Последовательность сигналов поглощения

Сигнальные последовательности поглощения ( USS ) представляют собой короткие последовательности ДНК , преимущественно поглощаемые компетентными бактериями семейства Pasteurellaceae ( например , Haemophilus influenzae ). Подобные последовательности, называемые последовательностями поглощения ДНК (DUS), обнаружены у видов семейства Neisseriaceae (включая Neisseria meningitidis и Neisseria gonorrhoeae ). ^{[ 1 ]}

Нейссерийный менингит

Генетическая трансформация — это процесс, посредством которого бактериальная клетка-реципиент поглощает обнаженную ДНК из окружающей среды и интегрирует эту ДНК в геном реципиента путем рекомбинации . У N. meningitidis трансформация ДНК требует присутствия коротких DUS (10-12 мер, находящихся в кодирующих и межгенных областях) донорской ДНК. Специфическое распознавание DUS опосредовано пилином IV типа . ^{[ 2 ]} Дэвидсен и др. ^{[ 3 ]} сообщили, что у N. meningitidis DUS встречаются со значительно более высокой плотностью в генах, участвующих в ДНК репарации и рекомбинации (а также в рестрикции-модификации и репликации), чем в других аннотированных группах генов. Эти авторы предположили, что чрезмерное представительство DUS в генах репарации и рекомбинации ДНК может отражать пользу поддержания целостности механизма репарации и рекомбинации ДНК за счет преимущественного использования генов поддержания генома, которые могли бы заменить их поврежденные аналоги в геноме клетки-реципиента. Поглощение таких генов может обеспечить механизм, способствующий восстановлению после повреждения ДНК после генотоксического стресса.

Ссылки

^ Фрай С.А., Нильсен М., Тоньюм Т., Амбур, Огайо (2013). «Диалекты последовательности поглощения ДНК у Neisseriaceae» . ПЛОС Генет . 9 (4): 3065–70. дои : 10.1371/journal.pgen.1003458 . ПМК 3630211 . ПМИД 23637627 .
^ Чеховин А., Симпсон П.Дж., Макдауэлл М.А., Браун Д.Р., Ношезе Р., Паллетт М., Брэйди Дж., Болдуин Г.С., Леа С.М., Мэтьюз С.Дж., Пеличич В. (2013). «Специфическое распознавание ДНК, опосредованное пилином IV типа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 110 (8): 3065–70. Бибкод : 2013PNAS..110.3065C . дои : 10.1073/pnas.1218832110 . ПМК 3581936 . ПМИД 23386723 .
^ Дэвидсен Т., Родланд Э.А., Лагесен К., Сиберг Э., Рогнес Т., Тоньюм Т. (2004). «Смещенное распределение последовательностей поглощения ДНК в сторону генов поддержания генома» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (3): 1050–8. дои : 10.1093/nar/gkh255 . ПМЦ 373393 . ПМИД 14960717 .

Внешние ссылки

Баккали, М.; Чен, Т.-Ю.; Ли, ХК; Редфилд, Р.Дж. (2004). «Эволюционная стабильность сигнальных последовательностей поглощения ДНК у Pasteurellaceae» . Труды Национальной академии наук . 101 (13): 4513–4518. Бибкод : 2004PNAS..101.4513B . дои : 10.1073/pnas.0306366101 . ПМЦ 384778 . ПМИД 15070749 .
Баккали, Мохаммед (2007). Фэрхед, Сесиль (ред.). «Динамика генома коротких олигонуклеотидов: пример последовательностей, усиливающих поглощение бактериальной ДНК» . ПЛОС ОДИН . 2 (8): е741. Бибкод : 2007PLoSO...2..741B . дои : 10.1371/journal.pone.0000741 . ЧВК 1939737 . ПМИД 17710141 .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid23637627-1] Фрай С.А., Нильсен М., Тоньюм Т., Амбур, Огайо (2013). «Диалекты последовательности поглощения ДНК у Neisseriaceae» . ПЛОС Генет . 9 (4): 3065–70. дои : 10.1371/journal.pgen.1003458 . ПМК 3630211 . ПМИД 23637627 .

[pmid23386723-2] Чеховин А., Симпсон П.Дж., Макдауэлл М.А., Браун Д.Р., Ношезе Р., Паллетт М., Брэйди Дж., Болдуин Г.С., Леа С.М., Мэтьюз С.Дж., Пеличич В. (2013). «Специфическое распознавание ДНК, опосредованное пилином IV типа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 110 (8): 3065–70. Бибкод : 2013PNAS..110.3065C . дои : 10.1073/pnas.1218832110 . ПМК 3581936 . ПМИД 23386723 .

[pmid14960717-3] Дэвидсен Т., Родланд Э.А., Лагесен К., Сиберг Э., Рогнес Т., Тоньюм Т. (2004). «Смещенное распределение последовательностей поглощения ДНК в сторону генов поддержания генома» . Нуклеиновые кислоты Рез . 32 (3): 1050–8. дои : 10.1093/nar/gkh255 . ПМЦ 373393 . ПМИД 14960717 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]