Jump to content

Шиладитья ДасСарма

Шиладитья ДасСарма
Рожденный ( 1957-11-11 ) 11 ноября 1957 г. (66 лет)
Национальность Американский (Натурализованный)
Образование Университет Индианы ( BS )
Массачусетский технологический институт ( доктор философии )
Занятие Профессор
Работодатель Университет Мэриленда в Балтиморе
Известный Галоархея , Действия по борьбе с изменением климата
Награды Маргарет Маквикар Премия

Шиладитья ДасСарма (родился 11 ноября 1957 г.) — молекулярный биолог, известный своим вкладом в биологию галофильных и экстремофильных микроорганизмов. [1] [2] Он является профессором Мэрилендского университета в Балтиморе . Он получил степень доктора биохимии в Массачусетском технологическом институте и степень бакалавра химии в Университете Индианы в Блумингтоне . Прежде чем занять должность преподавателя, он проводил исследования в Массачусетской больнице общего профиля , Гарвардской медицинской школе и Институте Пастера в Париже.

ДасСарма работал на факультете Массачусетского университета в Амхерсте (1986–2001), Института биотехнологии Университета Мэриленда (2001–2010) и Медицинской школы Университета Мэриленда , Института морских и экологических технологий (2010 – настоящее время). Он является исследователем и преподавателем молекулярной генетики, геномики и биоинформатики , а также наставником студентов, аспирантов и докторантов, а также младших преподавателей. Он широко известен тем, что сыграл важную роль в создании области галофилов. [3] и исследования экстремофилов.

Исследования [ править ]

Галофилы [ править ]

В ранних работах (1980-е годы) он обнаружил мобильные генетические элементы у галофильных архей. [4] [5] будучи аспирантом у Х. Гобинда Хорана (Нобелевского лауреата) и Уттама Л. РаджБхандари в Массачусетском технологическом институте. Он также показал, что промоторы транскрипции у архей [6] отличались от таковых у обычных бактерий, что способствовало принятию трехдоменной точки зрения на эволюцию, предложенной Карлом Везе .

В 1990-е годы он организовал и возглавил группу, которая расшифровала первую последовательность генома и генетический код галофильного микроба Halobacterium sp. НРК-1. [7] [8] [9] Эта работа показала, что его белки очень кислые, что дает понимание того, как белки могут функционировать в условиях высокой солености и низкой активности воды. [10] [11] [12] Последовательность генома помогла дополнительно установить достоверность архей. [13] путем обнаружения сходства с высшими эукариотическими организмами и отличий от бактерий.

Позже, в 2000-х годах, его работа также предположила, что определенные гены приобретаются посредством горизонтального переноса генов, например гены аэробного дыхания . Постгеномные исследования в его лаборатории установили основные и сигнатурные белки галофильных архей . [14] и функции многих генов и генетических элементов, включая множественные источники репликации, [15] общие факторы транскрипции, [16] и репарации ДНК . системы [17] [18]

Астробиология [ править ]

Недавнее исследование ДасСармы (2010-е годы) антарктического галофильного микроорганизма Halorubrum lacusprofundi привело к дальнейшему уточнению понимания функции белка в сочетании высокой солености и холодных условий. [19] Такие исследования могут объяснить, как жизнь может адаптироваться к новым условиям, включая внеземную среду. [20]

ДасСарма предположил, что пигменты сетчатки , первоначально обнаруженные у галофильных архей, могли предшествовать пигментам хлорофилла на ранней Земле, что назвало гипотезой « Пурпурной Земли ». [2] [21] Это предложение обеспечивает потенциально новую биосигнатуру для дистанционного обнаружения жизни.

Биотехнология [ править ]

Лаборатория ДасСармы сыграла важную роль в изучении плавучих газовых пузырьковых наночастиц ( GVNP ) у Halobacterium sp. NRC-1 и разработал систему экспрессии для биоинженерии GVNP для биотехнологических приложений. [22] Эти наночастицы могут представлять собой ценную платформу для доставки антигенов, разработки вакцин и других биомедицинских и экологических приложений. [23] [24]

