Ahcy с помощью неизвестного механизма.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика выявляет 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, археи и их метагеномов» . Геном биол . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC 2864571 . PMID 20230605 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта молекулярной или клеточной биологии статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |