белки@дома
 Заставка Белки@Дома | |
| Операционная система | Кросс-платформенный |
|---|---|
| Платформа | БОИНК |
белки@дома [1] был добровольным вычислительным проектом, в котором использовалась архитектура BOINC . Проект осуществлялся кафедрой биологии Политехнической школы . Проект начался 28 декабря 2006 г. и завершился в июне 2008 г.
Цель
[ редактировать ]«протеины @home» представляли собой крупномасштабный некоммерческий по прогнозированию структуры белков проект , в котором использовались добровольные компьютеры для выполнения интенсивных вычислений за небольшой промежуток времени. С их сайта:
Аминокислотная последовательность белка определяет его трехмерную структуру или «складку». И наоборот, трехмерная структура совместима с большим, но ограниченным набором аминокислотных последовательностей. Перечисление разрешенных последовательностей для заданной складки известно как «обратная задача сворачивания белка». Мы работаем над решением этой проблемы для большого количества известных складок белка (репрезентативное подмножество: около 1500 складок). Самый дорогостоящий шаг — создать базу данных энергетических функций, описывающую все эти структуры. Для каждой структуры мы рассматриваем все возможные последовательности аминокислот. Удивительно, но это вполне осуществимо с помощью вычислений, поскольку наши энергетические функции представляют собой суммы по парам взаимодействий. Как только это будет сделано, мы сможем быстро и эффективно исследовать пространство аминокислотных последовательностей и сохранить наиболее благоприятные последовательности. Это крупномасштабное картирование пространства последовательностей белков будет иметь применение для прогнозирования структуры и функций белков, для понимания эволюции белков и для проектирования новых белков. Присоединившись к проекту, вы поможете создать базу данных энергетических функций и продвинуть важную область науки с потенциальными биомедицинскими применениями. [2]
См. также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шмидт-ам-Буш, Марсель; Лопес, Энн; Миньон, Дэвид; Симонсон, Томас (29 мая 2008 г.). «Вычислительный дизайн белка: программная реализация, оптимизация параметров и производительность простой модели» . Журнал вычислительной химии . 29 (7): 1092–1102. дои : 10.1002/jcc.20870 . ISSN 1096-987X . ПМИД 18069664 . S2CID 890739 . Архивировано из оригинала 14 августа 2022 г. Проверено 05 сентября 2022 г.
- ^ «белки@дома» . 15 марта 2007 г. Архивировано из оригинала 15 марта 2007 г. Проверено 20 сентября 2022 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ] | Эта по информатике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта статья о компьютерах незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |