Jump to content

DSUP

Повреждение супрессор белок
Идентификаторы
Организм Ramazzottius varnornatus (tardigrade)
Символ DSUP
Uniprot P0Dow4
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro

DSUP (сокращение поврежденного супрессора ) -это ДНК -ассоциационный белок , уникальный для Tardigrade , [ 1 ] Это подавляет возникновение разрывов ДНК путем радиации. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Когда клетки HEK293 человека были разработаны с помощью DSUP-белков, они показали примерно на 40% больше толерантности к рентгеновским излучениям. [ 5 ]

Тардиграды могут выдержать в 1000 раз больше радиации, чем другие животные, [ 6 ] Средние летальные дозы 5000 Гр (гамма -лучей) и 6200 Гр (тяжелых ионов) у гидратированных животных (от 5 до 10 Гр может быть смертельным для человека). [ 6 ] Единственным объяснением, обнаруженным в более ранних экспериментах для этой способности, было то, что их пониженное состояние воды обеспечивает меньше реагентов для ионизирующего излучения . [ 6 ] Тем не менее, последующее исследование показало, что ТАРДИГРАДЫ, при гидратировании, по -прежнему остаются очень устойчивыми к коротковолновому ультрафиолетовому излучению по сравнению с другими животными, и что одним из факторов является их способность эффективно восстанавливать повреждение их ДНК, возникающее в результате этого воздействия. [ 7 ] Основное исследование белка DSUP показало, что оно может связывать нуклеосомы в клетке и защищать ДНК. [ 8 ]

Белок DSUP был протестирован на других клетках животных. Используя культуру человеческих клеток, которые экспрессируют белок DSUP, было обнаружено, что после рентгеновского воздействия клетки имели меньше разрывов ДНК, чем контрольные клетки. [ 3 ]

После перекиси водорода обработки DSUP+ клетки в основном активируют системы детоксикации и антиоксидантные ферменты, которые ограничивают окислительный стресс и устраняют окислительные свободные радикалы, в то время как механизмы репарации ДНК лишь незначительно активируются. [ 9 ] Таким образом, после индукции белка DSUP окислительного стресса, по -видимому, в основном защищает ДНК напрямую. [ 9 ]

Было обнаружено, что белок DSUP является нейротоксичным и способствует нейродегенерации при экспрессии в культивируемых нейронах путем увеличения повреждения ДНК за счет образования разрывов с двойными цепи. [ 10 ]

Функция и структура

[ редактировать ]

DSUP от Ramazzottius varieornatus в основном используется для исследования, поскольку он является одним из самых устойчивых к стрессу. Ортологичные версии DSUP также встречаются в Hypsibius exemplaris (OQV24709, A0A1W0XB17 ). DSUP не демонстрирует много вторичной структуры, за исключением спирали в середине. С-концевая половина содержит NLS, и эта половина, богатая ALA/GLY, достаточна для связывания ДНК. Вероятно, это в основном неупорядочен, но он имеет большой положительный заряд. [ 2 ]

Известно, что DSUP связывается со свободной ДНК, но он более тесно связывается с нуклеосомами , типичной упакованной формой ДНК в эукариотических клетках. Его домен связывания нуклеосом смутно похож на тот, который в HMGN . белках [ 11 ] DSUP, локализованный в ядерной ДНК, уменьшает разрывы в одну цепь и разрывы с двумя целями при подверженности ионизирующему излучению . [ 12 ]

Молекулярное динамическое моделирование DSUP в комплексе с ДНК показывает, что он является внутренним неупорядоченным белком . Его гибкость и электростатический заряд помогают ему связываться с ДНК и формировать агрегаты. [ 13 ]