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Экстремальные галофилы - модели для астробиологии» (PDF) . Микроб . 2006.
  2. Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Экстремальные микробы» Американский учёный . www.americanscientist.org . Проверено 11 июля 2016 г.
  3. ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (1 января 2001 г.). Галофилы . John Wiley & Sons, Ltd. doi : 10.1002/9780470015902.a0000394.pub3 . ISBN  9780470015902 .
  4. ^ Симсек, М.; ДасСарма, С.; РаджБхандари, UL; Корана, Х.Г. (1 декабря 1982 г.). «Мобильный элемент из Halobacterium halobium, который инактивирует ген бактериородопсина» . Труды Национальной академии наук . 79 (23): 7268–7272. Бибкод : 1982PNAS...79.7268S . дои : 10.1073/pnas.79.23.7268 . ISSN   0027-8424 . ПМК   347320 . ПМИД   6296826 .
  5. ^ ДасСарма, С.; РаджБхандари, UL; Корана, Х.Г. (1 апреля 1983 г.). «Высокочастотная спонтанная мутация гена бактериоопсина у Halobacterium halobium опосредована мобильными элементами» . Труды Национальной академии наук . 80 (8): 2201–2205. Бибкод : 1983PNAS...80.2201D . дои : 10.1073/pnas.80.8.2201 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   393786 . ПМИД   6300900 .
  6. ^ ДасСарма, Шиладитья; РаджБхандари, Уттам Л.; Корана, Х. Гобинд (1 января 1984 г.). «МРНК бактериоопсина в штаммах Halobacterium halobium дикого типа и с дефицитом бактериопсина» . Труды Национальной академии наук . 81 (1): 125–129. Бибкод : 1984PNAS...81..125D . дои : 10.1073/pnas.81.1.125 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   344623 . ПМИД   16593404 .
  7. ^ Нг, ВайЛап В.; Чуфо, Стейси А.; Смит, Тодд М.; Бамгарнер, Роджер Э.; Баскин, Дейл; Фауст, Джанет; Холл, Барбара; Лорец, Кэрол; Сето, Джейсон (1 ноября 1998 г.). «Снимок большого динамического репликона в галофильном архее: мегаплазмида или минихромосома?» . Геномные исследования . 8 (11): 1131–1141. дои : 10.1101/гр.8.11.1131 . ISSN   1088-9051 . ПМИД   9847077 .
  8. ^ Нг, Вайлап Виктор; Кеннеди, Шон П.; Махайрас, Грегори Г.; Берквист, Брайан; Пан, Мин; Шукла, Хем Датт; Ласки, Стивен Р.; Балига, Нитин С.; Торссон, Вестейн (24 октября 2000 г.). «Последовательность генома видов Halobacterium NRC-1» . Труды Национальной академии наук . 97 (22): 12176–12181. дои : 10.1073/pnas.190337797 . ISSN   0027-8424 . ПМК   17314 . ПМИД   11016950 .
  9. ^ «NSF - OLPA - PR 00-69: Международная исследовательская группа исследует геном вездесущих микробов» . www.nsf.gov . Проверено 11 июля 2016 г.
  10. ^ Кеннеди, Шон П.; Нг, Вайлап Виктор; Зальцберг, Стивен Л.; Худ, Лерой; ДасСарма, Шиладитья (1 октября 2001 г.). «Понимание адаптации видов галобактерий NRC-1 к экстремальным условиям окружающей среды посредством компьютерного анализа последовательности их генома» . Геномные исследования . 11 (10): 1641–1650. дои : 10.1101/гр.190201 . ISSN   1088-9051 . ПМК   311145 . ПМИД   11591641 .
  11. ^ Каран, Рам; Кейпс, Мелинда Д.; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2012 г.). «Функция и биотехнология экстремофильных ферментов при низкой активности воды» . Водные биосистемы . 8 (1): 4. дои : 10.1186/2046-9063-8-4 . ISSN   2046-9063 . ПМК   3310334 . ПМИД   22480329 .
  12. ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (01 июня 2015 г.). «Галофилы и их ферменты: негативное применение с пользой» . Современное мнение в микробиологии . Экологическая микробиология • Экстремофилы. 25 : 120–126. дои : 10.1016/j.mib.2015.05.009 . ПМЦ   4729366 . ПМИД   26066288 .
