ДНК-связывающий белок

специфичный для повреждения ДНК-связывающий белок 2, 48 кДа
специфичный для повреждения ДНК-связывающий белок 2, 48 кДа
Идентификаторы
Символ	DDB2
Альт. символы	DBB, UV-DDB2, FLJ34321
Ген NCBI	1643
HGNC	2718
Омим	600811
Refseq	NM_000107
Uniprot	Q92466
Другие данные
Локус	Хр. 11 P12-P11
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

специфичный для повреждения ДНК-связывающий белок 1, 127 кДа
специфичный для повреждения ДНК-связывающий белок 1, 127 кДа
Идентификаторы
Символ	DDB1
Альт. символы	Xpe
Ген NCBI	1642
HGNC	2717
Омим	600045
Refseq	NM_001923
Uniprot	Q16531
Другие данные
Локус	Хр. 11 Q12-Q13
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Связывающий повреждение ДНК белок или ультрафиолетовое излучение ^{[ 1 ]} является белковым комплексом, который отвечает за восстановление УФ-поврежденной ДНК . ^{[ 2 ]} Этот комплекс состоит из двух белковых субъединиц, большой субъединицы DDB1 (P127) и небольшой субъединицы DDB2 (P48). Когда клетки подвергаются воздействию ультрафиолетового излучения , DDB1 перемещается из цитозоля в ядро и связывается с DDB2, образуя тем самым комплекс УФ-DDB. Эта сложная формация очень благоприятна, и оно продемонстрировано предпочтением связывания ультрафиолетового ультрафиолета и высокой аффинностью к УФ-поражениям в ДНК. ^{[ 3 ]} Этот комплекс функционирует в репарации нуклеотидного удаления , распознавая ультрафиолетовые индуцированные (6-4) фотопродукты пиримидина-пиримидона и димеры циклобутанового пиримидина . ^{[ 1 ]}

Структура

Спиральный домен на N-конце DDB2 связывается с поврежденной ультрафиолетовой ДНК с высокой аффинностью с образованием комплекса ультрафиолета. Взаимодействие спирального связывания на N-конце DDB2 позволяет белка связываться сразу после обнаружения поврежденной УФ-ультрафиолетовой ДНК. ^{[ 3 ]} ДНК связывается с DDB2 только при повреждении ультрафиолетовым излучением. Связывание с высокой аффинностью к спиральному домену DDB2 в димерной форме, UV-DDB, облегчается N-концевым альфа-спиральным веслом и бета-крыльями субъединицы DDB2. ^{[ 3 ]} Как альфа -спиральная складка, так и петли бета -крыла образуют мотив «крылатой спирали». ^{[ 3 ]} Димеризованный комплекс действует как каркас для путей восстановления повреждения ДНК и позволяет другим белкам обнаруживать, взаимодействовать и восстанавливать поврежденную УФ -ультрафиолетовую ДНК.

DDB2

DDB2 является белковой частью комплекса CUL4A -RIR -RIR -лигазы (CRL4). Считалось, что DDB2 действует только для признания легионов поврежденной ультрафиолетовой ДНК. Было обнаружено, что DDB2 играет роль в стимулировании разворачивания хроматина. ^{[ 4 ]} Эта роль не зависит от роли DDB2 в комплексе CRL4.

Роль датчика повреждения

UV-DDB не только отвечает за восстановление поврежденной ДНК, но и может функционировать, выступая в качестве датчика повреждения. ^{[ 5 ]} In base excision repair, UV-DDB galvanizes OGG1 and APE 1 activities. ^{[ 5 ]} Во время повреждения ДНК белки OGG1 и APE 1 сталкиваются с трудностями в восстановлении поражений в оберщенной ДНК нуклеосоме. Кроме того, гистоны функционируют, делая ДНК недоступной из -за того, как они делают ДНК -катушку и обертывают в хроматин. УФ-ДДП играет роль в выявлении поврежденных участков в хроматине, что позволяет доступа к белкам восстановления базовых ударов. Когда УФ-ДДБ набирается на эти поврежденные участки, он распознает комплекс ДНК OGG1-AP и еще больше ускоряет оборот гликозилаз. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Iovine B, Iannella ML, Bevilacqua MA (декабрь 2011 г.). «Расчетный ДНК-связывающий белок 1 (DDB1): белок с широким спектром функций». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 43 (12). Elsevier: 1664–7. doi : 10.1016/j.biocel.2011.09.001 . PMID 21959250 .
^ Дулан Р., Броди Т., Кини С., Николс А.Ф., Адмон А., Линн С. (сентябрь 1995). «Хромосомная локализация и клонирование кДНК генов (DDB1 и DDB2) для субъединиц p127 и p48 специфичного для повреждения ДНК-специфического белка человека». Геномика . 29 (1): 62–9. doi : 10.1006/geno.1995.1215 . PMID 8530102 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Yeh Ji, Levine AS, Du S, Chinte U, Ghodke H, Wang H, et al. (Октябрь 2012 г.). «Поврежденная ДНК-индуцированная УФ-поврежденная ДНК-связывающая белок (УФ-ДДБ) димеризация и ее роль в хроматинизированной репарации ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (41): E2737-46. doi : 10.1073/pnas.1110067109 . PMC 3478663 . PMID 22822215 .
^ Luijsterburg MS, Lindh M, ACS K, Vrouwe MG, Pines A, Van Attikum H, et al. (Апрель 2012 г.). «DDB2 способствует деконденсации хроматина при повреждении ДНК, индуцированного ультрафиолетом» . Журнал клеточной биологии . 197 (2): 267–81. doi : 10.1083/jcb.201106074 . PMC 3328393 . PMID 22492724 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Jang S, Kumar N, Beckwitt EC, Kong M, Fouquerel E, Rapić-Otrin V, et al. (Август 2019). «Роль датчика повреждения ультрафиолетового ультрафиолета во время ремонта базового удаления» . Природа структурная и молекулярная биология . 26 (8): 695–703. doi : 10.1038/s41594-019-0261-7 . PMC 6684372 . PMID 31332353 .

Эта связанная с белком статья является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[Iovine2011-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Iovine B, Iannella ML, Bevilacqua MA (декабрь 2011 г.). «Расчетный ДНК-связывающий белок 1 (DDB1): белок с широким спектром функций». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 43 (12). Elsevier: 1664–7. doi : 10.1016/j.biocel.2011.09.001 . PMID 21959250 .

[pmid8530102-2] Дулан Р., Броди Т., Кини С., Николс А.Ф., Адмон А., Линн С. (сентябрь 1995). «Хромосомная локализация и клонирование кДНК генов (DDB1 и DDB2) для субъединиц p127 и p48 специфичного для повреждения ДНК-специфического белка человека». Геномика . 29 (1): 62–9. doi : 10.1006/geno.1995.1215 . PMID 8530102 .

[Yeh_2012-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Yeh Ji, Levine AS, Du S, Chinte U, Ghodke H, Wang H, et al. (Октябрь 2012 г.). «Поврежденная ДНК-индуцированная УФ-поврежденная ДНК-связывающая белок (УФ-ДДБ) димеризация и ее роль в хроматинизированной репарации ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (41): E2737-46. doi : 10.1073/pnas.1110067109 . PMC 3478663 . PMID 22822215 .

[4] Luijsterburg MS, Lindh M, ACS K, Vrouwe MG, Pines A, Van Attikum H, et al. (Апрель 2012 г.). «DDB2 способствует деконденсации хроматина при повреждении ДНК, индуцированного ультрафиолетом» . Журнал клеточной биологии . 197 (2): 267–81. doi : 10.1083/jcb.201106074 . PMC 3328393 . PMID 22492724 .

[Jang_2019-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Jang S, Kumar N, Beckwitt EC, Kong M, Fouquerel E, Rapić-Otrin V, et al. (Август 2019). «Роль датчика повреждения ультрафиолетового ультрафиолета во время ремонта базового удаления» . Природа структурная и молекулярная биология . 26 (8): 695–703. doi : 10.1038/s41594-019-0261-7 . PMC 6684372 . PMID 31332353 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]