Гаплогруппа G-M285
Гаплогруппа G1 | |
---|---|
Возможное время происхождения | 18 500 (95% ДИ 16 800 <-> 20 200) лет назад [ 1 ] |
Возможное место происхождения | возможно, Иран |
Предок | Гаплогруппа G (Y-ДНК) |
Потомки | Г1а, Г1б, Г1с |
Определение мутаций | M285 (G1), P20 (G1a), L201, L202, L203 (G1a1), L830, L831, L832, L834, L835 (G1b) |
В человека генетике гаплогруппа G-M285 или G-M342 , также известная как гаплогруппа G1 , представляет собой Y-хромосомы гаплогруппу . является первичным субкладом гаплогруппы G. Гаплогруппа G1
Возможно, считается, что G1 возник в Иране . Он имеет чрезвычайно низкую частоту в современных популяциях, за исключением (i) Ирана и его западных соседей, а также (ii) региона, охватывающего юг Центральной Сибири (Россия) и северный Казахстан . Самые базальные примеры G1, идентифицированные у живых особей, принадлежащих к субкладу G-L830, были обнаружены на территории от Аравийского полуострова ( регион северных границ Саудовской Аравии, Ад-Дава в Катаре) до евреев-ашкенази в Беларуси ( Минская область ) и Китае ( Аньхой ). [ 1 ] [ 2 ]
Генетические особенности
[ редактировать ]Почти все люди G1 имеют значение 12 по маркеру короткого тандемного повтора (STR) DYS392, и все будут иметь мутацию SNP M285 , которая характеризует эту группу. Это значение 12 также редко встречается в других гаплогруппах. Обозначение M для M285 указывает на то, что он был впервые идентифицирован в Стэнфордском университете .
M285 имеет следующие характеристики: Идентификатор ссылки — rs13447378..... Положение Y — 21151128…. Прямая последовательность праймера — ttatcctgagccgttgtccctg и обратная последовательность Тгатагагакакаггтгтакккт ....Мутация от G к C. [ 3 ] M285 впервые был описан в 2004 году Cinnioglu et al. [ 4 ]
На данный момент все протестированные люди с мутацией M285 также имеют положительную мутацию SNP M342. Если кто-то протестирует иначе, его результаты станут основой новой категории G1. M342 находится в позиции последовательности 21653330 и АГАГАГТТТТААСАГГГКГ в переднем праймере и TGGGAATCACTTTTGCAACT в обратном порядке. Это мутация от C к T. [ 4 ] M342 также был идентифицирован в Стэнфордском университете.
Кроме того, в гаплогруппе G протестированные на данный момент люди G1 являются однозначно положительными (производными) по SNP L89, в то время как все остальные люди G являются отрицательными (наследственными). Мутация SNP L89 также была обнаружена в других гаплогруппах. L89 расположен в позиции последовательности 8038725, а идентификационный номер ссылки — rs35160044. Это мутация от T к C. Обозначение L89 было предоставлено ДНК Семейного древа .
Датировка происхождения G1
[ редактировать ]Хотя научные исследования еще не датировали происхождение мутации SNP M285 G1, она, по-видимому, представляет собой одну из старых групп G, возникшую, возможно, на полпути между происхождением G и сегодняшним днем, исходя из количества мутаций маркера STR.
