✖


Jump to content

Сетка мирового сообщества

Сетка мирового сообщества
Разработчик(и)
Первоначальный выпуск 16 ноября 2004 г. ( 16 ноября 2004 г. ) [1]
Стабильная версия 7.16.19
Статус разработки Активный
Операционная система • Microsoft Windows
• Линукс
• macOS
• Андроид
• ОС Raspberry Pi
Платформа БОИНК
Тип Волонтерские вычисления
Средняя производительность 402 терафлопс [2]
Активные пользователи 23,248 [2]
Всего пользователей 79,354 [2]
Активные хосты 57,672 [2]
Всего хостов 5,517,865 [2]
Веб-сайт www .worldcommunitygrid .org

World Community Grid ( WCG ) — это попытка создать крупнейшую в мире добровольную вычислительную платформу для проведения научных исследований, приносящих пользу человечеству. [3] Запущенная 16 ноября 2004 года с собственным Grid MP клиентом от United Devices и добавлением поддержки Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) в 2005 году, World Community Grid в конечном итоге прекратила выпуск клиента Grid MP и консолидировалась на платформе BOINC в 2008 году. [4] В сентябре 2021 года было объявлено, что IBM передала право собственности Научно-исследовательскому институту Крембила университетской сети здравоохранения в Торонто , Онтарио . [5]

World Community Grid использует неиспользуемую вычислительную мощность потребительских устройств (ПК, ноутбуков, смартфонов Android и т. д.) для анализа данных, созданных исследовательскими группами, участвующими в сети. В проектах WCG были проанализированы данные, связанные с геномом человека , микробиомом человека , ВИЧ , лихорадкой денге , мышечной дистрофией , раком , гриппом , Эболой , вирусом Зика , виртуальным скринингом , урожайностью риса , чистой энергией , очисткой воды и COVID-19 , среди прочего. области исследований. [6]

В настоящее время существует пять активных проектов и 26 завершенных проектов. [7] Некоторые из этих проектов опубликовали рецензируемые статьи, основанные на анализе данных, полученных WCG. К ним относятся документ проекта OpenZika об открытии соединения (FAM 3), которое ингибирует белок NS3- хеликазы вируса Зика, тем самым снижая репликацию вируса до 86%; [8] [9] документ FightAIDS@home, посвященный обнаружению новых уязвимостей в капсидном белке ВИЧ-1 , которые могут позволить создать новую мишень для лекарств; [10] [11] документ FightAIDS@home о новых вычислительных методах открытия лекарств для более точных и точных результатов. [12] [13]

История [ править ]

В 2003 году IBM и другие участники исследования спонсировали проект «Сетевая сеть исследований оспы», чтобы ускорить открытие лекарства от оспы . [14] В исследовании оспы использовалась массивная распределенная вычислительная сеть для анализа эффективности соединений против оспы. [15] Проект позволил ученым проверить 35 миллионов потенциальных молекул лекарств на предмет сравнения с несколькими белками оспы, чтобы выявить хороших кандидатов для разработки средств лечения оспы. За первые 72 часа было получено 100 000 результатов. К концу проекта было выявлено 44 сильных кандидата на лечение. [16] Основываясь на успехе исследования оспы, IBM объявила о создании World Community Grid 16 ноября 2004 г. с целью создания технической среды, в которой можно было бы проводить другие гуманитарные исследования. [1] [15]

Первоначально World Community Grid поддерживала только Windows, используя проприетарное программное обеспечение Grid MP от United Devices , которое легло в основу проектов распределенных вычислений Grid.org . Спрос на поддержку Linux привел к добавлению в ноябре 2005 года программного обеспечения Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) с открытым исходным кодом , которое поддерживает такие проекты, как SETI@home и Climateprediction . [17] Поддержка Mac OS и Linux была добавлена ​​с момента появления BOINC. [18] В 2007 году World Community Grid перешла с Grid MP на BOINC для всех поддерживаемых платформ. [19]

В сентябре 2021 года IBM объявила о передаче права собственности на World Community Grid Исследовательскому институту Крембиля . Весь переходный процесс будет происходить в течение следующих нескольких месяцев. [5]

Масштаб проекта [ править ]

По состоянию на 8 января 2023 года у World Community Grid было более 23 000 активных учетных записей пользователей и более 57 000 активных устройств. [2] В ходе проекта было потрачено более 2 000 000 лет вычислительного времени и выполнено более 6 миллиардов единиц работы. [20]

Операция [ править ]

компьютера Клиентское программное обеспечение World Community Grid работает в фоновом режиме и отображается в виде небольшого значка на панели задач . Когда используется клиент BOINC , как в этом примере, значок имеет желто-синий цвет.
Окно состояния клиентского программного обеспечения, отображающее информацию о работе, выполняемой в фоновом режиме. Этот конкретный компьютер на 95,6% укомплектован своим текущим рабочим устройством. Когда он достигнет 100%, начнется новый рабочий блок, а результаты предыдущего рабочего блока будут переданы обратно в WCG.

Программное обеспечение World Community Grid использует неиспользованное вычислительное время подключенных к Интернету устройств для выполнения исследовательских расчетов. [21] Пользователи устанавливают клиентское программное обеспечение WCG на свои устройства. Это программное обеспечение работает в фоновом режиме, используя свободные системные ресурсы для обработки работы WCG. [21] [22] Когда часть работы или рабочий блок завершена, клиентское программное обеспечение отправляет его обратно в WCG через Интернет и загружает новый рабочий блок. [3] [23] Чтобы обеспечить точность, серверы WCG рассылают несколько копий каждого рабочего модуля. [24] Затем, когда результаты получены, они собираются и проверяются друг против друга. [25]

World Community Grid предлагает несколько гуманитарных проектов под одной крышей.По умолчанию пользователи включаются в подмножество проектов, но могут отказаться от участия в проектах по своему усмотрению. [26]

Несмотря на то, что WCG использует клиентское программное обеспечение с открытым исходным кодом, реальные приложения, выполняющие научные расчеты, могут им не пользоваться. Однако некоторые научные приложения доступны по бесплатной лицензии, хотя исходный код недоступен непосредственно у WCG. [27]

Возможные проблемы [ править ]

На рисунке показана конкретная история использования двух ЦП (в режиме Hyper-threading ), когда клиентское программное обеспечение BOINC обрабатывает две задачи на каждом ЦП под Microsoft Windows XP SP2. История использования ЦП показывает колебания от почти 0% до 100% с интервалом от пика до пика в 3 секунды , когда скорость просмотра + обновления установлена ​​на высокую, в первой половине периода записи. Оставшаяся половина периода истории настроена на нормальную скорость обновления, верхняя часть истории использования ЦП показывает чуть более 60%, а нижняя часть истории использования ЦП показывает примерно 35%. в среднем.

Программное обеспечение World Community Grid увеличивает загрузку ЦП , потребляя неиспользуемое время обработки; в конце 1990-х и начале 2000-х такие расчеты были призваны сократить «бесполезные» циклы ЦП. [28] В современных процессорах, в которых преобладает динамическое масштабирование частоты , увеличение нагрузки заставляет процессор работать на более высокой частоте. [29] увеличение энергопотребления и нагрева в противовес управлению питанием . Кроме того, из-за растущего внимания к силовым характеристикам, [30] или производительность на ватт , подключение старых/неэффективных компьютеров к сети увеличит общую/среднюю мощность, необходимую для выполнения тех же вычислений.

