Дифференциально метилированная область
Дифференциально метилированные области (DMR) представляют собой области генома с разным статусом метилирования ДНК в разных биологических образцах и рассматриваются как возможные функциональные области, участвующие в регуляции транскрипции генов . Биологические образцы могут представлять собой разные клетки/ткани одного и того же человека, одни и те же клетки/ткани в разное время, клетки/ткани от разных людей и даже разные аллели в одной и той же клетке. [1]
ДНК в основном метилируется в CpG-сайте , который представляет собой цитозин, за которым следует гуанин . Буква «p» относится к фосфатному линкеру между ними. DMR обычно включает соседние сайты или группу сайтов, расположенных близко друг к другу, которые имеют разные модели метилирования в разных образцах. Островки CpG , по-видимому, не метилированы в большинстве нормальных тканей, однако они сильно метилированы в раковых тканях. [1]
Существует несколько различных типов DMR. К ним относятся тканеспецифический DMR (tDMR), специфичный для рака DMR (cDMR), стадии развития (dDMR), специфичный для перепрограммирования DMR (rDMR), аллель-специфичный DMR (AMR) и специфичный для старения DMR (aDMR). [1] Метилирование ДНК связано с клеток дифференцировкой и пролиферацией . [2]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Ракян В.К.; Вниз, ТА; Балдинг, диджей; Бек, С. (12 июля 2011 г.). «Общеэпигеномные исследования ассоциаций распространенных заболеваний человека» . Обзоры природы. Генетика . 12 (8): 529–41. дои : 10.1038/nrg3000 . ПМЦ 3508712 . ПМИД 21747404 .
- ^ Рейк, Вт ; Дин, В; Уолтер, Дж. (10 августа 2001 г.). «Эпигенетическое перепрограммирование в развитии млекопитающих». Наука . 293 (5532): 1089–93. дои : 10.1126/science.1063443 . ПМИД 11498579 .