Домен GAF
| Домен GAF | |||
|---|---|---|---|
 3',5'-циклическая нуклеотидфосфодиэстераза 2А, содержащая домены GAF A и GAF B. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ГАФ | ||
| Пфам | PF01590 | ||
| Пфам Клан | CL0161 | ||
| ИнтерПро | ИПР003018 | ||
| УМНЫЙ | ГАФ | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1фл4 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Домен GAF — это тип белкового домена , который встречается в широком спектре белков всех видов. [ 2 ] Домен GAF назван в честь некоторых белков, в которых он обнаружен: c G MP-специфических фосфодиэстераз, a денилциклазы и F hlA. Первая структура домена GAF, раскрытая Хо и его коллегами, показала, что этот домен имеет сходную складку с доменом PAS . [ 3 ] У млекопитающих домены GAF обнаружены у пяти членов суперсемейства циклических нуклеотидных фосфодиэстераз: PDE2, PDE5 и PDE6, которые связывают цГМФ с доменом GAF, PDE10, который связывает цАМФ, и PDE11, который связывает как цГМФ, так и цАМФ. [ 4 ] [ 5 ]
Примеры
[ редактировать ]Белки человека, содержащие этот домен, включают:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Мартинес С.Е., Ву А.Ю., Главас Н.А., Тан К.Б., Терли С., Хол В.Г., Беаво Дж.А. (октябрь 2002 г.). «Два домена GAF в фосфодиэстеразы 2А играют различную роль в димеризации и связывании цГМФ» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (20): 13260–5. Бибкод : 2002PNAS...9913260M . дои : 10.1073/pnas.192374899 . JSTOR 3073384 . ПМК 130621 . ПМИД 12271124 .
- ^ Аравинд Л., Понтинг С.П. (декабрь 1997 г.). «Домен GAF: эволюционная связь между различными фототрансдуцирующими белками». Тенденции биохимических наук . 22 (12): 458–9. дои : 10.1016/S0968-0004(97)01148-1 . ПМИД 9433123 .
- ^ Хо Ю.С., Берден Л.М., Херли Дж.Х. (октябрь 2000 г.). «Структура домена GAF, повсеместный сигнальный мотив и новый класс циклических рецепторов GMP» . Журнал ЭМБО . 19 (20): 5288–99. дои : 10.1093/emboj/19.20.5288 . ПМК 314001 . ПМИД 11032796 .
- ^ Фосетт Л., Баксендейл Р., Стейси П., МакГрутер С., Харроу И., Содерлинг С., Хетман Дж., Биво Дж.А., Филлипс С.К. (март 2000 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика отдельного семейства генов фосфодиэстеразы человека: PDE11A» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3702–7. Бибкод : 2000PNAS...97.3702F . дои : 10.1073/pnas.050585197 . JSTOR 121956 . ПМК 16303 . ПМИД 10725373 .
- ^ Шульц Дж. Э. (2009). «Структурные и биохимические аспекты тандемных доменов GAF». CGMP: Генераторы, эффекторы и терапевтическое значение . Справочник по экспериментальной фармакологии. Том. 191. стр. 93–109. дои : 10.1007/978-3-540-68964-5_6 . ISBN 978-3-540-68960-7 . ПМИД 19089327 .