Рональд Бивис

Рональд С. Бивис
Рональд С. Бивис
	Рон Бивис
Рожденный	Рональд Чарльз Бивис ; Май 1958 г. ; Виннипег , Манитоба
Национальность	Канадский
Альма-матер	Университет Манитобы
Супруг	Венди С. Бивис
	Научная карьера
Поля	Протеомика , Вычислительная биология
Учреждения	Бивис Информатика Лтд.
Диссертация	Автоматизированный сбор сухих фракций для микробортовой высокоэффективной жидкостной хроматографии-масс-спектрометрии. (1987)
Докторантура	Кен Стэндинг

Рональд Чарльз Бивис (более известный профессионально как Рон Бивис ) — канадский биохимик белков, который занимался применением масс-спектрометрии к первичной структуре белков с приложениями в области протеомики и аналитической биохимии. Он разработал методы измерения идентичности и посттрансляционной модификации состояния белков, полученных из биологических образцов, с помощью масс-спектрометрии . В настоящее время он наиболее известен разработкой новых методов анализа данных протеомики и применением результатов этих методов к проблемам вычислительной биологии . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Фон

Рональд Чарльз Бивис родился в Виннипеге , Манитоба, в мае 1958 года. Он пошел в школу в Виннипеге и в раннем возрасте заинтересовался наукой. Будучи учеником старшей школы, он участвовал в Манитобской научной ярмарке проектов, связанных с химией и физикой. Он получил степень бакалавра наук. (с отличием) в области зоологии и физики и доктор философии. (физика) из Университета Манитобы.

Текущий статус

Бивис является основателем Beavis Informatics Ltd, канадской компании, предоставляющей консультационные услуги в общей области протеомики на основе масс-спектрометрии. ^{[ 7 ]} Он курирует разработку и эксплуатацию проектов GPM и GPMDB .

Профессиональная принадлежность

Бивис был одним из основателей Genome Prairie и одним из основателей ProteoMetrics, LLC. Он занимал академические должности в Университете Рокфеллера, Мемориальном университете Ньюфаундленда и Лабрадора, Медицинском центре Нью-Йоркского университета, Университете Британской Колумбии и Университете Манитобы. Он входил в редакционно-консультативный совет журнала исследований протеома и быстрых коммуникаций в масс-спектрометрии . Он также работал в редакционной коллегии журнала «Молекулярная и клеточная протеомика» и в редакционной коллегии журнала « Научные данные» . Он был участником проекта «Протеом человека» и одним из основателей проекта «Хромосома 17» в США. Он часто сотрудничал с Дэвидом Феньё в проектах по информатике.

Почести и награды

Постдокторская стипендия НАТО (1987)
Президентская премия за инновации, Eli Lilly & Co. (1999 г.)
Йенская стипендия (2003)
Кафедра исследований Канады уровня I (2007 г.)

Ссылки

^ Крейг, Р.; Кортенс, JP; Бивис, Р.К. (2004). «Система с открытым исходным кодом для анализа, проверки и хранения данных идентификации белков». Журнал исследований протеома . 3 (6): 1234–42. дои : 10.1021/pr049882h . ПМИД 15595733 .
^ Феньо, Д.; Финни, бакалавр наук; Бивис, Р.К. (2007). «Определение общей ценности наборов данных для идентификации белков: Rho-диаграммы и rho-показатели». Журнал исследований протеома . 6 (5): 1997–2004. дои : 10.1021/pr070025y . ПМИД 17397212 .
^ Бинц, Пенсильвания; Баркович, Р; Бивис, Колорадо; Кризи, Д; Хорн, ДМ; Джулиан-младший, РК; Сеймур, СЛ; Тейлор, CF; Ванденбрук, Ю (2008). «Руководство по отчетности об использовании масс-спектрометрической информатики в протеомике» . Природная биотехнология . 26 (8): 862. doi : 10.1038/nbt0808-862 . ПМИД 18688233 . S2CID 205270035 .
^ Крейг, Р.; Бивис, Р.К. (2004). «ТАНДЕМ: Сопоставление белков с тандемными масс-спектрами» . Биоинформатика . 20 (9): 1466–7. doi : 10.1093/биоинформатика/bth092 . ПМИД 14976030 .
^ Лейн, Л; Байрох, А; Бивис, Колорадо; Дойч, EW; Годе, П; Лундберг, Э; Оменн, GS (2014). «Метрики проекта «Протеом человека 2013-2014» и стратегии поиска недостающих белков» . Журнал исследований протеома . 13 (1): 15–20. дои : 10.1021/pr401144x . ПМЦ 3928647 . ПМИД 24364385 .
^ Лю, С; Я, Х; Байрох, А; Кристофанилли, М; Чен, Р; Дойч, EW; Далтон, С; Феньо, Д; Фанаян, С; Гейтс, К; Годе, П; Хинкапи, М; Ханаш, С; Ким, Х; Чон, СК; Лундберг, Э; Миас, Г; Менон, Р; Му, З; Приятно, Э; Пайк, Ю.К.; Улен, М; Уэллс, Л; Ву, СЛ; Ян, Ф; Чжан, Ф; Чжан, Ю; Снайдер, М; Оменн, Г.С.; и др. (2013). «Проект хромосомно-ориентированного протеома человека (C-HPP) для характеристики наборов белков, кодируемых в хромосоме 17» . Журнал исследований протеома . 12 (1): 45–57. дои : 10.1021/pr300985j . ПМЦ 4142220 . ПМИД 23259914 .
^ «Глобальная протеомная машина и база данных» . Проверено 8 сентября 2014 г.