  1. ^ Циммер С (12 апреля 2024 г.). «То, что делает крошечные тардиграды почти радиационными доказательствами - новое исследование обнаруживает, что микроскопические« воды »удивительно хороши в восстановлении своей ДНК после огромного взрыва радиации» . New York Times . Архивировано из оригинала 12 апреля 2024 года . Получено 13 апреля 2024 года .
  2. ^ Jump up to: а беременный Hashimoto T, Kunieda T (июнь 2017 г.). «Белок защиты от ДНК, новый механизм радиационной толерантности: уроки от Тардиградов» . Жизнь . 7 (2): 26. Bibcode : 2017life .... 7 ... 26h . doi : 10.3390/life7020026 . PMC   5492148 . PMID   28617314 .
  3. ^ Jump up to: а беременный Turk V (20 сентября 2016 г.). «Ученые идентифицируют ген, который защищает Тардиграды от радиации» . Порок . Получено 19 мая 2018 года .
  4. ^ Tauger N, Gill V (20 сентября 2016 г.). «Секрет выживания« Самого Хардного Живота Земли »раскрыта» . BBC News . Получено 2016-09-21 .
  5. ^ Jump up to: а беременный Hashimoto T, Horikawa DD, Saito Y, Kuwahara H, Kozuka-Hata H, Shin-I T, et al. (Сентябрь 2016 г.). «Экстремотолярный геном Tardigrade и улучшенная радиотолерантность культивируемых клеток человека белком-турником» . Природная связь . 7 : 12808. Bibcode : 2016natco ... 712808h . doi : 10.1038/ncomms12808 . PMC   5034306 . PMID   27649274 .
  6. ^ Jump up to: а беременный в Horikata DD, Sakashita T, Kaginagi C, Witanabad M, Cemakuadad T, Parted Y, Al. (Декабрь 2006 г.). Tardigrade Millesium нацелен. Международный журнал . 82 (12) (12): 843–8 doi : 10.1080/ 0955300000000 PMID   17178624 . S2CID   2534328 .
  7. ^ HORIKAWA DD. «Ультрафиолетовое ультрафиолетовое толерантность Тардиградов» . NASA.com. Архивировано из оригинала 2013-02-18 . Получено 2013-01-15 .
  8. ^ Chavez C, Cruz-Becerra G, Fei J, Kassavetis GA, Kadonaga JT (октябрь 2019). Джонс Ка, Тайлер Дж. К. (ред.). «Белок супрессора повреждения тардиграда связывается с нуклеосом и защищает ДНК от гидроксильных радикалов» . элиф . 8 : E47682. doi : 10.7554/elife.47682 . PMC   6773438 . PMID   31571581 .
  9. ^ Jump up to: а беременный Ricci C, Riolo G, Marzocchi C, Brunetti J, Pini A, Cantara S (сентябрь 2021 г.). «Белок супрессора повреждения тардиграда модулирует гены транскрипции и репарации ДНК в клетках человека, обработанных гидроксильными радикалами и УФ-C» . Биология . 10 (10): 970. doi : 10.3390/biology10100970 . PMC   8533384 . PMID   34681069 .
  10. ^ Escarcega RD, Patil AA, Meyer MD, Moruno-Manchon JF, Silvagnoli AD, McCullough LD, et al. (Июнь 2023 г.). «DSUP -супрессор повреждения Тардиграда способствует повреждению ДНК в нейронах» . Молекулярные и клеточные нейронауки . 125 : 103826. DOI : 10.1016/j.mcn.2023.103826 . PMC   10247392 . PMID   36858083 .
  11. ^ Chavez C, Cruz-Becerra G, Fei J, Kassavetis GA, Kadonaga JT (октябрь 2019). «Белок супрессора повреждения тардиграда связывается с нуклеосом и защищает ДНК от гидроксильных радикалов» . элиф . 8 doi : 10.7554/elife.47682 . PMC   6773438 . PMID   31571581 .
  12. ^ Агилар Р., Хикман А.Р., Тайлер Дж.К. (2023). «Мультивалентное связывание белка DSUP Tardigrade с хроматином способствует выживанию дрожжей и долговечности при воздействии окислительного повреждения» . Исследовательская площадь : RS.3.RS-3182883. doi : 10.21203/rs.3.rs-3182883/v1 . PMC   10402244 . PMID   37546815 .
  13. ^ Mínguez-Toral M, Cuevas-Zuviría B, Garrido-Arandia M, Pacios LF (август 2020 г.). «Вычислительное исследование по защите ДНК защиты ДНК белка DSUP-Tardigrade Unique» . Научные отчеты . 10 (1): 13424. Bibcode : 202020natsr..1013424M . Doi : 10.1038/s41598-020-70431-1 . PMC   7414916 . PMID   32770133 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: da2035798d510cad91ed7b61f40312a2__1723564620
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/da/a2/da2035798d510cad91ed7b61f40312a2.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Dsup - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)