Шиладитья ДасСарма
Шиладитья ДасСарма | |
---|---|
![]() | |
Рожденный | |
Национальность | Американский (Натурализованный) |
Образование | Университет Индианы ( BS ) Массачусетский технологический институт ( доктор философии ) |
Занятие | Профессор |
Работодатель | Университет Мэриленда в Балтиморе |
Известный | Галоархея , Действия по борьбе с изменением климата |
Награды | Маргарет Маквикар Премия |
Шиладитья ДасСарма (родился 11 ноября 1957 г.) — молекулярный биолог, известный своим вкладом в биологию галофильных и экстремофильных микроорганизмов. [1] [2] Он является профессором Мэрилендского университета в Балтиморе . Он получил степень доктора биохимии в Массачусетском технологическом институте и степень бакалавра химии в Университете Индианы в Блумингтоне . Прежде чем занять должность преподавателя, он проводил исследования в Массачусетской больнице общего профиля , Гарвардской медицинской школе и Институте Пастера в Париже.
ДасСарма работал на факультете Массачусетского университета в Амхерсте (1986–2001), Института биотехнологии Университета Мэриленда (2001–2010) и Медицинской школы Университета Мэриленда , Института морских и экологических технологий (2010 – настоящее время). Он является исследователем и преподавателем молекулярной генетики, геномики и биоинформатики , а также наставником студентов, аспирантов и докторантов, а также младших преподавателей. Он широко известен тем, что сыграл важную роль в создании области галофилов. [3] и исследования экстремофилов.
Исследования [ править ]
Галофилы [ править ]
В ранних работах (1980-е годы) он обнаружил мобильные генетические элементы у галофильных архей. [4] [5] будучи аспирантом у Х. Гобинда Хорана (Нобелевского лауреата) и Уттама Л. РаджБхандари в Массачусетском технологическом институте. Он также показал, что промоторы транскрипции у архей [6] отличались от таковых у обычных бактерий, что способствовало принятию трехдоменной точки зрения на эволюцию, предложенной Карлом Везе .
В 1990-е годы он организовал и возглавил группу, которая расшифровала первую последовательность генома и генетический код галофильного микроба Halobacterium sp. НРК-1. [7] [8] [9] Эта работа показала, что его белки очень кислые, что дает понимание того, как белки могут функционировать в условиях высокой солености и низкой активности воды. [10] [11] [12] Последовательность генома помогла дополнительно установить достоверность архей. [13] путем обнаружения сходства с высшими эукариотическими организмами и отличий от бактерий.
Позже, в 2000-х годах, его работа также предположила, что определенные гены приобретаются посредством горизонтального переноса генов, например гены аэробного дыхания . Постгеномные исследования в его лаборатории установили основные и сигнатурные белки галофильных архей . [14] и функции многих генов и генетических элементов, включая множественные источники репликации, [15] общие факторы транскрипции, [16] и репарации ДНК . системы [17] [18]
Астробиология [ править ]
Недавнее исследование ДасСармы (2010-е годы) антарктического галофильного микроорганизма Halorubrum lacusprofundi привело к дальнейшему уточнению понимания функции белка в сочетании высокой солености и холодных условий. [19] Такие исследования могут объяснить, как жизнь может адаптироваться к новым условиям, включая внеземную среду. [20]
ДасСарма предположил, что пигменты сетчатки , первоначально обнаруженные у галофильных архей, могли предшествовать пигментам хлорофилла на ранней Земле, что назвало гипотезой « Пурпурной Земли ». [2] [21] Это предложение обеспечивает потенциально новую биосигнатуру для дистанционного обнаружения жизни.
Биотехнология [ править ]
Лаборатория ДасСармы сыграла важную роль в изучении плавучих газовых пузырьковых наночастиц ( GVNP ) у Halobacterium sp. NRC-1 и разработал систему экспрессии для биоинженерии GVNP для биотехнологических приложений. [22] Эти наночастицы могут представлять собой ценную платформу для доставки антигенов, разработки вакцин и других биомедицинских и экологических приложений. [23] [24]
Ссылки [ править ]
- ^ «Экстремальные галофилы - модели для астробиологии» (PDF) . Микроб . 2006.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Экстремальные микробы» Американский учёный . www.americanscientist.org . Проверено 11 июля 2016 г.
- ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (1 января 2001 г.). Галофилы . John Wiley & Sons, Ltd. doi : 10.1002/9780470015902.a0000394.pub3 . ISBN 9780470015902 .