  13. ^ ДасСарма, С., Дж. А. Кокер и П. ДасСарма. 2010. Археи – Обзор. В Энциклопедии микробиологии, 3-е издание, Academic Press, М. Шехтер (ред.), стр. 118-139.
  14. ^ Кейпс, Мелинда Д.; ДасСарма, Прия; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2012 г.). «Основные и уникальные белки галоархей» . БМК Геномика . 13:39 . дои : 10.1186/1471-2164-13-39 . ISSN   1471-2164 . ПМЦ   3287961 . ПМИД   22272718 .
  15. ^ Берквист, Брайан Р.; ДасСарма, Шиладитья (15 октября 2003 г.). «Архейный хромосомный автономно реплицирующийся элемент последовательности из крайнего галофила, Halobacterium sp. Штамм NRC-1» . Журнал бактериологии . 185 (20): 5959–5966. дои : 10.1128/JB.185.20.5959-5966.2003 . ISSN   0021-9193 . ПМК   225043 . ПМИД   14526006 .
  16. ^ Кокер, Джеймс А.; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2007 г.). «Генетический и транскриптомный анализ генов факторов транскрипции в модельном галофильном архее: координированное действие TbpD и TfbA» . БМК Генетика . 8:61 . дои : 10.1186/1471-2156-8-61 . ISSN   1471-2156 . ПМК   2121645 . ПМИД   17892563 .
  17. ^ Каран, Р; ДасСарма, П; Бальцер-Кубичек, Э; Венг, РР; Ляо, CC; Гудлетт, доктор медицинских наук; Нг, Западная Вирджиния; Дассарма, С (2014). «Биоинженерная радиорезистентность путем перепроизводства RPA, одноцепочечного ДНК-связывающего белка млекопитающих, у галофильных архей» . Прикладная микробиология и биотехнология . 98 (4): 1737–1747. дои : 10.1007/s00253-013-5368-x . ПМК   4096848 . ПМИД   24292079 .
  18. ^ Вайс, Рик (25 сентября 2007 г.). « Супербактерии могут принести пользу людям» . Вашингтон Пост . ISSN   0190-8286 . Проверено 11 июля 2016 г.
  19. ^ ДасСарма, Шиладитья; Кейпс, Мелинда Д.; Каран, Рам; ДасСарма, Прия (11 марта 2013 г.). «Аминокислотные замены в холодоадаптированных белках Halorubrum lacusprofundi, чрезвычайно галофильного микроба из Антарктиды» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e58587. Бибкод : 2013PLoSO...858587D . дои : 10.1371/journal.pone.0058587 . ISSN   1932-6203 . ПМК   3594186 . ПМИД   23536799 .
  20. ^ «Биотехники: раскрыты способы выживания антарктических микробов» . www.biotechniques.com . Проверено 11 июля 2016 г.
  21. ^ «Экстремофилы и внеземная жизнь» .
  22. ^ ДасСарма, Шиладитья; Каран, Рам; ДасСарма, Прия; Барнс, Сьюзен; Экулона, Фоласаде; Смит, Барбара (1 января 2013 г.). «Улучшенная генетическая система для биоинженерии плавучих газовых пузырьковых наночастиц из Haloarchaea» . БМК Биотехнология . 13 :112. дои : 10.1186/1472-6750-13-112 . ISSN   1472-6750 . ПМЦ   3878110 . ПМИД   24359319 .
  23. ^ ДасСарма, П.; Неги, В.Д.; Балакришнан, А.; Ким, Дж.-М.; Каран, Р.; Чакравортти, Д.; ДасСарма, С. (1 января 2015 г.). «Процедуры 8-го Конгресса по вакцинам и независимым поставщикам ПО, Филадельфия, США, 2015 г.: Наночастицы галоархейных газовых пузырьков, демонстрирующие антигены сальмонеллы, как новый подход к разработке вакцин» . Процессия в вакцинологии . 9 : 16–23. дои : 10.1016/j.provac.2015.05.003 . ПМЦ   4758358 . ПМИД   26900411 .
  24. ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (07 сентября 2015 г.). «Газововезикулярные наночастицы для отображения антигенов» . Вакцина . 3 (3): 686–702. doi : 10.3390/vaccines3030686 . ПМЦ   4586473 . ПМИД   26350601 .

Внешние ссылки [ править ]

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 6ec531731b5ec3d1d117d5255a8d8890__1702817940
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/6e/90/6ec531731b5ec3d1d117d5255a8d8890.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Shiladitya DasSarma - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)