Клиент BOINC позволяет избежать замедления работы компьютера, используя различные ограничения, которые приостанавливают вычисления при недостаточности свободных ресурсов. В отличие от других проектов BOINC, World Community Grid устанавливает настройки BOINC по умолчанию консервативно, что делает вероятность повреждения компьютера крайне малой. По умолчанию дроссельная заслонка процессора составляет 60%. Дроссельная заслонка крупнозернистая; например, если использование установлено на 60 %, оно будет работать при 100 % в течение 3 секунд, а затем при 0 % в течение 2 секунд, что приведет к среднему снижению использования процессора. [31]

Дополнительная программа для компьютеров под управлением Windows — TThrottle — может решить проблему перегрева, напрямую ограничивая использование главного компьютера проектом BOINC. Он делает это путем измерения температуры процессора и/или графического процессора и соответствующим образом корректирует время работы. Он также использует более короткое время переключения (менее одной секунды), что приводит к меньшему изменению температуры во время переключения. [ нужна ссылка ]

и Статистика конкуренция ​

Вклад каждого пользователя записывается, а статистика вкладов пользователей доступна публично. [20] В связи с тем, что время обработки каждой рабочей единицы варьируется от компьютера к компьютеру и зависит от сложности рабочей единицы, скорости компьютера и количества доступных простаивающих ресурсов, вклад обычно измеряется в баллах . Баллы начисляются за каждую рабочую единицу в зависимости от усилий, необходимых для ее обработки. [32]

После завершения рабочего модуля клиент BOINC запросит количество баллов, которое, по его мнению, он заслуживает на основе тестов программного обеспечения ( см. BOINC Credit System#Cobblestones ). Поскольку несколько компьютеров обрабатывают одну и ту же рабочую единицу для обеспечения точности, серверы World Community Grid могут просматривать баллы, заявленные каждым из этих компьютеров. Серверы WCG игнорируют статистические выбросы, усредняют оставшиеся значения и присуждают полученное количество очков каждому компьютеру. [33] [34]

Внутри сетки пользователи могут присоединяться к командам, созданным организациями, группами или отдельными лицами. Команды позволяют усилить чувство принадлежности к сообществу, а также могут стимулировать конкуренцию. Поскольку команды соревнуются друг с другом, для сетки в целом выполняется больше работы. [35]

Пропаганда [ править ]

World Community Grid признает компании и организации партнерами , если они продвигают WCG внутри своей компании или организации. По состоянию на апрель 2021 года у WCG было 452 партнера. [36]

Кроме того, в рамках своих обязательств по улучшению здоровья и благосостояния людей результаты всех вычислений, выполненных в World Community Grid, публикуются в общественном достоянии и доступны научному сообществу. [3]

Научные результаты ​ ​

С момента запуска в World Community Grid реализовано более тридцати проектов. Некоторые из результатов включают в себя:

  • В феврале 2014 года ученые проекта «Помощь в борьбе с детским раком» объявили об открытии семи соединений, которые уничтожают раковые клетки нейробластомы без каких-либо видимых побочных эффектов. [37] Это открытие, сделанное при поддержке волонтеров WCG, является позитивным шагом на пути к новому лечению. Проект объявил, что ищет сотрудничества с фармацевтической компанией для разработки соединений для лечения. Учитывая успех проекта, ученые заявили, что они уже планируют последующий проект, который будет сосредоточен на других видах рака у детей , возможно, в сотрудничестве с недавно сформированной Паназиатской онкологической группой, одним из основателей которой они являются. [38]
  • По состоянию на июль 2012 года проект Human Proteome Folding Project опубликовал несколько статей с использованием данных WCG. [39] К ним относятся документ о методах проверки и новая база данных предсказаний структуры и функций белков; [40] статья об идентификации белков, регулирующих процессы в организме человека; [41] статья об анализе геномов пяти семейств растений и их протеомов, для которой с помощью WCG было создано более 29 000 белковых структур; [42] статья о протеоме Saccharomyces cerevisiae . [43]
  • Проект GO Fight Against Malaria сообщил об открытии нескольких молекул, эффективных против малярии и лекарственно-устойчивого туберкулеза (включая TDR-TB, для которого не существует лечения). В рамках проекта также проводились испытания новых молекул против MRSA , филяриатоза и бубонной чумы . Лабораторные испытания продолжаются, чтобы превратить эти молекулы в возможные методы лечения. GFAM также был первым проектом, когда-либо выполнившим миллиард различных расчетов стыковки. [44] В январе 2015 года была опубликована статья. [45] [46] еще два ожидают подачи. В июне 2015 года в проекте сообщалось, что из двух «хитов», обнаруженных против лекарственно-устойчивого штамма туберкулеза, синтезировано несколько «аналогов», лучший из которых подавляет рост микобактерии туберкулеза и относительно нетоксичен для млекопитающих. клетки. [45] Отсутствие финансирования помешало дальнейшим исследованиям данных.
  • Ученые проекта « Открытие лекарств от денге – вместе» сообщили об открытии нескольких новых ингибиторов протеазы денге, большинство из которых также ингибируют протеазу вируса Западного Нила . Некоторые из них уже прошли «важнейшие доклинические исследования фармакокинетики и эффективности». В ноябре 2014 года в обновлении сообщалось, что у ученых есть препарат, который отключает ключевой фермент, позволяющий вирусу Денге размножаться. Такое же поведение он продемонстрировал и в отношении других флавивирусов, таких как вирус Западного Нила. Никаких отрицательных побочных эффектов, таких как токсичность, канцерогенность или мутагенность, не наблюдалось, что делает этот препарат очень сильным кандидатом на противовирусное лечение этих вирусов. Сейчас ученые работают над синтезом вариантов молекулы, чтобы улучшить ее активность и провести запланированные доклинические и клинические испытания. [47] Однако в обновлении за октябрь 2018 года исследовательская группа сообщила, что ни одна из их текущих разработок не создала высокоэффективный ингибитор протеазы денге, который можно было бы протестировать in vivo . [48]
  • В июне 2013 года Проект «Чистая энергия» опубликовал базу данных, содержащую более 2,3 миллиона органических молекул, свойства которых были охарактеризованы. Из них 35 000 молекул продемонстрировали потенциал удвоения эффективности по сравнению с органическими солнечными элементами, производимыми в настоящее время. До этой инициативы учёным было известно лишь несколько материалов на основе углерода, способных эффективно преобразовывать солнечный свет в электричество. [49] [50]
  • В феврале 2010 года ученые проекта FightСПИД@Home объявили, что они обнаружили два соединения, которые делают возможным создание потенциально нового класса лекарств для борьбы со СПИДом. Соединения прикрепляются к вирусу в недавно открытых местах связывания и, таким образом, могут использоваться для «улучшения существующих методов лечения, лечения устойчивых к лекарствам штаммов заболевания и замедления развития лекарственной устойчивости вируса». [51] [52]
  • В июле 2015 года проект «Поиск лекарств от лейшманиоза» объявил, что протестировал 10 лучших соединений с самой высокой прогнозируемой эффективностью из более чем 100, выявленных с помощью рабочих подразделений WCG. Из этих 10 четверо показали «положительные результаты» при тестировании in vitro , а один показал «исключительно многообещающий результат». [53] В августе 2017 года испытания четырех соединений in vivo на хомяках показали положительные результаты: одно соединение вызвало «почти полное излечение поражений у двух из пяти хомяков». [54] Однако в обновлении за март 2018 года исследовательская группа объявила, что ни одно из 10 протестированных соединений не обладает достаточной активностью против лейшманиоза. [55]
  • В июле 2015 года проект «Вычисления для чистой воды» была опубликована статья, объявил, что в журнале Nature Nanotechnology описывающая новый тип фильтра для воды, эффективно использующий нанотрубки. «[Нанотрубки] состоят из листов атомов углерода толщиной в один атом, называемых графеном , скрученных в крошечные трубки диаметром всего несколько нанометров – одна десятитысячная диаметра человеческого волоса. Трубки пропускают молекулы воды, но блокируют более крупные патогены и загрязнения, очищая воду». Запустив моделирование на WCG, ученые обнаружили, что определенные виды естественных вибраций, называемые фононами , при определенных условиях могут привести к увеличению потока воды через нанотрубки более чем на 300% по сравнению с предыдущими теоретическими предсказаниями. [56]
  • В апреле 2015 года ученые проекта «Скажи нет шистосоме» сообщили, что был проведен последующий анализ и определены три наиболее перспективных вещества-кандидата для тестирования in vitro . [57]
  • В марте 2019 года исследователи FightAIDS@Home опубликовали статью, описывающую «новое межсубъединичное взаимодействие, критическое для базовой сборки ВИЧ-1», которое «определяет потенциально нацеливаемый карман связывания ингибитора». С помощью World Community Grid было использовано более 1,6 миллиона соединений для воздействия на 20 конформаций этого кармана. Предварительные результаты позволяют предположить, что это вероятный сайт связывания противовирусных соединений. Дальнейший анализ этих соединений является предметом независимого исследования. [58]

Активные подпроекты [ править ]

OpenPandemics - COVID-19 [ править ]

1 апреля 2020 года IBM анонсировала OpenPandemics — COVID-19 . Целью проекта является определение возможных методов лечения коронавируса 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2), который является причиной пандемии COVID-19 . WCG будет сотрудничать с Scripps Research , с которой она сотрудничала в прошлом, в частности, в FightAIDS@Home проектах . Проект работает на центральных и графических процессорах, а также послужит созданию «быстродействующего инструмента с открытым исходным кодом, который поможет всем ученым быстро искать методы лечения будущих пандемий». [6] [59] [60] [61]

