Субъединица C АТФ-синтазы
 V-типа Натриевая АТФаза Enterococcus hirae . Рассчитанные углеводородные границы липидного бислоя показаны красными и синими точками. | |||
| Идентификаторы | |||
|---|---|---|---|
| Символ | ATP-synt_C | ||
| Пфам | PF00137 | ||
| ИнтерПро | ИПР002379 | ||
| PROSITE | PDOC00526 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1аты / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 5 | ||
| белок OPM | 2бл2 | ||
| |||
АТФаза, субъединица C комплекса Fo/Vo, является основной трансмембранной субъединицей АТФ-синтаз V-типа, А-типа и F-типа . Субъединица C (также называемая субъединицей 9 или протеолипидом в F-АТФазах или протеолипидом 16 кДа в V-АТФазах) была обнаружена в комплексе Fo или Vo F- и V-АТФаз соответственно. Субъединицы образуют олигомерное кольцо С , составляющее ротор Fo/Vo/Ao, где фактическое количество субъединиц сильно варьируется в зависимости от конкретных ферментов. [ 1 ]
АТФазы (или АТФ-синтазы) представляют собой мембраносвязанные ферментные комплексы/переносчики ионов, которые сочетают синтез и/или гидролиз АТФ с транспортом протонов через мембрану. АТФазы могут использовать энергию протонного градиента, используя поток ионов через мембрану через протонный канал АТФазы для управления синтезом АТФ. Некоторые АТФазы работают наоборот. использование энергии гидролиза АТФ для создания протонного градиента. Существуют различные типы АТФаз, которые могут различаются по функции (синтез и/или гидролиз АТФ), структуре (F-, V- и А-АТФазы содержат вращательные двигатели) и типу ионов, которые они транспортируют. [ 2 ] [ 3 ]
F-АТФазы (или АТФазы F1Fo) и V-АТФазы (или АТФазы V1Vo) каждая состоят из двух связанных комплексов: комплекс F1 или V1 содержит каталитическое ядро, которое синтезирует/гидролизует АТФ, и комплекс Fo или Vo, который образует перекрывающая мембрану пора. Все F- и V-АТФазы содержат вращающиеся двигатели: один из них управляет перемещением протонов через мембрану, а другой — синтезом/гидролизом АТФ. [ 4 ] [ 5 ]
В F-АТФазах поток протонов через канал АТФазы приводит к вращению кольца субъединицы C, которое, в свою очередь, связано с вращением ротора гамма-субъединицы комплекса F1 из-за постоянного связывания между гамма- и эпсилон-субъединицами F1. и кольцо субъединицы C Fo. Последовательное протонирование и депротонирование Asp61 субъединицы C связано со ступенчатым движением ротора. [ 6 ]
В V-АТФазах есть три протеолипидные субъединицы (c, c' и c''), которые образуют часть протонпроводящей поры, каждая из которых содержит скрытый остаток глутаминовой кислоты, который необходим для транспорта протонов. [ 7 ] [ 8 ]
В недавнем исследовании c-субъединица была указана как критический компонент переходной поры митохондриальной проницаемости. [ 9 ]
Подсемейства
[ редактировать ]- АТФаза, комплекс Vo, протеолипидная субъединица C , InterPro : IPR000245
- АТФаза, комплекс Fo, субъединица C InterPro : IPR000454
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]АТФ5G1 ; АТФ5G2 ; АТФ5G3 ; АТР6В0Б ; ATP6V0C ;
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кюльбрандт В., Дэвис К.М. (январь 2016 г.). «Вращающиеся АТФазы: новый поворот в древней машине». Тенденции биохимических наук . 41 (1): 106–116. дои : 10.1016/j.tibs.2015.10.006 . ПМИД 26671611 .
- ^ Мюллер В., Кросс Р.Л. (2004). «Эволюция АТФ-синтаз и АТФаз A-, F- и V-типов: изменение функции и изменение соотношения H + / АТФ» . ФЭБС Летт . 576 (1): 1–4. дои : 10.1016/j.febslet.2004.08.065 . ПМИД 15473999 . S2CID 25800744 .
- ^ Чжан Х, Нива Х, Раппас М (2004). «Механизмы АТФаз - междисциплинарный подход». Curr Protein Pept Sci . 5 (2): 89–105. дои : 10.2174/1389203043486874 . ПМИД 15078220 .
- ^ Ито Х., Ёсида М., Ясуда Р., Ноджи Х., Киносита К. (2001). «Разрешение отдельных этапов вращения с помощью субмиллисекундного кинетического анализа F1-АТФазы». Природа . 410 (6831): 898–904. Бибкод : 2001Natur.410..898Y . дои : 10.1038/35073513 . ПМИД 11309608 . S2CID 3274681 .
- ^ Уилкенс С., Чжэн Ю, Чжан З (2005). «Структурная модель вакуолярной АТФазы по данным трансмиссионной электронной микроскопии». Микрон . 36 (2): 109–126. дои : 10.1016/j.micron.2004.10.002 . ПМИД 15629643 .
- ^ Филлингейм Р.Х., Анжуйн С.М., Дмитриев О.Ю. (2003). «Механика взаимодействия движений протонов с вращением С-кольца в АТФ-синтазе» . ФЭБС Летт . 555 (1): 29–34. дои : 10.1016/S0014-5793(03)01101-3 . ПМИД 14630314 . S2CID 38896804 .
- ^ Иноуэ Т., Форгак М. (2005). «Цистеин-опосредованное перекрестное связывание указывает на то, что субъединица C V-АТФазы находится в непосредственной близости от субъединиц E и G домена V1 и субъединицы a домена V0» . Ж. Биол. Хим . 280 (30): 27896–27903. дои : 10.1074/jbc.M504890200 . ПМИД 15951435 .
- ^ Джонс Р., Финдли Дж.Б., Харрисон М., Дюроуз Л., Сонг К.Ф., Барратт Э., Триник Дж. (2003). «Структура и функция вакуолярной H +-АТФазы: переход от моделей низкого разрешения к структурам высокого разрешения». Дж. Биоэнергетика. Биомембр . 35 (4): 337–345. дои : 10.1023/А:1025728915565 . ПМИД 14635779 . S2CID 43788207 .
- ^ Бонора, М; Бонони, А; Де Марки, Э; Георгий, К; Лебедзинская, М; Марки, С; Патерньяни, С; Римесси, А; Суски, Дж. М.; Войтала, А; Вецковски, MR; Кремер, Г; Галлуцци, Л; Пинтон, П. (15 февраля 2013 г.). «Роль субъединицы c FO АТФ-синтазы в переходе проницаемости митохондрий» . Клеточный цикл . 12 (4): 674–83. дои : 10.4161/cc.23599 . ПМЦ 3594268 . ПМИД 23343770 .