Миртрон
Миртроны представляют собой тип микроРНК , которые расположены в интронах мРНК , кодирующей гены хозяина. [ 1 ] [ 2 ] Эти короткие шпильковые интроны образуются посредством атипичных путей биогенеза микроРНК. [ 3 ] [ 4 ] Миртроны возникают из сплайсированных интронов и, как известно, участвуют в экспрессии генов.
Впервые миртроны были идентифицированы у Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans . [ 5 ] [ 6 ] На сегодняшний день идентифицировано 14, 9 и 19 миртронов у D. melanogaster, C. elegans и млекопитающих соответственно. [ 7 ] Миртроны являются альтернативными предшественниками биогенеза микроРНК. Короткие шпильковые интроны используют сплайсинг, чтобы обойти расщепление DROSHA, которое в остальном важно для генерации канонических микроРНК животных. Миртроны возникают из сплайсированных интронов и, как известно, функционируют как классические микроРНК (миР) и регулируют экспрессию генов путем дестабилизации мРНК, ингибирования трансляции или расщепления целевой мРНК. [ 8 ]
Сейчас появляется больше доказательств, подтверждающих существование миртронов у растений. Все микроРНК в растениях происходят в результате последовательного расщепления DCL1 от pri-микроРНК с образованием пре-миРНК (или предшественника микроРНК), но миртроны обходят расщепление DCL1 и входят в виде пре-миРНК в путь созревания микроРНК. [ 7 ]
Миртроны отличаются от канонических последовательностей микроРНК, и их можно отличить с помощью методов машинного обучения при анализе данных. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Руби, Дж. Г.; Ян, Швейцария; Бартель, ДП (5 июля 2007 г.). «Интронные предшественники микроРНК, обходящие процессинг Дроши» . Природа . 448 (7149): 83–6. Бибкод : 2007Natur.448...83R . дои : 10.1038/nature05983 . ПМЦ 2475599 . ПМИД 17589500 .
- ^ Вэнь, Цзяюй; Ладевиг, Эрик; Шенкер, Сол; Мохаммед, Джаавед; Лай, Эрик К. (2015). «Анализ почти тысячи миртронов млекопитающих выявил новые особенности субстратов Dicer» . PLOS Вычислительная биология . 11 (9): e1004441. Бибкод : 2015PLSCB..11E4441W . дои : 10.1371/journal.pcbi.1004441 . ПМЦ 4556696 . ПМИД 26325366 .
- ^ Руби, Дж. Г.; Ян, Швейцария; Бартель, ДП (5 июля 2007 г.). «Интронные предшественники микроРНК, обходящие процессинг Дроши» . Природа . 448 (7149): 83–6. Бибкод : 2007Natur.448...83R . дои : 10.1038/nature05983 . ПМЦ 2475599 . ПМИД 17589500 .
- ^ Да Фонсека, Бруно Энрике Рибейру; ДОМИНГ, Дуглас Сильва; Пасчоаль, Александр Росси (01 октября 2019 г.). «mirtronDB: база знаний Mirtron» . Биоинформатика . 35 (19): 3873–3874. doi : 10.1093/биоинформатика/btz153 . ISSN 1367-4803 . ПМК 6761972 . PMID 30874795 .
- ^ Руби, Дж. Г.; Ян, Швейцария; Бартель, ДП (5 июля 2007 г.). «Интронные предшественники микроРНК, обходящие процессинг Дроши» . Природа . 448 (7149): 83–6. Бибкод : 2007Natur.448...83R . дои : 10.1038/nature05983 . ПМЦ 2475599 . ПМИД 17589500 .
- ^ Ян, Швейцария; Руби, Дж. Г.; Фридман, Р; Бартель, ДП (6 января 2011 г.). «Формирование, регуляция и эволюция 3'UTR Caenorhabditis elegans» (PDF) . Природа . 469 (7328): 97–101. Бибкод : 2011Natur.469...97J . дои : 10.1038/nature09616 . ПМК 3057491 . ПМИД 21085120 .
- ^ Jump up to: а б Чжу, Ц.-Х.; Сприггс, А.; Мэтью, Л.; Фан, Л.; Кеннеди, Дж.; Габлер, Ф.; Хелливелл, К. (30 июля 2008 г.). «Разнообразный набор микроРНК и микроРНК-подобных малых РНК в развивающихся рисовых зернах» . Геномные исследования . 18 (9): 1456–1465. дои : 10.1101/гр.075572.107 . ПМК 2527712 . ПМИД 18687877 .
- ^ «миртрон» . mirtron.gene-quantification.info . Проверено 10 декабря 2022 г.
- ^ Рорбах, Гжегож; Унольд, Ольгерд; Конопка, Богумил М. (2018). «Отличение миртронов от канонических микроРНК с помощью методов исследования данных и машинного обучения» . Научные отчеты . 8 (1): 7560. Бибкод : 2018НатСР...8.7560Р . дои : 10.1038/s41598-018-25578-3 . ПМЦ 5953923 . ПМИД 29765080 .
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |