водка
 | |
| Оригинальный автор(ы) | Виктор Рюле, Кристоф Юнгханс , Александр Лукьянов, Курт Кремер , Денис Андриенко |
|---|---|
| Разработчик(и) | Институт Макса Планка исследований полимеров Национальная лаборатория Лос-Аламоса Институт перспективной науки и технологий Бекмана Эйндховенский технологический университет [1] |
| Первоначальный выпуск | 2008 год |
| Стабильная версия | 1.6.4
/ 12 января 2021 г [2] |
| Предварительный выпуск | 2021.rc.1
/ 15 января 2021 г [3] |
| Репозиторий | github |
| Написано в | С++ , Перл , Баш |
| Операционная система | Linux , macOS , Windows , любая другая Unix. разновидность |
| Платформа | х86 , х86-64 |
| Доступно в | Английский |
| Тип | Грубое моделирование |
| Лицензия | Лицензия Апач 2.0 |
| Веб-сайт | www |
Универсальный объектно-ориентированный инструментарий для крупнозернистых приложений ( VOTCA ) представляет собой пакет крупнозернистого моделирования , который фокусируется на анализе данных молекулярной динамики, разработке систематических методов грубого анализа, а также методов, используемых для моделирования микроскопического заряда (и экситонный) транспорт в неупорядоченных полупроводниках. Первоначально он был разработан в Институте Макса Планка по исследованию полимеров , а в настоящее время поддерживается разработчиками из Института Макса Планка по исследованию полимеров , Национальной лаборатории Лос-Аламоса , Технологического университета Эйндховена и Института перспективной науки и технологий Бекмана при участии исследователей. во всем мире. [4]
Функции
[ редактировать ]VOTCA состоит из трех основных частей: набора инструментов грубой обработки (VOTCA-CSG), набора инструментов переноса заряда (VOTCA-CTP) и набора инструментов переноса возбуждения (VOTCA-XTP). Все они основаны на библиотеке VOTCA Tools, реализующей общие процедуры.
Инструментарий грубой обработки (VOTCA-CSG)
[ редактировать ]ВОДКА-CSG [4] поддерживает множество различных методов грубой обработки, в т.ч. (итеративный) Инверсия Больцмана, Обратный метод Монте-Карло, Согласование сил (также известное как многомасштабный метод грубого анализа ) и Относительная энтропия [5] метод и их гибридные комбинации, а также подходы, основанные на оптимизации, такие как симплекс и CMA . Для сбора статистики VOTCA-CSG может использовать несколько молекулярной динамики пакетов , в т.ч. GROMACS , DL_POLY, ESPResSo , ESPResSo++, LAMMPS и HOOMD-blue для выборки.
Инструментарий переноса заряда (VOTCA-CTP)
[ редактировать ]ВОДКА-CTP [6] это модуль, который выполняет расчеты перекрытия молекулярных орбиталей и может оценивать энергетический беспорядок и электронные связи, необходимые для оценки свойств переноса заряда.
Набор инструментов для передачи возбуждения (VOTCA-XTP)
[ редактировать ]VOTCA-XTP — это расширение VOTCA-CTP, позволяющее моделировать транспортировку и свойства возбуждения. [7] Поэтому он предоставляет собственную реализацию GW - BSE и базовую реализацию DFT , используя локализованные базисы . Расчеты поляризации КМ/ММ для возбужденных состояний проводятся в рамках системы Толе. Он имеет интерфейс с пакетом Quantum Chemistry ORCA для крупномасштабного производства.
Названия релизов
[ редактировать ]Основным выпускам присвоены имена:
- 1.1 СуперЭнн
- 1.2 СуперДорис
- 1.3 СуперУзма
- 1.4 СуперКурт - к Курта Кремера 60-летию [8]
- 1.5 SuperVictor — назван в честь Виктора Рюле, одного из первоначальных разработчиков ядра. [9]
- 1.6 СуперПелагея
- 1.6.2 СуперГитта
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Страница развития VOTCA
- ^ Релизы VOTCA на Github
- ^ Релизы VOTCA на Github
- ^ Перейти обратно: а б Виктор Рюле, Кристоф Юнгханс, Александр Лукьянов, Курт Кремер и Денис Андриенко. «Универсальный объектно-ориентированный набор инструментов для крупнозернистых приложений» Журнал химической теории и вычислений 5 (2009): 3201. doi : 10.1021/ct900369w
- ^ Машаяк, С.Ю.; Йохум, Мара Н.; Кошке, Константин; Алуру, Северная Каролина; Рюле, Виктор; Юнгханс, Кристоф (20 июля 2015 г.). «Относительная энтропия и методы грубой обработки, основанные на оптимизации, в VOTCA» . ПЛОС ОДИН . 10 (7): e0131754. Бибкод : 2015PLoSO..1031754M . дои : 10.1371/journal.pone.0131754 . ISSN 1932-6203 . ПМК 4507862 . ПМИД 26192992 .
- ^ Виктор Рюле, Александр Лукьянов, Фальк Мэй, Мануэль Шредер, Торстен Вехофф, Джеймс Киркпатрик, Бьорн Баумайер, Денис Андриенко. «Микроскопическое моделирование переноса заряда в неупорядоченных органических полупроводниках» Журнал химической теории и вычислений, 7 (2011): 3335. doi : 10.1021/ct200388s
- ^ Йенс Венер, Лотар Бромбахер, Джошуа Браун, Кристоф Юнгханс, Онур Чайлак, Юрий Халак, Пранав Мадикар, Джанлука Тиримбо и Бьёрн Баумайер. «Электронные возбуждения в сложных молекулярных средах: теория функций Грина многих тел в VOTCA-XTP» Журнал химической теории и вычислений. doi : 10.1021/acs.jctc.8b00617
- ^ «Вышла вотча 1.4» .
- ^ «Вышла вотча 1.5» .