Проект стартовал 14 мая 2020 года. [62]

рака Картирование ​ маркеров

Картирование маркеров рака (запущено 8 ноября 2013 г.). Проект направлен на выявление маркеров, связанных с различными типами рака, и анализирует миллионы точек данных, собранных из тысяч образцов тканей здоровых и раковых пациентов. К ним относятся ткани с раком легких, яичников, простаты, поджелудочной железы и молочной железы. Сравнивая эти различные данные, исследователи стремятся выявить закономерности маркеров для различных видов рака и соотнести их с различными результатами, включая чувствительность к различным вариантам лечения. Проект сосредоточен на 4 типах рака, причем первый из них касается рака легких, а затем перейдет к раку яичников, раку простаты и саркоме. [63] [64]

Помогите остановить туберкулез [ править ]

Программа Help Stop TB была запущена в марте 2016 года для помощи в борьбе с туберкулезом — заболеванием, вызываемым бактерией , у которой развивается устойчивость к доступным в настоящее время методам лечения. Расчеты этого проекта нацелены на миколовые кислоты в защитной оболочке бактерий, моделируя поведение этих молекул, чтобы лучше понять, как они обеспечивают защиту бактерий. [65]

рак детский Победить ​

Основная статья: Победить детский рак

запущенный в январе 2017 года, Проект Smash Childhood Cancer, основывается на работе проекта «Помощь в борьбе с детским раком» и направлен на поиск кандидатов на лекарства, нацеленные на дополнительные виды рака у детей. [66] [67] После выхода на пенсию доктора Акиры Накагавары в марте 2020 года главным исследователем стал доктор Годфри Чан, который был одним из первых членов команды Smash Childhood Cancer. Кроме того, в качестве новых целей для расследования были добавлены PRDM14 и Fox01. [68] ингибитор белка остеопонтина . Смоделирован [69]

Проект дождевых осадков в Африке

Проект Africa Rainfall Project (запущен в октябре 2019 года) будет использовать вычислительные мощности World Community Grid, данные The Weather Company и другие данные для улучшения моделирования осадков, что может помочь фермерам в странах Африки к югу от Сахары успешно выращивать урожай. [70] Объем оперативной памяти, которая может быть задействована в вычислениях, составляет от 1 до 16 гигабайт. [71]

Завершенные подпроекты [ править ]

– 1 Фаза Складывание протеома человека

Основная статья: Проект складывания протеома человека

Первым проектом, запущенным в World Community Grid, был проект по сворачиванию протеома человека, или HPF1, целью которого является предсказание структуры белков человека . Проект стартовал 16 ноября 2004 года. [72] и завершено 18 июля 2006 г. [72] Этот проект был уникален тем, что вычисления выполнялись совместно с проектом распределенных вычислений Grid.org . [73] В проекте, разработанном Ричардом Бонно из Института системной биологии , использовались сеточные вычисления для определения вероятных структур каждого белка с использованием Rosetta Score. На основе этих предсказаний исследователи надеются предсказать функции множества белков. Это более глубокое понимание человеческих белков может оказаться жизненно важным в поисках лекарств от болезней человека . [74] Вычисления для этого проекта были официально завершены 18 июля 2006 года. [75] Опубликованы результаты исследований дрожжевой части HPF1. [76]

– 2 Фаза Складывание протеома человека

Основная статья: Проект складывания протеома человека

Складывание протеома человека - Фаза 2 (HPF2) (запущен 23 июня 2006 г.) [77] ) был третьим проектом, запущенным в World Community Grid и завершенным в 2013 году. Этот проект, последовавший за HPF1, был сосредоточен на белках, секретируемых человеком , с особым упором на биомаркеры и белки на поверхности клеток, а также на плазмодии . организм, вызывающий малярию. HPF2 генерирует модели белков с более высоким разрешением, чем HPF1. Хотя эти модели с более высоким разрешением более полезны, для их создания также требуется больше вычислительной мощности. [78]

В отчете о ходе работы за июль 2012 года ученые проекта сообщили, что результаты расчетов WCG используются доктором Маркусом Ландталером из Центра молекулярной медицины Макса Дельбруха (MDC) в Берлине. Результаты HPF2 помогли доктору Маркусу Ландталеру и его сотрудникам написать новую статью «Протеом, связанный с мРНК, и его глобальный профиль занятости в транскриптах, кодирующих белок». [79]

рак Помогите победить ​

Основная статья: Помогите победить рак

Проект «Помоги победить рак» направлен на улучшение способности медицинских работников определять лучшие варианты лечения пациентов с раком груди, головы или шеи. Проект стартовал 20 июля 2006 года. [72] и завершено в апреле 2007 г. [72] Проект работал над выявлением визуальных закономерностей на большом количестве микрочипов тканей, взятых из архивных образцов тканей. Сопоставляя данные о закономерностях с информацией о лечении и результатах лечения пациентов, результаты этого проекта могут помочь предоставить более целевые варианты лечения. [80]

Сравнение геномов [ править ]

Основная статья: Проект сравнения генома Фиокруса

Проект сравнения геномов спонсируется бразильским исследовательским институтом Fiocruz . [77] Проект стартовал 21 ноября 2006 года. [72] и завершено 21 июля 2007 г. [72] Проект направлен на сравнение последовательностей генов разных организмов друг с другом, чтобы найти сходство между ними. Ученые надеются выяснить, какой цели служит определенная последовательность генов в определенной функции одного организма, сравнивая ее с аналогичной последовательностью генов с известной функцией в другом организме. [81]

вылечить мышечную дистрофию – 1 Фаза Помогите

Основная статья: Помогите вылечить мышечную дистрофию

Программа Help Cure Muscular Dystrophy проводится компанией Décrypthon , созданной в результате сотрудничества Французской ассоциации мышечной дистрофии, Французского национального центра научных исследований и IBM . Фаза 1 была запущена 19 декабря 2006 года. [77] и завершено 11 июня 2007 г. [82] В рамках проекта были исследованы белок-белковые взаимодействия для 40 000 белков, структура которых известна, с особым акцентом на те белки, которые играют роль в нервно-мышечных заболеваниях . База данных полученной информации поможет исследователям разрабатывать молекулы, которые будут ингибировать или усиливать связывание определенных макромолекул , что, как мы надеемся, приведет к более эффективному лечению мышечной дистрофии и других нервно-мышечных заболеваний. [83] Этот проект был доступен только агентам, работающим с клиентом Grid MP , что делало его недоступным для пользователей, использующих BOINC . [84]

лекарства от денге вместе Открываем –

Основная статья: Открытие лекарств от денге – вместе

Программа «Открытие лекарств от денге – вместе» спонсировалась учеными из Техасского и Чикагского университетов и будет проходить в два этапа. [85] Фаза 1, запущенная 21 августа 2007 г., [77] использовал AutoDock 2007 (то же программное обеспечение, которое использовалось для FightAIDS@Home ) для тестирования потенциальных противовирусных препаратов (посредством ингибирования протеазы NS3 ) против вирусов семейства flaviviridae и завершился 11 августа 2009 года. [86] [87] Фаза 2 «[использует] более вычислительно интенсивную программу для отбора кандидатов, прошедших фазу 1». [88] Кандидаты на лекарства, прошедшие вторую фазу, затем пройдут лабораторные испытания. [88]

AfricanClimate@Home [ править ]

Миссия AfricanClimate@Home заключалась в разработке более точных климатических моделей конкретных регионов Африки. Он был задуман как основа для понимания того, как климат изменится в будущем, чтобы можно было реализовать меры, направленные на смягчение неблагоприятных последствий изменения климата. Огромная вычислительная мощность World Community Grid была использована для понимания и уменьшения неопределенности, с которой моделировались климатические процессы в Африке. Фаза 1 программы African Climate@Home запущена 3 сентября 2007 г. [89] и завершился в июле 2008 г. [90]

рак победить Помогите ​

Основная статья: Помогите победить рак

Проект «Помогите победить рак» (запущен 1 ноября 2007 г.) [91] ) спонсируется Институтом рака Онтарио (OCI), Больницей принцессы Маргарет и Университетской сетью здравоохранения Торонто, Канада. Проект предполагает рентгеновскую кристаллографию . Миссия организации Help Conquer Cancer — улучшить результаты рентгеновской кристаллографии белков, которая помогает исследователям не только комментировать неизвестные части человеческого протеома, но и, что важно, улучшает их понимание возникновения, прогрессирования и лечения рака. [92]

