Конечно
Конечно | |||
---|---|---|---|
![]() Кристаллическая структура надежного белка из T.maritima в комплексе с вольфрамовой статой. | |||
Идентификаторы | |||
Символ | Конечно | ||
Pfam | PF01975 | ||
InterPro | IPR002828 | ||
Краткое содержание | 1J9L / Scope / SUPFAM | ||
|
В молекулярной биологии белковый домен наверняка относится к белке выживания E. Первоначально было обнаружено, что клетки, которые не содержали этот белок, не могли выжить в стационарной фазе , при вышеприведенных нормальных температурах и в среде с высокой соли. Отсюда и название, белок выживания E. [ 1 ] Это металла ионная ионная , которая обнаруживается у бактерий и эукариот . Это важный белок стресс -реакции . [ 2 ] Этот домен обнаружен в кислотных фосфатазах ( EC ), 5'-нуклеотидазах ( EC ), 3'-нуклеотидазах ( EC ) и экзополифосфатазах ( EC ).
Взаимодействие с геном PCM
[ редактировать ]Ген бицистронного , конечно , является частью оперона , найденного вверх по течению от гена PCM . При мутировании их фенотипы или физические характеристики очень похожи и указывают на то, что оба гена важны для выживания в стрессовых условиях. [ 3 ]
Функция
[ редактировать ]С-концевой домен важен в основном для поддержания олигомерного состояния белка, конечно. Считается, что N-концевой домен является частью функционального домена. [ 3 ] Поскольку уверенно является фермент фосфатазы , он удаляет фосфатную группу из вещества, влияя на роль этого вещества в трансдукции сигнала . [ 4 ]
Структура
[ редактировать ]Этот белок состоит из двух белкового домена . Один-большой глобулярный N-концевой Домен, а другой-меньший С-концевой домен. [ Цитация необходима ]
N-концевой домен
[ редактировать ]домен N-концевой содержит трехслойный сэндвич Alpha/Beta/Alpha, который гомологичен с складом Rossmann (Cath Class 3.40.50.170), основной особенностью является длинное бета-лист , который состоит из девяти в основном параллельных бета-нитей . [ 4 ] Конечно структурный домен имеет аналогичную топологию с N-концевой белковой доменем семейства глутаминазы / аспарагиназы . [ 5 ]
С-концевой домен
[ редактировать ]С-концевой домен имеет 3 бета-нити и две выступы; Одним из которых является С-концевой альфа-спираль , а вторая- бета-шпилька . [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Li C, Ichikawa JK, Ravetto JJ, Kuo HC, Fu JC, Clarke S (1994). «Новый ген, участвующий в выживаемости стационарной фазы, расположенный в 59 минут на хромосоме Escherichia coli» . J Бактериол . 176 (19): 6015–22. doi : 10.1128/jb.176.19.6015-6022.1994 . PMC 196819 . PMID 7928962 .
- ^ Iwasaki W, Miki K (2007). «Кристаллическая структура стационарного белка выживания фазы уверена с ионами металлов и усилителя». J Mol Biol . 371 (1): 123–36. doi : 10.1016/j.jmb.2007.05.007 . PMID 17561111 .
- ^ Jump up to: а беременный в Чжан Р.Г., Скарина Т., Кац Дж., Бизли С., Хачатриан А., Вьяс С. и др. (2001). «Структура термотоги Маритима Стационарная фаза белок выживаемости уверен: новая кислотная фосфатаза» . Структура 9 (11): 1095–106. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00675-x . PMC 2792002 . PMID 11709173 .
- ^ Jump up to: а беременный Lee Jy, Kwak Je, Moon J, Eom SH, Liong EC, Pedelacq JD, et al. (2001). «Кристаллическая структура и функциональный анализ верного белка идентифицируют новое семейство фосфатазы». Nat Struct Biol . 8 (9): 789–94. doi : 10.1038/nsb0901-789 . PMID 11524683 . S2CID 25643004 .
- ^ Мура С., Кац Дж., Кларк С.Г., Эйзенберг Д (март 2003 г.). «Структура и функция археального гомолога белка выживания (Surealpha): кислотная фосфатаза со специфичностью пуриновой нуклеотид». J. Mol. Биол . 326 (5): 1559–75. doi : 10.1016/s0022-2836 (03) 00056-1 . PMID 12595266 .