- ^ Симсек, М.; ДасСарма, С.; РаджБхандари, UL; Корана, Х.Г. (1 декабря 1982 г.). «Мобильный элемент из Halobacterium halobium, который инактивирует ген бактериородопсина» . Труды Национальной академии наук . 79 (23): 7268–7272. Бибкод : 1982PNAS...79.7268S . дои : 10.1073/pnas.79.23.7268 . ISSN 0027-8424 . ПМК 347320 . ПМИД 6296826 .
- ^ ДасСарма, С.; РаджБхандари, UL; Корана, Х.Г. (1 апреля 1983 г.). «Высокочастотная спонтанная мутация гена бактериоопсина у Halobacterium halobium опосредована мобильными элементами» . Труды Национальной академии наук . 80 (8): 2201–2205. Бибкод : 1983PNAS...80.2201D . дои : 10.1073/pnas.80.8.2201 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 393786 . ПМИД 6300900 .
- ^ ДасСарма, Шиладитья; РаджБхандари, Уттам Л.; Корана, Х. Гобинд (1 января 1984 г.). «МРНК бактериоопсина в штаммах Halobacterium halobium дикого типа и с дефицитом бактериопсина» . Труды Национальной академии наук . 81 (1): 125–129. Бибкод : 1984PNAS...81..125D . дои : 10.1073/pnas.81.1.125 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 344623 . ПМИД 16593404 .
- ^ Нг, ВайЛап В.; Чуфо, Стейси А.; Смит, Тодд М.; Бамгарнер, Роджер Э.; Баскин, Дейл; Фауст, Джанет; Холл, Барбара; Лорец, Кэрол; Сето, Джейсон (1 ноября 1998 г.). «Снимок большого динамического репликона в галофильном архее: мегаплазмида или минихромосома?» . Геномные исследования . 8 (11): 1131–1141. дои : 10.1101/гр.8.11.1131 . ISSN 1088-9051 . ПМИД 9847077 .
- ^ Нг, Вайлап Виктор; Кеннеди, Шон П.; Махайрас, Грегори Г.; Берквист, Брайан; Пан, Мин; Шукла, Хем Датт; Ласки, Стивен Р.; Балига, Нитин С.; Торссон, Вестейн (24 октября 2000 г.). «Последовательность генома видов Halobacterium NRC-1» . Труды Национальной академии наук . 97 (22): 12176–12181. дои : 10.1073/pnas.190337797 . ISSN 0027-8424 . ПМК 17314 . ПМИД 11016950 .
- ^ «NSF - OLPA - PR 00-69: Международная исследовательская группа исследует геном вездесущих микробов» . www.nsf.gov . Проверено 11 июля 2016 г.
- ^ Кеннеди, Шон П.; Нг, Вайлап Виктор; Зальцберг, Стивен Л.; Худ, Лерой; ДасСарма, Шиладитья (1 октября 2001 г.). «Понимание адаптации видов галобактерий NRC-1 к экстремальным условиям окружающей среды посредством компьютерного анализа последовательности их генома» . Геномные исследования . 11 (10): 1641–1650. дои : 10.1101/гр.190201 . ISSN 1088-9051 . ПМК 311145 . ПМИД 11591641 .
- ^ Каран, Рам; Кейпс, Мелинда Д.; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2012 г.). «Функция и биотехнология экстремофильных ферментов при низкой активности воды» . Водные биосистемы . 8 (1): 4. дои : 10.1186/2046-9063-8-4 . ISSN 2046-9063 . ПМК 3310334 . ПМИД 22480329 .
- ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (01 июня 2015 г.). «Галофилы и их ферменты: негативное применение с пользой» . Современное мнение в микробиологии . Экологическая микробиология • Экстремофилы. 25 : 120–126. дои : 10.1016/j.mib.2015.05.009 . ПМЦ 4729366 . ПМИД 26066288 .
- ^ ДасСарма, С., Дж. А. Кокер и П. ДасСарма. 2010. Археи – Обзор. В Энциклопедии микробиологии, 3-е издание, Academic Press, М. Шехтер (ред.), стр. 118-139.
- ^ Кейпс, Мелинда Д.; ДасСарма, Прия; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2012 г.). «Основные и уникальные белки галоархей» . БМК Геномика . 13:39 . дои : 10.1186/1471-2164-13-39 . ISSN 1471-2164 . ПМЦ 3287961 . ПМИД 22272718 .