Проект HCC был первым проектом WCG, в котором использовались графические процессоры (GPU), что помогло завершить его намного раньше, чем первоначально планировалось, из-за огромной мощности графических процессоров. В отчете о состоянии за апрель 2013 г. [93] Ученые сообщают, что еще предстоит проанализировать много данных, но они готовят новый проект, который будет искать прогностические и предсказательные признаки (наборы генов, белков, микроРНК и т. д.), которые помогут предсказать выживаемость пациентов и реакцию на лечение.Проект завершился в мае 2013 года. [ нужна ссылка ]

для мира всего Питательный рис

Основная статья: Питательный рис для всего мира

Проект «Питательный рис для мира» осуществляется Рама Самудралы в Исследовательской группой вычислительной биологии Вашингтонском университете . Проект был запущен 12 мая 2008 года и завершен 6 апреля 2010 года. [94] Цель этого проекта — предсказать структуру белков основных сортов риса устойчивости , чтобы помочь фермерам выводить лучшие сорта риса с более высокой урожайностью , способствовать большей к болезням и вредителям , а также использовать полный спектр биодоступных питательных веществ , которые могут принести пользу. людей во всем мире, особенно в регионах, где недоедание является серьезной проблемой. С момента запуска проект освещали более 200 СМИ. [95] 13 апреля 2010 года World Community Grid официально объявила, что проект «Питательный рис для мира» завершился 6 апреля 2010 года. [94]

В апреле 2014 года было опубликовано обновление, в котором говорилось, что исследовательская группа смогла опубликовать структурную информацию о тысячах белков и продвинуться в области компьютерного моделирования белков. Ожидается, что эти результаты, которые стали возможны только благодаря огромному количеству пожертвованных вычислительных мощностей, которыми они располагали, будут определять будущие исследования и усилия в области науки о растениях. [96]

Проект « энергия » Чистая

Основная статья: Проект «Чистая энергия»

Проект «Чистая энергия» спонсируют ученые Гарвардского университета . факультета химии и химической биологии [97] Миссия проекта «Чистая энергия» — найти новые материалы для солнечных элементов следующего поколения , а затем и для устройств хранения энергии . Исследователи используют молекулярную механику и расчеты электронной структуры , чтобы предсказать оптические и транспортные свойства молекул, которые могут стать следующим поколением материалов для солнечных батарей. [ нужна ссылка ]

Фаза 1 была запущена 5 декабря 2008 г. и завершена 13 октября 2009 г. [98] Используя вычислительные мощности World Community Grid, исследователи смогли рассчитать электронные свойства десятков тысяч органических материалов – намного больше, чем когда-либо можно было протестировать в лаборатории – и определить, какие кандидаты наиболее перспективны для разработки доступной солнечной энергии. технология. [99]

Фаза 2 стартовала 28 июня 2010 г. [100] спонсируется учеными Гарвардского университета . факультета химии и химической биологии [97] Дальнейшие расчеты оптических, электронных и других физических свойств материалов-кандидатов проводятся с помощью программного обеспечения для квантовой химии Q-Chem . [101] Их результаты были представлены в журнале Energy & Environmental Science . [102]

Помогите бороться детским с раком

Проект «Помогите бороться с детским раком» (запущен 13 марта 2009 г.) [103] ) спонсируется учеными Научно-исследовательского института онкологического центра Тиба и Университета Тиба . [104] Миссия проекта «Помощь в борьбе с детским раком» — найти лекарства, способные вывести из строя три конкретных белка, связанных с нейробластомой , одной из наиболее часто встречающихся солидных опухолей у детей. Идентификация этих препаратов потенциально может сделать болезнь гораздо более излечимой в сочетании с химиотерапией . [105]

препаратов гриппа против Поиск противовирусных

Основная статья: Поиск противовирусных препаратов против гриппа

Проект поиска противовирусных препаратов против гриппа спонсируется доктором Стэном Ватовичем и его исследовательской группой из Техасского университета Медицинского отделения ( Галвестон , Техас , США). [106] Проект был запущен 5 мая 2009 года и завершен 22 октября 2009 года. [107] Миссия проекта «Поиск противовирусных препаратов против гриппа » — найти новые препараты, способные остановить распространение гриппозной инфекции в организме. Исследование будет конкретно направлено на штаммы гриппа, которые стали устойчивыми к лекарствам, а также на появляющиеся новые штаммы. Выявление химических соединений, которые являются лучшими кандидатами, ускорит усилия по разработке методов лечения, которые были бы полезны в борьбе с сезонными вспышками гриппа, а также с будущими эпидемиями и даже пандемиями гриппа. [108] Фаза 1 проекта «Поиск противовирусных препаратов против гриппа» уже завершилась 22 октября 2009 года. Сейчас исследователи выполняют постобработку результатов фазы 1 и готовятся к фазе 2. [107]

В ноябре 2012 года ученые проекта заявили, что, поскольку непосредственной опасности вспышки гриппа нет, все результаты проекта будут размещены в Интернете, а их ресурсы будут переориентированы на проект Денге. [109]

вылечить мышечную дистрофию – 2 Фаза Помогите

Основная статья: Помогите вылечить мышечную дистрофию

World Community Grid и исследователи при поддержке Decrypthon, партнерства AFM (Французской ассоциации мышечной дистрофии), CNRS (Французского национального центра научных исследований), Университета Пьера и Марии Кюри и IBM, исследовали белок-белковые взаимодействия для более чем 2200 белков, чьи структуры известны, причем особое внимание уделяется тем белкам, которые играют роль в нервно-мышечных заболеваниях . Фаза 2 была запущена 12 мая 2009 года. [110] и завершено 26 сентября 2012 года. Созданная база данных поможет исследователям разрабатывать молекулы, которые ингибируют или усиливают связывание определенных макромолекул , что, как мы надеемся, приведет к более эффективному лечению мышечной дистрофии и других нервно-мышечных заболеваний. [111]

Вторая фаза проекта «Помощь в лечении мышечной дистрофии» началась после анализа результатов первой фазы. Фаза 2 проходила на платформе BOINC . [4] [112]

лекарств от денге – вместе – 2 Открытие Фаза

Основная статья: Открытие лекарств от лихорадки денге — вместе

Открытие лекарств от денге – вместе – фаза 2 (запущен 17 февраля 2010 г.) [113] ) спонсируется Медицинским отделением Техасского университета (UTMB) в Галвестоне , штат Техас , США, и Чикагским университетом в Иллинойсе , США. Миссия состоит в том, чтобы выявить перспективных кандидатов на лекарства для борьбы с лихорадкой Денге , гепатитом С , Западным Нилом , желтой лихорадкой и другими родственными вирусами. Обширные вычислительные мощности World Community Grid будут использоваться для выполнения структурных расчетов открытия лекарств, необходимых для идентификации этих кандидатов на лекарства. [114]

чистой Вычисления для воды

Вычисления для чистой воды (запущен 20 сентября 2010 г.) [115] [116] ) спонсируется Центром нано- и микромеханики Университета Цинхуа в Пекине . Миссия проекта — обеспечить более глубокое понимание на молекулярном уровне причин эффективного потока воды через новый класс фильтрующих материалов. Это понимание, в свою очередь, будет определять будущую разработку недорогих и более эффективных фильтров для воды. По оценкам, 1,2 миллиарда человек не имеют доступа к безопасной питьевой воде, а 2,6 миллиарда практически не имеют доступа к канализации. В результате ежегодно умирают миллионы людей – примерно 3900 детей в день – из-за нехватки чистой воды. [117] 25 апреля 2014 года ученые проекта опубликовали обновленную информацию, в которой говорилось, что у них есть впечатляющие результаты, о которых они сообщат при подаче статьи, и что проект WCG завершен. [118]

от лейшманиоза Поиск лекарств

Поиск лекарств от лейшманиоза (запущен 7 сентября 2011 г.) [119] ) возглавляется Университетом Антиокии в Медельине , Колумбия , при содействии исследователей Медицинского отделения Техасского университета в Галвестоне, Техас. Миссия состоит в том, чтобы идентифицировать потенциальные молекулы-кандидаты, которые могут быть использованы для лечения лейшманиоза . Обширные вычислительные мощности World Community Grid будут использоваться для компьютерного моделирования взаимодействий между миллионами химических соединений и определенными целевыми белками. Это поможет найти наиболее перспективные соединения, которые могут привести к эффективному лечению этого заболевания. [120]

