Кандида Карсонелла рудди
| Кандида Карсонелла рудди | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | несекретный |
| Род: | Кандидат Карсонелла |
| Разновидность: | Что. С. рудди |
| Биномиальное имя | |
| Кандида Карсонелла рудди Тао и др. 2000 г. | |
Candidatus . Carsonella ruddii — облигатная эндосимбиотическая гаммапротеобактерия [1] с одним из самых маленьких геномов среди всех охарактеризованных бактерий. [2]
Это первый и по состоянию на февраль 2022 года единственный [3] [4] Вид описан из рода Candidatus Carsonella , названного в честь Рэйчел Карсон . [5]
Эндосимбиоз
[ редактировать ]Этот вид является эндосимбионтом , который присутствует у всех видов насекомых, питающихся соком флоэмы , известных как листлиды . [5] [6] Эндосимбионты встречаются в специализированной структуре, известной как бактериом .
C. ruddii не является полностью паразитическим во взаимоотношениях с насекомым-хозяином; он снабжает хозяина некоторыми незаменимыми аминокислотами. Поэтому, вероятно, он находится в эволюционном процессе становления органеллой , подобной митохондриям эукариотических клеток, которые также произошли от эндосимбионта. [7]
Геном
[ редактировать ]В 2006 году геном Ca. Штамм C. ruddii Pv (Carsonella-Pv) листовертки каркаса листовидного желчника Pachypsylla venusta был секвенирован в RIKEN в Японии и в Университете Аризоны . Было показано, что геном состоит из кольцевой хромосомы из 159 662 пар оснований и имеет высокую плотность кодирования (97%) с множеством перекрывающихся генов и уменьшенной длиной гена. Число предсказанных генов составило 182, что также является самым низким за всю историю ( NCBI-Genome ). Для сравнения, Mycoplasmagentium , имеющая самый маленький геном среди свободноживущих организмов, имеет геном из 521 гена. Многочисленные гены, считающиеся необходимыми для жизни, по-видимому, отсутствуют, что позволяет предположить, что этот вид, возможно, достиг статуса органеллы . [2]
На момент секвенирования считалось, что C. ruddii имеет самый маленький геном среди всех охарактеризованных видов бактерий. [8] Nasuia deltocephalinicola имеет самый маленький из известных бактериальных геномов (112 КБ). В настоящее время считается, что [9]
C. ruddii и родственные виды, по-видимому, активно подвергаются потере генов . [10]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сполдинг, AW; фон Долен, компакт-диск (1998). «Филогенетическая характеристика и молекулярная эволюция бактериальных эндосимбионтов у листолистных (Hemiptera: Sternorryncha)» . Молекулярная биология и эволюция . 15 (11): 1506–1513. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025878 . ПМИД 12572614 .
- ^ Jump up to: а б Накабати А., Ямасита А., Тох Х., Исикава Х., Данбар Х., Моран Н., Хаттори М. (2006). «Геном бактериального эндосимбионта Carsonella длиной 160 тысяч оснований ». Наука . 314 (5797): 267. doi : 10.1126/science.1134196 . ПМИД 17038615 . S2CID 44570539 .
- ^ «Браузер таксономии (« Candidatus Carsonella ruddii»)» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Шох, CL; Чуфо, С; Домрачев М; Хоттон, CL; Каннан, С; Хованская Р; Лейпе, Д; Маквей, Р; О'Нил, К; Робберце, Б; Шарма, С; Сусов, В; Салливан, JP; Солнце, Л; Тернер, С; Карш-Мизрачи, I (1 января 2020 г.). «Таксономия NCBI: комплексная обновленная информация о курировании, ресурсах и инструментах» . База данных: Журнал биологических баз данных и курирования . 2020 . дои : 10.1093/база данных/baaa062 . ПМК 7408187 . ПМИД 32761142 .
- ^ Jump up to: а б Тао, МайЛо Л.; Моран, Нэнси А.; Эббот, Патрик; Бреннан, Эрик Б.; Буркхардт, Дэниел Х.; Бауманн, Пол (июль 2000 г.). «Ковидообразование листочков и их первичных прокариотических эндосимбионтов» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (7): 2898–2905. Бибкод : 2000ApEnM..66.2898T . дои : 10.1128/aem.66.7.2898-2905.2000 . ПМК 92089 . ПМИД 10877784 .
- ^ Тао, МЛ (2001). «Филогенетический анализ вертикально передающихся эндосимбионтов листочков (Candidatus Carsonella ruddii) на основе atpAGD и rpoC: сравнение с филогенией, полученной из 16S-23S рДНК». Современная микробиология . 42 (6): 419–21. дои : 10.1007/s002840010240 . ПМИД 11381334 . S2CID 20069209 .
- ^ Тортора(1), Функе(2), Кейс(3), Джерард Дж(1), Берделл Р(2), Кристин Л(3) (2016). Микробиология: Введение (12-е изд.). США: Пирсон. п. 315. ИСБН 978-0321929150 .
{{cite book}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка ) - ^ Моран, Нэнси А.; Беннетт, Гордон М. (8 сентября 2014 г.). «Самые крошечные геномы» . Ежегодный обзор микробиологии . 68 (1): 195–215. doi : 10.1146/annurev-micro-091213-112901 . ПМИД 24995872 .
- ^ Беннетт, генеральный менеджер; Моран, Северная Каролина (5 августа 2013 г.). «Маленький, меньший, самый маленький: происхождение и эволюция древних двойных симбиозов у насекомых, питающихся флоэмой» . Геномная биология и эволюция . 5 (9): 1675–1688. дои : 10.1093/gbe/evt118 . ПМЦ 3787670 . ПМИД 23918810 .
- ^ Слоан, Д.Б.; Моран, Северная Каролина (19 июля 2012 г.). «Редукция генома и коэволюция первичных и вторичных бактериальных симбионтов листочков» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (12): 3781–3792. дои : 10.1093/molbev/mss180 . ПМЦ 3494270 . ПМИД 22821013 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Scientific American : крошечный геном может отражать формирующуюся органеллу