Географическое распространение
[ редактировать ]Географическое распространение
[ редактировать ]Хотя в большинстве научных исследований не удалось проверить наличие G1, вероятные или доказанные примеры были обнаружены в четырех группах (по географическому признаку и/или и/или вторичному субкладу):
- Иран/ Средняя Азия (включая российскую Среднюю Сибирь, Казахстан и Пакистан );
- Ближний Восток / Юго-Восточная Европа (например, Греция , Турция , Ирак , Дубай , Государство Израиль , Иордания , Саудовская Аравия и Йемен );
- в очень небольшом количестве в Южной Азии (например, в Непале , Индии и Шри-Ланке );
- на очень низких частотах в остальной Европе . [ 5 ] [ 6 ]
Самая высокая зарегистрированная концентрация G1 и его подгрупп в одной стране наблюдается в Иране , затем следуют по частоте концентрации в соседних странах на западе. В частности, в одном исследовании G1 был обнаружен в 5% из 177 образцов из южного Ирана. В том же исследовании G1 был обнаружен в 3% из 33 образцов на севере Ирана. Процент на юге был почти равен проценту G2, единственного региона в мире, где типы G2 не оказались сильно доминирующими. [ 7 ] Более ранние исследования, которые обнаружили примерно одинаковый процент G в различных частях Ирана, не смогли проверить конкретно G1. [ 8 ] [ 9 ]
В Турции Чинниоглу обнаружил 1% из 523 образцов всех типов, принадлежащих к гаплогруппе G1, и, как и все доступные G1 за пределами Ирана, G1 был затмеваем гораздо большим количеством мужчин G2 в выборке. Все образцы G1 в этом исследовании, кроме одного, принадлежали к дальнейшей подгруппе G1a, и все образцы были из северо-восточной Турции. [ 10 ]
Исследование Ливана, проведенное Zalloua et al. не удалось провести тест на G1, но 26% из 38 образцов G имели значение 12 для STR-маркера DYS392, почти всегда характерное для G1. Эти образцы G1 составляют лишь 2% от общего числа 587 ливанских образцов и были хорошо распределены среди всех религиозных групп страны. [ 11 ]
Более широкое исследование Леванта , проведенное Эль-Сибаем и др. также не удалось провести тест на G1, но 12% из 17 сирийских образцов G имели значение 12 при DYS392. Эти образцы G1 составляют менее 1% из 354 сирийских образцов. В том же исследовании 21% из 14 иорданских образцов G имели значение 12. Эти образцы G1 составляют 1% из 274 иорданских образцов. Ни один из 8 египетских образцов G не имел значения 12. [ 12 ]
Вероятные образцы G в базе данных YHRD [ 13 ] из региона Южного Кавказа ( Азербайджан , Грузия , Армения , Абазиния , Абхазия ) и с Северного Кавказа (северные осетины, кабардинцы , ингуши, даргинцы , лезгины, рутульцы и чеченцы) имеют только несколько 12-значных образцов DYS392, которые могут быть G1.
Участки с концентрацией G1
[ редактировать ]Самая высокая концентрация G1 внутри отдельной группы внутри страны была зарегистрирована среди казахского племени аргын – 67% и его ветви маджаров Казахстана , где люди G1 составляли 87% из 45 выборок. [ 14 ]
Подгруппы G1
[ редактировать ]Подгруппы, определенные SNP
[ редактировать ]Подгруппа G1a (P20) довольно распространена среди людей G1, но надежность SNP P20 при идентификации людей G1a делает некоторые тесты на P20 проблематичными. [ 15 ] Результаты P20 могут быть представлены как P20.1, P20.2 и P20.3, и у людей могут быть разные результаты для каждого из них. Технические характеристики P20: позиция Y — 25029911; 23396163.....передний капсюль tggatctgattcacaggtag .....обратный праймер ccaacaatatgtcacaatctc ...мутация представляет собой делецию C. [ 3 ] Мутация была обнаружена в Университете Аризоны и впервые зарегистрирована Консорциумом Y-хромосомы в 2002 году. [ 16 ] Категория G1a имеет отдельную подгруппу по наличию значения 8 в маркере коротких тандемных повторов DYS494. За исключением этой подгруппы G1a, все остальные люди G имеют 9 этого медленно мутирующего маркера. На данный момент около половины людей G1a, которые иначе не были бы отнесены к группе, имеют это значение 8. [ 17 ]
G1a1 (L201, L202 и L203) были идентифицированы у человека G1a, протестированного с помощью ДНК-анализа «Семейное древо» осенью 2009 года. Последующее тестирование показало, что только некоторые люди G1a имеют эти мутации, и на данный момент все они происходят из близкородственной -ашкенази еврейской группы мужчин . . Были отмечены следующие позиции Y: 2718285 для L201, 13001714 для L202 и 13001715 для L203. В L201 мутация C на T; в L202 от Т до С; и в L203 от A до G. Если бы у какого-либо человека была одна из этих мутаций SNP без других, эта информация стала бы основой новой классификации G1a1.
