Коллетотрихум

Коллетотрихум
	C. lindemuthianum на стручках фасоли
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
Королевство:	Грибы
Разделение:	Аскомикота
Сорт:	Сордариомицеты
Заказ:	Гломереллы
Семья:	клубочковые
Род:	Коллетотрихум ; Веревка, 1831 г.
Видовые комплексы
	Посмотреть текст

Colletotrichum (половая стадия: Glomerella ) — род грибов , которые являются симбионтами растений в качестве эндофитов (живущих внутри растения) или фитопатогенов . Многие виды этого рода являются патогенами растений , но некоторые виды могут иметь мутуалистические отношения с хозяевами . ^[1]

История

История рода Colletotrichum представляет собой тематическое исследование противоречий между комками и расщепителями . ^[2] Хотя род Colletotrichum был впервые предложен в 1831 году, ^[3] Точное определение Colletotrichum и видов, принадлежащих к этому роду, с тех пор постоянно меняется. ^[4] Самый большой недавний сдвиг произошел от определения (как рода, так и входящего в него вида), основанного на морфологии , к определению, основанному на сочетании морфологии и молекулярной филогенетики . ^[5]^[4] Использование молекулярной филогенетики привело к огромному увеличению числа признанных видов этого рода, и теперь виды организованы в комплексы видов , которые обычно носят название наиболее широко известного вида. Название вида при упоминании одноименного видового комплекса часто будет иметь суффикс sl или в широком смысле (в широком смысле), в то время как то же самое название при упоминании конкретного вида в комплексе видов будет иметь суффикс ss или sensu stricto ( в строгом смысле).

Самая последняя оценка этого рода идентифицирует 248 видов, большинство из которых относятся к 14 видовым комплексам. ^[6] Если история является каким-либо индикатором будущего, то список видовых комплексов и видов внутри этого рода будет продолжать пересматриваться и реорганизовываться по мере поступления дополнительной информации.

Виды и видовые комплексы

Colletotrichum acutatum Комплекс видов ^[7]

агав Colletotrichum Комплекс видов ^[6]

Агавы Colletotrichus в строгом смысле слова
Коллетотрихум молочайный
Коллетотрихум ледебурия
Коллетотрихум неосансевиерия
Коллетотрихум сансевиерия

Colletotrichum boninense Комплекс видов ^[8]

Colletotrichum dematium Комплекс видов ^[9]

Colletotrichum destructivum Комплекс видов ^[10]

Colletotrichum dracaenophilum Комплекс видов ^[11]

Коллетотрихум каринифери
Colletotrichum coelogynes
Colletotrichum Dragonophilus в строгом смысле слова
Коллетотрихум высокогорный
Коллетотрихум параллелофорум
Коллетотрихум тонгрененсе
Коллетотрихум тропический
Colletotrichum yunnanense

Colletotrichum gigasporum Комплекс видов ^[12]

Коллетотрихум arxii
Colletotrichum chiangraiense
Гигаспоры Colletotrichum в строгом смысле слова
Коллетотрихум джишуенсе
Коллетотрихум крупноспорум
Коллетотрихум псевдомаюс
Корень коллетотрихума
Коллетотрихум серранегренсе
Коллетотрихум вьетнамский

Colletotrichum gloeosporioides Комплекс видов ^[13]

Colletotrichum graminicola-caudatum Комплекс видов ^[6]

Виды-одиночки ^[6]

Названия видов, которые больше не действительны или были синонимизированы.