Проект GO Fight Against Malaria [ править ]

Миссия проекта GO Fight Against Malaria (запущен 16 ноября 2011 г.) [121] ) заключается в обнаружении многообещающих кандидатов на лекарства, из которых можно было бы создать новые лекарства для лечения устойчивых к лекарствам форм малярии . Вычислительные мощности World Community Grid будут использоваться для компьютерного моделирования взаимодействий между миллионами химических соединений и определенными целевыми белками, чтобы предсказать их способность искоренить малярию. Лучшие соединения будут протестированы учеными из Научно-исследовательского института Скриппса в Ла-Хойе, Калифорния, США, и в дальнейшем разработаны для возможных методов лечения этого заболевания. [122]

шистосоме нет ​ Скажи

Скажи нет шистосоме (запущен 22 февраля 2012 г.) [123] ) стал 20-м исследовательским проектом, запущенным в World Community Grid. Исследователи из Университета Инфориум в Белу-Оризонти и FIOCRUZ-Минас , Бразилия , запустили этот проект в World Community Grid, чтобы выполнить компьютерное моделирование взаимодействий между миллионами химических соединений и определенными целевыми белками в надежде найти эффективные методы лечения шистосомоза . [124] По состоянию на апрель 2015 года был проведен последующий анализ и определены три наиболее перспективных вещества-кандидата для тестирования in vitro. [57]

устойчивого Вычисления для водоснабжения

«Вычисления для устойчивого водоснабжения» стали 21-м исследовательским проектом, запущенным в сети World Community Grid. Исследователи из Университета Вирджинии реализовали этот проект в сети World Community Grid, чтобы изучить влияние человеческой деятельности на большой водораздел и получить более глубокое понимание того, какие действия могут способствовать восстановлению, здоровью и устойчивости этого важного водного ресурса. [125] Проект стартовал 17 апреля 2012 года. [126] и завершено 17 октября 2012 г.

генома тайн Раскрытие ​

Проект «Раскрытие тайн генома» , запущенный 16 октября 2014 года, является результатом совместного сотрудничества австралийских и бразильских ученых. Целью проекта является изучение около 200 миллионов генов многих форм жизни и сравнение их с известными генами, чтобы выяснить, какова их функция. Результаты могут оказать влияние на такие области, как медицина и экологические исследования. [127]

Эболу вместе Перехитрить ​

Программа «Перехитри Эболу вместе» была результатом сотрудничества с Научно-исследовательским институтом Скриппса с целью помочь найти химические соединения для борьбы с болезнью, вызванной вирусом Эбола . [128] Он был запущен 3 декабря 2014 года. [129] Цель состоит в том, чтобы заблокировать важные этапы жизненного цикла вируса путем поиска лекарств с высоким сродством связывания с определенными его белками. Есть две мишени: поверхностный белок, используемый вирусом для заражения клеток человека, и белки-трансформеры, которые меняют форму для выполнения различных функций. [130] Проект официально завершился 6 декабря 2018 года. [131]

ОпенЗика [ править ]

OpenZika был запущен 18 мая 2016 года для помощи в борьбе с вирусом Зика . Проект нацелен на белки, которые, как полагают, используются вирусом Зика для выживания и распространения в организме, основываясь на известных результатах лечения подобных заболеваний, таких как лихорадка денге и желтая лихорадка . Эти результаты помогут исследователям разработать препарат против Зика. [132] Проект официально завершился 13 декабря 2019 года. [133]

Борьба со СПИДом@Дома [ править ]

Основная статья: FightAIDS@Home

FightAIDS@Home (запущен 19 ноября 2005 г.) [134] ) был вторым проектом World Community Grid и первым, направленным на борьбу с одним заболеванием. Каждый отдельный компьютер обрабатывает одну потенциальную молекулу лекарства и проверяет, насколько хорошо она будет стыковаться с ВИЧ протеазой , действуя как ингибитор протеазы . [135] Научно-исследовательский институт Скриппса опубликовал свою первую рецензируемую научную статью о результатах FightAIDS@Home 21 апреля 2007 года. [136] В этом документе объясняется, что полученные к этому моменту результаты в первую очередь будут использоваться для повышения эффективности будущих расчетов FightAIDS@Home. [137]

FightAIDS@Home, Фаза 2 [ править ]

FightAIDS@Home, фаза 2 (запущен 30 сентября 2015 г.) [138] ) более внимательно изучает результаты Фазы 1. На ранних этапах эксперимента проект преследует две цели; архитектура моделирования работает правильно и дает надежные результаты, а совместное использование BEDAM и AutoDock дает лучшие результаты, чем использование только BEDAM или AutoDock. [139]

иммунитета микробиому к Проект

Проект «Микробиомный иммунитет» (запущен в августе 2017 г.) представляет собой исследование белков бактерий, расположенных внутри и на теле человека; микробиом человека , который включает около 3 миллионов отдельных бактериальных генов. Изучая гены бактерий, можно узнать их индивидуальные формы, и каждая физическая форма определяет функцию бактерий. [140] В число учреждений сотрудничества входят Калифорнийский университет в Сан-Диего , Институт Броуда Массачусетского технологического института и Гарварда, а также Институт Флэтайрон Фонда Саймонса . [141]