Последние публикации

Перес-Ривероль, Яссет; Бай, Минцзе; да Вейга Лепрево, Фелипе; Скиццато, Сильвано; Пак, Ён Ми; Хауг, Кеннет; Кэрролл, Адам Дж; Сполдинг, Дилан; Паскалл, Джастин; Ван, Минсюнь; дель-Торо, Ноэми; Тернент, Тобиас; Чжан, Пэн; Бусо, Никола; Бандейра, Нуно; Дойч, Эрик В; Кэмпбелл, Дэвид С; Бивис, Рональд С; Салек, Реза М; Сарканс, Угис; Петришак, Роберт; Киз, Мария; Фэи, Эоин; Суд, Маниш; Субраманиам, Шанкар; Барбера, Ариана; Хименес, Рафаэль С; Несвижский, Алексей I; Сансоне, Сусанна-Ассунта; Стейнбек, Кристоф; Лопес, Родриго; Вискайно, Хуан А; Пинг, Пейбэй; Хермякоб, Хеннинг (2017). «Обнаружение и связывание общедоступных наборов данных OMICS с использованием индекса Omics Discovery Index» . Природная биотехнология . 35 (5): 406–409. дои : 10.1038/nbt.3790 . ISSN 1087-0156 . ПМЦ 5831141 . ПМИД 28486464 .
Оменн, Гилберт С.; Лейн, Лиди; Лундберг, Эмма К.; Бивис, Рональд К.; В целом, Кристофер М.; Дойч, Эрик В. (2016). «Метрики проекта протеома человека 2016: прогресс в идентификации и характеристике протеома человека, включая посттрансляционные модификации» . Журнал исследований протеома . 15 (11): 3951–3960. doi : 10.1021/acs.jproteome.6b00511 . ISSN 1535-3893 . ПМК 5129622 . ПМИД 27487407 .
Спайсер, Вик; Эззати, Пейман; Нойстатер, Хейли; Бивис, Рональд К.; Уилкинс, Джон А.; Крохин, Олег В. (2016). «3D ВЭЖХ-МС с функцией обращенно-фазового разделения во всех трех измерениях для крупномасштабного сбора данных по протеомике снизу вверх и удержанию пептидов». Аналитическая химия . 88 (5): 2847–2855. дои : 10.1021/acs.analchem.5b04567 . ISSN 0003-2700 . ПМИД 26849966 .
Киган, Сара; Кортенс, Джон П.; Бивис, Рональд С; Феньё, Дэвид (2016). «g2pDB: база данных, сопоставляющая посттрансляционные модификации белков с координатами генома». Журнал исследований протеома . 15 (3): 983–990. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b01018 . ISSN 1535-3893 . ПМИД 26842767 .
Макафи, Элисон; Харпур, Брок А.; Мишо, Сара; Бивис, Рональд К.; Кент, Клемент Ф.; Заид, Амро; Фостер, Леонард Дж. (2016). «На пути к улучшенной аннотации генома медоносной пчелы (Apis melliferaL.) с использованием протеогеномики». Журнал исследований протеома . 15 (2): 411–421. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b00589 . ISSN 1535-3893 . ПМИД 26718741 .
Феньё, Дэвид; Бивис, Рональд К. (2015). «Селеноцистеин: зачем ты?». Журнал исследований протеома . 15 (2): 677–678. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b01028 . ISSN 1535-3893 . ПМИД 26680273 .
Лю, Фэй; Коваль, Майкл; Ранганатан, Шоба; Фанаян, Сьюзен; Хэнкок, Уильям С.; Лундберг, Эмма К.; Бивис, Рональд К.; Лейн, Лиди; Дуек, Паула; Маккуэйд, Леон; Келлехер, Нил Л.; Бейкер, Марк С. (2016). «Системная протеомика: взгляд на эндогенное семейство белков клаудина человека» . Журнал исследований протеома . 15 (2): 339–359. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b00769 . ISSN 1535-3893 . ПМЦ 4777318 . ПМИД 26680015 .
Ян, Джулия Фангфэй; Ким, Хоген; Чон, Сыль Ки; Ли, Хён Джу; Сетхи, Манвин К.; Ли, Лин Ю.; Бивис, Рональд К.; Я, Хогун; Снайдер, Майкл П.; Хофри, Матан; Идекер, Трей; Ву, Шиау-лин; Пайк, Ён-Ки; Фанаян, Сьюзен; Хэнкок, Уильям С. (2015). «Комплексный протеомный и геномный анализ тканей больных раком желудка» . Журнал исследований протеома . 14 (12): 4995–5006. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b00827 . ISSN 1535-3893 . ПМК 5706558 . ПМИД 26435392 .
Оменн, Гилберт С.; Лейн, Лиди; Лундберг, Эмма К.; Бивис, Рональд К.; Несвижский, Алексей Иванович; Дойч, Эрик В. (2015). «Метрики проекта протеома человека 2015: прогресс в области протеома человека и рекомендации по высокодостоверной идентификации белков» . Журнал исследований протеома . 14 (9): 3452–3460. doi : 10.1021/acs.jproteome.5b00499 . ISSN 1535-3893 . ПМЦ 4755311 . ПМИД 26155816 .
Феньё, Дэвид; Бивис, Рональд К. (2015). «Интерфейс REST GPMDB» . Биоинформатика . 31 (12): 2056–2058. doi : 10.1093/биоинформатика/btv107 . ISSN 1367-4803 . ПМИД 25697819 .