Ссылки

^ Родригес, Р.; Редман, Р. (2008). «Более 400 миллионов лет эволюции, а некоторые растения до сих пор не могут выжить самостоятельно: устойчивость растений к стрессу посредством грибкового симбиоза» . Журнал экспериментальной ботаники . 59 (5): 1109–1114. дои : 10.1093/jxb/erm342 . ПМИД 18267941 .
^ Хайд, Кевин Дэвид, Лей Цай, ЭХК Маккензи, Ю. Л. Ян, Дж. З. Чжан и Х. Прихастути (2009). «Colletotrichum: запутанный каталог» (PDF) . Грибное разнообразие . 39 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Август Карл Йозеф, Корда (1831 г.). Штурм, Джейкоб (ред.). Флора Германии в иллюстрациях на тему природы с описаниями (на немецком языке). Том 3. Нюрнберг, Германия. стр. 33–64.
^ Перейти обратно: ^а ^б Кэннон, ПФ; Дамм, У.; Джонстон, PR; Вейр, Б.С. (2012). «Коллетотрихум – современное состояние и будущие направления» . Исследования по микологии . 73 (1): 181–213. дои : 10.3114/sim0014 . ПМЦ 3458418 . ПМИД 23136460 .
^ Цай, Л., Хайд, К.Д., Тейлор, П.В.Дж., Вейр, Б.С., Уоллер, Дж., Абанг, М.М., Чжан, Дж.З., Ян, Ю.Л., Пуливонг, С., Лю, З.И., Прихастути, Х., Шивас, Р.Г., Маккензи, EHC и Джонстон, PR (2009). «Полифазный подход к изучению Colletotrichum» (PDF) . Грибное разнообразие . 39 : 183–204. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Бхунджун, Читрабхану С.; Пхухамсакда, Чаянард; Джаявардена, Рувишика С.; Дживон, Раджеш; Промпутта, Иттаякорн; Хайд, Кевин Д. (2021). «Исследование границ видов у Colletotrichum» . Грибное разнообразие . 107 (1): 107–127. дои : 10.1007/s13225-021-00471-z . ISSN 1878-9129 . S2CID 233617783 .
^ Дамм, У.; Кэннон, ПФ; Вауденберг, JHC; Кроус, PW (2012). «Комплекс видов Colletotrichum acutatum» . Исследования по микологии . 73 (1): 37–113. дои : 10.3114/sim0010 . ПМЦ 3458416 . ПМИД 23136458 .
^ Дамм, У.; Кэннон, ПФ; Вауденберг, JHC; Джонстон, PR; Вейр, Б.С.; Тан, Ю.П.; Шивас, Р.Г.; Кроус, PW (2012). «Комплекс видов Colletotrichum boninense» . Исследования по микологии . 73 (1): 1–36. дои : 10.3114/sim0002 . ПМЦ 3458415 . ПМИД 23136457 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Джаявардена Р.С., Хайд К.Д., Дамм У., Цай Л., Лю М., Ли Кс.Х., Чжан В., Чжао В.С. и Ян Дж.И. (2016). «Заметки о признанных в настоящее время видах Colletotrichum» (PDF) . Микосфера . 7 (8): 1192–1260. doi : 10.5943/микосфера/si/2c/9 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Дамм, У.; О'Коннелл, Р.Дж.; Гроеневальд, JZ; Кроус, PW (2014). «Комплекс видов Colletotrichum destructivum – гемибиотрофные возбудители кормовых и полевых культур» . Исследования по микологии . 79 : 49–84. дои : 10.1016/j.simyco.2014.09.003 . ISSN 0166-0616 . ПМЦ 4255528 . ПМИД 25492986 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Дамм, У.; Сато, Т.; Ализаде, А.; Гроеневальд, JZ; Кроус, PW (2018). «Комплексы видов Colletotrichum dracaenophilum, C. magnum и C. orchidearum» . Исследования по микологии . 90 (1): 71–118. дои : 10.1016/j.simyco.2017.11.002 . ISSN 0166-0616 . ПМЦ 5738211 . ПМИД 29276320 . S2CID 37921559 .
^ Лю, Ф.; Кай, Л.; Кроус, П.В.; Дамм, У. (2014). «Комплекс видов Colletotrichum gigasporum» . Персония - Молекулярная филогения и эволюция грибов . 33 (1): 83–97. дои : 10.3767/003158514X684447 . ПМЦ 4312939 . ПМИД 25737595 .
^ Вейр, Б.С.; Джонстон, PR; Дамм, У. (2012). «Комплекс видов Colletotrichum gloeosporioides» . Исследования по микологии . 73 (1): 115–180. дои : 10.3114/sim0011 . ПМЦ 3458417 . ПМИД 23136459 .
^ Аументадо, HDR, Арманд, А., Пхухамсакда, К., Хайд, К.Д., Джонс, Э.Г., и Джаявардена, Р.С. (2024). Полифазная идентификация двух новых видов Colletotrichum, вызывающих пятна на листьях мангровых зарослей в Таиланде. Европейский журнал патологии растений, 1-27. doi:10.1007/s10658-024-02819-y