См. также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «IBM представляет «World Community Grid» » (пресс-релиз). ИБМ . 16 ноября 2004 г. Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 11 февраля 2009 г.
  2. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж «BOINCStats» . Архивировано из оригинала 5 апреля 2023 г. Проверено 19 июня 2023 г.
  3. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с "О нас" . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 19 апреля 2022 года . Проверено 28 июля 2007 г.
  4. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б bbover3 (17 августа 2007 г.). «Объявление о миграции BOINC» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 03.11.2018 . Проверено 17 августа 2007 г. {{cite web}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  5. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «World Community Grid находит новый дом в Научно-исследовательском институте Крембиля» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 13 сентября 2021 г. Проверено 13 сентября 2021 г.
  6. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Мы хотим остановить пандемию» . IBM.org . 01.04.2020. Архивировано из оригинала 08 апреля 2020 г. Проверено 03 апреля 2020 г.
  7. ^ «Обзор исследования» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 18 апреля 2022 г. Проверено 17 апреля 2021 г.
  8. ^ Сильва С., Симидзу Дж.Ф., Оливейра Д.М., Ассис Л.Р., Биттар С., Моттин М. и др. (ноябрь 2019 г.). «Диариламин, полученный из антраниловой кислоты, ингибирует репликацию ZIKV» . Научные отчеты . 9 (1): 17703. Бибкод : 2019NatSR...917703S . дои : 10.1038/s41598-019-54169-z . ПМК   6881388 . ПМИД   31776405 .
  9. ^ «Сетка мирового сообщества — Новости» . Архивировано из оригинала 23 марта 2020 г. Проверено 17 марта 2020 г.
  10. ^ Кравёр П., Грес А.Т., Кирби К.А., Лю Д., Хаммонд Дж.А., Денг Ю. и др. (март 2019 г.). «Новое межсубъединичное взаимодействие, критическое для базовой сборки ВИЧ-1, определяет потенциально нацеливаемый карман связывания ингибитора» . мБио . 10 (2). дои : 10.1128/mBio.02858-18 . ПМК   6414707 . ПМИД   30862755 .
  11. ^ «FightAIDS@Home – исследователи фазы 1 определили новые потенциальные цели для противовирусных препаратов» . www.worldcommunitygrid.org . Проверено 17 апреля 2021 г.
  12. ^ Ся Дж., Флинн В., Галликкио Э., Уплингер К., Армстронг Дж.Д., Форли С. и др. (апрель 2019 г.). «Массовое моделирование свободной энергии связывания комплексов ВИЧ-интегразы с использованием структуры асинхронного обмена репликами, реализованной в распределенной сети IBM WCG» . Журнал химической информации и моделирования . 59 (4): 1382–1397. doi : 10.1021/acs.jcim.8b00817 . ПМК   6496938 . ПМИД   30758197 .
  13. ^ «Новая методика моделирования команды FightAIDS@Home, опубликованная в отраслевом журнале» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 17 апреля 2021 г. Проверено 17 апреля 2021 г.
  14. ^ «IBM создает сетку для исследований оспы». Архивировано 26 января 2020 г. на Wayback Machine . ComputerWeekly.com. 06 февраля 2003 г. Проверено 28 апреля 2014 г.
  15. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Компьютеры задействованы в борьбе с биотерроризмом» . Би-би-си. 5 февраля 2003 г. Архивировано из оригинала 5 ноября 2021 г. Проверено 24 ноября 2008 г.
  16. ^ Клери Д. (май 2005 г.). «Вычисления. IBM предлагает бесплатную обработку данных для проектов гуманитарных исследований». Наука . 308 (5723): 773. doi : 10.1126/science.308.5723.773a . ПМИД   15879179 . S2CID   45713783 .
  17. ^ Кнрид (31 октября 2005 г.). «Линукс здесь!!!» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 8 сентября 2014 года . Проверено 30 июля 2007 г.
  18. ^ «Системные требования» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 29 декабря 2014 года . Проверено 3 ноября 2014 г.
  19. ^ «Сетка мирового сообщества — Просмотр темы — Объявление о миграции BOINC» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 03.11.2018 . Проверено 18 августа 2007 г.
  20. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Глобальная статистика» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 мая 2023 г. Проверено 19 июня 2023 г.
  21. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Вайс Т. (17 ноября 2004 г.). « 'World Community Grid' стремится использовать неиспользуемые компьютеры» . Компьютерный мир . Архивировано из оригинала 15 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  22. ^ «Политика для участников» . Конфиденциальность и безопасность . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  23. ^ «Возврат результатов: что такое рабочая единица?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 14 июля 2007 г. Проверено 5 августа 2007 г.
  24. ^ «Установка агента Windows: если я переустановлю программное обеспечение, будет ли моя работа потеряна навсегда?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 14 июля 2007 г. Проверено 5 августа 2007 г.
  25. ^ «Очки: что такое проверка?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  26. ^ «Начало работы: я использую агент BOINC. Как мне выбрать, для какого проекта будут работать мои компьютерные процессы?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 19 февраля 2015 г. Проверено 26 сентября 2014 г.
  27. ^ «Агент: У меня есть платформа, которая не поддерживается World Community Grid. Могу ли я получить код и скомпилировать его самостоятельно?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 14 июля 2007 г. Проверено 5 августа 2007 г.
  28. ^ «SETI@Home» . Архивировано из оригинала 03 марта 2019 г. Проверено 28 июля 2017 г.
  29. ^ Хотя в Linux системах регулятор масштабирования частоты CPUfreq можно настроить иначе. Архивировано 7 июня 2017 г. на Wayback Machine с параметром ignore_nice_load.
  30. ^ «Таблица PassMark CPU TDP — Производительность/Мощность доступных процессоров» . Архивировано из оригинала 29 июля 2017 г. Проверено 28 июля 2017 г.
  31. ^ «Загрузка ЦП: почему мой компьютер показывает высокую загрузку ЦП?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 14 июля 2007 г. Проверено 5 августа 2007 г.
  32. ^ «Очки: Что такое очки?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  33. ^ «Очки: Как рассчитываются баллы для агента BOINC?» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 5 августа 2007 г.
  34. ^ Кнрид (2 ноября 2006 г.). «Очки БОИНК» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 07.11.2015 . Проверено 28 июля 2007 г.
  35. ^ «Команды» . Помощь . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 17 июля 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  36. ^ «О нас – Наши партнеры» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 8 февраля 2010 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  37. ^ «Прорыв в борьбе с детским раком» . worldcommunitygrid.org . 20 февраля 2014 года. Архивировано из оригинала 21 декабря 2014 года . Проверено 18 января 2015 г.
  38. ^ Накагавара А (2 июля 2014 г.). «Продвижение и расширение исследований по борьбе с детским раком» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 24 октября 2014 года . Проверено 24 октября 2014 г.
  39. ^ Сетка, Мировое сообщество (01 мая 2021 г.). «Сетка мирового сообщества — исследовательские работы HPF» . Сетка мирового сообщества . Архивировано из оригинала 1 мая 2021 г. Проверено 1 мая 2021 г.
  40. ^ Дрю, Кевин; Уинтерс, Патрик; Баттерфосс, Гленн Л.; Берстис, Викторс; Уплингер, Кейт; Армстронг, Джонатан; Риффл, Майкл; Швайгофер, Эрик; Боверманн, Билл; Гудлетт, Дэвид Р.; Дэвис, Триша Н. (1 ноября 2011 г.). «Проект складывания протеома: предсказание структуры и функции в масштабе протеома» . Геномные исследования . 21 (11): 1981–1994. дои : 10.1101/гр.121475.111 . ISSN   1088-9051 . ПМЦ   3205581 . ПМИД   21824995 .
  41. ^ Бальц, Александр Г.; Мюншауэр, Матиас; Шванхойссер, Бьёрн; Василе, Александра; Муракава, Ясухиро; Шулер, Маркус; Янгс, Ной; Пенфолд-Браун, Дункан; Дрю, Кевин; Милек, Миха; Уайлер, Эмануэль (8 июня 2012 г.). «Протеом, связанный с мРНК, и его глобальный профиль занятости в транскриптах, кодирующих белок» . Молекулярная клетка . 46 (5): 674–690. doi : 10.1016/j.molcel.2012.05.021 . ISSN   1097-2765 . ПМИД   22681889 .
  42. ^ Пентони, ММ; Уинтерс, П.; Пенфолд-Браун, Д.; Дрю, К.; Наречания, А.; ДеСалле, Р.; Бонно, Р.; Пуруганан, доктор медицины (2012). «Проект складывания растительного протеома: структура и положительный отбор в семействах растительных белков» . Геномная биология и эволюция . 4 (3): 360–371. дои : 10.1093/gbe/evs015 . ISSN   1759-6653 . ПМЦ   3318447 . ПМИД   22345424 .
  43. ^ Мальмстрем, Ларс; Риффл, Майкл; Штраус, Чарли EM; Чивиан, Дилан; Дэвис, Триша Н.; Бонно, Ричард; Бейкер, Дэвид (20 марта 2007 г.). «Назначение суперсемейства дрожжевого протеома посредством интеграции прогнозирования структуры с онтологией генов» . ПЛОС Биология . 5 (4): е76. дои : 10.1371/journal.pbio.0050076 . ISSN   1545-7885 . ПМЦ   1828141 . ПМИД   17373854 .
  44. ^ Перриман А.Л. (14 июля 2014 г.). «Обновление GO Fight Against Malaria: многообещающие ранние результаты в отношении малярии и лекарственно-устойчивого туберкулеза» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 24 октября 2014 года . Проверено 24 октября 2014 г.
