Acidithrix Ferrooxidans
| Acidithrix Ferrooxidans | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Actinomycetota |
| Сорт: | Acidimicrobiia |
| Заказ: | Acidimicrobiales |
| Семья: | неопределенность |
| Род: | "Acidithrix" Кей и соавт. 2013 [ 1 ] |
| Разновидность: | А. Ферроиданы
|
| Биномиальное название | |
| Acidithrix Ferrooxidans Кей и соавт. 2013 [ 1 ]
| |
| Тип напряжения | |
| DSM 28176 JCM 19728 Py-F3 [ 2 ] | |
Acidithrix Ferrooxidans ( A. ferrooxidans ) представляют собой гетеротрофическую , ацидофильную и грамположительную бактерию из рода Acidithrix . Тип штамм этого вида, A. ferrooxidans Py-F3, был выделен из кислого потока, истощающего из медного рудника в Уэльсе . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] Этот вид растет в различных кислых средах, таких как потоки, шахты или геотермальные участки. [ 1 ] Шахтные озера с ростом роста с редокклинатом с железом железа в качестве донора электронов. [ 1 ] [ 5 ] « A. ferrooxidans » быстро растет в макроскопическом стримере, вызывая большую плотность клеток, чем другие микробы, образующие стример. [ 6 ] Было предложено использование в биореакторах для исправления отходов шахты из -за плотности клеток и быстрого окисления окисления железа в кистном дренаже шахты. [ 6 ] Производство экзополисахаридов во время метаболизма субстрата металлов, такого как окисление железа, помогает предотвратить инкрустацию клеток минералами. [ 5 ]
Изоляты/секвенирование
[ редактировать ]Isolate Py-F3
[ редактировать ]Тип штамм Py-F3 был выделен из кислых, богатых металлом вод шахты в Северном Уэльсе. [ 5 ] PY-3 может выращивать различные метаболизмы для потенциальных субстратов роста, [ 4 ] и может расти в диапазоне температур от 10 до 30 ° C и рН от 1,5–4,4. [ 4 ] Штамм Py-F3 кодирует несколько ферментов для углеродной фиксации, включая Rubisco, но его активность углеродной фиксации не была изучена. [ 4 ] Гены, кодирующие белки для метаболических путей, использующих серы, азот и железо, были обнаружены в геноме. [ 4 ] Источником серы является сульфат, и он может использовать аминокислоты в качестве источника азота. Это уникальное требование изолята PY-F3, оставляя его неспособностью расти в среде, если не добавляются сложные субстраты. [ 4 ] Для рН -гомеостаза гены уреазы могут помочь выживанию из -за кодирования протонной насосной активности. [ 4 ] Поглощение мочевины задокументировано в PY-F3 и позволяет внутриклеточно производству мочевины, а не вносит ее в клетку. [ 4 ] Пептидогликан этого организма содержит мезо - диаминопимелевую кислоту , с основными цепями жирной кислоты и дыхательным хиноном. [ 4 ]
Изолят C25
[ редактировать ]Изолят C25 был извлечен из формирования железа в частиц в зоне экзаничинного листа, богатой пелагическим железом, в рамках озера шахты. [ 5 ] Этот изолят может как окислять Fe (II), так и уменьшать Fe (III) в микроотабельных условиях и было предположительно способствовать образованию твердых частиц в пелагической среде. [ 5 ] Рост не произошел при pH ниже, чем у PY-F3 (pH) 2, в то время как C25 обладал более высокой толерантностью к рН. [ 5 ] Наблюдение о том, что C25 может как окислять, так и уменьшение железа, дает представление о том, как микробы цикличны как железо, так и органический углерод в кислых условиях. [ 5 ] Быстрая скорость окисления железа приводит к регенерации железа железа в окружающей среде при pH всего 1,5. [ 7 ] [ 6 ] По сравнению с PY-F3 C25 не кодировал для рибулозы, но будущие исследования должны быть проведены для окончательного ответа. [ 5 ]
Применение к биоремедиации
[ редактировать ]The strains grow using iron metabolism on Tryptic Soy Broth/Agar (TSA/TSB) at low pH, where bacterial colonies form with iron precipitates.[ 5 ] [ 6 ] Лабораторные условия 25 ° C аэробно позволили окисление железа происходить в стерилизованной среде озера. [ 5 ] Исследователи признали потенциал использования « A. ferrooxidans » для биореактора посредством роста/приверженности на твердых поверхностях. [ 6 ] Железные шахты делают превосходное состояние растущего и аналогию для биореактора из -за подобных поверхностей. [ 6 ] Использование бактерий может способствовать удалению растворимого железа из железистой воды, а продукция железа (III) способствует растворению сульфидных минералов. [6]
References
[edit]- ^ Jump up to: a b c d e Jones, RM; Johnson, DB (2014). "Acidithrix ferrooxidans gen. nov., sp. nov.; a filamentous and obligately heterotrophic, acidophilic member of the Actinobacteria that catalyzes dissimilatory oxido-reduction of iron". Research in Microbiology. 166 (2): 111–20. doi:10.1016/j.resmic.2015.01.003. PMID 25638020.
- ^ Euzéby JP, Parte AC. "Acidithrix ferrooxidans". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved May 10, 2022.
- ^ Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (2015). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Nomenclature Abstract for Acidithrix ferrooxidans Jones and Johnson 2015". The NamesforLife Abstracts. doi:10.1601/nm.27541 (inactive 2024-04-17).
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactive as of April 2024 (link) - ^ Jump up to: a b c d e f g h i Eisen, Sebastian; Poehlein, Anja; Johnson, D. Barrie; Daniel, Rolf; Schlömann, Michael; Mühling, Martin (30 April 2015). "Genome Sequence of the Acidophilic Ferrous Iron-Oxidizing Isolate Acidithrix ferrooxidans Strain Py-F3, the Proposed Type Strain of the Novel Actinobacterial Genus Acidithrix". Genome Announcements. 3 (2): e00382-15. doi:10.1128/genomeA.00382-15. PMC 4417699. PMID 25931603.
- ^ Jump up to: a b c d e f g h i j Jiro F. Mori; Shipeng Lu; Matthias Händel; Kai Uwe Totsche; Thomas R. Neu; Vasile Vlad Iancu; Nicolae Tarcea; Jürgen Popp; Kirsten Küsel (2016-01-01). "Schwertmannite formation at cell junctions by a new filament-forming Fe(II)-oxidizing isolate affiliated with the novel genus Acidithrix". Microbiology. 162 (1): 62–71. doi:10.1099/mic.0.000205. ISSN 1350-0872. PMID 26506965.
- ^ Jump up to: a b c d e f g Jones, Rose M.; Johnson, D. Barrie (2016-07-15). "Iron Kinetics and Evolution of Microbial Populations in Low-pH, Ferrous Iron-Oxidizing Bioreactors". Environmental Science & Technology. 50 (15): 8239–8245. Bibcode:2016EnST...50.8239J. doi:10.1021/acs.est.6b02141. ISSN 0013-936X. PMID 27377871.
- ^ Hu, Danyu; Cha, Guihong; Gao, Beile (2018). "A Phylogenomic and Molecular Markers Based Analysis of the Class Acidimicrobiia". Frontiers in Microbiology. 9: 987. doi:10.3389/fmicb.2018.00987. ISSN 1664-302X. PMC 5962788. PMID 29867887.