Старый G1b (P76) был удален из официального списка в августе 2012 года, поскольку его обнаружение у одного человека делает его пока лишь частным SNP.
G1b (L830, L831, L832, L834, L835) были идентифицированы в конце 2011 года в генеалогическом древе ДНК . Мутации G1c: L830 (от T до C в положении 6923908), L831 (от T до C в положении 6991562), L832 (от T до G в положении 12796626), L834 (от T до A в положении 16019950), L835 (от G до A). в позиции 16291409).
Кластеры значений маркера STR
[ редактировать ]Существуют две отличительные кластеры евреев- ашкенази европейского происхождения в пределах G1a1 и G1c и особый кластер G1a казахов - все три основаны на значениях маркера коротких тандемных повторов (STR). [ 18 ] Мужчины в еврейском кластере G1c имеют значение 12 по STR-маркеру DYS446, что на несколько значений ниже, чем почти у всех людей G, но в двух других группах отсутствует одно конкретное значение маркера в качестве идентификатора. Когда при сравнении образцов доступно примерно 30 или более маркеров STR, легко определить членов каждой из трех групп. Одна из характерных комбинаций значений маркера STR евреев-ашкенази G1c европейского происхождения обнаружена также у иракского еврея в одном исследовании. [ 19 ] См. также страницу, посвященную евреям с гаплогруппой G (Y-ДНК) .
Среди доступных образцов G1 STR с 67 маркерами: [ 18 ] Еврейский кластер ашкенази G1a1 представляет собой ближайших родственников казахского кластера G1a на основании сходства значений маркера STR.
Ашкеназский кластер G1c лишь отдаленно связан с ашкеназским кластером G1a1, а ашкеназский кластер G1c имеет ближайших родственников среди различных европейцев.
Миграции лиц Г1
[ редактировать ]Концентрация G1, обнаруженная сегодня в Иране и на прилегающей территории к его западу, предполагает, но не доказывает, что эта же самая территория была местом происхождения G1. Из-за длительного возраста G1, отдаленные миграции небольшого числа людей G1 могли произойти в любое время в течение исторического периода посредством различных типов перемещения населения. Было бы спекулятивно предполагать, как группы мужчин ашкенази G1 или казахские группы мужчин G1 прибыли в северо-восточную Европу и Казахстан соответственно.
См. также
[ редактировать ]- генетическая генеалогия
- Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
- Гаплогруппа G (Y-ДНК) Страна за страной
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Доступ к YFull YTree v8.07.00 осуществлен 30 августа 2020 г.
- ^ «Добро пожаловать в FamilyTreeDNA Discover (бета)» . FamilyTreeDNA Discover (бета) .
- ^ Jump up to: а б Карафат, Т.; и др. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–38. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
- ^ Jump up to: а б Чинниоглу, К.; и др. (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF) . Генетика человека . 114 (2): 127–48. дои : 10.1007/s00439-003-1031-4 . ПМИД 14586639 . S2CID 10763736 . Архивировано из оригинала (PDF) 19 июня 2006 г.
- ^ «Образцы проекта гаплогруппы G» .
- ^ «Категории, образцы, диаграммы и т. д. гаплогруппы G: более 2800 образцов G из 83 стран» . Архивировано из оригинала 27 сентября 2011 г.
- ^ Регейро М., Каденас А.М., Гайден Т., Андерхилл П.А., Эррера Р.Дж. (2006). «Иран: трехконтинентальная связь для миграции, вызванной Y-хромосомой» . Наследственность человека . 61 (3): 132–43. дои : 10.1159/000093774 . ПМИД 16770078 . S2CID 7017701 .