  45. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Расчеты после сетки продолжают приносить прогресс и вдохновляют на новые методы борьбы со смертельными заболеваниями» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  46. ^ Перриман А.Л., Ю В., Ван Х, Экинс С., Форли С., Ли С.Г. и др. (март 2015 г.). «Виртуальный экран обнаруживает новые фрагментированные ингибиторы микобактерии туберкулеза InhA» . Журнал химической информации и моделирования . 55 (3): 645–59. дои : 10.1021/ci500672v . ПМК   4386068 . ПМИД   25636146 .
  47. ^ «Десятилетие открытий: новый препарат для борьбы с лихорадкой денге» . Архивировано из оригинала 12 ноября 2014 г. Проверено 12 ноября 2014 г.
  48. ^ «Открытие лекарств от денге: вместе мы применяем новый подход к анализу данных» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 16 июля 2021 г. Проверено 1 мая 2021 г.
  49. ^ «Десятилетие открытий: удвоение эффективности солнечных батарей на основе углерода» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 24 октября 2014 г. Проверено 24 октября 2014 г.
  50. ^ Гарвард публикует данные World Community Grid, оценивая миллионы соединений для использования в солнечных элементах , worldcommunitygrid.org, 24 июня 2013 г., заархивировано из оригинала 10 октября 2014 г. , получено 24 октября 2014 г.
  51. ^ «TSRI - Новости и мнения. Ученые обнаружили два соединения, которые закладывают основу для нового класса лекарств от СПИДа» . scripps.edu . Архивировано из оригинала 12 августа 2014 г. Проверено 25 октября 2014 г.
  52. ^ «Обнаружены два соединения, которые открывают путь к новому классу лекарств от СПИДа» . worldcommunitygrid.org . 2 марта 2010 г. Архивировано из оригинала 25 октября 2014 г. Проверено 25 октября 2014 г.
  53. ^ «Исключительные ранние результаты в борьбе с лейшманиозом» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  54. ^ «Потенциальные новые методы лечения лейшманиоза протестированы в лаборатории» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  55. ^ «Проект по поиску лекарств от лейшманиоза продолжает поиск лучших методов лечения» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 1 мая 2021 г. Проверено 1 мая 2021 г.
  56. ^ «Увеличение потенциала нанотехнологий для улучшения доступа миллионов людей к чистой воде» . secure.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 3 декабря 2016 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  57. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Превращение виртуальных результатов в реальные методы лечения шистосомы , архивировано из оригинала 14 июля 2015 г. , получено 14 июля 2015 г.
  58. ^ Кравёр П., Грес А.Т., Кирби К.А., Лю Д., Хаммонд Дж.А., Денг Ю. и др. (март 2019 г.). «Новое межсубъединичное взаимодействие, критическое для базовой сборки ВИЧ-1, определяет потенциально нацеливаемый карман связывания ингибитора» . мБио . 10 (2). дои : 10.1128/mBio.02858-18 . ПМК   6414707 . ПМИД   30862755 .
  59. ^ «Скоро: OpenPandemics» . Сетка мирового сообщества . 01.04.2020. Архивировано из оригинала 19 июля 2020 г. Проверено 03 апреля 2020 г.
  60. ^ «Вопросы о науке и технологиях для OpenPandemics (запуск будет объявлен позже)» . Сетка мирового сообщества . 01.04.2020. Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 03 апреля 2020 г.
  61. ^ «Вопросы о рабочих единицах и значках для OpenPandemics (запуск будет объявлен позже)» . Сетка мирового сообщества . 01.04.2020. Архивировано из оригинала 19 июля 2020 г. Проверено 03 апреля 2020 г.
  62. ^ «Помогите остановить COVID-19 и будущие пандемии» . Сетка мирового сообщества . 14 мая 2020 г. Архивировано из оригинала 14 мая 2020 г. Проверено 14 мая 2020 г.
  63. ^ «Сетка мирового сообщества – исследования – картирование маркеров рака» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 г. Проверено 16 ноября 2013 г.
  64. ^ «Сетка мирового сообщества — Просмотр темы — Обновление MCM1» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 15 апреля 2014 г.
  65. ^ «Помогите остановить туберкулез» . Сетка мирового сообщества . Архивировано из оригинала 19 июня 2019 года . Проверено 19 июня 2019 г.
  66. ^ «Перспективы помощи в борьбе с детским раком» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  67. ^ «Исследователи воссоединяются с сетью мирового сообщества, чтобы победить детский рак» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  68. ^ Исследовательская группа Smash Childhood Cancer (9 марта 2020 г.). «Команда Smash Childhood Cancer объявляет нового главного исследователя и новые цели проекта» . Сетка мирового сообщества . ИБМ . Архивировано из оригинала 19 июля 2020 года . Проверено 10 марта 2020 г.
  69. ^ «Обзор исследования от команды SCC (октябрь 2022 г.)» . www.worldcommunitygrid.org . Проверено 1 ноября 2022 г.
  70. ^ « Объявление о проекте по выпадению осадков в Африке. Архивировано 3 декабря 2019 г. в Wayback Machine », World Community Grid. Проверено 30 октября 2019 г.
  71. ^ «20x WCG Africa Rainfall Project — когда 16 ГБ ОЗУ едва хватает» . 9 сентября 2022 г.
  72. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д и ж «Обзор проекта «Помогите победить рак»» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 22 августа 2007 г. Проверено 4 августа 2007 г.
  73. ^ Викторс (26 июня 2006 г.). «Запуск проекта 2 фазы сворачивания протеома человека» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 04 февраля 2019 г. Проверено 4 августа 2007 г.
  74. ^ «Проект складывания протеома человека» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 20 августа 2007 г. Проверено 4 августа 2007 г.
  75. ^ «Обзор проекта складывания протеома человека» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 14 июля 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  76. ^ Мальмстрём Л., Риффл М., Штраус К.Э., Чивиан Д., Дэвис Т.Н., Бонно Р., Бейкер Д. (апрель 2007 г.). «Назначение суперсемейства протеома дрожжей посредством интеграции предсказания структуры с онтологией гена» . ПЛОС Биология . 5 (4): е76. дои : 10.1371/journal.pbio.0050076 . ПМЦ   1828141 . ПМИД   17373854 .
  77. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д «Активные исследования» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  78. ^ «Складывание протеома человека - Фаза 2» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  79. ^ Бальц А.Г., Мюншауэр М., Шванхойссер Б., Василе А., Муракава Ю., Шуелер М. и др. (июнь 2012 г.). «Протеом, связанный с мРНК, и его глобальный профиль занятости в транскриптах, кодирующих белки» . Молекулярная клетка . 46 (5): 674–90. doi : 10.1016/j.molcel.2012.05.021 . ПМИД   22681889 .
  80. ^ «О проекте» . Исследование: Помогите победить рак . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 октября 2007 г. Проверено 4 августа 2007 г.
  81. ^ «Обзор сравнения геномов» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 7 июля 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  82. ^ Уплингер (11 июня 2007 г.). «Помогите вылечить мышечную дистрофию. Фаза 1 завершена» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 31 января 2019 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  83. ^ «Помогите вылечить мышечную дистрофию» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 1 июля 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  84. ^ Викторс (19 декабря 2006 г.). «Запуск проекта «Помоги вылечить мышечную дистрофию»» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  85. ^ Дидактилос (21 июня 2007 г.). «Re: Проект о денге когда-либо» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 7 августа 2007 г.
  86. ^ «Открытие лекарств от денге – совместное завершение (фаза 1)» . Сетка мирового сообщества. 26 августа 2009 г. Архивировано из оригинала 4 июля 2013 г. Проверено 27 августа 2009 г.
  87. ^ «Открытие лекарств от денге – вместе: о проекте» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 октября 2007 г. Проверено 24 августа 2007 г.
  88. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Лоуренсхардин (10 июля 2007 г.). «Re: Результаты...» Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 7 августа 2007 г.
  89. ^ «Страница состояния AfricanClimate@Home (Сетка мирового сообщества IBM)» . Университет Кейптауна . Архивировано из оригинала 6 ноября 2009 г. Проверено 8 мая 2009 г.
  90. ^ «Африканский Климат@Дом» . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 3 мая 2009 г. Проверено 8 мая 2009 г.
  91. ^ «Запуск проекта «Помоги победить рак» . Сетка мирового сообщества. 01.11.2007. Архивировано из оригинала 31 января 2019 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  92. ^ «Страница исследования «Помогите победить рак» на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 16 ноября 2007 г. Проверено 21 мая 2013 г.
  93. ^ «Помогите победить рак, обновление за апрель 2013 г.» (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинала 17 апреля 2013 г. Проверено 11 апреля 2013 г.
  94. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Конец питательному рису для всего мира» . Сетка мирового сообщества. 13 апреля 2010 г. Архивировано из оригинала 17 апреля 2010 г. Проверено 16 апреля 2010 г.
  95. ^ «Питательный рис для мира» . Protinfo.compbio.washington.edu. Архивировано из оригинала 13 августа 2010 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  96. ^ «Прямая трансляция «Питательного риса для всего мира»: 17 апреля, 19:00 по всемирному координированному времени» . worldcommunitygrid.org . 15 апреля 2014 года. Архивировано из оригинала 16 апреля 2014 года . Проверено 15 апреля 2014 г.