- ^ Берквист, Брайан Р.; ДасСарма, Шиладитья (15 октября 2003 г.). «Архейный хромосомный автономно реплицирующийся элемент последовательности из крайнего галофила, Halobacterium sp. Штамм NRC-1» . Журнал бактериологии . 185 (20): 5959–5966. дои : 10.1128/JB.185.20.5959-5966.2003 . ISSN 0021-9193 . ПМК 225043 . ПМИД 14526006 .
- ^ Кокер, Джеймс А.; ДасСарма, Шиладитья (1 января 2007 г.). «Генетический и транскриптомный анализ генов факторов транскрипции в модельном галофильном архее: координированное действие TbpD и TfbA» . БМК Генетика . 8:61 . дои : 10.1186/1471-2156-8-61 . ISSN 1471-2156 . ПМК 2121645 . ПМИД 17892563 .
- ^ Каран, Р; ДасСарма, П; Бальцер-Кубичек, Э; Венг, РР; Ляо, CC; Гудлетт, доктор медицинских наук; Нг, Западная Вирджиния; Дассарма, С (2014). «Биоинженерная радиорезистентность путем перепроизводства RPA, одноцепочечного ДНК-связывающего белка млекопитающих, у галофильных архей» . Прикладная микробиология и биотехнология . 98 (4): 1737–1747. дои : 10.1007/s00253-013-5368-x . ПМК 4096848 . ПМИД 24292079 .
- ^ Вайс, Рик (25 сентября 2007 г.). « Супербактерии могут принести пользу людям» . Вашингтон Пост . ISSN 0190-8286 . Проверено 11 июля 2016 г.
- ^ ДасСарма, Шиладитья; Кейпс, Мелинда Д.; Каран, Рам; ДасСарма, Прия (11 марта 2013 г.). «Аминокислотные замены в холодоадаптированных белках Halorubrum lacusprofundi, чрезвычайно галофильного микроба из Антарктиды» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e58587. Бибкод : 2013PLoSO...858587D . дои : 10.1371/journal.pone.0058587 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3594186 . ПМИД 23536799 .
- ^ «Биотехники: раскрыты способы выживания антарктических микробов» . www.biotechniques.com . Проверено 11 июля 2016 г.
- ^ «Экстремофилы и внеземная жизнь» .
- ^ ДасСарма, Шиладитья; Каран, Рам; ДасСарма, Прия; Барнс, Сьюзен; Экулона, Фоласаде; Смит, Барбара (1 января 2013 г.). «Улучшенная генетическая система для биоинженерии плавучих газовых пузырьковых наночастиц из Haloarchaea» . БМК Биотехнология . 13 :112. дои : 10.1186/1472-6750-13-112 . ISSN 1472-6750 . ПМЦ 3878110 . ПМИД 24359319 .
- ^ ДасСарма, П.; Неги, В.Д.; Балакришнан, А.; Ким, Дж.-М.; Каран, Р.; Чакравортти, Д.; ДасСарма, С. (1 января 2015 г.). «Процедуры 8-го Конгресса по вакцинам и независимым поставщикам ПО, Филадельфия, США, 2015 г.: Наночастицы галоархейных газовых пузырьков, демонстрирующие антигены сальмонеллы, как новый подход к разработке вакцин» . Процессия в вакцинологии . 9 : 16–23. дои : 10.1016/j.provac.2015.05.003 . ПМЦ 4758358 . ПМИД 26900411 .
- ^ ДасСарма, Шиладитья; ДасСарма, Прия (07 сентября 2015 г.). «Газововезикулярные наночастицы для отображения антигенов» . Вакцина . 3 (3): 686–702. doi : 10.3390/vaccines3030686 . ПМЦ 4586473 . ПМИД 26350601 .
Внешние ссылки [ править ]
- Руководство по галофилам Колд-Спринг-Харбор http://www.worldcat.org/title/halophiles/oclc/33850503
- Галофилы, eLS http://www.els.net/WileyCDA/ElsArticle/refId-a0000394.html
- История CBS http://baltimore.cbslocal.com/2013/03/14/researchers-study-survival-secrets-of-mars/
- История Балтимора Сан http://www.baltimoresun.com/health/maryland-health/bs-hs-salt-vaccine-20120621-story.html
- Веб-сайт галоархейных геномов http://halo.umbc.edu/
- 1957 рождений
- Живые люди
- Индийские эмигранты в США
- Индийские молекулярные биологи
- Выпускники Университета Индианы в Блумингтоне
- Выпускники Школы наук Массачусетского технологического института
- Факультет Массачусетского университета в Амхерсте
- Университет Мэриленда, факультет Балтимора
- Ученые из Калькутты
- Индийские биологи XX века
- Индийские биоинженеры