- ^ Насидзе, И; и др. (2006). «Сопутствующая замена языка и мтДНК в южнокаспийских популяциях Ирана» . Современная биология . 16 (7): 668–73. дои : 10.1016/j.cub.2006.02.021 . ПМИД 16581511 . S2CID 7883334 .
- ^ Насидзе, И; и др. (2008). «Тесная генетическая связь между семитоязычными и индоевропейскоязычными группами в Иране». Анналы генетики человека . 72 (Часть 2): 241–52. дои : 10.1111/j.1469-1809.2007.00413.x . ПМИД 18205892 . S2CID 5873833 .
- ^ Чинниоглу, К.; и др. (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии». Генетика человека . 114 (2): 127–48. дои : 10.1007/s00439-003-1031-4 . ПМИД 14586639 . S2CID 10763736 .
- ^ Заллуа, П.; и др. (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье» . Американский журнал генетики человека . 83 (5): 633–42. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.10.012 . ПМК 2668035 . ПМИД 18976729 .
- ^ Эль-Сибай, М.; и др. (2009). «Географическая структура Y-хромосомного генетического ландшафта Леванта: контраст между побережьем и сушей» . Анналы генетики человека . 73 (6): 568–81. дои : 10.1111/j.1469-1809.2009.00538.x . ПМЦ 3312577 . ПМИД 19686289 .
- ^ "Поиск" . МПД . Архивировано из оригинала 13 января 2024 г.
- ^ Биро, А.; Залан, А.; и др. (2009). «Y-хромосомное сравнение маджар (Казахстан) и мадьяр (Венгрия)» . Американский журнал физической антропологии . 139 (3): 305–10. дои : 10.1002/ajpa.20984 . ПМИД 19170200 . Архивировано из оригинала 05 января 2013 г.
- ^ «Отчет Томаса Крана» .
- ^ Консорциум Y-хромосомы (2002). «Номенклатурная система дерева бинарных гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 12 (2): 339–48. дои : 10.1101/гр.217602 . ПМК 155271 . ПМИД 11827954 .
- ^ «Результаты проекта гаплогруппы G» .
- ^ Jump up to: а б «Реестр проектов» . Проект гаплогруппы G.
- ^ Хаммер, М.; и др. (2009). «Расширенные гаплотипы Y-хромосомы определяют многочисленные и уникальные линии еврейского духовенства» . Генетика человека . 126 (5): 719–24. дои : 10.1007/s00439-009-0727-5 . ПМЦ 2771134 . ПМИД 19669163 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- «Сайт проекта гаплогруппы G» . Архивировано из оригинала 31 июля 2014 г.
- «Распространение гаплогруппы G» . Нэшнл Географик . Архивировано из оригинала 16 ноября 2006 г.
- «Учебное пособие по гаплогруппе G из Genebase» . Архивировано из оригинала 16 июня 2009 г.
- «Гаплогруппа G Y-ДНК и ее субклады из гаплодерева ISOGG 2010 года» .
- Balanovsky, Oleg; Zhabagin, Maxat; Agdzhoyan, Anastasiya; Chukhryaeva, Marina; Zaporozhchenko, Valery; Utevska, Olga; Highnam, Gareth; Sabitov, Zhaxylyk; Greenspan, Elliott; Dibirova, Khadizhat; Skhalyakho, Roza; Kuznetsova, Marina; Koshel, Sergey; Yusupov, Yuldash; Nymadawa, Pagbajabyn; Zhumadilov, Zhaxybay; Pocheshkhova, Elvira; Haber, Marc; a. Zalloua, Pierre; Yepiskoposyan, Levon; Dybo, Anna; Tyler-Smith, Chris; Balanovska, Elena (2015). "Deep Phylogenetic Analysis of Haplogroup G1 Provides Estimates of SNP and STR Mutation Rates on the Human Y-Chromosome and Reveals Migrations of Iranic Speakers" . PLOS ONE . 10 (4): e0122968. Bibcode : 2015PLoSO..1022968B . doi : 10.1371/journal.pone.0122968 . PMC 4388827 . PMID 25849548 .