[1] Крейг, Р.; Кортенс, JP; Бивис, Р.К. (2004). «Система с открытым исходным кодом для анализа, проверки и хранения данных идентификации белков». Журнал исследований протеома . 3 (6): 1234–42. дои : 10.1021/pr049882h . ПМИД 15595733 .

[2] Феньо, Д.; Финни, бакалавр наук; Бивис, Р.К. (2007). «Определение общей ценности наборов данных для идентификации белков: Rho-диаграммы и rho-показатели». Журнал исследований протеома . 6 (5): 1997–2004. дои : 10.1021/pr070025y . ПМИД 17397212 .

[3] Бинц, Пенсильвания; Баркович, Р; Бивис, Колорадо; Кризи, Д; Хорн, ДМ; Джулиан-младший, РК; Сеймур, СЛ; Тейлор, CF; Ванденбрук, Ю (2008). «Руководство по отчетности об использовании масс-спектрометрической информатики в протеомике» . Природная биотехнология . 26 (8): 862. doi : 10.1038/nbt0808-862 . ПМИД 18688233 . S2CID 205270035 .

[4] Крейг, Р.; Бивис, Р.К. (2004). «ТАНДЕМ: Сопоставление белков с тандемными масс-спектрами» . Биоинформатика . 20 (9): 1466–7. doi : 10.1093/биоинформатика/bth092 . ПМИД 14976030 .

[5] Лейн, Л; Байрох, А; Бивис, Колорадо; Дойч, EW; Годе, П; Лундберг, Э; Оменн, GS (2014). «Метрики проекта «Протеом человека 2013-2014» и стратегии поиска недостающих белков» . Журнал исследований протеома . 13 (1): 15–20. дои : 10.1021/pr401144x . ПМЦ 3928647 . ПМИД 24364385 .

[6] Лю, С; Я, Х; Байрох, А; Кристофанилли, М; Чен, Р; Дойч, EW; Далтон, С; Феньо, Д; Фанаян, С; Гейтс, К; Годе, П; Хинкапи, М; Ханаш, С; Ким, Х; Чон, СК; Лундберг, Э; Миас, Г; Менон, Р; Му, З; Приятно, Э; Пайк, Ю.К.; Улен, М; Уэллс, Л; Ву, СЛ; Ян, Ф; Чжан, Ф; Чжан, Ю; Снайдер, М; Оменн, Г.С.; и др. (2013). «Проект хромосомно-ориентированного протеома человека (C-HPP) для характеристики наборов белков, кодируемых в хромосоме 17» . Журнал исследований протеома . 12 (1): 45–57. дои : 10.1021/pr300985j . ПМЦ 4142220 . ПМИД 23259914 .

[7] «Глобальная протеомная машина и база данных» . Проверено 8 сентября 2014 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ЯВЛЯЮТСЯ ВИАФ WorldCat
Национальный	Соединенные Штаты