Проект биогенома Земли
| Проект биогенома Земли | |
|---|---|
| Продолжительность | 1 ноября 2018 г. – 2028 г. |
| Веб-сайт | www |
Проект «Биогеном Земли» ( EBP ) — это инициатива, целью которой является секвенирование и каталогизация геномов всех описанных в настоящее время видов эукариот на Земле в течение десяти лет. [1] В рамках этой инициативы будет создана открытая база данных ДНК с биологической информацией, которая обеспечит платформу для научных исследований и поддержит экологические и природоохранные инициативы. [2] Научная статья, описывающая видение проекта, была опубликована в PNAS в апреле 2018 года. [3] и проект официально запущен 1 ноября 2018 года. [4]
Инициатива была вдохновлена проектом «Геном человека » и возникла во время встречи в ноябре 2015 года между Харрисом Левином ( UCD ), Джином Э. Робинсоном ( IGB ) и У. Джоном Крессом ( Смитсоновского института ) Национальный музей естественной истории . [3] [5] В феврале 2017 года на крупной конференции по геномике и биоразнообразию, организованной Смитсоновским институтом и BGI в Вашингтоне, округ Колумбия, был поддержан 10-летний план и организационная структура проекта. [3]
Краткое содержание
[ редактировать ]Стоимость проекта оценивается в 4,7 миллиарда долларов США. [1] Он включает в себя уже реализуемые проекты, такие как i5K (насекомые), [6] Б10К (птицы), 10КП (растения), [7] [8] и « Древо жизни Дарвина» , целью которого является секвенирование примерно 66 000 видов эукариот в Соединенном Королевстве. [1] Проект направлен на секвенирование и аннотирование примерно 1,5 миллиона известных видов эукариот в три этапа, сначала с созданием «аннотированных эталонных сборок в масштабе хромосом как минимум для одного репрезентативного вида каждого из ~ 9000 таксономических семейств эукариот». [3] [8]
Согласно документу PNAS , проект поддерживают несколько центров секвенирования, в том числе BGI (Китай), Медицинский колледж Бэйлора (США), Институт Wellcome Sanger (Великобритания), Университет Рокфеллера (США), при этом для проекта будет создан дополнительный центр. в Южной Америке Исследовательским фондом Сан-Паулу . [3] Что касается биообсерваторий, использующих геномику, примерами, отвечающими потребностям проекта, являются Национальная сеть экологических обсерваторий , Китайская сеть экологических исследований, ForestGEO и MarineGEO. [3] Чтобы дать представление о технико-экономических обоснованиях и технических требованиях к таким проектам «планетарного масштаба», как этот, проект «Геном 10 000 растений» опубликовал пилотный проект «Оцифровка ботанического сада Жуйли », в котором взят образец и секвенирован 761 образец сосудистых растений, растущих в ботаническом саду на юге страны. Западный Китай. [9]
См. также
[ редактировать ]- Список секвенированных геномов эукариот
- Проект микробиома Земли
- Проект «1000 геномов растений»
- Проект «100 000 геномов»
- Проект «Геном человека»
- Фонд всех видов
- Энциклопедия жизни
- Добро пожаловать в Институт Сэнгера
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Жизнь на Земле будет подвергнута анализу ДНК во имя сохранения» . Природа . 563 (7730): 155–156. Ноябрь 2018 г. Бибкод : 2018Natur.563..155. . дои : 10.1038/d41586-018-07323-y . ПМИД 30401859 .
- ^ «Секвенирование мира» . Экономист . 23 января 2018 года. Архивировано из оригинала 24 января 2018 года . Проверено 3 февраля 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж Левин Х.А., Робинсон Дж.Э., Кресс В.Дж., Бейкер В.Дж., Коддингтон Дж., Крэндалл К.А. и др. (апрель 2018 г.). «Проект Биогеном Земли: секвенирование жизни ради будущего жизни» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (17): 4325–4333. Бибкод : 2018PNAS..115.4325L . дои : 10.1073/pnas.1720115115 . ПМЦ 5924910 . ПМИД 29686065 .
- ^ «Ученые предпринимают усилия по составлению карты ДНК каждого вида» . Президентский ежедневный обзор: интригующе. ОЗЫ . 2 ноября 2018 г. Проверено 2 ноября 2018 г.
- ^ Дейли Дж. (5 ноября 2018 г.). «Начинается амбициозный проект по секвенированию геномов 1,5 миллионов видов» . Смитсоновский институт . Проверено 3 декабря 2018 г.
- ^ Консорциум i5K (01 сентября 2013 г.). «Инициатива i5K: продвижение геномики членистоногих для знаний, здоровья человека, сельского хозяйства и окружающей среды» . Журнал наследственности . 104 (5): 595–600. дои : 10.1093/jhered/est050 . ПМК 4046820 . ПМИД 23940263 .
{{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ Ченг С., Мелконян М., Смит С.А., Брокингтон С., Арчибальд Дж.М., Делокс П.М. и др. (март 2018 г.). «10КП: План секвенирования филовариантного генома» . ГигаСайенс . 7 (3): 1–9. doi : 10.1093/gigascience/giy013 . ПМК 5869286 . ПМИД 29618049 .
- ^ Jump up to: а б Экспозито-Алонсо, Мойзес; Дрост, Хайк-Георг; Бурбано, Эрнан; Вайгель, Детлеф (01 апреля 2020 г.). «Проект «Биогеном Земли: возможности и проблемы в области геномики и сохранения растений» . Заводской журнал . 102 (2): 222–229. дои : 10.1111/tpj.14631 . PMID 31788877 .
- ^ Лю Х., Вэй Дж., Ян Т., Му В., Сун Б., Ян Т. и др. (январь 2019 г.). «Молекулярная оцифровка ботанического сада: глубокое полногеномное секвенирование 689 видов сосудистых растений из ботанического сада Жуйли» . ГигаСайенс . 8 (4). doi : 10.1093/gigascience/giz007 . ПМК 6441391 . ПМИД 30689836 .