МУБИИ-ТБ-БД
Содержание | |
---|---|
Описание | База данных, которая документирует и отслеживает гены устойчивости туберкулеза к антибиотикам. |
Типы данных захвачен | Гены устойчивости к антибиотикам туберкулеза |
Организмы | Бактерии |
Контакт | |
Первичное цитирование | ПМИД 24731071 |
Доступ | |
Веб-сайт | umr5558-бибисерв |
Разнообразный | |
Добавить в закладки сущности | да |
MUBII-TB-DB — это база данных , посвященная туберкулеза генам устойчивости к антибиотикам . [ 1 ] Это хорошо структурированная текстовая база данных , посвященная микобактериям туберкулеза в семи различных мутаций локусах : rpoB , pncA , katG; mabA(fabG1)-inhA , gyrA, gyrB и rrs. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] MUBII анализирует запрос, используя две параллельные стратегии: 1). Поиск BLAST по ранее мутировавшим последовательностям. 2). Согласование последовательностей запросов с последовательностями дикого типа. MUBII выводит графики совпадений и описание мутации и терапевтического значения. [ 1 ] Терапевтически значимые мутации помечаются как «высокодостоверные» на основании критериев, установленных Sandgren et al. [ 6 ] MUBII-TB-DB предоставляет платформу, которую легко использовать даже пользователям, не имеющим подготовки в области биоинформатики . [ 1 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Фландруа, Жан-Пьер; Лина, Жерар; Думитреску, Оана (декабрь 2014 г.). «MUBII-TB-DB: база данных мутаций, связанных с устойчивостью к антибиотикам микобактерий туберкулеза» . БМК Биоинформатика . 15 (1): 107. дои : 10.1186/1471-2105-15-107 . ISSN 1471-2105 . ПМК 4021062 . ПМИД 24731071 .
- ^ Хейм, Б. (февраль 1997 г.). «Множественная лекарственная устойчивость микобактерий туберкулеза». Международный журнал противомикробных средств . 8 (1): 61–70. дои : 10.1016/s0924-8579(96)00356-1 . ISSN 0924-8579 . ПМИД 18611785 .
- ^ Массер, Дж. М. (октябрь 1995 г.). «Устойчивость микобактерий к противомикробным агентам: молекулярно-генетические данные» . Обзоры клинической микробиологии . 8 (4): 496–514. дои : 10.1128/cmr.8.4.496 . ISSN 0893-8512 . ПМК 172873 . ПМИД 8665467 .
- ^ Алмейда да Силва, PE; Паломино, Джей Си (01 июля 2011 г.). «Молекулярные основы и механизмы лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза: классические и новые препараты» . Журнал антимикробной химиотерапии . 66 (7): 1417–1430. дои : 10.1093/jac/dkr173 . ISSN 0305-7453 . ПМИД 21558086 .
- ^ Чжан, Ю.; Да, WW. (01.11.2015). «Механизмы лекарственной устойчивости микобактерий туберкулеза : обновленная информация 2015 г.». Международный журнал туберкулеза и болезней легких . 19 (11): 1276–1289. дои : 10.5588/ijtld.15.0389 . ISSN 1027-3719 . ПМИД 26467578 .
- ^ Сандгрен, Андреас; Стронг, Майкл; Мутукришнан, Притика; Вайнер, Брайан К; Черч, Джордж М; Мюррей, Меган Б. (10 февраля 2009 г.). «База данных мутаций лекарственной устойчивости туберкулеза» . ПЛОС Медицина . 6 (2): e1000002. doi : 10.1371/journal.pmed.1000002 . ISSN 1549-1676 . ПМЦ 2637921 . ПМИД 19209951 .