  97. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Страница исследования Проекта чистой энергии на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 22 апреля 2009 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  98. ^ «Завершение проекта «Чистая энергия (Фаза 1)» . Сетка мирового сообщества. 15 октября 2009 г. Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 25 ноября 2009 г.
  99. ^ «Страница исследования Проекта чистой энергии на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 14 апреля 2009 г. Проверено 15 июля 2015 г.
  100. ^ «Запуск проекта «Чистая энергия – Фаза 2»» . Сетка мирового сообщества. 28 июня 2010 г. Архивировано из оригинала 8 августа 2011 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  101. ^ Проект «Чистая энергия» - Фаза 2. Архивировано 17 июля 2011 г. в Wayback Machine «World Community Grid», дата доступа = 15 июля 2015 г.
  102. ^ «Исследователи проекта чистой энергии делятся результатами и планируют будущее» . www.worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 24 июля 2017 г. Проверено 4 марта 2018 г.
  103. ^ «Запуск проекта «Помощь в борьбе с детским раком» . Сетка мирового сообщества. 13 марта 2009 г. Архивировано из оригинала 26 февраля 2022 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  104. ^ «Страница исследования «Помогите бороться с детским раком» на WCG» . Worldcommunitygrid.org. 13 марта 2009 г. Архивировано из оригинала 21 апреля 2009 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  105. ^ «Страница исследования «Помогите бороться с детским раком» на WCG» . Worldcommunitygrid.org. 13 марта 2009 г. Архивировано из оригинала 3 мая 2009 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  106. ^ «Страница исследования поиска противовирусных препаратов против гриппа на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 30 мая 2009 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  107. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Завершение поиска противовирусного препарата против гриппа (Фаза 1)» . Сетка мирового сообщества. 09.11.2009. Архивировано из оригинала 5 сентября 2022 г. Проверено 25 ноября 2009 г.
  108. ^ «Страница исследования поиска противовирусных препаратов против гриппа на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 9 мая 2009 г. Проверено 7 июня 2010 г.
  109. ^ «Открытие лекарств от денге – обновленная информация о проекте вместе» . Форумы World Community Grid. 14 ноября 2012 г. Архивировано из оригинала 19 января 2015 г. Проверено 28 апреля 2014 г.
  110. ^ «Запуск проекта «Помощь в лечении мышечной дистрофии – фаза 2»» . Сетка мирового сообщества. 12 мая 2009 г. Архивировано из оригинала 30 января 2019 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  111. ^ «Страница исследования фазы 2 «Помогите вылечить мышечную дистрофию» на WCG» . Worldcommunitygrid.org. Архивировано из оригинала 2 июня 2009 г. Проверено 21 мая 2013 г.
  112. ^ «Помогите вылечить мышечную дистрофию» . Исследования — Часто задаваемые вопросы по проектам . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 6 июля 2009 г. Проверено 21 мая 2013 г.
  113. ^ «Запуск проекта «Обнаружение лекарств от лихорадки денге — вместе — фаза 2»» . Сетка мирового сообщества. 17 февраля 2010 г. Архивировано из оригинала 8 августа 2011 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  114. ^ «Открытие лекарств от денге – вместе – фаза 2» . Исследования – Обзор проекта . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 20 апреля 2013 г. Проверено 21 мая 2013 г.
  115. ^ «Вычисления для объявлений о чистой воде» . Сетка мирового сообщества. 23 августа 2010 г. Архивировано из оригинала 31 января 2019 г. Проверено 25 октября 2010 г.
  116. ^ «Компьютинг для чистой воды» . Пекин : Центр нано- и микромеханики, Университет Цинхуа . 20 сентября 2010 г. Архивировано из оригинала 3 марта 2016 г. Проверено 25 октября 2010 г.
  117. ^ «Сеть мирового сообщества — исследования — вычисления для чистой воды» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 30 октября 2011 г. Проверено 27 октября 2011 г.
  118. ^ Грей Ф (25 апреля 2014 г.). «Обновление проекта «Вычисления для чистой воды»» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 26 апреля 2014 года . Проверено 25 апреля 2014 г.
  119. ^ «Запуск проекта по поиску лекарств от лейшманиоза» . Сетка мирового сообщества. 07.09.2011. Архивировано из оригинала 4 ноября 2011 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  120. ^ «Поиск лекарств от лейшманиоза» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 16 июля 2021 г. Проверено 28 октября 2011 г.
  121. ^ «Запуск проекта GO по борьбе с малярией» . Сетка мирового сообщества. 16 ноября 2011 г. Архивировано из оригинала 25 января 2012 г. Проверено 11 января 2012 г.
  122. ^ «Проект GO по борьбе с малярией» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 5 апреля 2013 г. Проверено 11 апреля 2013 г.
  123. ^ «Запуск проекта «Скажи нет шистосоме»» . Сетка мирового сообщества. 22 февраля 2012 г. Архивировано из оригинала 6 апреля 2012 г. Проверено 24 мая 2012 г.
  124. ^ «Скажи нет шистосоме» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 6 апреля 2012 г. Проверено 24 мая 2012 г.
  125. ^ «Вычисления для устойчивого водоснабжения» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 20 апреля 2013 г. Проверено 21 мая 2013 г.
  126. ^ «Запуск проекта «Вычисления для устойчивого водоснабжения» . Сетка мирового сообщества. 17 апреля 2012 г. Архивировано из оригинала 11 мая 2012 г. Проверено 24 мая 2012 г.
  127. ^ «Запуск проекта: раскрытие тайн генома» . worldcommunitygrid.org . Архивировано из оригинала 24 октября 2014 г. Проверено 24 октября 2014 г.
  128. ^ Парк А (19 декабря 2014 г.). «Как ваш планшет может помочь найти лекарство от Эболы» . Архивировано из оригинала 8 октября 2016 года . Проверено 19 декабря 2014 г.
  129. ^ Сапфир ЭО (3 декабря 2014 г.). «Помогите исследователям найти лекарство от Эболы» . Архивировано из оригинала 20 декабря 2014 года . Проверено 20 декабря 2014 г.
  130. ^ «Давайте вместе перехитрим Эболу: О проекте» . Декабрь 2014. Архивировано из оригинала 20 декабря 2014 года . Проверено 20 декабря 2014 г.
  131. ^ «Проект завершен» . Сетка мирового сообщества . ИБМ . 6 декабря 2018 года. Архивировано из оригинала 30 января 2019 года . Проверено 6 декабря 2018 г. Мы завершили ОЕТ. Спасибо за вашу помощь и вклад в этот проект.
  132. ^ Исследование: OpenZika: Обзор проекта , заархивировано из оригинала 22 мая 2016 г. , получено 19 мая 2016 г.
  133. ^ Работа OpenZika над сетью мирового сообщества завершена. , заархивировано из оригинала 05 марта 2020 г. , получено 05 марта 2020 г.
  134. ^ «Сетка мирового сообщества нацелена на борьбу со СПИДом посредством гигантских исследовательских усилий» (пресс-релиз). 21 ноября 2005 г. Архивировано из оригинала 29 сентября 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  135. ^ «Борьба со СПИДом@Дома» . Исследовать . Сетка мирового сообщества. Архивировано из оригинала 10 августа 2007 г. Проверено 28 июля 2007 г.
  136. ^ Чанг М.В., Линдстрем В., Олсон А.Дж., Белью Р.К. (21 апреля 2007 г.). «Анализ диких и мутантных структур ВИЧ посредством стыковки in silico с различными библиотеками лигандов» . Журнал химической информации и моделирования . 47 (3). Американское химическое общество : 1258–62. дои : 10.1021/ci700044s . ПМИД   17447753 .
  137. ^ «Новости FightAIDS@Home, том 3» (PDF) . Исследовательский институт Скриппса . 10 мая 2007 г. Архивировано (PDF) из оригинала 8 августа 2007 г. Проверено 30 июля 2007 г.
  138. ^ Олсон А. (30 сентября 2015 г.). «Новые методы борьбы с ВИЧ» . Сетка мирового сообщества . ИБМ. Архивировано из оригинала 30 января 2019 года . Проверено 21 июня 2018 г.
  139. ^ «FightAIDS@Home – Фаза II: Введение» . FightAIDS@Home – Фаза II . Колледж науки и технологий Университета Темпли. Архивировано из оригинала 12 апреля 2018 года . Проверено 2 июля 2018 г. Первые эксперименты второго этапа FightAIDS@Home преследуют две цели: во-первых, подтвердить, что новая схема моделирования работает должным образом и дает достаточно надежные результаты по сравнению с традиционным моделированием; во-вторых, чтобы продемонстрировать, что использование BEDAM в сочетании с AutoDock приводит к лучшим прогнозам, чем использование AutoDock или BEDAM по отдельности.
  140. ^ «Проект микробиомного иммунитета» . Сетка мирового сообщества . Архивировано из оригинала 14 августа 2018 года . Проверено 2 июля 2018 г.
  141. ^ Костюлек Т., Тейлор Б. (19 июня 2018 г.). «Исследователи проекта иммунитета к микробиому создают амбициозные планы по сбору данных» . Сетка мирового сообщества . Архивировано из оригинала 14 августа 2018 года . Проверено 2 июля 2018 г.

Внешние ссылки [ править ]

Викискладе есть медиафайлы, связанные с World Community Grid .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=World_Community_Grid&oldid=1229495197"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 2bdef03abe0d5ae1cba32f06f6ffb778__1718585100
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/2b/78/2bdef03abe0d5ae1cba32f06f6ffb778.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
World Community Grid - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)