Утечка сканирования
Утечка сканирования - это механизм, используемый во время фазы инициации эукариотической трансляции , который позволяет регулировать экспрессию генов . Во время посвящения малая рибосомальная субъединица 40S (как 43 -е PIC ) «сканирует» или движется в направлении 5 ' -> 3' вдоль 5'UTR , чтобы найти начальный кодон, чтобы начать удлинение. Иногда сканирующая рибосома обходит первоначальный начальный кодон AUG и начинает перевод в дальнейших начальных кодонах вниз по течению. [ 1 ] Трансляция в эукариотических клетках в соответствии с большинством механизмов сканирования происходит на начальном кодоне AUG, проксимально к 5 -дюймовому концу мРНК ; Тем не менее, сканирующая рибосома может столкнуться с «неблагоприятным нуклеотидным контекстом» вокруг начального кодона и продолжать сканирование. [ 2 ]
Есть определенные случаи, когда было обнаружено, что инициация возникает вверх по течению в неверном кодоне. Эукариотические гены, содержащие последовательные GC последовательности лидеров , часто наблюдаются, выполняющие этот механизм. Предполагается, что сканирование замедляется из -за вторичной структуры, которая позволяет связывать Met - тРНК с кодоном несоответствия. [ 3 ]
Несколько вирусов используют протекающий механизм сканирования для получения жизненно важных белков , что подразумевает, что протекающее сканирование не является следствием неадекватности, но вместо этого позволяет вирусам преодолевать высокое селективное давление конкуренции со своими хозяевами. [ 4 ] Молекулярные биологи сужают поиск идеальной нуклеотидной среды для инициации трансляции и механизмов, с помощью которых вирусы повторяются. [ 1 ]
Открытие
[ редактировать ]Через несколько исследований Мэрилин Козак была первой, кто распознал основную роль сканирования во время инициации трансляции в клетках млекопитающих. Кодон AUG у млекопитающих оптимально признан контекстом GCCRCCAUGG, также известным как « консенсусная последовательность Козаков ». [ 5 ] Пурин (R) и каждый из нуклеотидов в этой последовательности высоко консервативны и обеспечивают важную функцию в распознавании и инициации трансляции для многих рибосомных субъединиц 40 -х годов. С оптимальным контекстом в начальном кодоне AUG рибосомы начнут инициацию в этот момент. Слабый контекст возникает, когда последовательности, прилегающие к начальному кодону AUG, отклонились от консенсусной последовательности. Несколько рибосомов по -прежнему будут инициировать перевод в слабом месте, но большинство из них выполнит протекающее сканирование и инициирует вниз по течению. Как следствие, могут быть продуцированы различные белки. [ 3 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный Козак, Мэрилин. «Инициирование перевода у прокариот и эукариот». Ген 234 (1999): 187-208. Академический поиск завершен. Веб - 10 июня 2014 года.
- ^ Herzog, Etienne., Et al. «Перевод второго гена вируса арахисового вируса 2 происходит путем протекающего сканирования in vitro». Вирусология 208. (1995): 215-225. Академический поиск завершен. Веб - 10 июня 1014.
- ^ Jump up to: а беременный Козак, Мэрилин. «Раздвижение границ сканирующего механизма инициирования перевода». Ген 299 (2002): 1-34. Академический поиск завершен. Веб - 11 июня 2014 года.
- ^ Ryaboba, Lyubov., Et al. «Перевод повреждения и протекающего сканирования в вирусах растений». Исследование вирусов 119 (2006): 52-62 Академический поиск завершен. Веб - 23 июня 2014 года.
- ^ Hinnebusch, Alan., «Молекулярный механизм сканирования и отбора начального кодона у эукариот». Американское общество для микробиологии Vol. 75 Нет. 3. (2011): 434-467. Веб - 11 июня 2014 года.