YdaO/yuaA лидер

ydaO/yuaА лидер
ydaO/yuaА лидер
	Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности ydaO-yuaA
Идентификаторы
Символ	ydaO-yuaA
Рфам	RF00379
Другие данные
РНК Тип	Цис-рег; рибопереключатель
Домен(ы)	Бактерии
ТАК	ТАК: 0000233
PDB Структуры	ПДБе

Лидер YdaO/YuaA (теперь называемый ди-АМФ циклическим рибопереключателем ) представляет собой консервативную структуру РНК , обнаруженную выше генов ydaO и yuaA у Bacillus subtilis и родственных генов у других бактерий. Его вторичная структура и ассоциации генов были предсказаны биоинформатикой. ^{[ 1 ]}

Эти РНК действуют как рибопереключатели и воспринимают сигнальную молекулу циклического ди-АМФ . ^{[ 2 ]} Взаимодействие рибопереключателя и c-ди-АМФ обнаружено в структурах атомного разрешения. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Баррик Дж.Э., Корбино К.А., Винклер В.К., Нахви А., Мандал М., Коллинз Дж., Ли М., Рот А., Сударсан Н., Джона И., Викайзер Дж.К., Брейкер Р.Р. (2004). «Новые мотивы РНК предполагают расширение возможностей рибопереключателей в генетическом контроле бактерий» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (17): 6421–6426. дои : 10.1073/pnas.0308014101 . ПМК 404060 . ПМИД 15096624 .
^ Нельсон Дж.В., Сударсан Н., Фурукава К., Вайнберг З., Ван Дж.К., Брейкер Р.Р. (2013). «Рибопереключатели в эубактериях означают второй мессенджер c-di-AMP» . Нат. хим. Биол . 9 (12): 834–839. дои : 10.1038/nchembio.1363 . ПМЦ 3830699 . ПМИД 24141192 .
^ Гао А, Серганов А (2014). «Структурные данные о распознавании c-di-AMP рибопереключателем ydaO» . Нат. хим. Биол . 10 (9): 787–792. дои : 10.1038/nchembio.1607 . ПМЦ 4294798 . ПМИД 25086507 .
^ Рен А, Патель DJ (2014). «c-di-AMP связывает рибопереключатель ydaO в двух карманах, связанных с псевдосимметрией» . Нат. хим. Биол . 10 (9): 780–786. дои : 10.1038/nchembio.1606 . ПМЦ 4217635 . ПМИД 25086509 .
^ Джонс CP, Ферре-Д'Амаре AR (2014). «Кристаллическая структура рибопереключателя c-di-AMP обнаруживает внутреннюю псевдодимерную РНК» . ЭМБО Дж . 33 (22): 2692–2703. дои : 10.15252/embj.201489209 . ПМЦ 4282576 . ПМИД 25271255 .

Внешние ссылки

Страница лидера ydaO/yuaA в Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Баррик Дж.Э., Корбино К.А., Винклер В.К., Нахви А., Мандал М., Коллинз Дж., Ли М., Рот А., Сударсан Н., Джона И., Викайзер Дж.К., Брейкер Р.Р. (2004). «Новые мотивы РНК предполагают расширение возможностей рибопереключателей в генетическом контроле бактерий» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (17): 6421–6426. дои : 10.1073/pnas.0308014101 . ПМК 404060 . ПМИД 15096624 .

[2] Нельсон Дж.В., Сударсан Н., Фурукава К., Вайнберг З., Ван Дж.К., Брейкер Р.Р. (2013). «Рибопереключатели в эубактериях означают второй мессенджер c-di-AMP» . Нат. хим. Биол . 9 (12): 834–839. дои : 10.1038/nchembio.1363 . ПМЦ 3830699 . ПМИД 24141192 .

[3] Гао А, Серганов А (2014). «Структурные данные о распознавании c-di-AMP рибопереключателем ydaO» . Нат. хим. Биол . 10 (9): 787–792. дои : 10.1038/nchembio.1607 . ПМЦ 4294798 . ПМИД 25086507 .

[4] Рен А, Патель DJ (2014). «c-di-AMP связывает рибопереключатель ydaO в двух карманах, связанных с псевдосимметрией» . Нат. хим. Биол . 10 (9): 780–786. дои : 10.1038/nchembio.1606 . ПМЦ 4217635 . ПМИД 25086509 .

[5] Джонс CP, Ферре-Д'Амаре AR (2014). «Кристаллическая структура рибопереключателя c-di-AMP обнаруживает внутреннюю псевдодимерную РНК» . ЭМБО Дж . 33 (22): 2692–2703. дои : 10.15252/embj.201489209 . ПМЦ 4282576 . ПМИД 25271255 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]