Атипичные SLCS
 | Эта статья может быть слишком технической для большинства читателей, чтобы понять . ( Август 2017 ) |
Семейства атипичных растворенных носителей (атипичные SLC) являются новыми вероятными вторичными активными или способствующими белкам транспортера, которые разделяют исконные фоны с известными семействами растворенных носителей (SLC) . Тем не менее, им не было назначено имя в соответствии с корневой системой SLC или были классифицированы по какой -либо из существующих семей SLC. [ 1 ] [ 2 ]
Атипичные крупные фасилитаторы суперсемейства транспортных семейств
[ редактировать ]Большинство атипичных SLC - это семьи в рамках основного суперсемейства фасилитатора (MFS). [ 3 ] Эти нетипичные SLC являются вероятными вторичными активными или способствующими белкам транспортера, которые имеют происхождение с известными носителями растворенного вещества . [ 1 ] [ 2 ] [ 4 ] Они, однако, не названы в соответствии с корневой системой SLC или классифицируются по какой -либо из существующих семей SLC. [ 1 ] ATMF классифицируются на основе их сходства последовательностей и филогенетической близости. [ 3 ]
| Amtf | Члены семьи | Семья SLC |
|---|---|---|
| AMTF1 | MFSD9, MFSD10, MFSD14A, MFSD14B | SLC46 |
| Amtf2 | MFSD8 | |
| Amtf3 | MFSD4A, MFSD4B | |
| AMTF4 | CLN3 | |
| AMTF5 | MFSD7 | SLC49 |
| AMTF6 | MFSD1, MFSD5 | |
| AMTF7 | MFSD12 | |
| Amtf8 | MFSD2A, MFSD2B | |
| AMTF9 | SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL | SLC22 |
| AMTF10 | MFSD11, UNC93A, UC93B1 | |
| AMTF11 | Spns1, spns2, spns3 | |
| AMTF12 | MFSD13A | |
| AMTF13 | MFSD6 | |
| AMTF14 | MFSD6L | |
| AMTF15 | MFSD3 |
Some Atypical SLC of MFS type are: OCA2 , CLN3 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3, SV2A , SV2B , SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1 , MFSD2A , MFSD2B, MFSD3 , MFSD4A, [ 5 ] MFSD4B, MFSD5 , MFSD6, MFSD6L, MFSD8 , MFSD9 , [ 5 ] MFSD10, MFSD11 , MFSD12, MFSD13A, MFSD14A , MFSD14B , UC93A [ 6 ] и UNC93B1 . Все это нетипичные SLC, обнаруженные в основном суперсемействе . Также TMEM104 (клан APC), OCA2 (IT CLAN) и CLN3 (не имеют клана) являются атипичными SLC у людей. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Не-MFS Transport Families
[ редактировать ]Хотя большинство атипичных SLC взяты из основного суперсемейства фасилитатора, есть исключения: TMEM104 ( Superbamily APC ), OCA2 (IT Superbamily) и CLN3 (неизвестная суперсемейство). [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Perland E, Fredriksson R (март 2017 г.). «Классификационные системы вторичных активных транспортеров». Тенденции в фармакологических науках . 38 (3): 305–315. doi : 10.1016/j.tips.2016.11.008 . PMID 27939446 .
- ^ Jump up to: а беременный Sreedharan S, Stephansson O, Schiöth HB, Fredriksson R (июнь 2011 г.). «Длинное эволюционное сохранение и значительная тканевая специфичность нескольких атипичных переносчиков растворенного носителя». Ген . 478 (1–2): 11–18. doi : 10.1016/j.gene.2010.10.011 . PMID 21044875 .
- ^ Jump up to: а беременный Perland E, Bagchi S, Klaesson A, Fredriksson R (сентябрь 2017 г.). «Характеристики 29 новых атипичных растворенных носителей из основного типа суперсемейства основных способностей: эволюционная сохранение, прогнозируемая структура и коэкспрессия нейронов» . Открытая биология . 7 (9): 170142. DOI : 10.1098/rsob.170142 . PMC 5627054 . PMID 28878041 .
- ^ Höglund PJ, Nordström KJ, Schiöth HB, Fredriksson R (апрель 2011 г.). «Семейства носителей растворенного вещества имеют удивительно длинную эволюционную историю с большинством человеческих семей, присутствующих до расхождения билатерианских видов» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (4): 1531–1541. doi : 10.1093/molbev/msq350 . PMC 3058773 . PMID 21186191 .
- ^ Jump up to: а беременный Perland E, Hellsten SV, Schweizer N, Arapi V, Rezayee F, Bushra M, Fredriksson R (2017). «Структурное предсказание двух новых человеческих атипичных транспортеров SLC, MFSD4A и MFSD9 и их нейроанатомического распределения у мышей» . Plos один . 12 (10): E0186325. BIBCODE : 2017PLOSO..1286325P . doi : 10.1371/journal.pone.0186325 . PMC 5648162 . PMID 29049335 .
- ^ Седер М.М., Лехольм Е., Хеллстен С.В., Перэрдленд Э., Фредрикссон Р. (2017). «Нейрональные и периферические мембраны, связанные с мембраной UNC93A, реагируют на доступность питательных веществ у мышей» . Границы в молекулярной нейробиологии . 10 : 351. DOI : 10.3389/fnmol.2017.00351 . PMC 5671512 . PMID 29163028 .
- ^ «TMEM104 Трансмембранной белок 104 [Homo sapiens (человек)] - ген - ncbi» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2022-03-14 .
- ^ «OCA2 OCA2 Меланосомный трансмембранной белок [Homo Sapiens (человек)] - ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2022-03-14 .
- ^ «CLN3 CLN3 Лизосомный/эндосомный трансмембранный белок, батенин [Homo Sapiens (человек)] - ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2022-03-14 .
 | Эта Genetics статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |