контрольная область мтДНК

Вторичная структура A контрольной области митохондриальной ДНК
Вторичная структура A контрольной области митохондриальной ДНК
	Консенсусная вторичная структура для всех гаплотипов контрольной области мтДНК.
Идентификаторы
Символ	мтДНК оцА
Рфам	РФ01853
Другие данные
РНК Тип	Антисмысловая РНК
Домен(ы)	Млекопитающие
PDB Структуры	ПДБе

представляет Контрольная область мтДНК собой область митохондриального генома , которая представляет собой некодирующую ДНК . Эта область контролирует синтез РНК и ДНК. ^{[ 1 ]} Это наиболее полиморфный участок генома мтДНК человека. ^{[ 2 ]} с полиморфизмом, сосредоточенным в гипервариабельных областях . Среднее нуклеотидное разнообразие в этих регионах составляет 1,7%. ^{[ 3 ]} Несмотря на эту изменчивость, транскрипт РНК из этой области имеет консервативную вторичную структуру ( на фото ), которая, как было обнаружено, находится под селективным давлением . ^{[ 4 ]}

Контрольная область мтДНК содержит точку начала репликации одной цепи и точку начала транскрипции обеих цепей. ^{[ 5 ]} Существует также открытая рамка считывания, которая, как полагают, кодирует 7s- рибосомальную РНК у людей, но не у мышей или коров, где она была удалена . ^{[ 6 ]}

Отличие от D-петли

Контрольная область и D-петля мтДНК иногда используются в литературе как синонимы; ^{[ 3 ]} в частности, контрольная область включает D-петлю вместе с прилегающими областями промотора транскрипции . По этой причине контрольная область также известна под аббревиатурой DLP, обозначающей D - Loop и связанные с ней промоторы . ^{[ 7 ]}

Исследование выносливости

контрольной области мтДНК Гаплотипы связаны с выносливостью у людей. ^{[ 8 ]} В исследовании 2002 года секвенировали контрольную область 55 субъектов и сравнили их гаплотипы с увеличением VO ₂ max после восьминедельной программы тренировок . Они обнаружили, что различные гаплотипы в значительной степени связаны с выносливостью испытуемых. Было высказано предположение, что это произошло потому, что контрольная область влияет на репликацию и транскрипцию в митохондриях. ^{[ 4 ]}^{[ 8 ]}

См. также

Ссылки

^ Структура Центра изучения ДНК митохондриального генома, Лаборатория Колд-Спринг-Харбор
^ Стоункинг М., Хеджкок Д., Хигучи Р.Г., Бдительный Л., Эрлих Х.А. (февраль 1991 г.). «Популяционная вариация последовательностей контрольной области мтДНК человека, обнаруженная с помощью ферментативной амплификации и олигонуклеотидных зондов, специфичных для последовательностей» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 48 (2): 370–82. ПМК 1683035 . ПМИД 1990843 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Aquadro CF, Greenberg BD (февраль 1983 г.). «Вариации и эволюция митохондриальной ДНК человека: анализ нуклеотидных последовательностей семи человек» . Генетика . 103 (2): 287–312. дои : 10.1093/генетика/103.2.287 . ПМК 1219980 . ПМИД 6299878 . Проверено 29 июля 2010 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Перейра Ф., Соарес П., Карнейру Дж. и др. (декабрь 2008 г.). «Доказательства переменного селективного давления в большой вторичной структуре контрольной области митохондриальной ДНК человека» . Мол. Биол. Эвол . 25 (12): 2759–70. дои : 10.1093/molbev/msn225 . ПМИД 18845547 .
^ Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г. и др. (апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа . 290 (5806): 457–65. Бибкод : 1981Natur.290..457A . дои : 10.1038/290457a0 . ПМИД 7219534 . S2CID 4355527 .
^ Охала Д., Монтойя Дж., Аттарди Дж. (апрель 1981 г.). «Модель пунктуации тРНК процессинга РНК в митохондриях человека». Природа . 290 (5806): 470–4. Бибкод : 1981Natur.290..470O . дои : 10.1038/290470a0 . ПМИД 7219536 . S2CID 4323371 .
^ Мичикава И., Маццучелли Ф., Бресолин Н., Скарлато Дж., Аттарди Дж. (октябрь 1999 г.). «Зависимое от старения большое накопление точковых мутаций в контрольной области мтДНК человека для репликации». Наука . 286 (5440): 774–9. дои : 10.1126/science.286.5440.774 . ПМИД 10531063 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мураками Х., Ота А., Симоджо Х., Окада М., Аджисака Р., Куно С. (июнь 2002 г.). «Полиморфизмы в контрольной области мтДНК связаны с индивидуальными различиями в выносливости или обучаемости» . Япония. Дж. Физиол . 52 (3): 247–56. дои : 10.2170/jjphysicalol.52.247 . ПМИД 12230801 .

Дальнейшее чтение

Стоункинг М (октябрь 2000 г.). «Гипервариабельные сайты в контрольной области мтДНК являются горячими точками мутаций» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 67 (4): 1029–32. дои : 10.1086/303092 . ПМЦ 1287875 . ПМИД 10968778 .
Сачиданандам Р., Вайсман Д., Шмидт С.К. и др. (февраль 2001 г.). «Карта вариаций последовательностей генома человека, содержащая 1,42 миллиона однонуклеотидных полиморфизмов» . Природа . 409 (6822): 928–33. дои : 10.1038/35057149 . ПМИД 11237013 .

Внешние ссылки

EMPOP - база данных контрольных регионов митохондриальной ДНК
Страница вторичной структуры A контрольной области митохондриальной ДНК в Rfam

[1] Структура Центра изучения ДНК митохондриального генома, Лаборатория Колд-Спринг-Харбор

[2] Стоункинг М., Хеджкок Д., Хигучи Р.Г., Бдительный Л., Эрлих Х.А. (февраль 1991 г.). «Популяционная вариация последовательностей контрольной области мтДНК человека, обнаруженная с помощью ферментативной амплификации и олигонуклеотидных зондов, специфичных для последовательностей» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 48 (2): 370–82. ПМК 1683035 . ПМИД 1990843 .

[Aqu83-3] Перейти обратно: ^а ^б Aquadro CF, Greenberg BD (февраль 1983 г.). «Вариации и эволюция митохондриальной ДНК человека: анализ нуклеотидных последовательностей семи человек» . Генетика . 103 (2): 287–312. дои : 10.1093/генетика/103.2.287 . ПМК 1219980 . ПМИД 6299878 . Проверено 29 июля 2010 г.

[Per09-4] Перейти обратно: ^а ^б Перейра Ф., Соарес П., Карнейру Дж. и др. (декабрь 2008 г.). «Доказательства переменного селективного давления в большой вторичной структуре контрольной области митохондриальной ДНК человека» . Мол. Биол. Эвол . 25 (12): 2759–70. дои : 10.1093/molbev/msn225 . ПМИД 18845547 .

[5] Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г. и др. (апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа . 290 (5806): 457–65. Бибкод : 1981Natur.290..457A . дои : 10.1038/290457a0 . ПМИД 7219534 . S2CID 4355527 .

[6] Охала Д., Монтойя Дж., Аттарди Дж. (апрель 1981 г.). «Модель пунктуации тРНК процессинга РНК в митохондриях человека». Природа . 290 (5806): 470–4. Бибкод : 1981Natur.290..470O . дои : 10.1038/290470a0 . ПМИД 7219536 . S2CID 4323371 .

[7] Мичикава И., Маццучелли Ф., Бресолин Н., Скарлато Дж., Аттарди Дж. (октябрь 1999 г.). «Зависимое от старения большое накопление точковых мутаций в контрольной области мтДНК человека для репликации». Наука . 286 (5440): 774–9. дои : 10.1126/science.286.5440.774 . ПМИД 10531063 .

[Mur02-8] Перейти обратно: ^а ^б Мураками Х., Ота А., Симоджо Х., Окада М., Аджисака Р., Куно С. (июнь 2002 г.). «Полиморфизмы в контрольной области мтДНК связаны с индивидуальными различиями в выносливости или обучаемости» . Япония. Дж. Физиол . 52 (3): 247–56. дои : 10.2170/jjphysicalol.52.247 . ПМИД 12230801 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]