Дальнейшее чтение

Кай, Л.; и др. (2009). «Полифазный подход к изучению Colletotrichum » (PDF) . Грибное разнообразие . 39 : 183–204.
Дамм, У.; Кэннон, ПФ; Вауденберг, JHC; Джонстон, PR; Вейр, Б.С.; Тан, Ю.П.; Шивас, Р.Г.; Кроус, PW (сентябрь 2012 г.). «Комплекс видов Colletotrichum boninense» . Исследования по микологии . 73 (1): 1–36. дои : 10.3114/sim0002 . ПМЦ 3458415 . ПМИД 23136457 .
Дамм, У.; Барончелли, Р.; Кай, Л.; Кубо, Ю.; О'Коннелл, Р.; Вейр, Б.; Ёсино, К.; Кэннон, ПФ (2010). « Colletotrichum : виды, экология и взаимодействие» . ИМА Гриб . 1 (2): 161–165. дои : 10.5598/imafungus.2010.01.02.08 . ПМЦ 3348780 . ПМИД 22679575 .
Хайд, К.Д. и др . 2009. Colletotrichum - названия, используемые в настоящее время. Грибное разнообразие 39 147–83.
Вейр, Б.С.; Джонстон, PR (2010). «Характеристика и неотипизация Gloeosporium kaki Hori как Colletotrichum horii nom. nov» . Микотаксон . 111 (1): 209–219. дои : 10.5248/111.209 .
Виейра, БЫЛ; Лима, РГ; Насименто, ES; Мичерефф, С.Дж.; Камара, член парламента; Дойл, вице-президент (2018). «Влияние фенотипических и молекулярных данных на вывод о разнообразии Colletotrichum, связанном с Musa ». Микология . 109 (6): 912–934. дои : 10.1080/00275514.2017.1418577 . ПМИД 29494311 . S2CID 3611193 .
Лю, Ф.; Тан, Г.; Чжэн, X.; Ли, Ю.; Солнце, Х.; Ци, X.; Чжоу, Ю.; Сюй, Дж.; Чен, Х.; Чанг, X.; Чжан, С.; Гонг, Г. (2016). «Молекулярная и фенотипическая характеристика видов Colletotrichum, связанных с заболеванием антракнозом перца из провинции Сычуань, Китай» . Научные отчеты . 6 (1): 32761. Бибкод : 2016NatSR...632761L . дои : 10.1038/srep32761 . ПМК 5016793 . ПМИД 27609555 .

[1] Родригес, Р.; Редман, Р. (2008). «Более 400 миллионов лет эволюции, а некоторые растения до сих пор не могут выжить самостоятельно: устойчивость растений к стрессу посредством грибкового симбиоза» . Журнал экспериментальной ботаники . 59 (5): 1109–1114. дои : 10.1093/jxb/erm342 . ПМИД 18267941 .

[2] Хайд, Кевин Дэвид, Лей Цай, ЭХК Маккензи, Ю. Л. Ян, Дж. З. Чжан и Х. Прихастути (2009). «Colletotrichum: запутанный каталог» (PDF) . Грибное разнообразие . 39 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[3] Август Карл Йозеф, Корда (1831 г.). Штурм, Джейкоб (ред.). Флора Германии в иллюстрациях на тему природы с описаниями (на немецком языке). Том 3. Нюрнберг, Германия. стр. 33–64.

[:0-4] Перейти обратно: ^а ^б Кэннон, ПФ; Дамм, У.; Джонстон, PR; Вейр, Б.С. (2012). «Коллетотрихум – современное состояние и будущие направления» . Исследования по микологии . 73 (1): 181–213. дои : 10.3114/sim0014 . ПМЦ 3458418 . ПМИД 23136460 .

[5] Цай, Л., Хайд, К.Д., Тейлор, П.В.Дж., Вейр, Б.С., Уоллер, Дж., Абанг, М.М., Чжан, Дж.З., Ян, Ю.Л., Пуливонг, С., Лю, З.И., Прихастути, Х., Шивас, Р.Г., Маккензи, EHC и Джонстон, PR (2009). «Полифазный подход к изучению Colletotrichum» (PDF) . Грибное разнообразие . 39 : 183–204. {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[:1-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Бхунджун, Читрабхану С.; Пхухамсакда, Чаянард; Джаявардена, Рувишика С.; Дживон, Раджеш; Промпутта, Иттаякорн; Хайд, Кевин Д. (2021). «Исследование границ видов у Colletotrichum» . Грибное разнообразие . 107 (1): 107–127. дои : 10.1007/s13225-021-00471-z . ISSN 1878-9129 . S2CID 233617783 .

[7] Дамм, У.; Кэннон, ПФ; Вауденберг, JHC; Кроус, PW (2012). «Комплекс видов Colletotrichum acutatum» . Исследования по микологии . 73 (1): 37–113. дои : 10.3114/sim0010 . ПМЦ 3458416 . ПМИД 23136458 .

[8] Дамм, У.; Кэннон, ПФ; Вауденберг, JHC; Джонстон, PR; Вейр, Б.С.; Тан, Ю.П.; Шивас, Р.Г.; Кроус, PW (2012). «Комплекс видов Colletotrichum boninense» . Исследования по микологии . 73 (1): 1–36. дои : 10.3114/sim0002 . ПМЦ 3458415 . ПМИД 23136457 .

[:2-9] Перейти обратно: ^а ^б ^с Джаявардена Р.С., Хайд К.Д., Дамм У., Цай Л., Лю М., Ли Кс.Х., Чжан В., Чжао В.С. и Ян Дж.И. (2016). «Заметки о признанных в настоящее время видах Colletotrichum» (PDF) . Микосфера . 7 (8): 1192–1260. doi : 10.5943/микосфера/si/2c/9 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[10] Дамм, У.; О'Коннелл, Р.Дж.; Гроеневальд, JZ; Кроус, PW (2014). «Комплекс видов Colletotrichum destructivum – гемибиотрофные возбудители кормовых и полевых культур» . Исследования по микологии . 79 : 49–84. дои : 10.1016/j.simyco.2014.09.003 . ISSN 0166-0616 . ПМЦ 4255528 . ПМИД 25492986 .

[:3-11] Перейти обратно: ^а ^б ^с Дамм, У.; Сато, Т.; Ализаде, А.; Гроеневальд, JZ; Кроус, PW (2018). «Комплексы видов Colletotrichum dracaenophilum, C. magnum и C. orchidearum» . Исследования по микологии . 90 (1): 71–118. дои : 10.1016/j.simyco.2017.11.002 . ISSN 0166-0616 . ПМЦ 5738211 . ПМИД 29276320 . S2CID 37921559 .

[12] Лю, Ф.; Кай, Л.; Кроус, П.В.; Дамм, У. (2014). «Комплекс видов Colletotrichum gigasporum» . Персония - Молекулярная филогения и эволюция грибов . 33 (1): 83–97. дои : 10.3767/003158514X684447 . ПМЦ 4312939 . ПМИД 25737595 .

[13] Вейр, Б.С.; Джонстон, PR; Дамм, У. (2012). «Комплекс видов Colletotrichum gloeosporioides» . Исследования по микологии . 73 (1): 115–180. дои : 10.3114/sim0011 . ПМЦ 3458417 . ПМИД 23136459 .

[14] Аументадо, HDR, Арманд, А., Пхухамсакда, К., Хайд, К.Д., Джонс, Э.Г., и Джаявардена, Р.С. (2024). Полифазная идентификация двух новых видов Colletotrichum, вызывающих пятна на листьях мангровых зарослей в Таиланде. Европейский журнал патологии растений, 1-27. doi:10.1007/s10658-024-02819-y

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

История

Виды и видовые комплексы

Colletotrichum acutatum Комплекс видов [7]

агав Colletotrichum Комплекс видов [6]

Colletotrichum boninense Комплекс видов [8]

Colletotrichum dematium Комплекс видов [9]

Colletotrichum destructivum Комплекс видов [10]

Colletotrichum dracaenophilum Комплекс видов [11]

Colletotrichum gigasporum Комплекс видов [12]

Colletotrichum gloeosporioides Комплекс видов [13]

Colletotrichum graminicola-caudatum Комплекс видов [6]

Colletotrichum magnum Комплекс видов [11]

Colletotrichum orbculare Комплекс видов [6]

Colletotrichum orchidearum Комплекс видов [11]

Colletotrichum spaethianus Комплекс видов [9]

Colletotrichum truncatum Комплекс видов [9]

Виды-одиночки [6]